MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 45067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19502	NC_013422	CGA	2	6	1125433	1125438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855640
19503	NC_013422	GTTT	2	8	1125499	1125506	0 %	75 %	25 %	0 %	261855640
19504	NC_013422	GTA	2	6	1125587	1125592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855640
19505	NC_013422	TCA	2	6	1125962	1125967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855641
19506	NC_013422	TGC	2	6	1126078	1126083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855641
19507	NC_013422	TGG	2	6	1126084	1126089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855641
19508	NC_013422	ATG	2	6	1126090	1126095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855641
19509	NC_013422	GC	3	6	1126173	1126178	0 %	0 %	50 %	50 %	261855641
19510	NC_013422	CGG	2	6	1126192	1126197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855641
19511	NC_013422	TGG	2	6	1126288	1126293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855641
19512	NC_013422	TGG	2	6	1126321	1126326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855641
19513	NC_013422	CTGG	2	8	1126327	1126334	0 %	25 %	50 %	25 %	261855641
19514	NC_013422	GATT	2	8	1126393	1126400	25 %	50 %	25 %	0 %	261855641
19515	NC_013422	CGA	2	6	1126401	1126406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855641
19516	NC_013422	ATC	2	6	1126464	1126469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855641
19517	NC_013422	CCTG	2	8	1126509	1126516	0 %	25 %	25 %	50 %	261855641
19518	NC_013422	AGG	3	9	1126549	1126557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261855641
19519	NC_013422	CAT	2	6	1126566	1126571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855641
19520	NC_013422	TCA	2	6	1126621	1126626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855641
19521	NC_013422	GCCC	2	8	1126665	1126672	0 %	0 %	25 %	75 %	261855641
19522	NC_013422	T	6	6	1126679	1126684	0 %	100 %	0 %	0 %	261855641
19523	NC_013422	G	6	6	1126715	1126720	0 %	0 %	100 %	0 %	261855641
19524	NC_013422	TCT	2	6	1126736	1126741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855641
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19526	NC_013422	ATT	2	6	1126781	1126786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261855641
19527	NC_013422	CAT	2	6	1126796	1126801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855641
19528	NC_013422	TGT	2	6	1126852	1126857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855641
19529	NC_013422	TAC	2	6	1126866	1126871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855641
19530	NC_013422	CGTC	2	8	1126902	1126909	0 %	25 %	25 %	50 %	261855641
19531	NC_013422	CTGA	2	8	1126914	1126921	25 %	25 %	25 %	25 %	261855641
19532	NC_013422	TGA	2	6	1126961	1126966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855641
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19534	NC_013422	TTG	2	6	1127082	1127087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855642
19535	NC_013422	AAT	2	6	1127129	1127134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261855642
19536	NC_013422	TTG	3	9	1127204	1127212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855642
19537	NC_013422	TGC	3	9	1127247	1127255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855642
19538	NC_013422	CCGC	2	8	1127318	1127325	0 %	0 %	25 %	75 %	261855642
19539	NC_013422	TGG	2	6	1127331	1127336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855642
19540	NC_013422	GCTG	2	8	1127413	1127420	0 %	25 %	50 %	25 %	261855642
19541	NC_013422	ATTG	2	8	1127425	1127432	25 %	50 %	25 %	0 %	261855642
19542	NC_013422	TCGG	2	8	1127447	1127454	0 %	25 %	50 %	25 %	261855642
19543	NC_013422	TGC	2	6	1127469	1127474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855642
19544	NC_013422	TC	3	6	1127496	1127501	0 %	50 %	0 %	50 %	261855642
19545	NC_013422	CCGA	2	8	1127525	1127532	25 %	0 %	25 %	50 %	261855642
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19548	NC_013422	AAT	2	6	1127820	1127825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261855642
19549	NC_013422	GTC	2	6	1128018	1128023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855643
19550	NC_013422	AAG	2	6	1128059	1128064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855643
19551	NC_013422	TG	3	6	1128115	1128120	0 %	50 %	50 %	0 %	261855643
19552	NC_013422	TGG	2	6	1128131	1128136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855643
19553	NC_013422	TGGC	2	8	1128139	1128146	0 %	25 %	50 %	25 %	261855643
19554	NC_013422	GCC	2	6	1128162	1128167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855643
19555	NC_013422	TTG	2	6	1128481	1128486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855643
19556	NC_013422	TCGA	2	8	1128568	1128575	25 %	25 %	25 %	25 %	261855643
19557	NC_013422	CAC	2	6	1128583	1128588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855643
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19562	NC_013422	GCC	2	6	1128868	1128873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855643
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19584	NC_013422	GC	3	6	1129823	1129828	0 %	0 %	50 %	50 %	261855644
19585	NC_013422	CG	3	6	1129966	1129971	0 %	0 %	50 %	50 %	261855644
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19588	NC_013422	TGG	3	9	1130042	1130050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855644
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19591	NC_013422	CGA	2	6	1130426	1130431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855645
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19597	NC_013422	CGCC	2	8	1130659	1130666	0 %	0 %	25 %	75 %	261855645
19598	NC_013422	A	6	6	1130716	1130721	100 %	0 %	0 %	0 %	261855645
19599	NC_013422	TCC	2	6	1130723	1130728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261855645
19600	NC_013422	AG	3	6	1130939	1130944	50 %	0 %	50 %	0 %	261855645
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19604	NC_013422	ACCGA	2	10	1131196	1131205	40 %	0 %	20 %	40 %	261855645
