MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 45067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_013422	CGA	2	6	974466	974471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855514
17003	NC_013422	GAT	2	6	974577	974582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855514
17004	NC_013422	AGCAG	2	10	974585	974594	40 %	0 %	40 %	20 %	261855514
17005	NC_013422	CTTG	2	8	974766	974773	0 %	50 %	25 %	25 %	261855514
17006	NC_013422	ACC	2	6	974845	974850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855514
17007	NC_013422	ATT	2	6	974884	974889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261855514
17008	NC_013422	TGC	2	6	974898	974903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855514
17009	NC_013422	GATG	2	8	974950	974957	25 %	25 %	50 %	0 %	261855514
17010	NC_013422	GATT	2	8	975045	975052	25 %	50 %	25 %	0 %	261855514
17011	NC_013422	GC	3	6	975115	975120	0 %	0 %	50 %	50 %	261855514
17012	NC_013422	TGA	2	6	975215	975220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855514
17013	NC_013422	GC	3	6	975224	975229	0 %	0 %	50 %	50 %	261855514
17014	NC_013422	CCA	2	6	975291	975296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855514
17015	NC_013422	CGG	2	6	975462	975467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855514
17016	NC_013422	ACC	2	6	975539	975544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855514
17017	NC_013422	A	6	6	975601	975606	100 %	0 %	0 %	0 %	261855514
17018	NC_013422	T	6	6	975715	975720	0 %	100 %	0 %	0 %	261855514
17019	NC_013422	TGA	2	6	975747	975752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855514
17020	NC_013422	CTT	2	6	975798	975803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855514
17021	NC_013422	GTT	2	6	975939	975944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855514
17022	NC_013422	GAA	2	6	975960	975965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855514
17023	NC_013422	TGT	2	6	975966	975971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855514
17024	NC_013422	CAT	2	6	976002	976007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855514
17025	NC_013422	CAT	2	6	976011	976016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855514
17026	NC_013422	CGG	2	6	976071	976076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855514
17027	NC_013422	AT	3	6	976088	976093	50 %	50 %	0 %	0 %	261855514
17028	NC_013422	GCA	2	6	976098	976103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855514
17029	NC_013422	TAG	2	6	976220	976225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855514
17030	NC_013422	CCT	2	6	976311	976316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261855514
17031	NC_013422	TCG	2	6	976328	976333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855514
17032	NC_013422	GAT	2	6	976345	976350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855514
17033	NC_013422	ATGC	2	8	976390	976397	25 %	25 %	25 %	25 %	261855514
17034	NC_013422	TGG	2	6	976457	976462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855514
17035	NC_013422	GTG	2	6	976538	976543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855514
17036	NC_013422	GTT	2	6	976659	976664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855514
17037	NC_013422	CAT	3	9	976686	976694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855514
17038	NC_013422	GC	4	8	976704	976711	0 %	0 %	50 %	50 %	261855514
17039	NC_013422	CCTT	2	8	976844	976851	0 %	50 %	0 %	50 %	261855514
17040	NC_013422	CGTG	2	8	976889	976896	0 %	25 %	50 %	25 %	261855514
17041	NC_013422	TGAA	2	8	976967	976974	50 %	25 %	25 %	0 %	261855514
17042	NC_013422	CAA	2	6	977101	977106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855515
17043	NC_013422	CAA	2	6	977122	977127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855515
17044	NC_013422	TGT	2	6	977135	977140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855515
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17046	NC_013422	CGG	2	6	977155	977160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855515
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17048	NC_013422	TGCC	2	8	977209	977216	0 %	25 %	25 %	50 %	261855515
17049	NC_013422	A	7	7	977294	977300	100 %	0 %	0 %	0 %	261855515
17050	NC_013422	AGC	2	6	977402	977407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855515
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17052	NC_013422	CTGG	2	8	977496	977503	0 %	25 %	50 %	25 %	261855515
17053	NC_013422	CGG	2	6	977509	977514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855515
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17056	NC_013422	GCAA	2	8	977667	977674	50 %	0 %	25 %	25 %	261855515
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17059	NC_013422	AGAA	2	8	977781	977788	75 %	0 %	25 %	0 %	261855515
17060	NC_013422	ACC	2	6	977825	977830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855516
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17062	NC_013422	AG	3	6	977927	977932	50 %	0 %	50 %	0 %	261855516
17063	NC_013422	GCT	2	6	977991	977996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855516
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17065	NC_013422	CTG	2	6	978065	978070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855516
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17085	NC_013422	AG	3	6	978840	978845	50 %	0 %	50 %	0 %	261855516
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17091	NC_013422	AAAG	2	8	979064	979071	75 %	0 %	25 %	0 %	261855516
17092	NC_013422	ATG	2	6	979078	979083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855516
17093	NC_013422	CGG	2	6	979124	979129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855516
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17102	NC_013422	ATC	2	6	979761	979766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855517
