MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 45067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27003	NC_013422	GAA	2	6	1574250	1574255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856056
27004	NC_013422	CG	3	6	1574354	1574359	0 %	0 %	50 %	50 %	261856056
27005	NC_013422	AGGA	2	8	1574362	1574369	50 %	0 %	50 %	0 %	261856056
27006	NC_013422	CAAT	2	8	1574495	1574502	50 %	25 %	0 %	25 %	261856056
27007	NC_013422	AAC	2	6	1574522	1574527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856056
27008	NC_013422	AGC	2	6	1574537	1574542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856056
27009	NC_013422	GAA	2	6	1574565	1574570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856056
27010	NC_013422	ATC	2	6	1574580	1574585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856056
27011	NC_013422	AGC	2	6	1574587	1574592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856056
27012	NC_013422	GGTT	2	8	1574673	1574680	0 %	50 %	50 %	0 %	261856056
27013	NC_013422	CAG	2	6	1574748	1574753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856056
27014	NC_013422	TCA	2	6	1574782	1574787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856056
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27016	NC_013422	CGT	2	6	1574859	1574864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856056
27017	NC_013422	A	6	6	1574886	1574891	100 %	0 %	0 %	0 %	261856056
27018	NC_013422	CAT	2	6	1574915	1574920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856056
27019	NC_013422	GAA	2	6	1574973	1574978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261856056
27020	NC_013422	GTT	2	6	1575445	1575450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261856057
27021	NC_013422	CAT	2	6	1575451	1575456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856057
27022	NC_013422	GGCG	2	8	1575538	1575545	0 %	0 %	75 %	25 %	261856057
27023	NC_013422	GC	3	6	1575564	1575569	0 %	0 %	50 %	50 %	261856057
27024	NC_013422	GC	3	6	1575586	1575591	0 %	0 %	50 %	50 %	261856057
27025	NC_013422	GGTG	2	8	1575592	1575599	0 %	25 %	75 %	0 %	261856057
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27029	NC_013422	CGC	2	6	1575713	1575718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856057
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27033	NC_013422	T	6	6	1575876	1575881	0 %	100 %	0 %	0 %	261856058
27034	NC_013422	GC	3	6	1575915	1575920	0 %	0 %	50 %	50 %	261856058
27035	NC_013422	TTA	2	6	1575932	1575937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261856058
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27044	NC_013422	AAT	2	6	1576515	1576520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261856058
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27052	NC_013422	TGA	2	6	1576863	1576868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856058
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27054	NC_013422	CCA	2	6	1576884	1576889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856058
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27100	NC_013422	CAG	2	6	1579823	1579828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856060
27101	NC_013422	TCTGT	2	10	1579897	1579906	0 %	60 %	20 %	20 %	261856060
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27103	NC_013422	CGTC	2	8	1580064	1580071	0 %	25 %	25 %	50 %	261856061
27104	NC_013422	GTC	2	6	1580102	1580107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261856061
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27107	NC_013422	TCGG	2	8	1580232	1580239	0 %	25 %	50 %	25 %	261856061
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27117	NC_013422	CAG	2	6	1580780	1580785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856061
27118	NC_013422	GCA	2	6	1580824	1580829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856061
27119	NC_013422	CACGAC	2	12	1580962	1580973	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	261856061
27120	NC_013422	GGC	2	6	1580974	1580979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856061
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27122	NC_013422	GTCT	2	8	1581034	1581041	0 %	50 %	25 %	25 %	261856062
27123	NC_013422	CTTG	2	8	1581057	1581064	0 %	50 %	25 %	25 %	261856062
