MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 45067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31002	NC_013422	GCA	2	6	1796818	1796823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856260
31003	NC_013422	GATG	2	8	1796844	1796851	25 %	25 %	50 %	0 %	261856260
31004	NC_013422	GAT	2	6	1796887	1796892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856260
31005	NC_013422	GGTTC	2	10	1796896	1796905	0 %	40 %	40 %	20 %	261856260
31006	NC_013422	GATG	2	8	1796941	1796948	25 %	25 %	50 %	0 %	261856260
31007	NC_013422	TCAA	2	8	1796962	1796969	50 %	25 %	0 %	25 %	261856260
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31009	NC_013422	GCAG	2	8	1797040	1797047	25 %	0 %	50 %	25 %	261856260
31010	NC_013422	CCA	2	6	1797136	1797141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856260
31011	NC_013422	CGG	2	6	1797173	1797178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856260
31012	NC_013422	AGA	2	6	1797534	1797539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856261
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31014	NC_013422	TCA	2	6	1797617	1797622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856261
31015	NC_013422	GCCC	2	8	1797642	1797649	0 %	0 %	25 %	75 %	261856261
31016	NC_013422	GGA	2	6	1797756	1797761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261856261
31017	NC_013422	CCTG	2	8	1797782	1797789	0 %	25 %	25 %	50 %	261856262
31018	NC_013422	GCC	2	6	1797850	1797855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856262
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31024	NC_013422	GC	3	6	1798099	1798104	0 %	0 %	50 %	50 %	261856263
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31029	NC_013422	GCTG	2	8	1798406	1798413	0 %	25 %	50 %	25 %	261856263
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31032	NC_013422	CG	3	6	1798572	1798577	0 %	0 %	50 %	50 %	261856263
31033	NC_013422	TCA	2	6	1798595	1798600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856263
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31051	NC_013422	GC	5	10	1799421	1799430	0 %	0 %	50 %	50 %	261856264
31052	NC_013422	TAC	2	6	1799593	1799598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856264
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31057	NC_013422	AGCC	3	12	1799786	1799797	25 %	0 %	25 %	50 %	261856265
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31098	NC_013422	TGA	2	6	1802614	1802619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856267
31099	NC_013422	CCGA	2	8	1802637	1802644	25 %	0 %	25 %	50 %	261856268
31100	NC_013422	GATC	2	8	1802663	1802670	25 %	25 %	25 %	25 %	261856268
31101	NC_013422	GGC	2	6	1802774	1802779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856268
31102	NC_013422	CGT	2	6	1802789	1802794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856268
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31114	NC_013422	GAA	2	6	1803366	1803371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856268
31115	NC_013422	TCG	2	6	1803421	1803426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856268
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31117	NC_013422	TGC	2	6	1803466	1803471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856268
31118	NC_013422	CGG	2	6	1803505	1803510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856268
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31222	NC_013422	GAT	2	6	1809034	1809039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856271
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31225	NC_013422	TTCA	2	8	1809355	1809362	25 %	50 %	0 %	25 %	261856272
31226	NC_013422	CAA	2	6	1809412	1809417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856272
31227	NC_013422	GC	3	6	1809461	1809466	0 %	0 %	50 %	50 %	261856272
31228	NC_013422	TCAA	2	8	1809509	1809516	50 %	25 %	0 %	25 %	261856272
31229	NC_013422	CTG	2	6	1809526	1809531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856272
31230	NC_013422	CTC	2	6	1809558	1809563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261856272
31231	NC_013422	GGC	2	6	1809576	1809581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856272
31232	NC_013422	TGC	3	9	1809638	1809646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856272
31233	NC_013422	AAC	2	6	1809671	1809676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856272
31234	NC_013422	CCA	2	6	1809814	1809819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856272
31235	NC_013422	CCTG	2	8	1809938	1809945	0 %	25 %	25 %	50 %	261856272
31236	NC_013422	CCA	2	6	1809957	1809962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856272
31237	NC_013422	T	6	6	1810241	1810246	0 %	100 %	0 %	0 %	261856273
31238	NC_013422	CG	3	6	1810437	1810442	0 %	0 %	50 %	50 %	261856273
31239	NC_013422	CAA	2	6	1810463	1810468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856273