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17105	NC_013422	GTAA	2	8	979894	979901	50 %	25 %	25 %	0 %	261855517
17106	NC_013422	TCT	2	6	979913	979918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855517
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17108	NC_013422	TCA	2	6	980032	980037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855517
17109	NC_013422	TGC	3	9	980139	980147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855517
17110	NC_013422	CT	3	6	980148	980153	0 %	50 %	0 %	50 %	261855517
17111	NC_013422	T	6	6	980171	980176	0 %	100 %	0 %	0 %	261855517
17112	NC_013422	CTT	2	6	980177	980182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855517
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17114	NC_013422	CGA	2	6	980263	980268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855517
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17118	NC_013422	ACC	2	6	980455	980460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855517
17119	NC_013422	TCT	2	6	980483	980488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855517
17120	NC_013422	GTC	2	6	980497	980502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855517
17121	NC_013422	ATA	2	6	980544	980549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261855517
17122	NC_013422	CGT	2	6	980592	980597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855517
17123	NC_013422	TCA	2	6	980605	980610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855517
17124	NC_013422	CCG	2	6	980651	980656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855517
17125	NC_013422	GCA	2	6	980681	980686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855517
17126	NC_013422	TCA	2	6	980785	980790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855517
17127	NC_013422	TGC	2	6	980839	980844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855517
17128	NC_013422	TGC	2	6	980910	980915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855517
17129	NC_013422	GGGT	2	8	980947	980954	0 %	25 %	75 %	0 %	261855517
17130	NC_013422	TC	3	6	981020	981025	0 %	50 %	0 %	50 %	261855517
17131	NC_013422	GCA	2	6	981049	981054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855517
17132	NC_013422	GTTG	2	8	981062	981069	0 %	50 %	50 %	0 %	261855517
17133	NC_013422	TCC	2	6	981074	981079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261855517
17134	NC_013422	CG	3	6	981127	981132	0 %	0 %	50 %	50 %	261855517
17135	NC_013422	CG	3	6	981153	981158	0 %	0 %	50 %	50 %	261855517
17136	NC_013422	TTC	2	6	981175	981180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855517
17137	NC_013422	TGC	2	6	981213	981218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855517
17138	NC_013422	TGTT	2	8	981261	981268	0 %	75 %	25 %	0 %	261855517
17139	NC_013422	ATC	2	6	981285	981290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855517
17140	NC_013422	TCA	2	6	981319	981324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855517
17141	NC_013422	ACGG	2	8	981329	981336	25 %	0 %	50 %	25 %	261855517
17142	NC_013422	A	7	7	981378	981384	100 %	0 %	0 %	0 %	261855517
17143	NC_013422	GCG	2	6	981420	981425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855517
17144	NC_013422	CAA	2	6	981434	981439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855517
17145	NC_013422	TCGC	2	8	981453	981460	0 %	25 %	25 %	50 %	261855517
17146	NC_013422	GGC	2	6	981513	981518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855517
17147	NC_013422	TCGGT	2	10	981523	981532	0 %	40 %	40 %	20 %	261855517
17148	NC_013422	CGC	2	6	981559	981564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855517
17149	NC_013422	AAG	2	6	981609	981614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855517
17150	NC_013422	G	6	6	981629	981634	0 %	0 %	100 %	0 %	261855517
17151	NC_013422	AAAG	2	8	981658	981665	75 %	0 %	25 %	0 %	261855517
17152	NC_013422	TAA	2	6	981767	981772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261855517
17153	NC_013422	CAG	2	6	981780	981785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855517
17154	NC_013422	CTG	2	6	981794	981799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855517
17155	NC_013422	TAAC	2	8	981848	981855	50 %	25 %	0 %	25 %	261855517
17156	NC_013422	TCA	2	6	981856	981861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855517
17157	NC_013422	TTC	2	6	982005	982010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855517
17158	NC_013422	AATC	2	8	982058	982065	50 %	25 %	0 %	25 %	261855518
17159	NC_013422	ATC	2	6	982117	982122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855518
17160	NC_013422	CAG	2	6	982149	982154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855518
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17162	NC_013422	CCGT	2	8	982194	982201	0 %	25 %	25 %	50 %	261855518
17163	NC_013422	TGG	2	6	982233	982238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855518
17164	NC_013422	GC	3	6	982255	982260	0 %	0 %	50 %	50 %	261855518
17165	NC_013422	TGGC	2	8	982269	982276	0 %	25 %	50 %	25 %	261855518
17166	NC_013422	TCT	2	6	982334	982339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855518
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17168	NC_013422	TCA	2	6	982384	982389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855519
17169	NC_013422	CGT	2	6	982462	982467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855519
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17172	NC_013422	TGCG	2	8	982592	982599	0 %	25 %	50 %	25 %	261855519
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17182	NC_013422	GCA	2	6	983078	983083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855520
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17187	NC_013422	ATG	2	6	983685	983690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855521