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27125	NC_013422	CAGTT	2	10	1581166	1581175	20 %	40 %	20 %	20 %	261856062
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27223	NC_013422	GCC	2	6	1586939	1586944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856066
27224	NC_013422	AACA	2	8	1586960	1586967	75 %	0 %	0 %	25 %	261856066
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27457	NC_013422	CG	3	6	1600054	1600059	0 %	0 %	50 %	50 %	261856076
27458	NC_013422	A	6	6	1600099	1600104	100 %	0 %	0 %	0 %	261856076
27459	NC_013422	CCGTCG	2	12	1600124	1600135	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	261856076
27460	NC_013422	CACCC	2	10	1600158	1600167	20 %	0 %	0 %	80 %	261856076
27461	NC_013422	GGC	2	6	1600189	1600194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856076
27462	NC_013422	AAC	2	6	1600223	1600228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856076
27463	NC_013422	CCA	2	6	1600232	1600237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261856076
27464	NC_013422	ACT	2	6	1600248	1600253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856076
27465	NC_013422	CTGC	2	8	1600297	1600304	0 %	25 %	25 %	50 %	261856076
27466	NC_013422	CGC	2	6	1600330	1600335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856076
27467	NC_013422	A	6	6	1600366	1600371	100 %	0 %	0 %	0 %	261856076
27468	NC_013422	AC	3	6	1600401	1600406	50 %	0 %	0 %	50 %	261856076
27469	NC_013422	TC	3	6	1600413	1600418	0 %	50 %	0 %	50 %	261856076
27470	NC_013422	ATC	2	6	1600483	1600488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856076
27471	NC_013422	GCG	2	6	1600535	1600540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856076
27472	NC_013422	CA	3	6	1600617	1600622	50 %	0 %	0 %	50 %	261856076
27473	NC_013422	GCC	2	6	1600888	1600893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856076
27474	NC_013422	CCG	2	6	1600901	1600906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856076
27475	NC_013422	GCC	3	9	1600948	1600956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261856076
27476	NC_013422	CAA	2	6	1601026	1601031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261856076
27477	NC_013422	ACCC	2	8	1601054	1601061	25 %	0 %	0 %	75 %	261856076
27478	NC_013422	ATG	2	6	1601080	1601085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261856076
27479	NC_013422	CG	3	6	1601094	1601099	0 %	0 %	50 %	50 %	261856076
27480	NC_013422	TGTA	2	8	1601120	1601127	25 %	50 %	25 %	0 %	261856076
27481	NC_013422	CGAG	2	8	1601256	1601263	25 %	0 %	50 %	25 %	261856076
27482	NC_013422	T	8	8	1601813	1601820	0 %	100 %	0 %	0 %	261856077
27483	NC_013422	ATTCA	2	10	1601827	1601836	40 %	40 %	0 %	20 %	261856077
27484	NC_013422	AGC	2	6	1601837	1601842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856077
27485	NC_013422	CGG	2	6	1601928	1601933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856077
27486	NC_013422	TGGCAA	2	12	1601947	1601958	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	261856077
27487	NC_013422	CG	3	6	1601974	1601979	0 %	0 %	50 %	50 %	261856077
27488	NC_013422	GGT	2	6	1601995	1602000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261856077
27489	NC_013422	GC	3	6	1602046	1602051	0 %	0 %	50 %	50 %	261856077
27490	NC_013422	G	6	6	1602096	1602101	0 %	0 %	100 %	0 %	261856077
27491	NC_013422	CTT	2	6	1602120	1602125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261856077
27492	NC_013422	TAC	2	6	1602147	1602152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261856077
27493	NC_013422	CTTCC	2	10	1602217	1602226	0 %	40 %	0 %	60 %	261856077
27494	NC_013422	GCA	2	6	1602444	1602449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856077
27495	NC_013422	AC	3	6	1602465	1602470	50 %	0 %	0 %	50 %	261856077
27496	NC_013422	ATA	2	6	1602494	1602499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261856077
27497	NC_013422	GCA	2	6	1602648	1602653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856077
27498	NC_013422	CG	3	6	1602665	1602670	0 %	0 %	50 %	50 %	261856077
27499	NC_013422	AGC	2	6	1602671	1602676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261856077
27500	NC_013422	GCG	2	6	1602715	1602720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261856078

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