MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 45067

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20118	NC_013422	GTC	2	6	1162245	1162250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855674
20119	NC_013422	CGG	2	6	1162290	1162295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855674
20120	NC_013422	ACTGC	2	10	1162547	1162556	20 %	20 %	20 %	40 %	261855675
20121	NC_013422	TTGG	2	8	1162557	1162564	0 %	50 %	50 %	0 %	261855675
20122	NC_013422	CA	3	6	1162600	1162605	50 %	0 %	0 %	50 %	261855675
20123	NC_013422	TCT	2	6	1162641	1162646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855675
20124	NC_013422	GTT	2	6	1162709	1162714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855675
20125	NC_013422	GCG	2	6	1162721	1162726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855675
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20127	NC_013422	CTG	2	6	1162760	1162765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855675
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20131	NC_013422	CGG	2	6	1163112	1163117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855676
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20133	NC_013422	GTG	2	6	1163167	1163172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855676
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20142	NC_013422	TGG	2	6	1163659	1163664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855677
20143	NC_013422	A	7	7	1163775	1163781	100 %	0 %	0 %	0 %	261855677
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20145	NC_013422	A	7	7	1163898	1163904	100 %	0 %	0 %	0 %	261855677
20146	NC_013422	TGA	2	6	1164029	1164034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855677
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20152	NC_013422	TCG	2	6	1164347	1164352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855677
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20220	NC_013422	ATTGC	2	10	1168220	1168229	20 %	40 %	20 %	20 %	261855680
20221	NC_013422	GCG	2	6	1168277	1168282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855680
20222	NC_013422	CCG	2	6	1168289	1168294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855680
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20225	NC_013422	TCA	2	6	1168502	1168507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855680
20226	NC_013422	TGA	2	6	1168545	1168550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855680
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20228	NC_013422	CCA	2	6	1168585	1168590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855680
20229	NC_013422	T	7	7	1168610	1168616	0 %	100 %	0 %	0 %	261855681
20230	NC_013422	CACGC	2	10	1168631	1168640	20 %	0 %	20 %	60 %	261855681
20231	NC_013422	AGC	2	6	1168680	1168685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855681
20232	NC_013422	AGC	2	6	1168693	1168698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855681
20233	NC_013422	CAC	2	6	1168722	1168727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855681
20234	NC_013422	AACATG	2	12	1168750	1168761	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	261855681
20235	NC_013422	GCT	2	6	1168816	1168821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855681
20236	NC_013422	CCAT	2	8	1168838	1168845	25 %	25 %	0 %	50 %	261855681
20237	NC_013422	GAT	2	6	1168878	1168883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855681
20238	NC_013422	GGC	2	6	1168890	1168895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855681
20239	NC_013422	CAA	2	6	1168932	1168937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855681
20240	NC_013422	GCA	2	6	1168942	1168947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855681
20241	NC_013422	CTG	2	6	1168998	1169003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855681
20242	NC_013422	GCGCC	2	10	1169010	1169019	0 %	0 %	40 %	60 %	261855681
20243	NC_013422	AAAT	2	8	1169100	1169107	75 %	25 %	0 %	0 %	261855681
20244	NC_013422	CGC	2	6	1169130	1169135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855681
20245	NC_013422	AAGA	2	8	1169151	1169158	75 %	0 %	25 %	0 %	261855681
20246	NC_013422	CCAG	2	8	1169284	1169291	25 %	0 %	25 %	50 %	261855682
20247	NC_013422	ACC	2	6	1169316	1169321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855682
20248	NC_013422	GATG	2	8	1169344	1169351	25 %	25 %	50 %	0 %	261855682
20249	NC_013422	GGTG	2	8	1169359	1169366	0 %	25 %	75 %	0 %	261855682
20250	NC_013422	TTC	2	6	1169390	1169395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855682
20251	NC_013422	ATA	2	6	1169436	1169441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261855682
20252	NC_013422	TGC	2	6	1169452	1169457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855682
20253	NC_013422	GC	3	6	1169478	1169483	0 %	0 %	50 %	50 %	261855682
20254	NC_013422	CTG	2	6	1169558	1169563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855682
20255	NC_013422	ATC	2	6	1169585	1169590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855682
20256	NC_013422	GCAGG	2	10	1169738	1169747	20 %	0 %	60 %	20 %	261855682
20257	NC_013422	ATC	2	6	1169795	1169800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855682
20258	NC_013422	CCCA	2	8	1169802	1169809	25 %	0 %	0 %	75 %	261855682
20259	NC_013422	GA	3	6	1169904	1169909	50 %	0 %	50 %	0 %	261855682
20260	NC_013422	TGA	2	6	1170011	1170016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855683
20261	NC_013422	ACA	2	6	1170085	1170090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855683
20262	NC_013422	CCATC	2	10	1170092	1170101	20 %	20 %	0 %	60 %	261855683
20263	NC_013422	TGA	2	6	1170182	1170187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855683
20264	NC_013422	CTGG	2	8	1170192	1170199	0 %	25 %	50 %	25 %	261855683
20265	NC_013422	TTC	2	6	1170250	1170255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855683
20266	NC_013422	CGG	2	6	1170282	1170287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855683
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20272	NC_013422	CACG	2	8	1170842	1170849	25 %	0 %	25 %	50 %	261855684