19605	NC_013422	AG	3	6	1131238	1131243	50 %	0 %	50 %	0 %	261855645
19606	NC_013422	GAT	2	6	1131416	1131421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855646
19607	NC_013422	CGAA	2	8	1131431	1131438	50 %	0 %	25 %	25 %	261855646
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19611	NC_013422	GCG	2	6	1131605	1131610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855646
19612	NC_013422	TGA	2	6	1131649	1131654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855646
19613	NC_013422	AGA	2	6	1131686	1131691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855646
19614	NC_013422	AGC	2	6	1131760	1131765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855646
19615	NC_013422	TC	3	6	1131784	1131789	0 %	50 %	0 %	50 %	261855646
19616	NC_013422	GAT	2	6	1131816	1131821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855646
19617	NC_013422	GCA	2	6	1131827	1131832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855646
19618	NC_013422	ACG	2	6	1131883	1131888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855647
19619	NC_013422	GCC	2	6	1131907	1131912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855647
19620	NC_013422	CAT	2	6	1131914	1131919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855647
19621	NC_013422	GGC	2	6	1131987	1131992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855647
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19623	NC_013422	GCG	2	6	1132326	1132331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855647
19624	NC_013422	GAT	2	6	1132466	1132471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855647
19625	NC_013422	TGT	2	6	1132504	1132509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855647
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19628	NC_013422	CTG	2	6	1132926	1132931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855648
19629	NC_013422	GCA	2	6	1133012	1133017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855648
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19644	NC_013422	TC	3	6	1133476	1133481	0 %	50 %	0 %	50 %	261855648
19645	NC_013422	GTT	2	6	1133607	1133612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855648
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19726	NC_013422	TGC	2	6	1138921	1138926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855653
19727	NC_013422	CA	3	6	1138964	1138969	50 %	0 %	0 %	50 %	261855653
19728	NC_013422	CATT	2	8	1138978	1138985	25 %	50 %	0 %	25 %	261855653
19729	NC_013422	GC	3	6	1139002	1139007	0 %	0 %	50 %	50 %	261855653
19730	NC_013422	GAT	2	6	1139034	1139039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855653
19731	NC_013422	AAGTG	2	10	1139047	1139056	40 %	20 %	40 %	0 %	261855653
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19733	NC_013422	CGA	2	6	1139095	1139100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855653
19734	NC_013422	GTTT	2	8	1139304	1139311	0 %	75 %	25 %	0 %	261855654
19735	NC_013422	GTG	2	6	1139454	1139459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855654
19736	NC_013422	CGA	2	6	1139462	1139467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855654
19737	NC_013422	TGGT	2	8	1139501	1139508	0 %	50 %	50 %	0 %	261855654
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19847	NC_013422	CAG	2	6	1146207	1146212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855659
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19849	NC_013422	ATGC	2	8	1146236	1146243	25 %	25 %	25 %	25 %	261855659
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19960	NC_013422	A	9	9	1153007	1153015	100 %	0 %	0 %	0 %	261855665
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19965	NC_013422	CTGT	2	8	1153195	1153202	0 %	50 %	25 %	25 %	261855665
19966	NC_013422	TGA	2	6	1153215	1153220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855665
19967	NC_013422	TGA	2	6	1153230	1153235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855665
19968	NC_013422	TA	3	6	1153239	1153244	50 %	50 %	0 %	0 %	261855665
19969	NC_013422	T	7	7	1153263	1153269	0 %	100 %	0 %	0 %	261855665
19970	NC_013422	TTG	2	6	1153328	1153333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855665
19971	NC_013422	GAAA	2	8	1153353	1153360	75 %	0 %	25 %	0 %	261855665
19972	NC_013422	AAG	2	6	1153403	1153408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855665
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19974	NC_013422	TGTT	2	8	1153568	1153575	0 %	75 %	25 %	0 %	261855665
19975	NC_013422	ACT	2	6	1153590	1153595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855665
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19979	NC_013422	TTGG	2	8	1153756	1153763	0 %	50 %	50 %	0 %	261855665
19980	NC_013422	CAA	2	6	1153871	1153876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855665
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19983	NC_013422	A	6	6	1154048	1154053	100 %	0 %	0 %	0 %	261855665
19984	NC_013422	CGT	2	6	1154095	1154100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855666
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19989	NC_013422	TCT	2	6	1154367	1154372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855666
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19991	NC_013422	A	6	6	1154386	1154391	100 %	0 %	0 %	0 %	261855666
19992	NC_013422	GGC	2	6	1154393	1154398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855666
19993	NC_013422	TTTGGT	3	18	1154438	1154455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855666
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19996	NC_013422	T	6	6	1154631	1154636	0 %	100 %	0 %	0 %	261855666
19997	NC_013422	TGC	2	6	1154650	1154655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855666
19998	NC_013422	CGA	2	6	1154698	1154703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855666
19999	NC_013422	ATGG	2	8	1155059	1155066	25 %	25 %	50 %	0 %	261855667
20000	NC_013422	A	7	7	1155080	1155086	100 %	0 %	0 %	0 %	261855667

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