MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 45067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31501	NC_013422	GAA	2	6	1823333	1823338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856283
31502	NC_013422	ACG	2	6	1823367	1823372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856283
31503	NC_013422	TGA	2	6	1823479	1823484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856283
31504	NC_013422	TGA	2	6	1823524	1823529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856283
31505	NC_013422	CTG	2	6	1823531	1823536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856283
31506	NC_013422	GCG	2	6	1823598	1823603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856283
31507	NC_013422	GAT	2	6	1823756	1823761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856283
31508	NC_013422	ATGCCG	2	12	1823787	1823798	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	261856283
31509	NC_013422	GCG	2	6	1823868	1823873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856283
31510	NC_013422	A	6	6	1823942	1823947	100 %	0 %	0 %	0 %	261856283
31511	NC_013422	CGG	2	6	1823952	1823957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856283
31512	NC_013422	GCTG	2	8	1824004	1824011	0 %	25 %	50 %	25 %	261856283
31513	NC_013422	ATC	2	6	1824035	1824040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856283
31514	NC_013422	AGA	2	6	1824055	1824060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856283
31515	NC_013422	GAA	2	6	1824125	1824130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856283
31516	NC_013422	AGC	2	6	1824191	1824196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856283
31517	NC_013422	GTGC	2	8	1824200	1824207	0 %	25 %	50 %	25 %	261856283
31518	NC_013422	AAC	2	6	1824275	1824280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856283
31519	NC_013422	CAT	2	6	1824289	1824294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856283
31520	NC_013422	GAA	2	6	1824323	1824328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856283
31521	NC_013422	GC	3	6	1824351	1824356	0 %	0 %	50 %	50 %	261856283
31522	NC_013422	CGT	2	6	1824405	1824410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856283
31523	NC_013422	GGC	2	6	1824466	1824471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856283
31524	NC_013422	TCG	2	6	1824504	1824509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856283
31525	NC_013422	GATCG	2	10	1824563	1824572	20 %	20 %	40 %	20 %	261856283
31526	NC_013422	CAA	2	6	1824655	1824660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856283
31527	NC_013422	GTCA	2	8	1824851	1824858	25 %	25 %	25 %	25 %	261856283
31528	NC_013422	CAT	2	6	1825042	1825047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856283
31529	NC_013422	ATT	2	6	1825085	1825090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261856283
31530	NC_013422	TTA	2	6	1825199	1825204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261856283
31531	NC_013422	GATG	2	8	1825363	1825370	25 %	25 %	50 %	0 %	261856283
31532	NC_013422	CAG	2	6	1825387	1825392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856283
31533	NC_013422	CAA	2	6	1825405	1825410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856283
31534	NC_013422	GAC	2	6	1825463	1825468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856283
31535	NC_013422	CCA	2	6	1825469	1825474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856283
31536	NC_013422	ATC	2	6	1825478	1825483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856283
31537	NC_013422	TCA	2	6	1825488	1825493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856283
31538	NC_013422	GTC	3	9	1825532	1825540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856283
31539	NC_013422	AAT	2	6	1825655	1825660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261856283
31540	NC_013422	CAA	2	6	1825689	1825694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856283
31541	NC_013422	CA	3	6	1825714	1825719	50 %	0 %	0 %	50 %	261856283
31542	NC_013422	GC	3	6	1825752	1825757	0 %	0 %	50 %	50 %	261856283
31543	NC_013422	GGAA	2	8	1825765	1825772	50 %	0 %	50 %	0 %	261856283
31544	NC_013422	GAA	2	6	1825808	1825813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856283
31545	NC_013422	TTGA	2	8	1825820	1825827	25 %	50 %	25 %	0 %	261856283
31546	NC_013422	CAAA	2	8	1825902	1825909	75 %	0 %	0 %	25 %	261856283
31547	NC_013422	ACT	2	6	1825918	1825923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856283
31548	NC_013422	CGCA	2	8	1825971	1825978	25 %	0 %	25 %	50 %	261856283
31549	NC_013422	GGT	2	6	1826029	1826034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856284
31550	NC_013422	CTG	2	6	1826050	1826055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856284
31551	NC_013422	GCC	2	6	1826057	1826062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856284
31552	NC_013422	GGT	2	6	1826082	1826087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856284
31553	NC_013422	GCA	2	6	1826093	1826098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856284
31554	NC_013422	T	6	6	1826124	1826129	0 %	100 %	0 %	0 %	261856284
31555	NC_013422	GAC	2	6	1826266	1826271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856284
31556	NC_013422	TGC	2	6	1826414	1826419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856284
31557	NC_013422	GCC	2	6	1826434	1826439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856284
