MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 45067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_013422	TGT	2	6	1035762	1035767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855562
18003	NC_013422	ATT	2	6	1035833	1035838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261855562
18004	NC_013422	TA	3	6	1035899	1035904	50 %	50 %	0 %	0 %	261855562
18005	NC_013422	ATG	2	6	1035962	1035967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855562
18006	NC_013422	AGA	2	6	1035976	1035981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855562
18007	NC_013422	CT	3	6	1035989	1035994	0 %	50 %	0 %	50 %	261855562
18008	NC_013422	AT	3	6	1035999	1036004	50 %	50 %	0 %	0 %	261855562
18009	NC_013422	AT	3	6	1036037	1036042	50 %	50 %	0 %	0 %	261855562
18010	NC_013422	C	6	6	1036050	1036055	0 %	0 %	0 %	100 %	261855562
18011	NC_013422	TGG	3	9	1036057	1036065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855562
18012	NC_013422	TC	3	6	1036100	1036105	0 %	50 %	0 %	50 %	261855562
18013	NC_013422	GCA	2	6	1036206	1036211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855562
18014	NC_013422	AAGTA	2	10	1036291	1036300	60 %	20 %	20 %	0 %	261855562
18015	NC_013422	GCC	2	6	1037282	1037287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855563
18016	NC_013422	AGA	2	6	1037322	1037327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855563
18017	NC_013422	TG	3	6	1037450	1037455	0 %	50 %	50 %	0 %	261855563
18018	NC_013422	TGA	2	6	1037509	1037514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855563
18019	NC_013422	GGT	2	6	1037565	1037570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855563
18020	NC_013422	ACC	2	6	1037577	1037582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855563
18021	NC_013422	CT	3	6	1037654	1037659	0 %	50 %	0 %	50 %	261855563
18022	NC_013422	CAT	2	6	1037764	1037769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855563
18023	NC_013422	GCA	2	6	1037807	1037812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855563
18024	NC_013422	GA	4	8	1037829	1037836	50 %	0 %	50 %	0 %	261855563
18025	NC_013422	GAG	2	6	1037847	1037852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261855563
18026	NC_013422	ATG	2	6	1037914	1037919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855563
18027	NC_013422	ATG	2	6	1037953	1037958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855563
18028	NC_013422	GC	3	6	1037974	1037979	0 %	0 %	50 %	50 %	261855563
18029	NC_013422	TAT	2	6	1038072	1038077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261855563
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18031	NC_013422	GT	3	6	1038344	1038349	0 %	50 %	50 %	0 %	261855564
18032	NC_013422	ATTG	2	8	1038392	1038399	25 %	50 %	25 %	0 %	261855564
18033	NC_013422	TGG	2	6	1038512	1038517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855564
18034	NC_013422	CTT	2	6	1038534	1038539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855564
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18037	NC_013422	TG	3	6	1038734	1038739	0 %	50 %	50 %	0 %	261855564
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18040	NC_013422	CCAC	2	8	1038848	1038855	25 %	0 %	0 %	75 %	261855564
18041	NC_013422	TCC	2	6	1038970	1038975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261855564
18042	NC_013422	TGC	2	6	1038986	1038991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855564
18043	NC_013422	GGC	2	6	1038992	1038997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855564
18044	NC_013422	GAAG	2	8	1039028	1039035	50 %	0 %	50 %	0 %	261855564
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18050	NC_013422	TC	3	6	1039625	1039630	0 %	50 %	0 %	50 %	261855565
18051	NC_013422	TAA	2	6	1039671	1039676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261855565
18052	NC_013422	ATG	2	6	1039690	1039695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855565
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18054	NC_013422	CCAT	2	8	1039822	1039829	25 %	25 %	0 %	50 %	261855565
18055	NC_013422	TCC	2	6	1039853	1039858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261855565
18056	NC_013422	TAC	2	6	1039930	1039935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855565
18057	NC_013422	AT	3	6	1039947	1039952	50 %	50 %	0 %	0 %	261855565
18058	NC_013422	AGT	2	6	1039989	1039994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855565
18059	NC_013422	TCA	2	6	1039998	1040003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855565
18060	NC_013422	ATTTAA	2	12	1040026	1040037	50 %	50 %	0 %	0 %	261855565
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18067	NC_013422	TGA	2	6	1040429	1040434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855566
18068	NC_013422	TG	5	10	1040468	1040477	0 %	50 %	50 %	0 %	261855566
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18084	NC_013422	CTG	2	6	1041229	1041234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855567
18085	NC_013422	TTACT	2	10	1041277	1041286	20 %	60 %	0 %	20 %	261855567
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18088	NC_013422	TGCT	2	8	1041434	1041441	0 %	50 %	25 %	25 %	261855567
18089	NC_013422	CT	3	6	1041458	1041463	0 %	50 %	0 %	50 %	261855567
18090	NC_013422	GCATG	2	10	1041729	1041738	20 %	20 %	40 %	20 %	261855568
