MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 45067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
29001	NC_013422	GGCT	2	8	1681736	1681743	0 %	25 %	50 %	25 %	261856140
29002	NC_013422	CTG	2	6	1681878	1681883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856141
29003	NC_013422	TCG	2	6	1682035	1682040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856141
29004	NC_013422	TGCGC	2	10	1682071	1682080	0 %	20 %	40 %	40 %	261856141
29005	NC_013422	CGC	2	6	1682085	1682090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856141
29006	NC_013422	CTG	2	6	1682097	1682102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856141
29007	NC_013422	AGT	2	6	1682105	1682110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856141
29008	NC_013422	CTT	2	6	1682222	1682227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856141
29009	NC_013422	ACG	2	6	1682233	1682238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856141
29010	NC_013422	GCGG	2	8	1682265	1682272	0 %	0 %	75 %	25 %	261856141
29011	NC_013422	GGTT	2	8	1682300	1682307	0 %	50 %	50 %	0 %	261856141
29012	NC_013422	TTC	2	6	1682349	1682354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856141
29013	NC_013422	GAAT	2	8	1682413	1682420	50 %	25 %	25 %	0 %	261856141
29014	NC_013422	CTG	2	6	1682484	1682489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856141
29015	NC_013422	TCA	2	6	1682594	1682599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856141
29016	NC_013422	GCG	2	6	1682610	1682615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856141
29017	NC_013422	CGC	2	6	1682628	1682633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856141
29018	NC_013422	TCG	2	6	1682731	1682736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856141
29019	NC_013422	CAA	2	6	1682814	1682819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856141
29020	NC_013422	CCA	2	6	1682867	1682872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856141
29021	NC_013422	CA	3	6	1682871	1682876	50 %	0 %	0 %	50 %	261856141
29022	NC_013422	GAA	2	6	1682919	1682924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856141
29023	NC_013422	GAC	2	6	1682987	1682992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856141
29024	NC_013422	T	7	7	1683005	1683011	0 %	100 %	0 %	0 %	261856141
29025	NC_013422	CAT	2	6	1683051	1683056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856141
29026	NC_013422	GCCC	2	8	1683228	1683235	0 %	0 %	25 %	75 %	261856142
29027	NC_013422	TGG	2	6	1683381	1683386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856142
29028	NC_013422	CAA	2	6	1683406	1683411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856142
29029	NC_013422	C	6	6	1683462	1683467	0 %	0 %	0 %	100 %	261856142
29030	NC_013422	ACC	2	6	1683468	1683473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856142
29031	NC_013422	GC	3	6	1683514	1683519	0 %	0 %	50 %	50 %	261856142
29032	NC_013422	GC	3	6	1683661	1683666	0 %	0 %	50 %	50 %	261856142
29033	NC_013422	TTTA	2	8	1683720	1683727	25 %	75 %	0 %	0 %	261856142
29034	NC_013422	CT	3	6	1683729	1683734	0 %	50 %	0 %	50 %	261856142
29035	NC_013422	GATC	2	8	1683786	1683793	25 %	25 %	25 %	25 %	261856142
29036	NC_013422	CTG	2	6	1683810	1683815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856142
29037	NC_013422	CAAA	2	8	1683869	1683876	75 %	0 %	0 %	25 %	261856142
29038	NC_013422	GTC	2	6	1683880	1683885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856142
29039	NC_013422	T	6	6	1683896	1683901	0 %	100 %	0 %	0 %	261856142
29040	NC_013422	TTCACC	2	12	1683937	1683948	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	261856142
29041	NC_013422	CGA	2	6	1683968	1683973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856142
29042	NC_013422	TGG	2	6	1684014	1684019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856142
29043	NC_013422	CGTTG	2	10	1684042	1684051	0 %	40 %	40 %	20 %	261856142
29044	NC_013422	A	7	7	1684115	1684121	100 %	0 %	0 %	0 %	261856143
29045	NC_013422	TCG	2	6	1684142	1684147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856143
29046	NC_013422	TCA	2	6	1684148	1684153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856143
29047	NC_013422	GC	3	6	1684208	1684213	0 %	0 %	50 %	50 %	261856143
29048	NC_013422	CGAC	2	8	1684239	1684246	25 %	0 %	25 %	50 %	261856143
29049	NC_013422	CCG	2	6	1684271	1684276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856143