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17189	NC_013422	GCA	2	6	983748	983753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855521
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17199	NC_013422	GCT	2	6	984264	984269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855522
17200	NC_013422	GACCA	2	10	984478	984487	40 %	0 %	20 %	40 %	261855523
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17202	NC_013422	CAC	2	6	984549	984554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855523
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17204	NC_013422	CCAA	2	8	984596	984603	50 %	0 %	0 %	50 %	261855523
17205	NC_013422	CGG	2	6	984612	984617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855523
17206	NC_013422	CTG	2	6	984696	984701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855523
17207	NC_013422	GAT	2	6	984775	984780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855524
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17209	NC_013422	TCC	2	6	984917	984922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261855524
17210	NC_013422	GAAC	2	8	984980	984987	50 %	0 %	25 %	25 %	261855524
17211	NC_013422	AAT	2	6	985023	985028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261855525
17212	NC_013422	TGC	2	6	985080	985085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855525
17213	NC_013422	CCTG	2	8	985145	985152	0 %	25 %	25 %	50 %	261855525
17214	NC_013422	GC	3	6	985154	985159	0 %	0 %	50 %	50 %	261855525
17215	NC_013422	TTG	2	6	985214	985219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855525
17216	NC_013422	TTCT	2	8	985390	985397	0 %	75 %	0 %	25 %	261855526
17217	NC_013422	AATCGG	2	12	985439	985450	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	261855526
17218	NC_013422	CACATC	2	12	985493	985504	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	261855526
17219	NC_013422	TTC	2	6	985514	985519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855526
17220	NC_013422	GTA	2	6	985538	985543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855526
17221	NC_013422	TCA	2	6	985566	985571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855526
17222	NC_013422	AT	3	6	985590	985595	50 %	50 %	0 %	0 %	261855526
17223	NC_013422	ACC	2	6	985631	985636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855526
17224	NC_013422	TAC	2	6	985646	985651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855526
17225	NC_013422	GTT	2	6	985670	985675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855526
17226	NC_013422	ACG	2	6	985697	985702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855526
17227	NC_013422	AAT	2	6	985775	985780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261855526
17228	NC_013422	TGT	2	6	985831	985836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855526
17229	NC_013422	A	6	6	985857	985862	100 %	0 %	0 %	0 %	261855526
17230	NC_013422	ATCCGT	2	12	985895	985906	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	261855526
17231	NC_013422	GCA	2	6	985943	985948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855526
17232	NC_013422	TCA	2	6	985978	985983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855526
17233	NC_013422	TGC	2	6	986006	986011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855526
17234	NC_013422	GT	3	6	986045	986050	0 %	50 %	50 %	0 %	261855526
17235	NC_013422	CGG	2	6	986136	986141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855526
17236	NC_013422	ATC	2	6	986168	986173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855526
17237	NC_013422	GAC	2	6	986263	986268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855526
17238	NC_013422	GAA	2	6	986315	986320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855526
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17346	NC_013422	TGAT	2	8	993122	993129	25 %	50 %	25 %	0 %	261855530
17347	NC_013422	TGA	2	6	993156	993161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855530
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17479	NC_013422	GCC	2	6	1001292	1001297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855539
17480	NC_013422	CAC	2	6	1001424	1001429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855540
17481	NC_013422	CTC	2	6	1001432	1001437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261855540
17482	NC_013422	CCA	2	6	1001503	1001508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855540
17483	NC_013422	CGC	2	6	1001525	1001530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855540
17484	NC_013422	T	6	6	1001571	1001576	0 %	100 %	0 %	0 %	261855540
17485	NC_013422	CCT	2	6	1001590	1001595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261855540
17486	NC_013422	GCG	2	6	1001601	1001606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855540
17487	NC_013422	T	7	7	1001636	1001642	0 %	100 %	0 %	0 %	261855540
17488	NC_013422	T	6	6	1001660	1001665	0 %	100 %	0 %	0 %	261855540
17489	NC_013422	AGAA	2	8	1001741	1001748	75 %	0 %	25 %	0 %	261855540
17490	NC_013422	TCA	2	6	1001772	1001777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855540
17491	NC_013422	AGG	2	6	1001803	1001808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261855540
17492	NC_013422	GCGACC	2	12	1001868	1001879	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	261855540
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17494	NC_013422	CTT	2	6	1002016	1002021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855541
17495	NC_013422	TGA	2	6	1002036	1002041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855541
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17497	NC_013422	GAA	2	6	1002114	1002119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855541
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