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18093	NC_013422	CAG	2	6	1041838	1041843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855568
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18098	NC_013422	CT	4	8	1042243	1042250	0 %	50 %	0 %	50 %	261855569
18099	NC_013422	GAT	2	6	1042320	1042325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855569
18100	NC_013422	GTAA	2	8	1042336	1042343	50 %	25 %	25 %	0 %	261855569
18101	NC_013422	AATA	2	8	1042384	1042391	75 %	25 %	0 %	0 %	261855569
18102	NC_013422	ATG	2	6	1042397	1042402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855569
18103	NC_013422	ATA	2	6	1042412	1042417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261855569
18104	NC_013422	AAT	2	6	1042586	1042591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261855569
18105	NC_013422	TGC	2	6	1042643	1042648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855569
18106	NC_013422	ACT	2	6	1042672	1042677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855569
18107	NC_013422	TG	3	6	1042698	1042703	0 %	50 %	50 %	0 %	261855570
18108	NC_013422	T	6	6	1042721	1042726	0 %	100 %	0 %	0 %	261855570
18109	NC_013422	TCG	2	6	1042770	1042775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855570
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18111	NC_013422	GA	3	6	1042822	1042827	50 %	0 %	50 %	0 %	261855570
18112	NC_013422	C	6	6	1042855	1042860	0 %	0 %	0 %	100 %	261855570
18113	NC_013422	CCA	2	6	1043209	1043214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855571
18114	NC_013422	TCC	2	6	1043217	1043222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261855571
18115	NC_013422	CAT	2	6	1043288	1043293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855571
18116	NC_013422	A	7	7	1043312	1043318	100 %	0 %	0 %	0 %	261855571
18117	NC_013422	ATC	2	6	1043372	1043377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855571
18118	NC_013422	ACC	2	6	1043486	1043491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855571
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18233	NC_013422	TGT	2	6	1050949	1050954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855575
18234	NC_013422	TGA	2	6	1050955	1050960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855575
18235	NC_013422	ACC	2	6	1051543	1051548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855576
18236	NC_013422	TCA	2	6	1051671	1051676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855576
18237	NC_013422	GCT	2	6	1051740	1051745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855576
18238	NC_013422	G	7	7	1051788	1051794	0 %	0 %	100 %	0 %	261855576
18239	NC_013422	GCG	2	6	1051829	1051834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855576
18240	NC_013422	TGT	2	6	1051861	1051866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855576
18241	NC_013422	TGG	2	6	1051869	1051874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855576
18242	NC_013422	CAT	2	6	1051879	1051884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855576
18243	NC_013422	TTTC	2	8	1051977	1051984	0 %	75 %	0 %	25 %	261855577
18244	NC_013422	GAACCA	2	12	1052104	1052115	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	261855577
18245	NC_013422	T	6	6	1052242	1052247	0 %	100 %	0 %	0 %	261855577
18246	NC_013422	TTG	2	6	1052393	1052398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855577
18247	NC_013422	GGT	2	6	1052444	1052449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855577
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18249	NC_013422	TGG	2	6	1052550	1052555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855577
18250	NC_013422	TGG	2	6	1052574	1052579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855577
18251	NC_013422	CG	3	6	1052606	1052611	0 %	0 %	50 %	50 %	261855577
18252	NC_013422	CAGG	2	8	1052674	1052681	25 %	0 %	50 %	25 %	261855577
18253	NC_013422	TGA	2	6	1052692	1052697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855577
18254	NC_013422	CGG	2	6	1052723	1052728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855577
18255	NC_013422	GACCGA	2	12	1052737	1052748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855577
18256	NC_013422	TGGCTC	2	12	1052797	1052808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855578
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18261	NC_013422	AAT	2	6	1053108	1053113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261855578
18262	NC_013422	GAC	2	6	1053173	1053178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855578
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18272	NC_013422	TGAC	2	8	1053960	1053967	25 %	25 %	25 %	25 %	261855578
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18275	NC_013422	GT	3	6	1054114	1054119	0 %	50 %	50 %	0 %	261855578
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18321	NC_013422	TTC	2	6	1056387	1056392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855581
18322	NC_013422	T	7	7	1056405	1056411	0 %	100 %	0 %	0 %	261855581
18323	NC_013422	TCG	2	6	1056509	1056514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855581
18324	NC_013422	AAG	2	6	1056627	1056632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855581
18325	NC_013422	GCCA	2	8	1056640	1056647	25 %	0 %	25 %	50 %	261855581
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18329	NC_013422	TGTCC	2	10	1056886	1056895	0 %	40 %	20 %	40 %	261855581
