MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 45067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
28501	NC_013422	AAC	2	6	1654138	1654143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856114
28502	NC_013422	ATC	3	9	1654727	1654735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856116
28503	NC_013422	GGGC	2	8	1654736	1654743	0 %	0 %	75 %	25 %	261856116
28504	NC_013422	GAT	2	6	1654773	1654778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856116
28505	NC_013422	TCA	3	9	1654857	1654865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856116
28506	NC_013422	CGA	2	6	1654933	1654938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856116
28507	NC_013422	TGC	2	6	1655000	1655005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856116
28508	NC_013422	CTT	2	6	1655062	1655067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856116
28509	NC_013422	TGG	2	6	1655400	1655405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856117
28510	NC_013422	CAG	2	6	1655426	1655431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856117
28511	NC_013422	CGGGCA	2	12	1655451	1655462	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	261856117
28512	NC_013422	CGC	2	6	1655473	1655478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856117
28513	NC_013422	GCA	2	6	1655491	1655496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856117
28514	NC_013422	AGG	2	6	1655573	1655578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261856117
28515	NC_013422	ACA	2	6	1655628	1655633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856117
28516	NC_013422	ACG	2	6	1655810	1655815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856117
28517	NC_013422	GATCG	2	10	1656094	1656103	20 %	20 %	40 %	20 %	261856118
28518	NC_013422	ATC	2	6	1656302	1656307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856118
28519	NC_013422	CTT	2	6	1656372	1656377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856118
28520	NC_013422	CAG	2	6	1656391	1656396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856118
28521	NC_013422	GCCC	2	8	1656455	1656462	0 %	0 %	25 %	75 %	261856118
28522	NC_013422	GCA	2	6	1656522	1656527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856118
28523	NC_013422	CCG	2	6	1656578	1656583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856118
28524	NC_013422	ATC	2	6	1656766	1656771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856118
28525	NC_013422	C	6	6	1656942	1656947	0 %	0 %	0 %	100 %	261856119
28526	NC_013422	CCGC	2	8	1656954	1656961	0 %	0 %	25 %	75 %	261856119
28527	NC_013422	CTCG	2	8	1656962	1656969	0 %	25 %	25 %	50 %	261856119
28528	NC_013422	GCT	2	6	1656982	1656987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856119
28529	NC_013422	TAT	2	6	1657011	1657016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261856119
28530	NC_013422	TGC	2	6	1657101	1657106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856119
28531	NC_013422	CTGG	2	8	1657117	1657124	0 %	25 %	50 %	25 %	261856119
28532	NC_013422	ACC	2	6	1657159	1657164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856119
28533	NC_013422	CGT	2	6	1657185	1657190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856119
28534	NC_013422	GCTG	2	8	1657192	1657199	0 %	25 %	50 %	25 %	261856119
28535	NC_013422	GCAC	2	8	1657206	1657213	25 %	0 %	25 %	50 %	261856119
28536	NC_013422	CG	3	6	1657226	1657231	0 %	0 %	50 %	50 %	261856119
28537	NC_013422	CCG	2	6	1657297	1657302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856119
28538	NC_013422	GT	3	6	1657317	1657322	0 %	50 %	50 %	0 %	261856119
28539	NC_013422	GTT	2	6	1657342	1657347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856119
28540	NC_013422	GCG	2	6	1657355	1657360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856119
28541	NC_013422	CTG	3	9	1657412	1657420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856119
28542	NC_013422	ATG	2	6	1657502	1657507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856119
28543	NC_013422	TTA	2	6	1657545	1657550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261856119
28544	NC_013422	CGA	2	6	1657571	1657576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856119
28545	NC_013422	TTGGT	2	10	1657608	1657617	0 %	60 %	40 %	0 %	261856119
28546	NC_013422	T	7	7	1657620	1657626	0 %	100 %	0 %	0 %	261856119
28547	NC_013422	CAG	2	6	1657700	1657705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856119
28548	NC_013422	CAG	2	6	1657723	1657728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856119
28549	NC_013422	ATTT	2	8	1657748	1657755	25 %	75 %	0 %	0 %	261856119
28550	NC_013422	GTT	2	6	1657768	1657773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856119
28551	NC_013422	CGG	2	6	1657774	1657779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856119
