MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 45067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_013422	A	6	6	862787	862792	100 %	0 %	0 %	0 %	261855409
15002	NC_013422	GAC	3	9	862832	862840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855409
15003	NC_013422	CA	3	6	862917	862922	50 %	0 %	0 %	50 %	261855409
15004	NC_013422	AGG	2	6	862933	862938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261855409
15005	NC_013422	GGT	2	6	862990	862995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855410
15006	NC_013422	TCA	2	6	863013	863018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855410
15007	NC_013422	TCTGGA	2	12	863050	863061	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	261855410
15008	NC_013422	CTG	2	6	863174	863179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855410
15009	NC_013422	GCGG	2	8	863226	863233	0 %	0 %	75 %	25 %	261855410
15010	NC_013422	GCG	2	6	863247	863252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855410
15011	NC_013422	GAA	2	6	863348	863353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855410
15012	NC_013422	T	6	6	863392	863397	0 %	100 %	0 %	0 %	261855410
15013	NC_013422	GTTGA	2	10	863468	863477	20 %	40 %	40 %	0 %	261855410
15014	NC_013422	CAA	2	6	863524	863529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855410
15015	NC_013422	ATT	2	6	863754	863759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261855411
15016	NC_013422	GAA	2	6	863768	863773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855411
15017	NC_013422	CGA	2	6	863840	863845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855411
15018	NC_013422	AG	3	6	863876	863881	50 %	0 %	50 %	0 %	261855411
15019	NC_013422	GCA	2	6	864026	864031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855411
15020	NC_013422	AC	3	6	864053	864058	50 %	0 %	0 %	50 %	261855411
15021	NC_013422	CG	4	8	864059	864066	0 %	0 %	50 %	50 %	261855411
15022	NC_013422	A	7	7	864076	864082	100 %	0 %	0 %	0 %	261855411
15023	NC_013422	TTG	2	6	864093	864098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855411
15024	NC_013422	CGG	2	6	864181	864186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855411
15025	NC_013422	GGC	2	6	864192	864197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855411
15026	NC_013422	GCG	2	6	864474	864479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855411
15027	NC_013422	ACG	2	6	864535	864540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855411
15028	NC_013422	GCG	2	6	864549	864554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855411
15029	NC_013422	GTGGA	2	10	864630	864639	20 %	20 %	60 %	0 %	261855411
15030	NC_013422	GGC	2	6	864650	864655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855411
15031	NC_013422	CGT	2	6	864676	864681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855411
15032	NC_013422	CGC	2	6	864691	864696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855411
15033	NC_013422	CGT	2	6	864776	864781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855411
15034	NC_013422	CTA	2	6	864854	864859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855411
15035	NC_013422	ATC	2	6	864879	864884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855411
15036	NC_013422	CAG	2	6	865017	865022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855411
15037	NC_013422	ACC	2	6	865023	865028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855411
15038	NC_013422	TGT	2	6	865072	865077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855411
15039	NC_013422	GGTCG	2	10	865113	865122	0 %	20 %	60 %	20 %	261855411
15040	NC_013422	GCC	2	6	865142	865147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855411
15041	NC_013422	TGG	2	6	865192	865197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855411
15042	NC_013422	CGC	2	6	865211	865216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855411
15043	NC_013422	ACC	2	6	865266	865271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855411
15044	NC_013422	GC	4	8	865285	865292	0 %	0 %	50 %	50 %	261855411
15045	NC_013422	CTCAAG	2	12	865362	865373	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	261855411
15046	NC_013422	GCG	2	6	865384	865389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855411
15047	NC_013422	GCG	2	6	865428	865433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855411
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15049	NC_013422	CGG	2	6	865475	865480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855411
15050	NC_013422	CAC	2	6	865535	865540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855411
15051	NC_013422	GC	3	6	865627	865632	0 %	0 %	50 %	50 %	261855411
15052	NC_013422	CGA	3	9	865646	865654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855411
15053	NC_013422	TTC	2	6	865665	865670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855411
15054	NC_013422	GCGT	2	8	865711	865718	0 %	25 %	50 %	25 %	261855411
