MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 45067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_013422	TGT	2	6	893464	893469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855432
15502	NC_013422	GCAGA	2	10	893530	893539	40 %	0 %	40 %	20 %	261855432
15503	NC_013422	TTCA	2	8	893558	893565	25 %	50 %	0 %	25 %	261855432
15504	NC_013422	T	6	6	893601	893606	0 %	100 %	0 %	0 %	261855433
15505	NC_013422	CG	3	6	893774	893779	0 %	0 %	50 %	50 %	261855433
15506	NC_013422	CGC	2	6	893789	893794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855433
15507	NC_013422	GCG	2	6	893797	893802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855433
15508	NC_013422	TGCC	2	8	893832	893839	0 %	25 %	25 %	50 %	261855433
15509	NC_013422	TCT	2	6	893857	893862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855433
15510	NC_013422	TTC	2	6	893961	893966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855433
15511	NC_013422	ATG	2	6	894022	894027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855433
15512	NC_013422	GAA	2	6	894123	894128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855433
15513	NC_013422	CAC	2	6	894167	894172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855433
15514	NC_013422	T	6	6	894180	894185	0 %	100 %	0 %	0 %	261855433
15515	NC_013422	GC	3	6	894229	894234	0 %	0 %	50 %	50 %	261855433
15516	NC_013422	ATT	2	6	894243	894248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261855433
15517	NC_013422	CAA	2	6	894308	894313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855433
15518	NC_013422	CAG	2	6	894435	894440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855433
15519	NC_013422	TTG	2	6	894486	894491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855434
15520	NC_013422	TGGT	2	8	894493	894500	0 %	50 %	50 %	0 %	261855434
15521	NC_013422	GT	3	6	894499	894504	0 %	50 %	50 %	0 %	261855434
15522	NC_013422	GAA	2	6	894515	894520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855434
15523	NC_013422	GTA	2	6	894536	894541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855434
15524	NC_013422	GCCC	2	8	894598	894605	0 %	0 %	25 %	75 %	261855434
15525	NC_013422	CGA	2	6	894616	894621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855434
15526	NC_013422	GAT	2	6	894664	894669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855434
15527	NC_013422	GTG	2	6	894690	894695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855434
15528	NC_013422	CGC	2	6	894719	894724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855434
15529	NC_013422	GTA	2	6	894728	894733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855434
15530	NC_013422	CCT	2	6	894769	894774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261855434
15531	NC_013422	T	6	6	894781	894786	0 %	100 %	0 %	0 %	261855434
15532	NC_013422	GTTG	2	8	894830	894837	0 %	50 %	50 %	0 %	261855434
15533	NC_013422	GCG	2	6	894875	894880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855434
15534	NC_013422	ATG	2	6	894906	894911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855434
15535	NC_013422	GCG	2	6	894912	894917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855434
15536	NC_013422	TCTGC	2	10	894934	894943	0 %	40 %	20 %	40 %	261855434
15537	NC_013422	TTGA	2	8	894962	894969	25 %	50 %	25 %	0 %	261855434
15538	NC_013422	CGC	2	6	895018	895023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855434
15539	NC_013422	TGT	2	6	895039	895044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855434
15540	NC_013422	GCCTT	2	10	895047	895056	0 %	40 %	20 %	40 %	261855434
15541	NC_013422	GCG	2	6	895108	895113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855434
15542	NC_013422	CG	3	6	895112	895117	0 %	0 %	50 %	50 %	261855434
15543	NC_013422	GTC	2	6	895130	895135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855434
15544	NC_013422	CGGT	2	8	895239	895246	0 %	25 %	50 %	25 %	261855434
15545	NC_013422	TGCAC	2	10	895275	895284	20 %	20 %	20 %	40 %	261855434
15546	NC_013422	GTC	2	6	895322	895327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855434
15547	NC_013422	GGT	2	6	895332	895337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855434
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15549	NC_013422	GTG	2	6	895461	895466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855434
15550	NC_013422	GAAA	2	8	895544	895551	75 %	0 %	25 %	0 %	261855434
15551	NC_013422	CAA	2	6	895684	895689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855434
15552	NC_013422	TCA	2	6	895738	895743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855434
15553	NC_013422	TAG	2	6	895750	895755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855434
15554	NC_013422	GGC	2	6	895886	895891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855434
15555	NC_013422	TGT	2	6	895893	895898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855434
15556	NC_013422	CGA	2	6	895900	895905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855434
