MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 45067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_013422	GTGA	2	8	919332	919339	25 %	25 %	50 %	0 %	261855457
16002	NC_013422	ATA	2	6	919405	919410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261855457
16003	NC_013422	CGA	2	6	919439	919444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855457
16004	NC_013422	CGG	2	6	919637	919642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855457
16005	NC_013422	CCG	2	6	919684	919689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855457
16006	NC_013422	ATG	2	6	919720	919725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855457
16007	NC_013422	CGG	2	6	919727	919732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855457
16008	NC_013422	CGGG	2	8	919735	919742	0 %	0 %	75 %	25 %	261855457
16009	NC_013422	GTG	2	6	919814	919819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855458
16010	NC_013422	TGG	2	6	919833	919838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855458
16011	NC_013422	CGG	2	6	919855	919860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855458
16012	NC_013422	TCA	2	6	919897	919902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855458
16013	NC_013422	CCGC	2	8	920089	920096	0 %	0 %	25 %	75 %	261855458
16014	NC_013422	GCC	2	6	920105	920110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855458
16015	NC_013422	CCGT	2	8	920139	920146	0 %	25 %	25 %	50 %	261855458
16016	NC_013422	CTG	2	6	920180	920185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855458
16017	NC_013422	AGCG	3	12	920218	920229	25 %	0 %	50 %	25 %	261855458
16018	NC_013422	TGGT	2	8	920231	920238	0 %	50 %	50 %	0 %	261855458
16019	NC_013422	TTC	2	6	920303	920308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855458
16020	NC_013422	GC	3	6	920343	920348	0 %	0 %	50 %	50 %	261855458
16021	NC_013422	TTTC	2	8	920393	920400	0 %	75 %	0 %	25 %	261855458
16022	NC_013422	TTCT	2	8	920426	920433	0 %	75 %	0 %	25 %	261855458
16023	NC_013422	GTC	2	6	920595	920600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855458
16024	NC_013422	CAT	2	6	920624	920629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855458
16025	NC_013422	CAC	2	6	920665	920670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855458
16026	NC_013422	TG	4	8	920737	920744	0 %	50 %	50 %	0 %	261855458
16027	NC_013422	ATG	2	6	920745	920750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855458
16028	NC_013422	TCG	2	6	920802	920807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855458
16029	NC_013422	TCG	2	6	920838	920843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855458
16030	NC_013422	GCT	2	6	920872	920877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855458
16031	NC_013422	TGA	2	6	920878	920883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855458
16032	NC_013422	CTC	2	6	920975	920980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261855458
16033	NC_013422	CTT	2	6	920987	920992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855458
16034	NC_013422	ATGCCG	2	12	921084	921095	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	261855458
16035	NC_013422	TTGA	2	8	921137	921144	25 %	50 %	25 %	0 %	261855458
16036	NC_013422	GT	3	6	921166	921171	0 %	50 %	50 %	0 %	261855458
16037	NC_013422	CGG	2	6	921244	921249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855458
16038	NC_013422	ACA	2	6	921279	921284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855458
16039	NC_013422	GAT	2	6	921308	921313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855458
16040	NC_013422	GAT	2	6	921397	921402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855459
16041	NC_013422	CGC	2	6	921432	921437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855459
16042	NC_013422	CCA	2	6	921447	921452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855459
16043	NC_013422	TGA	2	6	921467	921472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855459
16044	NC_013422	CAG	2	6	921508	921513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855459
16045	NC_013422	GTG	2	6	921548	921553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855459
16046	NC_013422	GAT	2	6	921664	921669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855459
16047	NC_013422	GAT	2	6	921700	921705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855459
16048	NC_013422	GCC	2	6	921946	921951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855459
16049	NC_013422	GAT	2	6	921979	921984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855459
16050	NC_013422	T	6	6	921998	922003	0 %	100 %	0 %	0 %	261855459
16051	NC_013422	GAAT	2	8	922047	922054	50 %	25 %	25 %	0 %	261855459
16052	NC_013422	GCTCA	2	10	922108	922117	20 %	20 %	20 %	40 %	261855460
16053	NC_013422	TTCC	2	8	922136	922143	0 %	50 %	0 %	50 %	261855460
16054	NC_013422	GTC	2	6	922151	922156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855460
16055	NC_013422	AGGGC	2	10	922185	922194	20 %	0 %	60 %	20 %	261855460
16056	NC_013422	CGC	2	6	922255	922260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855460
16057	NC_013422	AGC	2	6	922284	922289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855460
16058	NC_013422	GC	3	6	922303	922308	0 %	0 %	50 %	50 %	261855460
16059	NC_013422	ATG	2	6	922331	922336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855460
16060	NC_013422	GTA	2	6	922375	922380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855460