15055	NC_013422	GGC	2	6	865755	865760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855411
15056	NC_013422	CGG	2	6	865868	865873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855411
15057	NC_013422	CAT	2	6	865892	865897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855411
15058	NC_013422	CGC	2	6	866044	866049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855411
15059	NC_013422	CGG	2	6	866053	866058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855411
15060	NC_013422	TC	3	6	866068	866073	0 %	50 %	0 %	50 %	261855411
15061	NC_013422	GGCG	2	8	866129	866136	0 %	0 %	75 %	25 %	261855411
15062	NC_013422	TTG	2	6	866145	866150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855411
15063	NC_013422	CTCGAT	2	12	866172	866183	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	261855411
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15066	NC_013422	GCA	2	6	866327	866332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855411
15067	NC_013422	TGA	2	6	866357	866362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855411
15068	NC_013422	GTG	2	6	866468	866473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855411
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15079	NC_013422	GCC	2	6	866955	866960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855411
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15093	NC_013422	GCAC	2	8	867729	867736	25 %	0 %	25 %	50 %	261855412
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15102	NC_013422	GCG	2	6	868140	868145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855412
15103	NC_013422	GC	3	6	868153	868158	0 %	0 %	50 %	50 %	261855412
15104	NC_013422	CGC	2	6	868182	868187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855412
15105	NC_013422	GT	3	6	868191	868196	0 %	50 %	50 %	0 %	261855412
15106	NC_013422	ATG	2	6	868277	868282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855412
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15109	NC_013422	TGAA	2	8	868341	868348	50 %	25 %	25 %	0 %	261855412
15110	NC_013422	GGC	2	6	868375	868380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855412
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15117	NC_013422	GC	4	8	868774	868781	0 %	0 %	50 %	50 %	261855412
15118	NC_013422	TAT	2	6	868798	868803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261855412
15119	NC_013422	GCTCG	2	10	868804	868813	0 %	20 %	40 %	40 %	261855412
15120	NC_013422	GAGC	2	8	868880	868887	25 %	0 %	50 %	25 %	261855412
15121	NC_013422	GGC	2	6	868894	868899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855412
15122	NC_013422	GCG	2	6	868944	868949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855412
15123	NC_013422	GAT	2	6	868958	868963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855412
15124	NC_013422	TGC	2	6	868969	868974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855412
15125	NC_013422	CGGG	2	8	868995	869002	0 %	0 %	75 %	25 %	261855412
15126	NC_013422	TGT	2	6	869046	869051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855412
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15132	NC_013422	GC	3	6	869339	869344	0 %	0 %	50 %	50 %	261855412
15133	NC_013422	TCG	2	6	869349	869354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855412
15134	NC_013422	CGT	2	6	869407	869412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855412
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15138	NC_013422	GAGC	2	8	869612	869619	25 %	0 %	50 %	25 %	261855412
15139	NC_013422	GCC	2	6	869632	869637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855412
15140	NC_013422	GTGC	2	8	869639	869646	0 %	25 %	50 %	25 %	261855412
15141	NC_013422	GGC	2	6	869647	869652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855412
15142	NC_013422	AG	3	6	869690	869695	50 %	0 %	50 %	0 %	261855412
15143	NC_013422	CTG	2	6	869696	869701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855412
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15147	NC_013422	CGGC	2	8	870113	870120	0 %	0 %	50 %	50 %	261855413
15148	NC_013422	GTG	2	6	870145	870150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855413
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15150	NC_013422	CAT	2	6	870233	870238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855413
15151	NC_013422	GGC	2	6	870242	870247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855413
15152	NC_013422	CGAT	2	8	870501	870508	25 %	25 %	25 %	25 %	261855414
15153	NC_013422	GTCG	2	8	870534	870541	0 %	25 %	50 %	25 %	261855414
15154	NC_013422	CGG	2	6	870574	870579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855414
15155	NC_013422	GC	3	6	870643	870648	0 %	0 %	50 %	50 %	261855414
15156	NC_013422	TCG	2	6	870663	870668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855414
15157	NC_013422	CG	3	6	870667	870672	0 %	0 %	50 %	50 %	261855414
15158	NC_013422	TGC	2	6	870696	870701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855414