29050	NC_013422	CG	3	6	1684300	1684305	0 %	0 %	50 %	50 %	261856143
29051	NC_013422	GCC	2	6	1684336	1684341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856143
29052	NC_013422	AAC	2	6	1684378	1684383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856143
29053	NC_013422	TGA	2	6	1684457	1684462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856143
29054	NC_013422	CTG	2	6	1684528	1684533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856143
29055	NC_013422	AC	3	6	1684619	1684624	50 %	0 %	0 %	50 %	261856143
29056	NC_013422	CGC	2	6	1684632	1684637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856143
29057	NC_013422	GATC	2	8	1684650	1684657	25 %	25 %	25 %	25 %	261856143
29058	NC_013422	CTG	2	6	1684780	1684785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856143
29059	NC_013422	CGGAT	2	10	1684847	1684856	20 %	20 %	40 %	20 %	261856143
29060	NC_013422	AT	3	6	1684860	1684865	50 %	50 %	0 %	0 %	261856143
29061	NC_013422	CGG	2	6	1684920	1684925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856144
29062	NC_013422	TTC	2	6	1684940	1684945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856144
29063	NC_013422	CAT	2	6	1684965	1684970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856144
29064	NC_013422	TTG	2	6	1685020	1685025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856144
29065	NC_013422	ATC	2	6	1685026	1685031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856144
29066	NC_013422	CAGA	2	8	1685130	1685137	50 %	0 %	25 %	25 %	261856145
29067	NC_013422	CGC	2	6	1685340	1685345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856145
29068	NC_013422	CCCCA	2	10	1685356	1685365	20 %	0 %	0 %	80 %	261856145
29069	NC_013422	A	6	6	1685384	1685389	100 %	0 %	0 %	0 %	261856145
29070	NC_013422	TCT	2	6	1685429	1685434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856145
29071	NC_013422	TGT	2	6	1685493	1685498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856145
29072	NC_013422	CTG	3	9	1685578	1685586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856145
29073	NC_013422	TGC	2	6	1685612	1685617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856145
29074	NC_013422	CAT	2	6	1685688	1685693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856145
29075	NC_013422	GC	3	6	1685694	1685699	0 %	0 %	50 %	50 %	261856145
29076	NC_013422	TGA	2	6	1685760	1685765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856145
29077	NC_013422	GCT	2	6	1685868	1685873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856145
29078	NC_013422	ATT	2	6	1685880	1685885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261856145
29079	NC_013422	CTT	2	6	1685934	1685939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856145
29080	NC_013422	TGT	2	6	1685954	1685959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856145
29081	NC_013422	CGA	2	6	1685961	1685966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856145
29082	NC_013422	GGT	2	6	1686000	1686005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856145
29083	NC_013422	AGGCGT	2	12	1686024	1686035	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	261856145
29084	NC_013422	GC	3	6	1686114	1686119	0 %	0 %	50 %	50 %	261856145
29085	NC_013422	CGTG	2	8	1686144	1686151	0 %	25 %	50 %	25 %	261856145
29086	NC_013422	CCG	2	6	1686152	1686157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856145
29087	NC_013422	TCA	2	6	1686200	1686205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856145
29088	NC_013422	CCG	2	6	1686289	1686294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856145
29089	NC_013422	TGA	2	6	1686318	1686323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856145
29090	NC_013422	CGC	2	6	1686330	1686335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856145
29091	NC_013422	CAT	2	6	1686336	1686341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856145
29092	NC_013422	GCT	2	6	1686402	1686407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856145
29093	NC_013422	AGC	2	6	1686410	1686415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856145
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29095	NC_013422	A	7	7	1686470	1686476	100 %	0 %	0 %	0 %	261856145
29096	NC_013422	TCA	2	6	1686527	1686532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856145