15557	NC_013422	TGC	2	6	895970	895975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855434
15558	NC_013422	T	7	7	896026	896032	0 %	100 %	0 %	0 %	261855434
15559	NC_013422	TTC	2	6	896114	896119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855434
15560	NC_013422	GAC	2	6	896164	896169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855434
15561	NC_013422	ATC	2	6	896199	896204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855434
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15564	NC_013422	AAG	2	6	896267	896272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855435
15565	NC_013422	GGGT	2	8	896291	896298	0 %	25 %	75 %	0 %	261855435
15566	NC_013422	GCA	2	6	896313	896318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855435
15567	NC_013422	CGG	2	6	896358	896363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855435
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15569	NC_013422	GCA	2	6	896390	896395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855435
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15571	NC_013422	CGGCG	2	10	896488	896497	0 %	0 %	60 %	40 %	261855435
15572	NC_013422	GTA	2	6	896502	896507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855435
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15576	NC_013422	GAT	2	6	896933	896938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855436
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15579	NC_013422	CCACG	2	10	897128	897137	20 %	0 %	20 %	60 %	261855436
15580	NC_013422	AACG	2	8	897140	897147	50 %	0 %	25 %	25 %	261855436
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15584	NC_013422	AATCC	2	10	897476	897485	40 %	20 %	0 %	40 %	261855436
15585	NC_013422	ACC	2	6	897502	897507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855436
15586	NC_013422	CG	3	6	897554	897559	0 %	0 %	50 %	50 %	261855436
15587	NC_013422	CAT	2	6	897680	897685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855436
15588	NC_013422	GCG	2	6	897687	897692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855436
15589	NC_013422	GTC	2	6	897822	897827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855436
15590	NC_013422	TGT	2	6	897860	897865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855436
15591	NC_013422	ACG	2	6	897922	897927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855436
15592	NC_013422	CATC	2	8	898007	898014	25 %	25 %	0 %	50 %	261855436
15593	NC_013422	ACG	2	6	898018	898023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855436
15594	NC_013422	CGA	2	6	898028	898033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855436
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15598	NC_013422	GAC	2	6	898104	898109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855436
15599	NC_013422	GAC	2	6	898139	898144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855436
15600	NC_013422	CGG	2	6	898229	898234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855436
15601	NC_013422	GAT	2	6	898242	898247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855436
15602	NC_013422	ATG	2	6	898270	898275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855436
15603	NC_013422	TTG	2	6	898282	898287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855436
15604	NC_013422	GCC	3	9	898335	898343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855436
15605	NC_013422	CCG	2	6	898442	898447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855436
15606	NC_013422	TGTCCA	2	12	898529	898540	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	261855436
15607	NC_013422	CCA	2	6	898571	898576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855436
15608	NC_013422	AAC	2	6	898585	898590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855436
15609	NC_013422	GCC	2	6	898620	898625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855436
15610	NC_013422	CGG	2	6	898673	898678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855436
15611	NC_013422	CAG	2	6	898842	898847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855436
15612	NC_013422	TGAG	2	8	898860	898867	25 %	25 %	50 %	0 %	261855436
15613	NC_013422	GCTT	2	8	898920	898927	0 %	50 %	25 %	25 %	261855436
15614	NC_013422	CTG	2	6	898938	898943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855436
15615	NC_013422	CG	3	6	899017	899022	0 %	0 %	50 %	50 %	261855436
15616	NC_013422	GCT	2	6	899029	899034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855436
15617	NC_013422	CA	3	6	899043	899048	50 %	0 %	0 %	50 %	261855436
15618	NC_013422	CTTG	2	8	899099	899106	0 %	50 %	25 %	25 %	261855436
15619	NC_013422	T	6	6	899126	899131	0 %	100 %	0 %	0 %	261855436
15620	NC_013422	TGA	2	6	899282	899287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855437
15621	NC_013422	TCA	2	6	899408	899413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855437
15622	NC_013422	GCT	2	6	900237	900242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855438
