MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 45067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30002	NC_013422	TCG	2	6	1738178	1738183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856190
30003	NC_013422	CAT	2	6	1738275	1738280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856190
30004	NC_013422	TGA	2	6	1738364	1738369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856190
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30006	NC_013422	CTG	2	6	1738488	1738493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856190
30007	NC_013422	TA	3	6	1738544	1738549	50 %	50 %	0 %	0 %	261856190
30008	NC_013422	CGA	2	6	1738571	1738576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856190
30009	NC_013422	GAT	2	6	1738611	1738616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856190
30010	NC_013422	CCA	2	6	1738619	1738624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856190
30011	NC_013422	TAA	2	6	1738630	1738635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261856190
30012	NC_013422	TGA	2	6	1738727	1738732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856190
30013	NC_013422	GAT	2	6	1738749	1738754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856190
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30018	NC_013422	CAG	2	6	1739170	1739175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856191
30019	NC_013422	GCA	2	6	1739256	1739261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856191
30020	NC_013422	GACA	2	8	1739366	1739373	50 %	0 %	25 %	25 %	261856191
30021	NC_013422	TGCT	2	8	1739388	1739395	0 %	50 %	25 %	25 %	261856191
30022	NC_013422	GCG	2	6	1739457	1739462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856191
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30050	NC_013422	AATC	2	8	1741249	1741256	50 %	25 %	0 %	25 %	261856192
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30055	NC_013422	CGG	2	6	1741532	1741537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856192
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30062	NC_013422	CTGTC	2	10	1742299	1742308	0 %	40 %	20 %	40 %	261856193
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30100	NC_013422	CCAA	2	8	1745074	1745081	50 %	0 %	0 %	50 %	261856196
30101	NC_013422	GC	4	8	1745120	1745127	0 %	0 %	50 %	50 %	261856196
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30106	NC_013422	A	7	7	1745351	1745357	100 %	0 %	0 %	0 %	261856197
30107	NC_013422	CTCC	2	8	1745416	1745423	0 %	25 %	0 %	75 %	261856197
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30114	NC_013422	CATTT	2	10	1745687	1745696	20 %	60 %	0 %	20 %	261856197
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30116	NC_013422	TCG	2	6	1745826	1745831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856197
30117	NC_013422	TTG	2	6	1745839	1745844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856197
30118	NC_013422	TAA	2	6	1745882	1745887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261856197
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30121	NC_013422	TGA	2	6	1745946	1745951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856197
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30129	NC_013422	AGC	2	6	1746476	1746481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856198
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30200	NC_013422	TGA	2	6	1750758	1750763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856204
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30207	NC_013422	TGA	2	6	1750932	1750937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856204
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30210	NC_013422	ATCA	2	8	1751062	1751069	50 %	25 %	0 %	25 %	261856204
30211	NC_013422	TGGTT	2	10	1751095	1751104	0 %	60 %	40 %	0 %	261856204
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30215	NC_013422	GGC	2	6	1751396	1751401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856204
30216	NC_013422	GAT	2	6	1751413	1751418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856204
30217	NC_013422	T	7	7	1751436	1751442	0 %	100 %	0 %	0 %	261856204
30218	NC_013422	CTC	2	6	1751554	1751559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261856204
30219	NC_013422	GAA	2	6	1751562	1751567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856204
30220	NC_013422	GGT	2	6	1751590	1751595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856204
30221	NC_013422	CTT	2	6	1751637	1751642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856204
30222	NC_013422	T	6	6	1751673	1751678	0 %	100 %	0 %	0 %	261856204