29097	NC_013422	GCA	2	6	1686533	1686538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856145
29098	NC_013422	GCT	2	6	1686585	1686590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856145
29099	NC_013422	CAAGAT	2	12	1686888	1686899	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	261856146
29100	NC_013422	GGC	2	6	1686995	1687000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856146
29101	NC_013422	ACT	2	6	1687035	1687040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856146
29102	NC_013422	GC	3	6	1687112	1687117	0 %	0 %	50 %	50 %	261856146
29103	NC_013422	GCCATG	2	12	1687134	1687145	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	261856146
29104	NC_013422	CCA	2	6	1687207	1687212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856146
29105	NC_013422	TTC	2	6	1687236	1687241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856146
29106	NC_013422	TTC	2	6	1687278	1687283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856146
29107	NC_013422	CGC	2	6	1687292	1687297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856146
29108	NC_013422	GAA	2	6	1687341	1687346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856146
29109	NC_013422	TGGGTC	2	12	1687447	1687458	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	261856146
29110	NC_013422	CGGCGA	2	12	1687550	1687561	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	261856146
29111	NC_013422	TTGGC	2	10	1687591	1687600	0 %	40 %	40 %	20 %	261856146
29112	NC_013422	TCA	2	6	1687633	1687638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856146
29113	NC_013422	CGGCAA	2	12	1687673	1687684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856146
29114	NC_013422	TCA	2	6	1687732	1687737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856146
29115	NC_013422	CTGG	2	8	1687753	1687760	0 %	25 %	50 %	25 %	261856146
29116	NC_013422	TGC	2	6	1687768	1687773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856146
29117	NC_013422	TGA	2	6	1687804	1687809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856146
29118	NC_013422	CTT	2	6	1687874	1687879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856146
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29152	NC_013422	TCAT	2	8	1689324	1689331	25 %	50 %	0 %	25 %	261856146
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29212	NC_013422	CCACCC	2	12	1692655	1692666	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	261856148
29213	NC_013422	GCC	2	6	1692730	1692735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856148
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29215	NC_013422	AG	3	6	1692747	1692752	50 %	0 %	50 %	0 %	261856148
29216	NC_013422	GT	3	6	1692788	1692793	0 %	50 %	50 %	0 %	261856149
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29220	NC_013422	CAGCC	2	10	1692947	1692956	20 %	0 %	20 %	60 %	261856149
29221	NC_013422	CGGTG	2	10	1692960	1692969	0 %	20 %	60 %	20 %	261856149
29222	NC_013422	T	6	6	1692988	1692993	0 %	100 %	0 %	0 %	261856149
29223	NC_013422	A	6	6	1692998	1693003	100 %	0 %	0 %	0 %	261856149
29224	NC_013422	TCA	2	6	1693025	1693030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856149
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29227	NC_013422	CGA	2	6	1693100	1693105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856149
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29229	NC_013422	CTC	2	6	1693147	1693152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261856149
29230	NC_013422	CA	3	6	1693176	1693181	50 %	0 %	0 %	50 %	261856149
29231	NC_013422	A	6	6	1693319	1693324	100 %	0 %	0 %	0 %	261856149
29232	NC_013422	TTGA	2	8	1693670	1693677	25 %	50 %	25 %	0 %	261856150
29233	NC_013422	T	6	6	1693704	1693709	0 %	100 %	0 %	0 %	261856150
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29349	NC_013422	TTC	2	6	1700123	1700128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856156
29350	NC_013422	C	6	6	1700144	1700149	0 %	0 %	0 %	100 %	261856156
29351	NC_013422	ACC	2	6	1700156	1700161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856156
29352	NC_013422	ACA	2	6	1700238	1700243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856156
29353	NC_013422	GC	3	6	1700372	1700377	0 %	0 %	50 %	50 %	261856156
29354	NC_013422	GC	3	6	1700386	1700391	0 %	0 %	50 %	50 %	261856156
29355	NC_013422	GCCC	2	8	1700407	1700414	0 %	0 %	25 %	75 %	261856156