31240	NC_013422	CAT	2	6	1810523	1810528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856273
31241	NC_013422	CTG	2	6	1810533	1810538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856273
31242	NC_013422	GC	3	6	1810559	1810564	0 %	0 %	50 %	50 %	261856273
31243	NC_013422	GCC	2	6	1810602	1810607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856273
31244	NC_013422	CCATG	2	10	1810661	1810670	20 %	20 %	20 %	40 %	261856273
31245	NC_013422	CGC	2	6	1810673	1810678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856273
31246	NC_013422	TGGCAT	2	12	1810705	1810716	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	261856273
31247	NC_013422	ACG	2	6	1810722	1810727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856273
31248	NC_013422	CTG	2	6	1810740	1810745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856273
31249	NC_013422	AGC	2	6	1810795	1810800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856273
31250	NC_013422	GTGATG	2	12	1810803	1810814	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	261856273
31251	NC_013422	ATG	2	6	1810818	1810823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856273
31252	NC_013422	TGATGC	2	12	1810834	1810845	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	261856273
31253	NC_013422	AAC	2	6	1810846	1810851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856273
31254	NC_013422	AGCC	3	12	1810925	1810936	25 %	0 %	25 %	50 %	261856273
31255	NC_013422	GTTCGG	2	12	1810945	1810956	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	261856273
31256	NC_013422	CAG	2	6	1810994	1810999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856274
31257	NC_013422	A	6	6	1811067	1811072	100 %	0 %	0 %	0 %	261856274
31258	NC_013422	GAA	2	6	1811108	1811113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856274
31259	NC_013422	TGC	2	6	1811178	1811183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856274
31260	NC_013422	CGC	2	6	1811203	1811208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856274
31261	NC_013422	AGC	2	6	1811252	1811257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856274
31262	NC_013422	GCA	2	6	1811259	1811264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856274
31263	NC_013422	CA	3	6	1811323	1811328	50 %	0 %	0 %	50 %	261856274
31264	NC_013422	TTC	2	6	1811566	1811571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856274
31265	NC_013422	AGGC	2	8	1811634	1811641	25 %	0 %	50 %	25 %	261856274
31266	NC_013422	CA	3	6	1811666	1811671	50 %	0 %	0 %	50 %	261856274
31267	NC_013422	GCG	2	6	1811723	1811728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856274
31268	NC_013422	GCG	2	6	1811732	1811737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856274
31269	NC_013422	TGT	2	6	1811740	1811745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856274
31270	NC_013422	TCG	2	6	1811854	1811859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856274
31271	NC_013422	AACC	2	8	1811914	1811921	50 %	0 %	0 %	50 %	261856274
31272	NC_013422	AGCC	2	8	1811945	1811952	25 %	0 %	25 %	50 %	261856274
31273	NC_013422	ATG	2	6	1811977	1811982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856275
31274	NC_013422	CAG	2	6	1811983	1811988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856275
31275	NC_013422	TAC	2	6	1812012	1812017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856275
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31277	NC_013422	CTG	2	6	1812130	1812135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856275
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31282	NC_013422	CGC	2	6	1812264	1812269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856275
31283	NC_013422	TGC	2	6	1812327	1812332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856275
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31285	NC_013422	GACT	2	8	1812389	1812396	25 %	25 %	25 %	25 %	261856275
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31312	NC_013422	GCA	2	6	1813940	1813945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856276
31313	NC_013422	ATT	2	6	1813965	1813970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261856276
31314	NC_013422	ATG	2	6	1814002	1814007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856276
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31319	NC_013422	GCTT	2	8	1814183	1814190	0 %	50 %	25 %	25 %	261856276
31320	NC_013422	ACA	2	6	1814275	1814280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856276
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31322	NC_013422	GCG	2	6	1814335	1814340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856276
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31324	NC_013422	GCG	2	6	1814381	1814386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856276
31325	NC_013422	TGC	2	6	1814395	1814400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856276