20273	NC_013422	ATGT	2	8	1170893	1170900	25 %	50 %	25 %	0 %	261855684
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20282	NC_013422	CGA	2	6	1171333	1171338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855684
20283	NC_013422	GTC	2	6	1171422	1171427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855684
20284	NC_013422	CG	3	6	1171463	1171468	0 %	0 %	50 %	50 %	261855684
20285	NC_013422	TCA	2	6	1171561	1171566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855684
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20293	NC_013422	GAC	2	6	1171853	1171858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855684
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20296	NC_013422	CGA	2	6	1172035	1172040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855684
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20304	NC_013422	GTC	2	6	1172717	1172722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855686
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20335	NC_013422	GCT	2	6	1173834	1173839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855687
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20346	NC_013422	TGA	2	6	1174415	1174420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855688
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20348	NC_013422	GAA	2	6	1174491	1174496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855688
20349	NC_013422	CAG	2	6	1174542	1174547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855688
20350	NC_013422	GAT	2	6	1174578	1174583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855688
20351	NC_013422	TTC	2	6	1174848	1174853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855688
20352	NC_013422	GGC	2	6	1174914	1174919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855688
20353	NC_013422	CCA	2	6	1174955	1174960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855688
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20355	NC_013422	CTG	2	6	1174977	1174982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855688
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20456	NC_013422	ATC	2	6	1180799	1180804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855692
20457	NC_013422	TCG	2	6	1180959	1180964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855692
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20459	NC_013422	AGC	3	9	1181160	1181168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855692
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20461	NC_013422	CTT	3	9	1181287	1181295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855692
20462	NC_013422	T	7	7	1181341	1181347	0 %	100 %	0 %	0 %	261855692
20463	NC_013422	GCT	2	6	1181350	1181355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855692
20464	NC_013422	GCA	2	6	1181377	1181382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855692
20465	NC_013422	GGC	2	6	1181490	1181495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855692
20466	NC_013422	CTT	2	6	1181542	1181547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855692
20467	NC_013422	GTC	2	6	1181588	1181593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855692
20468	NC_013422	AGG	2	6	1181679	1181684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261855692
20469	NC_013422	TGG	2	6	1181695	1181700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855692
20470	NC_013422	CGC	2	6	1181735	1181740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855692
20471	NC_013422	CAT	2	6	1181798	1181803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855692
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20474	NC_013422	GTC	2	6	1182068	1182073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855692
20475	NC_013422	TCA	2	6	1182132	1182137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855692
20476	NC_013422	GCA	2	6	1182247	1182252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855692
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20479	NC_013422	TGT	2	6	1182310	1182315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855692
20480	NC_013422	TTC	2	6	1182342	1182347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855692
20481	NC_013422	TGA	2	6	1182429	1182434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855692
20482	NC_013422	GGT	2	6	1182449	1182454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855692
20483	NC_013422	GC	3	6	1182518	1182523	0 %	0 %	50 %	50 %	261855692
20484	NC_013422	CACC	2	8	1182622	1182629	25 %	0 %	0 %	75 %	261855692
20485	NC_013422	TTC	2	6	1182650	1182655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855692
20486	NC_013422	CAG	2	6	1182665	1182670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855692
20487	NC_013422	GGC	2	6	1182707	1182712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855692
20488	NC_013422	GA	3	6	1182743	1182748	50 %	0 %	50 %	0 %	261855692
20489	NC_013422	TAT	2	6	1182853	1182858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261855692
20490	NC_013422	G	7	7	1182897	1182903	0 %	0 %	100 %	0 %	261855693
20491	NC_013422	AGA	2	6	1182926	1182931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855693
20492	NC_013422	TTG	2	6	1183020	1183025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855693
20493	NC_013422	TGA	2	6	1183064	1183069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855693
20494	NC_013422	AC	3	6	1183200	1183205	50 %	0 %	0 %	50 %	261855694
20495	NC_013422	TGC	2	6	1183222	1183227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855694
20496	NC_013422	GCT	2	6	1183404	1183409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855694
20497	NC_013422	TGG	2	6	1183410	1183415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855694
20498	NC_013422	TCA	2	6	1183431	1183436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855694
20499	NC_013422	CGA	2	6	1183526	1183531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855694
20500	NC_013422	CAC	2	6	1183552	1183557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855694

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