MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 45067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_013422	TGC	2	6	1002235	1002240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855541
17502	NC_013422	TTGGC	2	10	1002248	1002257	0 %	40 %	40 %	20 %	261855541
17503	NC_013422	CCCG	2	8	1002349	1002356	0 %	0 %	25 %	75 %	261855541
17504	NC_013422	CAG	2	6	1002441	1002446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855541
17505	NC_013422	TCA	2	6	1002452	1002457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855541
17506	NC_013422	GTG	2	6	1002468	1002473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855541
17507	NC_013422	ATC	2	6	1002529	1002534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855541
17508	NC_013422	CAA	2	6	1002540	1002545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855541
17509	NC_013422	A	6	6	1002631	1002636	100 %	0 %	0 %	0 %	261855541
17510	NC_013422	GGA	2	6	1002793	1002798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261855542
17511	NC_013422	T	6	6	1002815	1002820	0 %	100 %	0 %	0 %	261855542
17512	NC_013422	TCA	2	6	1002916	1002921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855542
17513	NC_013422	T	6	6	1002926	1002931	0 %	100 %	0 %	0 %	261855542
17514	NC_013422	TGG	2	6	1002998	1003003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855542
17515	NC_013422	CATT	2	8	1003078	1003085	25 %	50 %	0 %	25 %	261855542
17516	NC_013422	TCG	2	6	1003102	1003107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855542
17517	NC_013422	CT	3	6	1003484	1003489	0 %	50 %	0 %	50 %	261855543
17518	NC_013422	TTG	2	6	1003531	1003536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855543
17519	NC_013422	GCC	2	6	1003649	1003654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855543
17520	NC_013422	ATGATT	2	12	1003702	1003713	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	261855543
17521	NC_013422	ATT	2	6	1003727	1003732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261855543
17522	NC_013422	TGA	2	6	1003742	1003747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855543
17523	NC_013422	ATTT	2	8	1003773	1003780	25 %	75 %	0 %	0 %	261855543
17524	NC_013422	TCAAC	2	10	1003806	1003815	40 %	20 %	0 %	40 %	261855543
17525	NC_013422	AAAT	2	8	1003889	1003896	75 %	25 %	0 %	0 %	261855543
17526	NC_013422	T	7	7	1003968	1003974	0 %	100 %	0 %	0 %	261855543
17527	NC_013422	TAATC	2	10	1004063	1004072	40 %	40 %	0 %	20 %	261855543
17528	NC_013422	TCA	2	6	1004184	1004189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855543
17529	NC_013422	AATA	2	8	1004192	1004199	75 %	25 %	0 %	0 %	261855543
17530	NC_013422	ATTT	2	8	1004201	1004208	25 %	75 %	0 %	0 %	261855543
17531	NC_013422	GGT	2	6	1004238	1004243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855543
17532	NC_013422	AT	3	6	1004274	1004279	50 %	50 %	0 %	0 %	261855543
17533	NC_013422	ATCA	2	8	1004314	1004321	50 %	25 %	0 %	25 %	261855543
17534	NC_013422	AGC	2	6	1004378	1004383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855543
17535	NC_013422	TGA	2	6	1004408	1004413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855543
17536	NC_013422	CGG	2	6	1004514	1004519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855543
17537	NC_013422	GCA	2	6	1004567	1004572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855544
17538	NC_013422	TTC	2	6	1004582	1004587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855544
17539	NC_013422	GTG	2	6	1004700	1004705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855544
17540	NC_013422	TC	3	6	1004718	1004723	0 %	50 %	0 %	50 %	261855544
17541	NC_013422	TAT	2	6	1004736	1004741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261855544
17542	NC_013422	GAT	2	6	1004759	1004764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855544
17543	NC_013422	TAA	2	6	1004779	1004784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261855544
17544	NC_013422	CA	3	6	1004791	1004796	50 %	0 %	0 %	50 %	261855544
17545	NC_013422	AC	3	6	1004801	1004806	50 %	0 %	0 %	50 %	261855544
17546	NC_013422	GCTAT	2	10	1004814	1004823	20 %	40 %	20 %	20 %	261855544
17547	NC_013422	TGA	2	6	1004836	1004841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855544
17548	NC_013422	ATTGA	2	10	1004958	1004967	40 %	40 %	20 %	0 %	261855545
17549	NC_013422	CAT	2	6	1004976	1004981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855545
17550	NC_013422	TCA	2	6	1005015	1005020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855545
17551	NC_013422	TCC	2	6	1005092	1005097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261855545
17552	NC_013422	GGTA	2	8	1005128	1005135	25 %	25 %	50 %	0 %	261855545
17553	NC_013422	TGC	2	6	1005165	1005170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855545
17554	NC_013422	TG	3	6	1005224	1005229	0 %	50 %	50 %	0 %	261855545
17555	NC_013422	CGTGC	2	10	1005237	1005246	0 %	20 %	40 %	40 %	261855545
17556	NC_013422	TCAT	2	8	1005347	1005354	25 %	50 %	0 %	25 %	261855545
17557	NC_013422	CTG	2	6	1005377	1005382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855545
17558	NC_013422	GGA	2	6	1005476	1005481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261855545
17559	NC_013422	CAC	2	6	1005528	1005533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855545
17560	NC_013422	GAT	2	6	1005574	1005579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855545
17561	NC_013422	GCA	2	6	1005720	1005725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855545
17562	NC_013422	ACC	2	6	1005731	1005736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855545
17563	NC_013422	TCGG	2	8	1005774	1005781	0 %	25 %	50 %	25 %	261855545
17564	NC_013422	GGC	2	6	1005789	1005794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855545
17565	NC_013422	AGT	2	6	1005828	1005833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855545