28552	NC_013422	CGGT	2	8	1657794	1657801	0 %	25 %	50 %	25 %	261856119
28553	NC_013422	CTGG	2	8	1657807	1657814	0 %	25 %	50 %	25 %	261856119
28554	NC_013422	ATC	2	6	1657860	1657865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856119
28555	NC_013422	GCA	2	6	1657893	1657898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856119
28556	NC_013422	TGT	2	6	1657902	1657907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856119
28557	NC_013422	TCT	2	6	1657908	1657913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856119
28558	NC_013422	TTG	2	6	1657973	1657978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856119
28559	NC_013422	AGC	2	6	1658028	1658033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856119
28560	NC_013422	CGT	2	6	1658095	1658100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856119
28561	NC_013422	CGTG	2	8	1658149	1658156	0 %	25 %	50 %	25 %	261856119
28562	NC_013422	CCGATG	2	12	1658169	1658180	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	261856119
28563	NC_013422	ACTATT	2	12	1658193	1658204	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	261856119
28564	NC_013422	CAGC	2	8	1658234	1658241	25 %	0 %	25 %	50 %	261856119
28565	NC_013422	AAT	2	6	1658270	1658275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261856119
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28568	NC_013422	GAT	2	6	1658432	1658437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856119
28569	NC_013422	GCA	2	6	1658447	1658452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856119
28570	NC_013422	CGC	2	6	1658491	1658496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856119
28571	NC_013422	TAAG	2	8	1658542	1658549	50 %	25 %	25 %	0 %	261856119
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28574	NC_013422	A	6	6	1658738	1658743	100 %	0 %	0 %	0 %	261856120
28575	NC_013422	CCG	2	6	1658769	1658774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856120
28576	NC_013422	CAGCCG	2	12	1658838	1658849	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	261856120
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28579	NC_013422	GCA	2	6	1658916	1658921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856120
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28583	NC_013422	GCC	2	6	1659113	1659118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856121
28584	NC_013422	GTC	2	6	1659144	1659149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856121
28585	NC_013422	GCC	2	6	1659197	1659202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856121
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28587	NC_013422	CCG	2	6	1659305	1659310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856121
28588	NC_013422	TGCG	2	8	1659366	1659373	0 %	25 %	50 %	25 %	261856121
28589	NC_013422	CAG	2	6	1659455	1659460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856121
28590	NC_013422	CCGAA	2	10	1659496	1659505	40 %	0 %	20 %	40 %	261856121
28591	NC_013422	ACA	2	6	1659520	1659525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856121
28592	NC_013422	GGC	2	6	1659608	1659613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856121
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28595	NC_013422	CGT	2	6	1659805	1659810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856121
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28598	NC_013422	TCAT	2	8	1659936	1659943	25 %	50 %	0 %	25 %	261856121
28599	NC_013422	TGA	2	6	1660314	1660319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856122
28600	NC_013422	CCG	2	6	1660352	1660357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856122
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28603	NC_013422	CGAT	2	8	1660544	1660551	25 %	25 %	25 %	25 %	261856122
28604	NC_013422	ATCG	2	8	1660558	1660565	25 %	25 %	25 %	25 %	261856122
28605	NC_013422	GC	3	6	1660572	1660577	0 %	0 %	50 %	50 %	261856122
28606	NC_013422	CGA	2	6	1660776	1660781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856122
28607	NC_013422	GATCT	2	10	1660801	1660810	20 %	40 %	20 %	20 %	261856122
28608	NC_013422	CTAC	2	8	1661072	1661079	25 %	25 %	0 %	50 %	261856122
28609	NC_013422	GTT	2	6	1661115	1661120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856122
28610	NC_013422	CATCG	2	10	1661133	1661142	20 %	20 %	20 %	40 %	261856122
28611	NC_013422	GGA	2	6	1661253	1661258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261856122
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28613	NC_013422	TGT	2	6	1661384	1661389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856122
28614	NC_013422	TGC	2	6	1661426	1661431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856122
28615	NC_013422	TC	3	6	1661439	1661444	0 %	50 %	0 %	50 %	261856122