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29358	NC_013422	GCA	2	6	1700457	1700462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856156
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29360	NC_013422	GC	3	6	1700590	1700595	0 %	0 %	50 %	50 %	261856156
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29362	NC_013422	TGGCA	2	10	1700678	1700687	20 %	20 %	40 %	20 %	261856156
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29365	NC_013422	GCG	2	6	1700874	1700879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856157
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29378	NC_013422	TTGC	2	8	1701580	1701587	0 %	50 %	25 %	25 %	261856157
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29449	NC_013422	T	6	6	1705989	1705994	0 %	100 %	0 %	0 %	261856161
29450	NC_013422	TGT	2	6	1706009	1706014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856161
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29453	NC_013422	GC	3	6	1706203	1706208	0 %	0 %	50 %	50 %	261856162
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29466	NC_013422	CGG	2	6	1706860	1706865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856162
29467	NC_013422	TGAT	2	8	1706868	1706875	25 %	50 %	25 %	0 %	261856162
29468	NC_013422	GGC	2	6	1707016	1707021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856162
29469	NC_013422	CAG	2	6	1707043	1707048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856162
29470	NC_013422	CGG	2	6	1707122	1707127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856163
29471	NC_013422	CGCC	2	8	1707141	1707148	0 %	0 %	25 %	75 %	261856163
29472	NC_013422	CAA	2	6	1707149	1707154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856163
29473	NC_013422	GTGCAG	2	12	1707155	1707166	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	261856163
29474	NC_013422	CCT	2	6	1707175	1707180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261856163
29475	NC_013422	CCT	2	6	1707235	1707240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261856163
29476	NC_013422	CGA	2	6	1707259	1707264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856163
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29478	NC_013422	AAT	2	6	1707335	1707340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261856163
29479	NC_013422	CGG	2	6	1707426	1707431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856163
29480	NC_013422	A	6	6	1707804	1707809	100 %	0 %	0 %	0 %	261856164
29481	NC_013422	GCC	2	6	1707822	1707827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856164
29482	NC_013422	ATG	2	6	1707837	1707842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856164
29483	NC_013422	AC	3	6	1707914	1707919	50 %	0 %	0 %	50 %	261856164
29484	NC_013422	CAT	2	6	1707959	1707964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856164
29485	NC_013422	GCC	2	6	1707972	1707977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856164
29486	NC_013422	TCAA	2	8	1708038	1708045	50 %	25 %	0 %	25 %	261856164
29487	NC_013422	CAAC	2	8	1708069	1708076	50 %	0 %	0 %	50 %	261856164
29488	NC_013422	CTA	2	6	1708144	1708149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856164
29489	NC_013422	ATC	2	6	1708344	1708349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856165
29490	NC_013422	GTC	2	6	1708416	1708421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856165
29491	NC_013422	CCG	2	6	1708427	1708432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856165
29492	NC_013422	CTT	2	6	1708491	1708496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856165
29493	NC_013422	GTC	2	6	1708508	1708513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856165
29494	NC_013422	CTT	2	6	1708697	1708702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856165
29495	NC_013422	CTT	2	6	1708873	1708878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856165
29496	NC_013422	CGT	2	6	1708886	1708891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856165
29497	NC_013422	TCCGG	2	10	1708938	1708947	0 %	20 %	40 %	40 %	261856165
29498	NC_013422	AAT	2	6	1709117	1709122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261856165
29499	NC_013422	CAC	2	6	1709245	1709250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856165
29500	NC_013422	AGG	2	6	1709257	1709262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261856165

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