17566	NC_013422	GCG	2	6	1005853	1005858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855545
17567	NC_013422	GCTG	2	8	1005912	1005919	0 %	25 %	50 %	25 %	261855545
17568	NC_013422	TGG	2	6	1005945	1005950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855545
17569	NC_013422	TTTC	2	8	1006097	1006104	0 %	75 %	0 %	25 %	261855546
17570	NC_013422	TAT	2	6	1006168	1006173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261855546
17571	NC_013422	GCT	2	6	1006175	1006180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855546
17572	NC_013422	AAATGA	2	12	1006183	1006194	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	261855546
17573	NC_013422	TAG	2	6	1006198	1006203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855546
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17576	NC_013422	ACT	2	6	1007608	1007613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855547
17577	NC_013422	TGC	2	6	1007625	1007630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855547
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17581	NC_013422	CGG	2	6	1008075	1008080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855547
17582	NC_013422	GCA	2	6	1008269	1008274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855547
17583	NC_013422	ACCG	2	8	1008313	1008320	25 %	0 %	25 %	50 %	261855547
17584	NC_013422	CAC	2	6	1008330	1008335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855547
17585	NC_013422	GCC	2	6	1008367	1008372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855547
17586	NC_013422	CAGCTA	2	12	1008462	1008473	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	261855547
17587	NC_013422	CAG	2	6	1008543	1008548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855547
17588	NC_013422	CAC	2	6	1008642	1008647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855547
17589	NC_013422	CGGG	2	8	1008659	1008666	0 %	0 %	75 %	25 %	261855547
17590	NC_013422	CAG	2	6	1008667	1008672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855547
17591	NC_013422	GTC	2	6	1008728	1008733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855547
17592	NC_013422	CTG	2	6	1008775	1008780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855547
17593	NC_013422	CAG	2	6	1008817	1008822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855547
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17595	NC_013422	TGGCT	2	10	1008972	1008981	0 %	40 %	40 %	20 %	261855547
17596	NC_013422	GCCG	2	8	1008984	1008991	0 %	0 %	50 %	50 %	261855547
17597	NC_013422	CGAC	2	8	1008996	1009003	25 %	0 %	25 %	50 %	261855547
17598	NC_013422	TCA	2	6	1009037	1009042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855547
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17600	NC_013422	CGCC	2	8	1009091	1009098	0 %	0 %	25 %	75 %	261855547
17601	NC_013422	ACA	2	6	1009133	1009138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855547
17602	NC_013422	CAC	2	6	1009191	1009196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855547
17603	NC_013422	ACA	2	6	1009205	1009210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855547
17604	NC_013422	CAC	2	6	1009215	1009220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855547
17605	NC_013422	AAC	2	6	1009272	1009277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855547
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17613	NC_013422	CAG	2	6	1009714	1009719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855547
17614	NC_013422	CAA	3	9	1009728	1009736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855547
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17616	NC_013422	CGG	2	6	1009797	1009802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855547
17617	NC_013422	ACC	2	6	1009804	1009809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855547
17618	NC_013422	ATCA	2	8	1009837	1009844	50 %	25 %	0 %	25 %	261855547
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17629	NC_013422	AC	3	6	1010297	1010302	50 %	0 %	0 %	50 %	261855547
17630	NC_013422	CAC	2	6	1010331	1010336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855547
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17731	NC_013422	CAG	2	6	1015379	1015384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855549
17732	NC_013422	GAA	2	6	1015472	1015477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855550
17733	NC_013422	TTC	2	6	1015506	1015511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855550
17734	NC_013422	ATC	2	6	1015631	1015636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855551
17735	NC_013422	TCA	2	6	1015753	1015758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855551
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17737	NC_013422	CCA	2	6	1015946	1015951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855552
17738	NC_013422	GTC	2	6	1015961	1015966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855552
17739	NC_013422	ATC	2	6	1016090	1016095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855552
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17743	NC_013422	TCG	2	6	1016337	1016342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855552
17744	NC_013422	TGC	2	6	1016347	1016352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855552
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17747	NC_013422	TTC	2	6	1016555	1016560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855552
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17840	NC_013422	TCTGA	2	10	1027197	1027206	20 %	40 %	20 %	20 %	261855560
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17964	NC_013422	GGC	2	6	1033782	1033787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855561
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