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31331	NC_013422	CGA	2	6	1814702	1814707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856276
31332	NC_013422	GAT	2	6	1814853	1814858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856276
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31334	NC_013422	CAAGAT	2	12	1814909	1814920	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	261856276
31335	NC_013422	AAG	2	6	1814925	1814930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856276
31336	NC_013422	TTG	2	6	1814932	1814937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856276
31337	NC_013422	CTC	2	6	1814970	1814975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261856276
31338	NC_013422	ACTGGA	2	12	1815002	1815013	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	261856276
31339	NC_013422	CCG	2	6	1815037	1815042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856276
31340	NC_013422	CCG	2	6	1815199	1815204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856276
31341	NC_013422	AG	3	6	1815206	1815211	50 %	0 %	50 %	0 %	261856276
31342	NC_013422	CAA	2	6	1815212	1815217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856276
31343	NC_013422	GAT	2	6	1815402	1815407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856277
31344	NC_013422	ATC	2	6	1815472	1815477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856277
31345	NC_013422	CAC	2	6	1815492	1815497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856277
31346	NC_013422	CAG	2	6	1815498	1815503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856277
31347	NC_013422	ATC	2	6	1815517	1815522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856277
31348	NC_013422	TGA	2	6	1815530	1815535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856277
31349	NC_013422	CCG	3	9	1815539	1815547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856277
31350	NC_013422	CGA	2	6	1815634	1815639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856277
31351	NC_013422	GC	3	6	1815669	1815674	0 %	0 %	50 %	50 %	261856277
31352	NC_013422	CTG	2	6	1815675	1815680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856277
31353	NC_013422	CAC	2	6	1815752	1815757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856277
31354	NC_013422	ATTG	2	8	1815816	1815823	25 %	50 %	25 %	0 %	261856277
31355	NC_013422	CGC	2	6	1815828	1815833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856277
31356	NC_013422	CCG	3	9	1815881	1815889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856277
31357	NC_013422	TCT	2	6	1815904	1815909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856277
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31359	NC_013422	ATG	2	6	1815958	1815963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856277
31360	NC_013422	AGT	2	6	1815980	1815985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856277
31361	NC_013422	CTG	2	6	1815986	1815991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856277
31362	NC_013422	TGCC	2	8	1816023	1816030	0 %	25 %	25 %	50 %	261856277
31363	NC_013422	CCG	2	6	1816035	1816040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856277
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31367	NC_013422	TGA	2	6	1816117	1816122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856277
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31375	NC_013422	CCA	2	6	1816484	1816489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856277
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31378	NC_013422	CTG	2	6	1816569	1816574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856277
31379	NC_013422	GCC	2	6	1816711	1816716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856277
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31382	NC_013422	TG	3	6	1816937	1816942	0 %	50 %	50 %	0 %	261856277
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31415	NC_013422	CAT	2	6	1818796	1818801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856278
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31417	NC_013422	CTG	2	6	1818830	1818835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856278
31418	NC_013422	TGA	2	6	1818894	1818899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856278
31419	NC_013422	TGA	2	6	1818907	1818912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856278
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31421	NC_013422	AGA	2	6	1818984	1818989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856278
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31427	NC_013422	ACT	2	6	1819353	1819358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856279
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31441	NC_013422	ACG	3	9	1819941	1819949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856279