18330	NC_013422	CAGC	2	8	1056977	1056984	25 %	0 %	25 %	50 %	261855581
18331	NC_013422	GCT	2	6	1057041	1057046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855581
18332	NC_013422	CAG	2	6	1057052	1057057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855581
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18334	NC_013422	GC	3	6	1057134	1057139	0 %	0 %	50 %	50 %	261855581
18335	NC_013422	GCG	2	6	1057171	1057176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855581
18336	NC_013422	GTGTG	2	10	1057240	1057249	0 %	40 %	60 %	0 %	261855581
18337	NC_013422	GTTC	2	8	1057320	1057327	0 %	50 %	25 %	25 %	261855581
18338	NC_013422	CGA	2	6	1057366	1057371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855581
18339	NC_013422	TG	3	6	1057376	1057381	0 %	50 %	50 %	0 %	261855581
18340	NC_013422	CCG	2	6	1057429	1057434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855581
18341	NC_013422	TTG	2	6	1057457	1057462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855581
18342	NC_013422	CCG	2	6	1057483	1057488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855581
18343	NC_013422	TCT	2	6	1057635	1057640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855581
18344	NC_013422	GC	3	6	1057663	1057668	0 %	0 %	50 %	50 %	261855581
18345	NC_013422	ACG	2	6	1057671	1057676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855581
18346	NC_013422	ATG	2	6	1057716	1057721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855581
18347	NC_013422	TCA	2	6	1058028	1058033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855582
18348	NC_013422	TGA	2	6	1058112	1058117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855582
18349	NC_013422	TC	3	6	1058121	1058126	0 %	50 %	0 %	50 %	261855582
18350	NC_013422	CT	3	6	1058206	1058211	0 %	50 %	0 %	50 %	261855582
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18462	NC_013422	AATGA	2	10	1065703	1065712	60 %	20 %	20 %	0 %	261855591
18463	NC_013422	CAACTG	2	12	1065761	1065772	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	261855591
18464	NC_013422	GAT	2	6	1065773	1065778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855591
18465	NC_013422	TGGT	2	8	1065833	1065840	0 %	50 %	50 %	0 %	261855591
18466	NC_013422	GTTT	2	8	1065877	1065884	0 %	75 %	25 %	0 %	261855591
18467	NC_013422	CAT	2	6	1065908	1065913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855591
18468	NC_013422	TTGG	2	8	1065989	1065996	0 %	50 %	50 %	0 %	261855591
18469	NC_013422	TGG	2	6	1066010	1066015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855591
18470	NC_013422	ATG	2	6	1066021	1066026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855591
18471	NC_013422	TCA	2	6	1066033	1066038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855591
18472	NC_013422	T	6	6	1066097	1066102	0 %	100 %	0 %	0 %	261855591
18473	NC_013422	CATG	2	8	1066123	1066130	25 %	25 %	25 %	25 %	261855591
18474	NC_013422	TGC	2	6	1066234	1066239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855591
18475	NC_013422	TGC	2	6	1066245	1066250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855591
18476	NC_013422	CATG	2	8	1066288	1066295	25 %	25 %	25 %	25 %	261855591
18477	NC_013422	GCAA	2	8	1066309	1066316	50 %	0 %	25 %	25 %	261855591
18478	NC_013422	CAT	2	6	1066626	1066631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855592
18479	NC_013422	TTAA	2	8	1066633	1066640	50 %	50 %	0 %	0 %	261855592
18480	NC_013422	TCT	2	6	1066655	1066660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855592
18481	NC_013422	TCGT	2	8	1066680	1066687	0 %	50 %	25 %	25 %	261855592
18482	NC_013422	G	7	7	1066701	1066707	0 %	0 %	100 %	0 %	261855592
18483	NC_013422	ATG	2	6	1066712	1066717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855592
18484	NC_013422	AAG	2	6	1066754	1066759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855592
18485	NC_013422	TTTGA	2	10	1066921	1066930	20 %	60 %	20 %	0 %	261855592
18486	NC_013422	GCA	2	6	1067050	1067055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855592
18487	NC_013422	CAG	2	6	1067166	1067171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855593
18488	NC_013422	TTGAT	2	10	1067187	1067196	20 %	60 %	20 %	0 %	261855593
18489	NC_013422	CGA	2	6	1067201	1067206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855593
18490	NC_013422	GCAA	2	8	1067290	1067297	50 %	0 %	25 %	25 %	261855593
18491	NC_013422	TGG	2	6	1067355	1067360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855593
18492	NC_013422	GGTT	2	8	1067361	1067368	0 %	50 %	50 %	0 %	261855593
18493	NC_013422	TCG	2	6	1067371	1067376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855593
18494	NC_013422	GAG	2	6	1067444	1067449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261855593
18495	NC_013422	GTG	2	6	1067510	1067515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855593
18496	NC_013422	CGG	2	6	1067541	1067546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855593
18497	NC_013422	GAAT	2	8	1067776	1067783	50 %	25 %	25 %	0 %	261855593
18498	NC_013422	CT	3	6	1067795	1067800	0 %	50 %	0 %	50 %	261855593
18499	NC_013422	GAT	2	6	1067840	1067845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855593
18500	NC_013422	TCA	2	6	1067895	1067900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855593

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