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15220	NC_013422	CAGC	2	8	874606	874613	25 %	0 %	25 %	50 %	261855417
15221	NC_013422	CATT	2	8	874652	874659	25 %	50 %	0 %	25 %	261855417
15222	NC_013422	CCAA	2	8	874761	874768	50 %	0 %	0 %	50 %	261855417
15223	NC_013422	GCT	2	6	874782	874787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855417
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15227	NC_013422	GTT	2	6	875164	875169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855418
15228	NC_013422	T	6	6	875194	875199	0 %	100 %	0 %	0 %	261855418
15229	NC_013422	ATTT	2	8	875206	875213	25 %	75 %	0 %	0 %	261855418
15230	NC_013422	T	6	6	875211	875216	0 %	100 %	0 %	0 %	261855418
15231	NC_013422	CAT	2	6	875226	875231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855418
15232	NC_013422	TCC	2	6	875260	875265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261855418
15233	NC_013422	T	6	6	875321	875326	0 %	100 %	0 %	0 %	261855418
15234	NC_013422	AAC	2	6	875380	875385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855418
15235	NC_013422	A	6	6	875468	875473	100 %	0 %	0 %	0 %	261855418
15236	NC_013422	ATG	2	6	875486	875491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855418
15237	NC_013422	AT	3	6	875920	875925	50 %	50 %	0 %	0 %	261855419
15238	NC_013422	GCTG	2	8	875937	875944	0 %	25 %	50 %	25 %	261855419
15239	NC_013422	AACA	2	8	876014	876021	75 %	0 %	0 %	25 %	261855419
15240	NC_013422	AGC	2	6	876039	876044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855419
15241	NC_013422	ACC	2	6	876061	876066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855419
15242	NC_013422	AAG	2	6	876166	876171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855419
15243	NC_013422	CG	3	6	876206	876211	0 %	0 %	50 %	50 %	261855419
15244	NC_013422	A	6	6	876233	876238	100 %	0 %	0 %	0 %	261855419
15245	NC_013422	TGA	2	6	876341	876346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855419
15246	NC_013422	GCA	2	6	876493	876498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855419
15247	NC_013422	ATCG	2	8	876584	876591	25 %	25 %	25 %	25 %	261855420
15248	NC_013422	TTGGG	2	10	876723	876732	0 %	40 %	60 %	0 %	261855420
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15250	NC_013422	TCGA	2	8	877048	877055	25 %	25 %	25 %	25 %	261855420
15251	NC_013422	CAG	2	6	877170	877175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855420
15252	NC_013422	CATC	2	8	877220	877227	25 %	25 %	0 %	50 %	261855420
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15254	NC_013422	TGC	2	6	877366	877371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855420
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15260	NC_013422	GCG	2	6	877716	877721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855421
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15267	NC_013422	GCGG	2	8	877998	878005	0 %	0 %	75 %	25 %	261855421
15268	NC_013422	GCC	2	6	878038	878043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855421
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15273	NC_013422	GAA	2	6	878241	878246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855421
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15275	NC_013422	GCCA	2	8	878272	878279	25 %	0 %	25 %	50 %	261855421
15276	NC_013422	TCG	2	6	878324	878329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855421
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15300	NC_013422	GCTT	2	8	879840	879847	0 %	50 %	25 %	25 %	261855423
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15355	NC_013422	AGCC	2	8	883562	883569	25 %	0 %	25 %	50 %	261855426
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15360	NC_013422	GAT	2	6	883870	883875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855426
15361	NC_013422	GCAG	2	8	883893	883900	25 %	0 %	50 %	25 %	261855426
15362	NC_013422	CAG	2	6	883918	883923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855426
15363	NC_013422	GCA	2	6	883947	883952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855426
15364	NC_013422	A	6	6	883984	883989	100 %	0 %	0 %	0 %	261855426
15365	NC_013422	GCCA	2	8	883993	884000	25 %	0 %	25 %	50 %	261855426
15366	NC_013422	GCC	2	6	884035	884040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855426
15367	NC_013422	GCCA	2	8	884056	884063	25 %	0 %	25 %	50 %	261855426
15368	NC_013422	TGC	2	6	884133	884138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855426
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15370	NC_013422	GGT	2	6	884181	884186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855426
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15372	NC_013422	TGG	2	6	884219	884224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855426
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15374	NC_013422	CT	4	8	884414	884421	0 %	50 %	0 %	50 %	261855426
15375	NC_013422	GGC	2	6	884484	884489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855426