28616	NC_013422	CGG	2	6	1661460	1661465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856122
28617	NC_013422	ACC	2	6	1661468	1661473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856122
28618	NC_013422	T	6	6	1661563	1661568	0 %	100 %	0 %	0 %	261856123
28619	NC_013422	CG	3	6	1661584	1661589	0 %	0 %	50 %	50 %	261856123
28620	NC_013422	CGATC	2	10	1661624	1661633	20 %	20 %	20 %	40 %	261856123
28621	NC_013422	A	6	6	1661672	1661677	100 %	0 %	0 %	0 %	261856123
28622	NC_013422	AC	3	6	1661860	1661865	50 %	0 %	0 %	50 %	261856124
28623	NC_013422	CCA	2	6	1661968	1661973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856124
28624	NC_013422	GCTT	2	8	1661974	1661981	0 %	50 %	25 %	25 %	261856124
28625	NC_013422	ATC	2	6	1662009	1662014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856124
28626	NC_013422	GAC	2	6	1662086	1662091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856124
28627	NC_013422	T	8	8	1662094	1662101	0 %	100 %	0 %	0 %	261856124
28628	NC_013422	CATC	2	8	1662169	1662176	25 %	25 %	0 %	50 %	261856124
28629	NC_013422	AC	3	6	1662196	1662201	50 %	0 %	0 %	50 %	261856124
28630	NC_013422	CAC	2	6	1662213	1662218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856124
28631	NC_013422	GGC	2	6	1662236	1662241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856124
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28633	NC_013422	GTACG	2	10	1662278	1662287	20 %	20 %	40 %	20 %	261856124
28634	NC_013422	AAC	2	6	1662368	1662373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856124
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28636	NC_013422	CCA	2	6	1662748	1662753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856125
28637	NC_013422	A	6	6	1662765	1662770	100 %	0 %	0 %	0 %	261856125
28638	NC_013422	CGG	2	6	1662911	1662916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856125
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28643	NC_013422	GC	3	6	1663127	1663132	0 %	0 %	50 %	50 %	261856125
28644	NC_013422	GC	3	6	1663155	1663160	0 %	0 %	50 %	50 %	261856125
28645	NC_013422	AGC	2	6	1663165	1663170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856125
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28648	NC_013422	CG	3	6	1663897	1663902	0 %	0 %	50 %	50 %	261856126
28649	NC_013422	ATT	2	6	1663923	1663928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261856126
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28653	NC_013422	TGT	2	6	1664006	1664011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856126
28654	NC_013422	GC	3	6	1664030	1664035	0 %	0 %	50 %	50 %	261856126
28655	NC_013422	GCT	2	6	1664055	1664060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856126
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28668	NC_013422	GC	3	6	1664822	1664827	0 %	0 %	50 %	50 %	261856127
28669	NC_013422	GC	3	6	1664840	1664845	0 %	0 %	50 %	50 %	261856127
28670	NC_013422	GTG	2	6	1664851	1664856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856127
28671	NC_013422	CGC	2	6	1664859	1664864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856127
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28693	NC_013422	TCG	2	6	1665708	1665713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856128
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28706	NC_013422	TCG	3	9	1666209	1666217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856128
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28719	NC_013422	TGG	2	6	1667329	1667334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856129
28720	NC_013422	TTCGA	2	10	1667388	1667397	20 %	40 %	20 %	20 %	261856129
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28723	NC_013422	TA	3	6	1667541	1667546	50 %	50 %	0 %	0 %	261856129
28724	NC_013422	A	7	7	1667564	1667570	100 %	0 %	0 %	0 %	261856129
28725	NC_013422	A	7	7	1667643	1667649	100 %	0 %	0 %	0 %	261856129
28726	NC_013422	GCA	2	6	1667760	1667765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856129
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28730	NC_013422	TAG	2	6	1668039	1668044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856129
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28734	NC_013422	TTC	2	6	1668431	1668436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856129
28735	NC_013422	ATT	2	6	1668566	1668571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261856130
28736	NC_013422	ACT	2	6	1668614	1668619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856130
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28834	NC_013422	CACG	2	8	1673144	1673151	25 %	0 %	25 %	50 %	261856133
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28844	NC_013422	GCG	2	6	1673513	1673518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856133
