MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 45067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_013422	CCAA	2	8	140514	140521	50 %	0 %	0 %	50 %	261854771
2502	NC_013422	GATT	2	8	140573	140580	25 %	50 %	25 %	0 %	261854771
2503	NC_013422	GCC	2	6	140593	140598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261854771
2504	NC_013422	TCGC	2	8	140603	140610	0 %	25 %	25 %	50 %	261854771
2505	NC_013422	GCC	2	6	140629	140634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261854771
2506	NC_013422	GGT	2	6	140673	140678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854771
2507	NC_013422	ACCG	2	8	140716	140723	25 %	0 %	25 %	50 %	261854771
2508	NC_013422	CGTG	2	8	140724	140731	0 %	25 %	50 %	25 %	261854771
2509	NC_013422	GC	3	6	140735	140740	0 %	0 %	50 %	50 %	261854771
2510	NC_013422	CCG	2	6	140776	140781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261854771
2511	NC_013422	ATG	2	6	140782	140787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261854771
2512	NC_013422	CGG	2	6	140801	140806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854771
2513	NC_013422	GCG	2	6	140816	140821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854771
2514	NC_013422	GCC	2	6	140845	140850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261854771
2515	NC_013422	GCA	2	6	140853	140858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854771
2516	NC_013422	ATG	2	6	141003	141008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261854772
2517	NC_013422	TCTT	2	8	141026	141033	0 %	75 %	0 %	25 %	261854772
2518	NC_013422	GGC	2	6	141038	141043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854772
2519	NC_013422	GTC	2	6	141102	141107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854772
2520	NC_013422	TCG	2	6	141136	141141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854772
2521	NC_013422	GCCAAG	2	12	141180	141191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854772
2522	NC_013422	ACC	2	6	141255	141260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261854772
2523	NC_013422	GGC	2	6	141432	141437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854772
2524	NC_013422	GAA	2	6	141471	141476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261854772
2525	NC_013422	TCA	2	6	141507	141512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261854773
2526	NC_013422	CCGTG	2	10	141523	141532	0 %	20 %	40 %	40 %	261854773
2527	NC_013422	CCA	2	6	141565	141570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261854773
2528	NC_013422	GCGCT	2	10	141586	141595	0 %	20 %	40 %	40 %	261854773
2529	NC_013422	GTG	2	6	141623	141628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854773
2530	NC_013422	TGA	2	6	141663	141668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261854773
2531	NC_013422	CG	3	6	141680	141685	0 %	0 %	50 %	50 %	261854773
2532	NC_013422	GAT	2	6	141689	141694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261854773
2533	NC_013422	TGGC	2	8	141725	141732	0 %	25 %	50 %	25 %	261854773
2534	NC_013422	CAA	2	6	141789	141794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261854773
2535	NC_013422	ACC	2	6	141819	141824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261854773
2536	NC_013422	CGG	2	6	141843	141848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854773
2537	NC_013422	CAAG	2	8	141849	141856	50 %	0 %	25 %	25 %	261854773
2538	NC_013422	GCC	2	6	141971	141976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261854773
2539	NC_013422	CG	3	6	141984	141989	0 %	0 %	50 %	50 %	261854773
2540	NC_013422	GC	3	6	142041	142046	0 %	0 %	50 %	50 %	261854773
2541	NC_013422	TCA	2	6	142109	142114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261854773
2542	NC_013422	TGA	2	6	142151	142156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261854773
2543	NC_013422	ACG	2	6	142159	142164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854774
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2546	NC_013422	AGTG	2	8	142251	142258	25 %	25 %	50 %	0 %	261854774
2547	NC_013422	GAT	2	6	142318	142323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261854774
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2549	NC_013422	CGG	2	6	142427	142432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854774
2550	NC_013422	CCCCG	2	10	142476	142485	0 %	0 %	20 %	80 %	261854774
2551	NC_013422	GCG	2	6	142602	142607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854775
2552	NC_013422	CTG	2	6	142620	142625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854775
2553	NC_013422	TGG	2	6	142633	142638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854775
2554	NC_013422	TGG	2	6	142657	142662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854775
2555	NC_013422	GCG	2	6	142768	142773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854775
2556	NC_013422	GGC	3	9	142839	142847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854775
2557	NC_013422	AGCCG	2	10	142898	142907	20 %	0 %	40 %	40 %	261854775
2558	NC_013422	GGC	2	6	142927	142932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854775
2559	NC_013422	GC	3	6	142952	142957	0 %	0 %	50 %	50 %	261854775
2560	NC_013422	GCC	2	6	142967	142972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261854775
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2565	NC_013422	CAAC	2	8	143096	143103	50 %	0 %	0 %	50 %	261854775