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15380	NC_013422	TGG	2	6	884788	884793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855427
15381	NC_013422	TGG	2	6	884797	884802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855427
15382	NC_013422	GC	3	6	884828	884833	0 %	0 %	50 %	50 %	261855427
15383	NC_013422	CG	3	6	884894	884899	0 %	0 %	50 %	50 %	261855427
15384	NC_013422	GCA	2	6	884989	884994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855427
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15386	NC_013422	GCA	2	6	885041	885046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855427
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15392	NC_013422	ACCC	2	8	885544	885551	25 %	0 %	0 %	75 %	261855427
15393	NC_013422	ATC	2	6	885558	885563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855427
15394	NC_013422	GCTG	2	8	885728	885735	0 %	25 %	50 %	25 %	261855427
15395	NC_013422	TCG	2	6	885784	885789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855427
15396	NC_013422	ATTT	2	8	885791	885798	25 %	75 %	0 %	0 %	261855427
15397	NC_013422	CG	3	6	885810	885815	0 %	0 %	50 %	50 %	261855427
15398	NC_013422	GTC	2	6	885822	885827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855427
15399	NC_013422	CGCTCA	2	12	885841	885852	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	261855427
15400	NC_013422	CAT	2	6	885866	885871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855427
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15402	NC_013422	GC	3	6	885910	885915	0 %	0 %	50 %	50 %	261855427
15403	NC_013422	TC	3	6	885920	885925	0 %	50 %	0 %	50 %	261855427
15404	NC_013422	CTG	2	6	885933	885938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855427
15405	NC_013422	TGA	2	6	885941	885946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855427
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15410	NC_013422	GTG	2	6	886176	886181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855427
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15419	NC_013422	ATC	2	6	886599	886604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855427
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15466	NC_013422	ACG	2	6	891889	891894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855429
15467	NC_013422	GC	3	6	891930	891935	0 %	0 %	50 %	50 %	261855429
15468	NC_013422	GCA	2	6	891952	891957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855429
15469	NC_013422	GCA	2	6	891986	891991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855429
15470	NC_013422	CAT	2	6	892067	892072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855429
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15472	NC_013422	GT	3	6	892235	892240	0 %	50 %	50 %	0 %	261855429
15473	NC_013422	TG	3	6	892248	892253	0 %	50 %	50 %	0 %	261855429
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15477	NC_013422	GTG	2	6	892597	892602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855430
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15479	NC_013422	CTGG	2	8	892626	892633	0 %	25 %	50 %	25 %	261855431
15480	NC_013422	GGT	2	6	892680	892685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855431
15481	NC_013422	GGT	2	6	892725	892730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855431
15482	NC_013422	GCC	2	6	892802	892807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855431
15483	NC_013422	GACA	2	8	892915	892922	50 %	0 %	25 %	25 %	261855431
15484	NC_013422	CTC	2	6	892967	892972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261855432
15485	NC_013422	TTTC	2	8	893023	893030	0 %	75 %	0 %	25 %	261855432
15486	NC_013422	GCGT	2	8	893048	893055	0 %	25 %	50 %	25 %	261855432
15487	NC_013422	TGG	2	6	893063	893068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855432
15488	NC_013422	CCG	2	6	893107	893112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855432
15489	NC_013422	TG	3	6	893139	893144	0 %	50 %	50 %	0 %	261855432
15490	NC_013422	CGC	2	6	893157	893162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855432
15491	NC_013422	CTG	2	6	893169	893174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855432
15492	NC_013422	CGC	2	6	893186	893191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855432
15493	NC_013422	GGC	2	6	893203	893208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855432
15494	NC_013422	GCG	2	6	893238	893243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855432
15495	NC_013422	GTC	2	6	893252	893257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855432
15496	NC_013422	TGC	2	6	893305	893310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855432
15497	NC_013422	CG	3	6	893378	893383	0 %	0 %	50 %	50 %	261855432
15498	NC_013422	GATTT	2	10	893400	893409	20 %	60 %	20 %	0 %	261855432
15499	NC_013422	CTGC	2	8	893440	893447	0 %	25 %	25 %	50 %	261855432
15500	NC_013422	CG	4	8	893449	893456	0 %	0 %	50 %	50 %	261855432

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