31558	NC_013422	CCG	2	6	1826528	1826533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856284
31559	NC_013422	GCCC	2	8	1826577	1826584	0 %	0 %	25 %	75 %	261856284
31560	NC_013422	ACC	2	6	1826675	1826680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856284
31561	NC_013422	GCC	2	6	1826725	1826730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856284
31562	NC_013422	CTGA	2	8	1826734	1826741	25 %	25 %	25 %	25 %	261856284
31563	NC_013422	AGGCA	2	10	1826781	1826790	40 %	0 %	40 %	20 %	261856284
31564	NC_013422	CGAT	2	8	1826865	1826872	25 %	25 %	25 %	25 %	261856284
31565	NC_013422	GCA	2	6	1826919	1826924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856284
31566	NC_013422	TCA	2	6	1826934	1826939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856284
31567	NC_013422	TGG	2	6	1826966	1826971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856284
31568	NC_013422	TGC	2	6	1827023	1827028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856284
31569	NC_013422	ACGC	2	8	1827044	1827051	25 %	0 %	25 %	50 %	261856284
31570	NC_013422	GCC	2	6	1827106	1827111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856284
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31572	NC_013422	A	6	6	1827174	1827179	100 %	0 %	0 %	0 %	261856284
31573	NC_013422	GC	3	6	1827193	1827198	0 %	0 %	50 %	50 %	261856284
31574	NC_013422	GCA	2	6	1827201	1827206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856284
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31577	NC_013422	GCA	2	6	1827505	1827510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856285
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31585	NC_013422	CAG	2	6	1827786	1827791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856285
31586	NC_013422	GCCA	2	8	1827845	1827852	25 %	0 %	25 %	50 %	261856285
31587	NC_013422	GAG	2	6	1827888	1827893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261856285
31588	NC_013422	TTTGC	2	10	1827909	1827918	0 %	60 %	20 %	20 %	261856285
31589	NC_013422	GCC	2	6	1827921	1827926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856285
31590	NC_013422	ATC	2	6	1827980	1827985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856285
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31593	NC_013422	CGA	2	6	1828089	1828094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856286
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31597	NC_013422	T	7	7	1828247	1828253	0 %	100 %	0 %	0 %	261856286
31598	NC_013422	CCG	2	6	1828316	1828321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856286
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31601	NC_013422	GGT	2	6	1828462	1828467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856286
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31605	NC_013422	CAGAA	2	10	1828571	1828580	60 %	0 %	20 %	20 %	261856286
31606	NC_013422	GTT	2	6	1828626	1828631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856286
31607	NC_013422	CTT	2	6	1828641	1828646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856286
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31612	NC_013422	ACA	2	6	1828811	1828816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856286
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31614	NC_013422	GCG	2	6	1828899	1828904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856286
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31616	NC_013422	T	6	6	1828980	1828985	0 %	100 %	0 %	0 %	261856286
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31618	NC_013422	CAG	2	6	1829050	1829055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856286
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31732	NC_013422	TCA	2	6	1835454	1835459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856296
31733	NC_013422	GGC	2	6	1835460	1835465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856296
31734	NC_013422	ATC	2	6	1835520	1835525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856296
31735	NC_013422	GCG	2	6	1835545	1835550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856296
31736	NC_013422	GTT	2	6	1835610	1835615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856296
31737	NC_013422	AAATGG	2	12	1835636	1835647	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	261856296
31738	NC_013422	CGCTG	2	10	1835711	1835720	0 %	20 %	40 %	40 %	261856296
31739	NC_013422	CCA	2	6	1835761	1835766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856296
31740	NC_013422	GAT	2	6	1835961	1835966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856296
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31744	NC_013422	CAAC	2	8	1836277	1836284	50 %	0 %	0 %	50 %	261856296
31745	NC_013422	GGC	2	6	1836320	1836325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856296
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31750	NC_013422	CGT	2	6	1836389	1836394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856296
31751	NC_013422	CAC	2	6	1836443	1836448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856296
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31753	NC_013422	CA	3	6	1836650	1836655	50 %	0 %	0 %	50 %	261856296
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31758	NC_013422	CTG	2	6	1836816	1836821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856296
