MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 45067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20502	NC_013422	TCG	2	6	1183586	1183591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855694
20503	NC_013422	GC	3	6	1183612	1183617	0 %	0 %	50 %	50 %	261855694
20504	NC_013422	TGT	2	6	1183621	1183626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855694
20505	NC_013422	CCAA	2	8	1183638	1183645	50 %	0 %	0 %	50 %	261855694
20506	NC_013422	GCC	2	6	1183651	1183656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855694
20507	NC_013422	TCG	2	6	1183658	1183663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855694
20508	NC_013422	CTG	3	9	1183849	1183857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855694
20509	NC_013422	GATCG	2	10	1184218	1184227	20 %	20 %	40 %	20 %	261855695
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20512	NC_013422	GCC	2	6	1184380	1184385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855695
20513	NC_013422	GAT	2	6	1184389	1184394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855695
20514	NC_013422	TCA	2	6	1184450	1184455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855695
20515	NC_013422	TCGCCT	2	12	1184486	1184497	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	261855695
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20519	NC_013422	CAT	2	6	1184767	1184772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855695
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20602	NC_013422	GCGCC	2	10	1189915	1189924	0 %	0 %	40 %	60 %	261855701
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20615	NC_013422	GTACCA	2	12	1190617	1190628	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	261855701
20616	NC_013422	GAA	2	6	1190746	1190751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855701
20617	NC_013422	ATCAA	2	10	1190792	1190801	60 %	20 %	0 %	20 %	261855701
20618	NC_013422	GCT	2	6	1190875	1190880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855701
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20623	NC_013422	CG	3	6	1191007	1191012	0 %	0 %	50 %	50 %	261855702
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20726	NC_013422	TGC	2	6	1197288	1197293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855705
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20964	NC_013422	T	6	6	1210000	1210005	0 %	100 %	0 %	0 %	261855714
20965	NC_013422	GTG	2	6	1210045	1210050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855714
20966	NC_013422	GCTTG	2	10	1210053	1210062	0 %	40 %	40 %	20 %	261855714
20967	NC_013422	CGG	2	6	1210071	1210076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855714
20968	NC_013422	AAC	2	6	1210184	1210189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855714
20969	NC_013422	TGC	2	6	1210220	1210225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855714
20970	NC_013422	CAC	2	6	1210354	1210359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855714
20971	NC_013422	T	6	6	1210476	1210481	0 %	100 %	0 %	0 %	261855714
20972	NC_013422	CCG	2	6	1210601	1210606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855714
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20974	NC_013422	AC	3	6	1210636	1210641	50 %	0 %	0 %	50 %	261855714
20975	NC_013422	TGC	2	6	1210668	1210673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855714
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20979	NC_013422	GAT	2	6	1210876	1210881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855714
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20981	NC_013422	CAGGT	2	10	1210975	1210984	20 %	20 %	40 %	20 %	261855714
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20983	NC_013422	T	6	6	1211061	1211066	0 %	100 %	0 %	0 %	261855714
20984	NC_013422	TGA	2	6	1211659	1211664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855715
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20987	NC_013422	CGG	2	6	1211742	1211747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855715
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20989	NC_013422	CAG	2	6	1211839	1211844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855715
20990	NC_013422	TCA	2	6	1211869	1211874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855715
20991	NC_013422	CTT	2	6	1211918	1211923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855715
20992	NC_013422	GTTT	3	12	1211935	1211946	0 %	75 %	25 %	0 %	261855715
20993	NC_013422	GGT	2	6	1211994	1211999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855715
20994	NC_013422	TGC	2	6	1212142	1212147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855715
20995	NC_013422	CGT	2	6	1212196	1212201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855715
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20998	NC_013422	CTGG	2	8	1212299	1212306	0 %	25 %	50 %	25 %	261855715
20999	NC_013422	CGG	2	6	1212307	1212312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855715
21000	NC_013422	CGC	4	12	1212394	1212405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855715

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