2566	NC_013422	CGG	2	6	143107	143112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854775
2567	NC_013422	TGC	2	6	143134	143139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854775
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2579	NC_013422	CTG	3	9	143639	143647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854776
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2587	NC_013422	CGCC	2	8	143865	143872	0 %	0 %	25 %	75 %	261854776
2588	NC_013422	TAC	2	6	143873	143878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261854776
2589	NC_013422	CGC	2	6	143943	143948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261854776
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2595	NC_013422	GC	3	6	144293	144298	0 %	0 %	50 %	50 %	261854777
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2601	NC_013422	GCC	2	6	144769	144774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261854777
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2603	NC_013422	CT	3	6	144952	144957	0 %	50 %	0 %	50 %	261854777
2604	NC_013422	TGG	2	6	145006	145011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854777
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2607	NC_013422	TGG	2	6	145052	145057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854777
2608	NC_013422	ACC	2	6	145085	145090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261854777
2609	NC_013422	CA	3	6	145116	145121	50 %	0 %	0 %	50 %	261854777
2610	NC_013422	GC	3	6	145205	145210	0 %	0 %	50 %	50 %	261854777
2611	NC_013422	GCTG	2	8	145233	145240	0 %	25 %	50 %	25 %	261854777
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2617	NC_013422	GTTT	2	8	145617	145624	0 %	75 %	25 %	0 %	261854778
2618	NC_013422	GCT	2	6	145687	145692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854778
2619	NC_013422	A	6	6	145708	145713	100 %	0 %	0 %	0 %	261854778
2620	NC_013422	GCC	2	6	145783	145788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261854778
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2622	NC_013422	GAC	2	6	145837	145842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854778
2623	NC_013422	GCC	2	6	145861	145866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261854778
2624	NC_013422	TGC	2	6	145968	145973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854778
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2626	NC_013422	GCC	2	6	146014	146019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261854778
2627	NC_013422	GCC	2	6	146056	146061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261854779
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2630	NC_013422	TCG	2	6	146277	146282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854779
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2654	NC_013422	GCT	2	6	147800	147805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854780
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2673	NC_013422	TTGA	2	8	149003	149010	25 %	50 %	25 %	0 %	261854781
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2683	NC_013422	GC	3	6	150406	150411	0 %	0 %	50 %	50 %	261854782
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2742	NC_013422	CGG	2	6	153372	153377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854783
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2864	NC_013422	CA	3	6	160297	160302	50 %	0 %	0 %	50 %	261854789
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2866	NC_013422	TTGCG	2	10	160338	160347	0 %	40 %	40 %	20 %	261854789
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2980	NC_013422	CA	3	6	165784	165789	50 %	0 %	0 %	50 %	261854791
2981	NC_013422	GTTG	2	8	165902	165909	0 %	50 %	50 %	0 %	261854791
2982	NC_013422	AGGC	2	8	165925	165932	25 %	0 %	50 %	25 %	261854791
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2985	NC_013422	GC	3	6	166197	166202	0 %	0 %	50 %	50 %	261854792
2986	NC_013422	TCA	2	6	166246	166251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261854792
2987	NC_013422	CAT	2	6	166268	166273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261854792
2988	NC_013422	GCGG	2	8	166278	166285	0 %	0 %	75 %	25 %	261854792
2989	NC_013422	GGC	2	6	166316	166321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854792
2990	NC_013422	GGC	2	6	166361	166366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854792
2991	NC_013422	AGT	2	6	166367	166372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261854792
2992	NC_013422	CTG	2	6	166395	166400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854792
2993	NC_013422	GAT	2	6	166404	166409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261854792
2994	NC_013422	GCG	2	6	166430	166435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854792
2995	NC_013422	CG	4	8	166504	166511	0 %	0 %	50 %	50 %	261854792
2996	NC_013422	GAT	2	6	166517	166522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261854792
2997	NC_013422	TGC	2	6	166594	166599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854792
2998	NC_013422	CGC	3	9	166679	166687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261854792
2999	NC_013422	GCC	2	6	166698	166703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261854792
3000	NC_013422	GAA	2	6	166722	166727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261854792

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