31759	NC_013422	TGA	2	6	1837035	1837040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856297
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31769	NC_013422	TCA	2	6	1837636	1837641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856298
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31843	NC_013422	CG	4	8	1843892	1843899	0 %	0 %	50 %	50 %	261856302
31844	NC_013422	CCG	3	9	1843903	1843911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856302
31845	NC_013422	CG	3	6	1843921	1843926	0 %	0 %	50 %	50 %	261856302
31846	NC_013422	ATG	2	6	1843992	1843997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856302
31847	NC_013422	TCG	2	6	1844001	1844006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856302
31848	NC_013422	TCT	2	6	1844043	1844048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856302
31849	NC_013422	GCA	2	6	1844086	1844091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856302
31850	NC_013422	GAC	2	6	1844117	1844122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856302
31851	NC_013422	CAC	2	6	1844137	1844142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856302
31852	NC_013422	CTC	2	6	1844171	1844176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261856302
31853	NC_013422	CCT	2	6	1844182	1844187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261856302
31854	NC_013422	CGT	2	6	1844245	1844250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856302
31855	NC_013422	AAT	2	6	1844303	1844308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261856302
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31859	NC_013422	CGC	4	12	1844417	1844428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856302
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31862	NC_013422	CCG	2	6	1844867	1844872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856303
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31864	NC_013422	GGCTC	2	10	1844993	1845002	0 %	20 %	40 %	40 %	261856303
31865	NC_013422	GGCCTT	2	12	1845008	1845019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856303
31866	NC_013422	GCA	2	6	1845041	1845046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856303
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31874	NC_013422	CGG	2	6	1845677	1845682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856303
31875	NC_013422	CGC	2	6	1845690	1845695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856303
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31881	NC_013422	ACC	2	6	1846090	1846095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856304
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31883	NC_013422	GGCT	2	8	1846226	1846233	0 %	25 %	50 %	25 %	261856304
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31949	NC_013422	TCGAT	2	10	1849692	1849701	20 %	40 %	20 %	20 %	261856307
31950	NC_013422	TGC	2	6	1849737	1849742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856307
31951	NC_013422	A	7	7	1849827	1849833	100 %	0 %	0 %	0 %	261856307
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31954	NC_013422	TCAAA	2	10	1850187	1850196	60 %	20 %	0 %	20 %	261856308
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31957	NC_013422	ACT	2	6	1850393	1850398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856308
31958	NC_013422	TGGT	2	8	1850453	1850460	0 %	50 %	50 %	0 %	261856308
31959	NC_013422	TTC	2	6	1850540	1850545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856308
31960	NC_013422	CGA	2	6	1850565	1850570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856308
31961	NC_013422	GCAATG	2	12	1850651	1850662	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	261856308
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31963	NC_013422	T	7	7	1850778	1850784	0 %	100 %	0 %	0 %	261856308
31964	NC_013422	TGA	2	6	1850868	1850873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856308
31965	NC_013422	CG	3	6	1850941	1850946	0 %	0 %	50 %	50 %	261856308
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31968	NC_013422	GAC	2	6	1851172	1851177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856309
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31981	NC_013422	TGA	2	6	1851858	1851863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856310
31982	NC_013422	CAT	2	6	1851901	1851906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856310
31983	NC_013422	CAA	2	6	1851940	1851945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856310
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31985	NC_013422	T	6	6	1852046	1852051	0 %	100 %	0 %	0 %	261856311
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31987	NC_013422	GCA	2	6	1852072	1852077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856311
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31991	NC_013422	GCA	2	6	1852457	1852462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856312
31992	NC_013422	ATC	2	6	1852513	1852518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856312
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31995	NC_013422	GA	3	6	1852721	1852726	50 %	0 %	50 %	0 %	261856312
31996	NC_013422	GAT	2	6	1852797	1852802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856312
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31998	NC_013422	GCCA	2	8	1852851	1852858	25 %	0 %	25 %	50 %	261856312
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