MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 45067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_013422	CGG	2	6	1067967	1067972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855593
18503	NC_013422	CGC	2	6	1067998	1068003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855593
18504	NC_013422	GC	3	6	1068040	1068045	0 %	0 %	50 %	50 %	261855593
18505	NC_013422	GCAC	2	8	1068092	1068099	25 %	0 %	25 %	50 %	261855593
18506	NC_013422	AC	3	6	1068098	1068103	50 %	0 %	0 %	50 %	261855593
18507	NC_013422	ACGC	2	8	1068105	1068112	25 %	0 %	25 %	50 %	261855593
18508	NC_013422	CCAA	2	8	1068176	1068183	50 %	0 %	0 %	50 %	261855593
18509	NC_013422	TGG	2	6	1068189	1068194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855593
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18511	NC_013422	CGG	2	6	1068261	1068266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855593
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18514	NC_013422	GTT	2	6	1068337	1068342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855593
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18517	NC_013422	CGGC	2	8	1068411	1068418	0 %	0 %	50 %	50 %	261855593
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18520	NC_013422	GGTG	2	8	1068520	1068527	0 %	25 %	75 %	0 %	261855593
18521	NC_013422	GTC	2	6	1068647	1068652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855593
18522	NC_013422	CGG	2	6	1068670	1068675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855593
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18590	NC_013422	GC	3	6	1073285	1073290	0 %	0 %	50 %	50 %	261855596
18591	NC_013422	GCACG	2	10	1073306	1073315	20 %	0 %	40 %	40 %	261855596
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18607	NC_013422	CCAGAT	2	12	1074556	1074567	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	261855597
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18620	NC_013422	GC	3	6	1075505	1075510	0 %	0 %	50 %	50 %	261855598
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18733	NC_013422	CTG	2	6	1081939	1081944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855601
18734	NC_013422	GGC	2	6	1081999	1082004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855601
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18737	NC_013422	GAGC	2	8	1082108	1082115	25 %	0 %	50 %	25 %	261855601
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18763	NC_013422	GC	4	8	1083444	1083451	0 %	0 %	50 %	50 %	261855602
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18771	NC_013422	TGC	2	6	1083845	1083850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855603
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18834	NC_013422	TGA	3	9	1086870	1086878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855605
18835	NC_013422	TCG	2	6	1086894	1086899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855605
18836	NC_013422	CGTT	2	8	1086906	1086913	0 %	50 %	25 %	25 %	261855605
18837	NC_013422	CCG	2	6	1086942	1086947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855605
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18839	NC_013422	TCA	2	6	1087187	1087192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855606
18840	NC_013422	CA	3	6	1087411	1087416	50 %	0 %	0 %	50 %	261855607
18841	NC_013422	CGC	2	6	1087445	1087450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855607
18842	NC_013422	CCA	2	6	1087556	1087561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855607
18843	NC_013422	TCC	2	6	1087570	1087575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261855607
18844	NC_013422	AGC	2	6	1087611	1087616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855607
18845	NC_013422	CAC	2	6	1087622	1087627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855607
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18964	NC_013422	GCA	2	6	1094089	1094094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855612
18965	NC_013422	GGC	2	6	1094134	1094139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855612
18966	NC_013422	GAT	2	6	1094172	1094177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855612
18967	NC_013422	CTT	2	6	1094264	1094269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855612
18968	NC_013422	AT	3	6	1094281	1094286	50 %	50 %	0 %	0 %	261855612
18969	NC_013422	GTC	2	6	1094346	1094351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855612
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18971	NC_013422	GCT	2	6	1094375	1094380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855612
18972	NC_013422	ACC	2	6	1094509	1094514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855612
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18975	NC_013422	TGCC	2	8	1094693	1094700	0 %	25 %	25 %	50 %	261855612
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18979	NC_013422	GTC	2	6	1094832	1094837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855612
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18981	NC_013422	T	6	6	1094949	1094954	0 %	100 %	0 %	0 %	261855613
18982	NC_013422	ACC	2	6	1094986	1094991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855613
18983	NC_013422	GAT	2	6	1095025	1095030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855613
18984	NC_013422	GCCC	2	8	1095072	1095079	0 %	0 %	25 %	75 %	261855613
18985	NC_013422	CGA	2	6	1095195	1095200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855613
18986	NC_013422	ATC	3	9	1095206	1095214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855613
18987	NC_013422	TAAAG	2	10	1095246	1095255	60 %	20 %	20 %	0 %	261855613
18988	NC_013422	CG	3	6	1095273	1095278	0 %	0 %	50 %	50 %	261855613
18989	NC_013422	TGACGA	2	12	1095342	1095353	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	261855613
18990	NC_013422	TGC	2	6	1095402	1095407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855613
18991	NC_013422	TCA	2	6	1095420	1095425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855613
18992	NC_013422	ATG	3	9	1095458	1095466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855613
18993	NC_013422	GTTC	2	8	1095512	1095519	0 %	50 %	25 %	25 %	261855613
18994	NC_013422	CTT	2	6	1095523	1095528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855613
18995	NC_013422	GAG	2	6	1095544	1095549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261855613
18996	NC_013422	GCCG	2	8	1095574	1095581	0 %	0 %	50 %	50 %	261855613
18997	NC_013422	AAG	2	6	1095605	1095610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855613
18998	NC_013422	GT	3	6	1095635	1095640	0 %	50 %	50 %	0 %	261855613
18999	NC_013422	GCC	2	6	1095646	1095651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855613
19000	NC_013422	GC	3	6	1095684	1095689	0 %	0 %	50 %	50 %	261855613

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