MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 45067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_013422	AACG	2	8	809293	809300	50 %	0 %	25 %	25 %	261855361
14002	NC_013422	GGTT	2	8	809301	809308	0 %	50 %	50 %	0 %	261855361
14003	NC_013422	CAGCC	2	10	809421	809430	20 %	0 %	20 %	60 %	261855361
14004	NC_013422	CCG	2	6	809475	809480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855361
14005	NC_013422	CAA	2	6	809495	809500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855361
14006	NC_013422	TCAA	2	8	809547	809554	50 %	25 %	0 %	25 %	261855361
14007	NC_013422	GTA	2	6	809928	809933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855362
14008	NC_013422	T	6	6	810003	810008	0 %	100 %	0 %	0 %	261855363
14009	NC_013422	GT	3	6	810048	810053	0 %	50 %	50 %	0 %	261855363
14010	NC_013422	CAT	2	6	810096	810101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855363
14011	NC_013422	CTTT	2	8	810138	810145	0 %	75 %	0 %	25 %	261855363
14012	NC_013422	TTTGG	2	10	810208	810217	0 %	60 %	40 %	0 %	261855363
14013	NC_013422	AAT	2	6	810219	810224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261855363
14014	NC_013422	CAT	2	6	810274	810279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855363
14015	NC_013422	CGGT	2	8	810311	810318	0 %	25 %	50 %	25 %	261855364
14016	NC_013422	CGTC	2	8	810358	810365	0 %	25 %	25 %	50 %	261855364
14017	NC_013422	T	6	6	810451	810456	0 %	100 %	0 %	0 %	261855364
14018	NC_013422	CCA	2	6	810491	810496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855364
14019	NC_013422	CG	3	6	810680	810685	0 %	0 %	50 %	50 %	261855364
14020	NC_013422	AGT	2	6	810707	810712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855364
14021	NC_013422	TGA	2	6	810738	810743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855364
14022	NC_013422	GC	3	6	810748	810753	0 %	0 %	50 %	50 %	261855364
14023	NC_013422	ATC	2	6	810809	810814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855364
14024	NC_013422	TTG	2	6	810881	810886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855364
14025	NC_013422	GCT	2	6	810923	810928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855364
14026	NC_013422	GGA	2	6	811194	811199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261855364
14027	NC_013422	GGTCG	2	10	811285	811294	0 %	20 %	60 %	20 %	261855364
14028	NC_013422	GAT	2	6	811303	811308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855364
14029	NC_013422	GAT	2	6	811368	811373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855364
14030	NC_013422	GTG	2	6	811400	811405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855364
14031	NC_013422	GTC	2	6	811420	811425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855364
14032	NC_013422	TGC	2	6	811455	811460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855364
14033	NC_013422	GTC	2	6	811507	811512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855364
14034	NC_013422	GTT	2	6	811525	811530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855364
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14036	NC_013422	CGCCT	2	10	811543	811552	0 %	20 %	20 %	60 %	261855364
14037	NC_013422	TCG	2	6	811643	811648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855364
14038	NC_013422	CAA	2	6	811663	811668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855364
14039	NC_013422	GCA	2	6	811725	811730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855364
14040	NC_013422	CTG	2	6	811741	811746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855364
14041	NC_013422	GATG	2	8	812148	812155	25 %	25 %	50 %	0 %	261855365
14042	NC_013422	TCA	2	6	812204	812209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855365
14043	NC_013422	GGC	2	6	812230	812235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855365
14044	NC_013422	TCG	3	9	812257	812265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855365
14045	NC_013422	GCA	2	6	812325	812330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855365
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14050	NC_013422	GC	3	6	812465	812470	0 %	0 %	50 %	50 %	261855365
14051	NC_013422	GCC	2	6	812528	812533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855365
14052	NC_013422	TGG	2	6	812559	812564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855365
14053	NC_013422	AGT	2	6	812588	812593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855365
14054	NC_013422	CGA	2	6	812595	812600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855365
14055	NC_013422	TGG	2	6	812691	812696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855365
14056	NC_013422	CCG	2	6	812803	812808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855366
14057	NC_013422	CCCG	2	8	812814	812821	0 %	0 %	25 %	75 %	261855366
14058	NC_013422	GAC	2	6	812826	812831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855366
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14063	NC_013422	TGAT	2	8	813085	813092	25 %	50 %	25 %	0 %	261855366
14064	NC_013422	CTTG	2	8	813122	813129	0 %	50 %	25 %	25 %	261855366
14065	NC_013422	ATCG	2	8	813159	813166	25 %	25 %	25 %	25 %	261855366
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14079	NC_013422	CG	3	6	813768	813773	0 %	0 %	50 %	50 %	261855367
14080	NC_013422	GCG	2	6	813801	813806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855367
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14104	NC_013422	TGGC	2	8	815222	815229	0 %	25 %	50 %	25 %	261855369
14105	NC_013422	GAA	2	6	815245	815250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855369