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31447	NC_013422	TCA	2	6	1820185	1820190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856280
31448	NC_013422	CGCTCG	2	12	1820200	1820211	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	261856280
31449	NC_013422	TGG	2	6	1820275	1820280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856280
31450	NC_013422	ATG	2	6	1820289	1820294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856280
31451	NC_013422	GCT	2	6	1820378	1820383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856280
31452	NC_013422	GCC	2	6	1820412	1820417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856280
31453	NC_013422	CTGCC	2	10	1820465	1820474	0 %	20 %	20 %	60 %	261856280
31454	NC_013422	CGCC	2	8	1820531	1820538	0 %	0 %	25 %	75 %	261856280
31455	NC_013422	TGG	2	6	1820551	1820556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856280
31456	NC_013422	CCG	2	6	1820557	1820562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856280
31457	NC_013422	GCC	2	6	1820739	1820744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856280
31458	NC_013422	CAT	2	6	1820828	1820833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856280
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31460	NC_013422	A	6	6	1820946	1820951	100 %	0 %	0 %	0 %	261856280
31461	NC_013422	A	6	6	1820959	1820964	100 %	0 %	0 %	0 %	261856280
31462	NC_013422	ATC	2	6	1820968	1820973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856280
31463	NC_013422	TGC	2	6	1821026	1821031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856280
31464	NC_013422	GAA	2	6	1821048	1821053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856280
31465	NC_013422	GCA	2	6	1821110	1821115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856280
31466	NC_013422	GAA	2	6	1821184	1821189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856281
31467	NC_013422	CAG	2	6	1821256	1821261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856281
31468	NC_013422	CGTG	2	8	1821264	1821271	0 %	25 %	50 %	25 %	261856281
31469	NC_013422	CCAGC	2	10	1821309	1821318	20 %	0 %	20 %	60 %	261856281
31470	NC_013422	CTG	2	6	1821358	1821363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856281
31471	NC_013422	GAT	2	6	1821372	1821377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856281
31472	NC_013422	CG	3	6	1821400	1821405	0 %	0 %	50 %	50 %	261856281
31473	NC_013422	GCA	2	6	1821428	1821433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856281
31474	NC_013422	TCG	2	6	1821858	1821863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856282
31475	NC_013422	AAT	2	6	1821864	1821869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261856282
31476	NC_013422	GCGGG	2	10	1821962	1821971	0 %	0 %	80 %	20 %	261856282
31477	NC_013422	GAC	2	6	1821996	1822001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856282
31478	NC_013422	GCA	2	6	1822043	1822048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856282
31479	NC_013422	GC	3	6	1822099	1822104	0 %	0 %	50 %	50 %	261856282
31480	NC_013422	GTCATG	2	12	1822135	1822146	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	261856282
31481	NC_013422	GC	3	6	1822314	1822319	0 %	0 %	50 %	50 %	261856282
31482	NC_013422	ACGA	2	8	1822437	1822444	50 %	0 %	25 %	25 %	261856282
31483	NC_013422	CGC	2	6	1822460	1822465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856282
31484	NC_013422	C	6	6	1822471	1822476	0 %	0 %	0 %	100 %	261856282
31485	NC_013422	CCCA	2	8	1822740	1822747	25 %	0 %	0 %	75 %	261856283
31486	NC_013422	CAA	2	6	1822750	1822755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856283
31487	NC_013422	TGA	2	6	1822774	1822779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856283
31488	NC_013422	GCC	2	6	1822784	1822789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856283
31489	NC_013422	CTTG	2	8	1822840	1822847	0 %	50 %	25 %	25 %	261856283
31490	NC_013422	CTG	2	6	1822869	1822874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856283
31491	NC_013422	CGA	2	6	1822876	1822881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856283
31492	NC_013422	ATT	2	6	1822912	1822917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261856283
31493	NC_013422	TTGT	2	8	1822928	1822935	0 %	75 %	25 %	0 %	261856283
31494	NC_013422	GAAT	2	8	1822972	1822979	50 %	25 %	25 %	0 %	261856283
31495	NC_013422	TAA	2	6	1822986	1822991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261856283
31496	NC_013422	CGGC	2	8	1822992	1822999	0 %	0 %	50 %	50 %	261856283
31497	NC_013422	AGCA	2	8	1823037	1823044	50 %	0 %	25 %	25 %	261856283
31498	NC_013422	TCG	2	6	1823094	1823099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856283
31499	NC_013422	T	7	7	1823169	1823175	0 %	100 %	0 %	0 %	261856283
31500	NC_013422	TGG	3	9	1823214	1823222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856283

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