28845	NC_013422	GAC	2	6	1673580	1673585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856133
28846	NC_013422	GGC	2	6	1673709	1673714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856133
28847	NC_013422	CGC	2	6	1673736	1673741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856133
28848	NC_013422	CGG	2	6	1673768	1673773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856133
28849	NC_013422	TGC	3	9	1673787	1673795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856133
28850	NC_013422	GC	3	6	1673826	1673831	0 %	0 %	50 %	50 %	261856133
28851	NC_013422	GC	4	8	1673861	1673868	0 %	0 %	50 %	50 %	261856133
28852	NC_013422	CATCGC	2	12	1673874	1673885	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	261856133
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28855	NC_013422	TCG	2	6	1674076	1674081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856133
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28857	NC_013422	TGC	2	6	1674211	1674216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856133
28858	NC_013422	GC	3	6	1674248	1674253	0 %	0 %	50 %	50 %	261856133
28859	NC_013422	GTTCGC	2	12	1674254	1674265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856133
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28863	NC_013422	GC	3	6	1674547	1674552	0 %	0 %	50 %	50 %	261856133
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28955	NC_013422	CCG	2	6	1679796	1679801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856138
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28966	NC_013422	TGG	2	6	1680324	1680329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856139
28967	NC_013422	A	6	6	1680341	1680346	100 %	0 %	0 %	0 %	261856139
28968	NC_013422	CGT	2	6	1680373	1680378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856139
28969	NC_013422	ATC	2	6	1680401	1680406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856139
28970	NC_013422	CTG	2	6	1680409	1680414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856139
28971	NC_013422	CCG	2	6	1680483	1680488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856139
28972	NC_013422	GC	3	6	1680526	1680531	0 %	0 %	50 %	50 %	261856139
28973	NC_013422	GGT	2	6	1680559	1680564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856139
28974	NC_013422	AAC	2	6	1680566	1680571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856139
28975	NC_013422	CTG	2	6	1680616	1680621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856139
28976	NC_013422	CG	3	6	1680659	1680664	0 %	0 %	50 %	50 %	261856139
28977	NC_013422	GCCA	2	8	1680718	1680725	25 %	0 %	25 %	50 %	261856139
28978	NC_013422	GGACCA	2	12	1680814	1680825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856140
28979	NC_013422	CCA	2	6	1680907	1680912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856140
28980	NC_013422	GCC	2	6	1680951	1680956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856140
28981	NC_013422	TGA	2	6	1681017	1681022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856140
28982	NC_013422	GCC	2	6	1681028	1681033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856140
28983	NC_013422	GGT	2	6	1681049	1681054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856140
28984	NC_013422	GCA	2	6	1681161	1681166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856140
28985	NC_013422	CCG	2	6	1681178	1681183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856140
28986	NC_013422	CGCC	2	8	1681204	1681211	0 %	0 %	25 %	75 %	261856140
28987	NC_013422	CGT	3	9	1681261	1681269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856140
28988	NC_013422	CCGA	2	8	1681286	1681293	25 %	0 %	25 %	50 %	261856140
28989	NC_013422	CAA	2	6	1681327	1681332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856140
28990	NC_013422	TC	3	6	1681348	1681353	0 %	50 %	0 %	50 %	261856140
28991	NC_013422	GCG	2	6	1681359	1681364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856140
28992	NC_013422	TGG	2	6	1681415	1681420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856140
28993	NC_013422	AC	3	6	1681464	1681469	50 %	0 %	0 %	50 %	261856140
28994	NC_013422	CGG	2	6	1681522	1681527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856140
28995	NC_013422	CGG	2	6	1681532	1681537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856140
28996	NC_013422	GCT	2	6	1681552	1681557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856140
28997	NC_013422	CAT	2	6	1681570	1681575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856140
28998	NC_013422	CGG	2	6	1681585	1681590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856140
28999	NC_013422	ATCA	2	8	1681643	1681650	50 %	25 %	0 %	25 %	261856140
29000	NC_013422	GAT	2	6	1681693	1681698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856140

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