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14120	NC_013422	TGC	2	6	816164	816169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855370
14121	NC_013422	GCCT	2	8	816214	816221	0 %	25 %	25 %	50 %	261855370
14122	NC_013422	GCGG	2	8	816248	816255	0 %	0 %	75 %	25 %	261855370
14123	NC_013422	CAC	2	6	816257	816262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855370
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14126	NC_013422	CGG	2	6	816314	816319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855370
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14130	NC_013422	GTG	2	6	816674	816679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855371
14131	NC_013422	CGG	2	6	816725	816730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855371
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14135	NC_013422	TCG	2	6	816864	816869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855371
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14140	NC_013422	CGG	2	6	817009	817014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855371
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14149	NC_013422	CCG	2	6	817484	817489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855372
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14185	NC_013422	GATC	2	8	819074	819081	25 %	25 %	25 %	25 %	261855374
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14221	NC_013422	CGTG	2	8	821365	821372	0 %	25 %	50 %	25 %	261855377
14222	NC_013422	CGGG	2	8	821377	821384	0 %	0 %	75 %	25 %	261855377
14223	NC_013422	TCC	2	6	821411	821416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261855377
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14231	NC_013422	GAT	2	6	821882	821887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855378
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14235	NC_013422	CGG	2	6	822068	822073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855378
14236	NC_013422	TGA	2	6	822235	822240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855378
14237	NC_013422	CG	3	6	822284	822289	0 %	0 %	50 %	50 %	261855378
14238	NC_013422	GATC	2	8	822302	822309	25 %	25 %	25 %	25 %	261855378
14239	NC_013422	TCA	2	6	822364	822369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855378
14240	NC_013422	GCGT	2	8	822397	822404	0 %	25 %	50 %	25 %	261855378
14241	NC_013422	TGC	2	6	822449	822454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855378
14242	NC_013422	CGT	2	6	822588	822593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855378
14243	NC_013422	CATG	2	8	822725	822732	25 %	25 %	25 %	25 %	261855378
14244	NC_013422	TGC	2	6	822742	822747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855378
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14247	NC_013422	GAT	2	6	822821	822826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855378
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14249	NC_013422	ATC	2	6	823036	823041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855379
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14251	NC_013422	CCTA	2	8	823195	823202	25 %	25 %	0 %	50 %	261855379
14252	NC_013422	GCG	2	6	823216	823221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855379
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14334	NC_013422	ACG	2	6	827370	827375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855382
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14338	NC_013422	CA	3	6	827579	827584	50 %	0 %	0 %	50 %	261855382
14339	NC_013422	A	6	6	827620	827625	100 %	0 %	0 %	0 %	261855382
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14342	NC_013422	GACC	2	8	827732	827739	25 %	0 %	25 %	50 %	261855382
14343	NC_013422	ATT	2	6	827934	827939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261855382
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14346	NC_013422	GCA	3	9	828041	828049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855382
14347	NC_013422	CTG	2	6	828087	828092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855382
14348	NC_013422	GAA	2	6	828120	828125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855382
14349	NC_013422	TTC	2	6	828130	828135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855382
14350	NC_013422	ATG	2	6	828206	828211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855383
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14352	NC_013422	CAG	2	6	828245	828250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855383
14353	NC_013422	GAC	2	6	828374	828379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855383
14354	NC_013422	CAA	2	6	828464	828469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855383
14355	NC_013422	ATG	2	6	828473	828478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855383
14356	NC_013422	CGG	2	6	828489	828494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855383
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14358	NC_013422	TCGG	2	8	828594	828601	0 %	25 %	50 %	25 %	261855384
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14362	NC_013422	TTGG	2	8	828809	828816	0 %	50 %	50 %	0 %	261855384
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14480	NC_013422	TTG	2	6	834365	834370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855388
14481	NC_013422	GCA	2	6	834474	834479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855388
14482	NC_013422	CG	3	6	834630	834635	0 %	0 %	50 %	50 %	261855388
14483	NC_013422	TTC	2	6	834667	834672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855388
14484	NC_013422	GGC	2	6	834688	834693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855388
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