16061	NC_013422	CCG	2	6	922397	922402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855460
16062	NC_013422	CCG	2	6	922418	922423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855460
16063	NC_013422	GC	4	8	922469	922476	0 %	0 %	50 %	50 %	261855460
16064	NC_013422	GCA	2	6	922542	922547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855460
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16068	NC_013422	TGA	2	6	923042	923047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855461
16069	NC_013422	CT	3	6	923059	923064	0 %	50 %	0 %	50 %	261855461
16070	NC_013422	A	6	6	923071	923076	100 %	0 %	0 %	0 %	261855461
16071	NC_013422	AAGG	2	8	923088	923095	50 %	0 %	50 %	0 %	261855461
16072	NC_013422	CGC	2	6	923187	923192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855461
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16082	NC_013422	CG	3	6	923439	923444	0 %	0 %	50 %	50 %	261855461
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16087	NC_013422	GCT	2	6	923667	923672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855461
16088	NC_013422	CAGC	2	8	923703	923710	25 %	0 %	25 %	50 %	261855461
16089	NC_013422	CCG	2	6	923848	923853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855461
16090	NC_013422	ATCATG	2	12	923854	923865	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	261855461
16091	NC_013422	ACC	2	6	923958	923963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855461
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16101	NC_013422	AC	3	6	924586	924591	50 %	0 %	0 %	50 %	261855462
16102	NC_013422	CGG	2	6	924601	924606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855462
16103	NC_013422	GAT	2	6	924611	924616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855462
16104	NC_013422	ACG	2	6	924645	924650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855462
16105	NC_013422	GATC	2	8	924661	924668	25 %	25 %	25 %	25 %	261855462
16106	NC_013422	CGAC	2	8	924748	924755	25 %	0 %	25 %	50 %	261855462
16107	NC_013422	T	6	6	924827	924832	0 %	100 %	0 %	0 %	261855462
16108	NC_013422	TCA	2	6	924879	924884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855462
16109	NC_013422	GAA	2	6	924893	924898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855462
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16111	NC_013422	TTGC	2	8	925051	925058	0 %	50 %	25 %	25 %	261855462
16112	NC_013422	CTT	2	6	925096	925101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855462
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16116	NC_013422	TGTT	2	8	925321	925328	0 %	75 %	25 %	0 %	261855462
16117	NC_013422	TTC	2	6	925446	925451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855463
16118	NC_013422	GA	3	6	925684	925689	50 %	0 %	50 %	0 %	261855463
16119	NC_013422	T	6	6	925805	925810	0 %	100 %	0 %	0 %	261855463
16120	NC_013422	CCT	2	6	925945	925950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261855463
16121	NC_013422	GAA	2	6	926015	926020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855463
16122	NC_013422	GCT	2	6	926157	926162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855463
16123	NC_013422	AGC	3	9	926219	926227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855463
16124	NC_013422	CGA	2	6	926250	926255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855463
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16129	NC_013422	GCT	2	6	926853	926858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855464
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16131	NC_013422	TAC	2	6	926944	926949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855464
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16150	NC_013422	AATC	2	8	927858	927865	50 %	25 %	0 %	25 %	261855465
16151	NC_013422	CGCC	2	8	927996	928003	0 %	0 %	25 %	75 %	261855465
16152	NC_013422	CGA	2	6	928120	928125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855465
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16174	NC_013422	TGC	2	6	929315	929320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855467
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16232	NC_013422	GCG	2	6	931878	931883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855468
16233	NC_013422	GC	3	6	931889	931894	0 %	0 %	50 %	50 %	261855468
16234	NC_013422	CGGCAA	2	12	931912	931923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855468
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16239	NC_013422	CATG	2	8	932269	932276	25 %	25 %	25 %	25 %	261855468
16240	NC_013422	CTG	3	9	932322	932330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855469
16241	NC_013422	CTT	2	6	932340	932345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855469
16242	NC_013422	CAA	2	6	932346	932351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855469
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16244	NC_013422	CGG	3	9	932429	932437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855469
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16351	NC_013422	TGC	2	6	937712	937717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855474
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16355	NC_013422	GCAG	2	8	937912	937919	25 %	0 %	50 %	25 %	261855475
16356	NC_013422	CAAT	2	8	937951	937958	50 %	25 %	0 %	25 %	261855475
16357	NC_013422	CGC	2	6	937969	937974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855475
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16360	NC_013422	GTC	2	6	938129	938134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855475