30223	NC_013422	GCG	2	6	1751703	1751708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856204
30224	NC_013422	GATT	2	8	1751788	1751795	25 %	50 %	25 %	0 %	261856204
30225	NC_013422	CG	3	6	1751930	1751935	0 %	0 %	50 %	50 %	261856204
30226	NC_013422	ACA	2	6	1751936	1751941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856204
30227	NC_013422	CCA	2	6	1752039	1752044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856204
30228	NC_013422	CCGC	2	8	1752051	1752058	0 %	0 %	25 %	75 %	261856204
30229	NC_013422	GACC	2	8	1752059	1752066	25 %	0 %	25 %	50 %	261856204
30230	NC_013422	CGG	2	6	1752087	1752092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856204
30231	NC_013422	T	6	6	1752124	1752129	0 %	100 %	0 %	0 %	261856204
30232	NC_013422	AGC	2	6	1752136	1752141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856204
30233	NC_013422	CG	3	6	1752204	1752209	0 %	0 %	50 %	50 %	261856204
30234	NC_013422	CAC	2	6	1752247	1752252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856204
30235	NC_013422	TGAG	2	8	1752369	1752376	25 %	25 %	50 %	0 %	261856204
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30335	NC_013422	A	6	6	1757715	1757720	100 %	0 %	0 %	0 %	261856209
30336	NC_013422	TCA	2	6	1757730	1757735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856209
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30346	NC_013422	TTTAA	2	10	1758321	1758330	40 %	60 %	0 %	0 %	261856209
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30464	NC_013422	GAT	2	6	1764982	1764987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856221
30465	NC_013422	CGA	2	6	1765039	1765044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856221
30466	NC_013422	GGC	2	6	1765072	1765077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856221
30467	NC_013422	ATC	2	6	1765082	1765087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856221
30468	NC_013422	TC	4	8	1765102	1765109	0 %	50 %	0 %	50 %	261856221
30469	NC_013422	TTGA	2	8	1765114	1765121	25 %	50 %	25 %	0 %	261856221
30470	NC_013422	TCA	2	6	1765131	1765136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856221
30471	NC_013422	CAA	2	6	1765158	1765163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856221
30472	NC_013422	GC	3	6	1765197	1765202	0 %	0 %	50 %	50 %	261856221
30473	NC_013422	GAT	2	6	1765222	1765227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856221
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30475	NC_013422	CTG	2	6	1765304	1765309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856221
30476	NC_013422	GAT	2	6	1765312	1765317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856221
30477	NC_013422	CGG	2	6	1765334	1765339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856221
30478	NC_013422	GCG	2	6	1765368	1765373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856221
30479	NC_013422	TCG	2	6	1765413	1765418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856221
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30483	NC_013422	GC	3	6	1765527	1765532	0 %	0 %	50 %	50 %	261856221
30484	NC_013422	A	6	6	1765593	1765598	100 %	0 %	0 %	0 %	261856221
30485	NC_013422	A	8	8	1765631	1765638	100 %	0 %	0 %	0 %	261856221
30486	NC_013422	ATC	2	6	1765659	1765664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856221
30487	NC_013422	A	6	6	1765672	1765677	100 %	0 %	0 %	0 %	261856221
30488	NC_013422	A	6	6	1765706	1765711	100 %	0 %	0 %	0 %	261856221
30489	NC_013422	CAA	2	6	1765733	1765738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856221
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30491	NC_013422	AAT	2	6	1765768	1765773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261856221
30492	NC_013422	A	6	6	1765775	1765780	100 %	0 %	0 %	0 %	261856221
30493	NC_013422	ACC	2	6	1765783	1765788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856221
30494	NC_013422	CTC	2	6	1765796	1765801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261856221
30495	NC_013422	GGT	2	6	1765836	1765841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856221
30496	NC_013422	TGG	3	9	1765842	1765850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856221
30497	NC_013422	CTT	2	6	1765958	1765963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856221
30498	NC_013422	GAA	2	6	1765966	1765971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856221
30499	NC_013422	TCT	2	6	1766018	1766023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856221
30500	NC_013422	CTGCC	2	10	1766037	1766046	0 %	20 %	20 %	60 %	261856221

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