15623	NC_013422	AGC	2	6	900279	900284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855438
15624	NC_013422	CTG	2	6	900297	900302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855438
15625	NC_013422	CAT	2	6	900320	900325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855438
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15627	NC_013422	CAT	2	6	900352	900357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855438
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15734	NC_013422	GGCA	2	8	906425	906432	25 %	0 %	50 %	25 %	261855443
15735	NC_013422	GAA	2	6	906450	906455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855443
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15739	NC_013422	CGG	2	6	906647	906652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855443
15740	NC_013422	ATG	2	6	906723	906728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855443
15741	NC_013422	GCA	2	6	906740	906745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855443
15742	NC_013422	TGA	2	6	906890	906895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855444
15743	NC_013422	TCG	2	6	906914	906919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855444
15744	NC_013422	CTGG	2	8	906954	906961	0 %	25 %	50 %	25 %	261855444
15745	NC_013422	GGC	2	6	907033	907038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855444
15746	NC_013422	CGCC	2	8	907067	907074	0 %	0 %	25 %	75 %	261855444
15747	NC_013422	TGC	2	6	907088	907093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855444
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15749	NC_013422	CTG	2	6	907229	907234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855444
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15752	NC_013422	ATC	2	6	907441	907446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855444
15753	NC_013422	A	7	7	907454	907460	100 %	0 %	0 %	0 %	261855444
15754	NC_013422	GCC	2	6	907488	907493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855444
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15758	NC_013422	TGC	2	6	907619	907624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855444
15759	NC_013422	TTC	2	6	907663	907668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855444
15760	NC_013422	TTCCTG	2	12	907696	907707	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	261855444
15761	NC_013422	GCATT	2	10	907824	907833	20 %	40 %	20 %	20 %	261855444
15762	NC_013422	AACC	2	8	907850	907857	50 %	0 %	0 %	50 %	261855444
15763	NC_013422	CGCCC	2	10	907872	907881	0 %	0 %	20 %	80 %	261855444
15764	NC_013422	AGCCA	2	10	908043	908052	40 %	0 %	20 %	40 %	261855444
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15767	NC_013422	TGATC	2	10	908108	908117	20 %	40 %	20 %	20 %	261855445
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15771	NC_013422	TCA	2	6	908257	908262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855445
15772	NC_013422	GCCA	2	8	908457	908464	25 %	0 %	25 %	50 %	261855445
15773	NC_013422	ATCA	2	8	908485	908492	50 %	25 %	0 %	25 %	261855445
15774	NC_013422	TGGT	2	8	908570	908577	0 %	50 %	50 %	0 %	261855445
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15853	NC_013422	TTG	2	6	912652	912657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855449
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15858	NC_013422	TGG	2	6	912926	912931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855449
15859	NC_013422	GGGCAT	2	12	912978	912989	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	261855449
15860	NC_013422	TGC	2	6	913016	913021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855449
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15870	NC_013422	TC	3	6	913545	913550	0 %	50 %	0 %	50 %	261855450
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15963	NC_013422	CAAG	2	8	917735	917742	50 %	0 %	25 %	25 %	261855455
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15977	NC_013422	CGTGT	2	10	918439	918448	0 %	40 %	40 %	20 %	261855455
15978	NC_013422	GGT	2	6	918486	918491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855455
15979	NC_013422	CGTAGG	2	12	918497	918508	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	261855455
15980	NC_013422	TGCC	2	8	918524	918531	0 %	25 %	25 %	50 %	261855455
15981	NC_013422	ACC	2	6	918537	918542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855455
15982	NC_013422	TTG	2	6	918556	918561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855455
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15985	NC_013422	CAGC	2	8	918671	918678	25 %	0 %	25 %	50 %	261855455
15986	NC_013422	GCC	2	6	918698	918703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855455
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16000	NC_013422	CAG	2	6	919326	919331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855457

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