16361	NC_013422	GAA	2	6	938147	938152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855475
16362	NC_013422	GCG	2	6	938234	938239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855475
16363	NC_013422	TGCC	2	8	938410	938417	0 %	25 %	25 %	50 %	261855475
16364	NC_013422	TGC	2	6	938494	938499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855475
16365	NC_013422	GTG	2	6	938546	938551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855475
16366	NC_013422	GCA	2	6	938631	938636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855475
16367	NC_013422	GAC	3	9	938639	938647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855475
16368	NC_013422	GAC	2	6	938677	938682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855475
16369	NC_013422	GGC	2	6	938689	938694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855475
16370	NC_013422	GTG	2	6	938706	938711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855475
16371	NC_013422	ACC	2	6	938733	938738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855475
16372	NC_013422	AGCA	2	8	938784	938791	50 %	0 %	25 %	25 %	261855475
16373	NC_013422	AGCGG	2	10	938828	938837	20 %	0 %	60 %	20 %	261855475
16374	NC_013422	TGT	2	6	938880	938885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855475
16375	NC_013422	ATTG	2	8	938968	938975	25 %	50 %	25 %	0 %	261855475
16376	NC_013422	CTG	2	6	939003	939008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855475
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16379	NC_013422	TTG	2	6	939178	939183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855476
16380	NC_013422	AGCC	2	8	939184	939191	25 %	0 %	25 %	50 %	261855476
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16392	NC_013422	TGG	2	6	940080	940085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855477
16393	NC_013422	A	8	8	940121	940128	100 %	0 %	0 %	0 %	261855477
16394	NC_013422	GCA	2	6	940139	940144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855477
16395	NC_013422	TTCT	2	8	940224	940231	0 %	75 %	0 %	25 %	261855477
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16399	NC_013422	GTC	2	6	940383	940388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855477
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16449	NC_013422	GATC	2	8	943964	943971	25 %	25 %	25 %	25 %	261855481
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16462	NC_013422	GCCC	2	8	944828	944835	0 %	0 %	25 %	75 %	261855482
16463	NC_013422	TCGA	2	8	944880	944887	25 %	25 %	25 %	25 %	261855482
16464	NC_013422	GCC	3	9	944908	944916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855482
16465	NC_013422	CACTT	2	10	945039	945048	20 %	40 %	0 %	40 %	261855482
16466	NC_013422	CCGAT	2	10	945079	945088	20 %	20 %	20 %	40 %	261855482
16467	NC_013422	CCA	2	6	945091	945096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855482
16468	NC_013422	CGA	2	6	945185	945190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855482
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16470	NC_013422	GTG	2	6	945772	945777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855483
16471	NC_013422	GCC	2	6	945803	945808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855483
16472	NC_013422	CGT	2	6	945884	945889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855483
16473	NC_013422	AAG	2	6	945955	945960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855483
16474	NC_013422	T	6	6	945969	945974	0 %	100 %	0 %	0 %	261855483
16475	NC_013422	ATC	2	6	946005	946010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855483
16476	NC_013422	GAT	2	6	946022	946027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855483
16477	NC_013422	GCC	2	6	946036	946041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855484
16478	NC_013422	CTA	2	6	946094	946099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855484
16479	NC_013422	CCAA	2	8	946115	946122	50 %	0 %	0 %	50 %	261855484
16480	NC_013422	TTCG	2	8	946162	946169	0 %	50 %	25 %	25 %	261855484
16481	NC_013422	AT	3	6	946284	946289	50 %	50 %	0 %	0 %	261855484
16482	NC_013422	GAC	2	6	946309	946314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855484
16483	NC_013422	GCA	2	6	946327	946332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855484
16484	NC_013422	TCA	2	6	946343	946348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855484
16485	NC_013422	TGT	2	6	946454	946459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855484
16486	NC_013422	TTGG	2	8	946486	946493	0 %	50 %	50 %	0 %	261855484
16487	NC_013422	CAT	2	6	946500	946505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855484
16488	NC_013422	TGA	2	6	946613	946618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855484
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16490	NC_013422	GCA	2	6	946654	946659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855484
16491	NC_013422	CGC	2	6	946688	946693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855484
16492	NC_013422	TA	3	6	946785	946790	50 %	50 %	0 %	0 %	261855484
16493	NC_013422	CAGG	2	8	946829	946836	25 %	0 %	50 %	25 %	261855484
16494	NC_013422	CCGT	2	8	946863	946870	0 %	25 %	25 %	50 %	261855484
16495	NC_013422	TCG	2	6	947546	947551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855485
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16500	NC_013422	TGA	2	6	947736	947741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855485

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