MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 45067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_013422	GTT	2	6	781904	781909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855332
13502	NC_013422	TCA	2	6	781918	781923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855332
13503	NC_013422	CTG	2	6	781926	781931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855332
13504	NC_013422	AAC	2	6	781933	781938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855332
13505	NC_013422	TGC	2	6	781960	781965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855332
13506	NC_013422	A	6	6	782004	782009	100 %	0 %	0 %	0 %	261855332
13507	NC_013422	GGT	2	6	782010	782015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855332
13508	NC_013422	TCA	2	6	782067	782072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855332
13509	NC_013422	GTG	2	6	782076	782081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855332
13510	NC_013422	GAT	2	6	782100	782105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855332
13511	NC_013422	TGG	2	6	782253	782258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855333
13512	NC_013422	GCG	2	6	782328	782333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855333
13513	NC_013422	GTTG	2	8	782356	782363	0 %	50 %	50 %	0 %	261855333
13514	NC_013422	CCGAG	2	10	782374	782383	20 %	0 %	40 %	40 %	261855333
13515	NC_013422	CAT	2	6	782431	782436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855333
13516	NC_013422	GATGT	2	10	782438	782447	20 %	40 %	40 %	0 %	261855333
13517	NC_013422	GC	3	6	782488	782493	0 %	0 %	50 %	50 %	261855333
13518	NC_013422	TCGG	2	8	782510	782517	0 %	25 %	50 %	25 %	261855333
13519	NC_013422	TC	3	6	782649	782654	0 %	50 %	0 %	50 %	261855333
13520	NC_013422	GTC	2	6	782672	782677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855333
13521	NC_013422	CAGA	2	8	782741	782748	50 %	0 %	25 %	25 %	261855333
13522	NC_013422	TTC	2	6	782749	782754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855333
13523	NC_013422	GCC	2	6	782756	782761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855333
13524	NC_013422	GAA	2	6	782780	782785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855333
13525	NC_013422	CGG	2	6	782859	782864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855333
13526	NC_013422	GCGA	2	8	782879	782886	25 %	0 %	50 %	25 %	261855333
13527	NC_013422	GAA	2	6	782900	782905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855333
13528	NC_013422	CAA	2	6	783107	783112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855333
13529	NC_013422	ACC	2	6	783137	783142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855333
13530	NC_013422	TCA	2	6	783171	783176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855333
13531	NC_013422	GAA	2	6	783245	783250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855333
13532	NC_013422	AAG	2	6	783332	783337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855333
13533	NC_013422	GTG	2	6	783359	783364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855333
13534	NC_013422	CCG	2	6	783561	783566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855333
13535	NC_013422	TGC	2	6	783630	783635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855333
13536	NC_013422	TGA	2	6	783660	783665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855333
13537	NC_013422	TTC	2	6	783714	783719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855333
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13539	NC_013422	TGG	2	6	783900	783905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855333
13540	NC_013422	CCA	2	6	783999	784004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855333
13541	NC_013422	TGGC	2	8	784049	784056	0 %	25 %	50 %	25 %	261855333
13542	NC_013422	TGG	2	6	784098	784103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855333
13543	NC_013422	GTG	2	6	784139	784144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855333
13544	NC_013422	GAA	2	6	784163	784168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855333
13545	NC_013422	GTG	2	6	784169	784174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855333
13546	NC_013422	TGC	2	6	784194	784199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855333
13547	NC_013422	GTGG	2	8	784205	784212	0 %	25 %	75 %	0 %	261855333
13548	NC_013422	CGA	2	6	784224	784229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855333
13549	NC_013422	TTG	2	6	784354	784359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855334
13550	NC_013422	TCT	2	6	784369	784374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855334
13551	NC_013422	AATT	2	8	784393	784400	50 %	50 %	0 %	0 %	261855334
13552	NC_013422	GAT	2	6	784407	784412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855334
13553	NC_013422	GTT	2	6	784422	784427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855334
13554	NC_013422	GCC	2	6	784434	784439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855334
13555	NC_013422	CAT	2	6	784484	784489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855334
13556	NC_013422	GATG	2	8	784493	784500	25 %	25 %	50 %	0 %	261855334
13557	NC_013422	ATGG	2	8	784515	784522	25 %	25 %	50 %	0 %	261855334
13558	NC_013422	ATG	2	6	784569	784574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855334
13559	NC_013422	CT	3	6	784575	784580	0 %	50 %	0 %	50 %	261855334
13560	NC_013422	GGC	2	6	784721	784726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855334
13561	NC_013422	GTC	2	6	784816	784821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855334
13562	NC_013422	TCT	2	6	784842	784847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855334
13563	NC_013422	CGG	2	6	784850	784855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855334
13564	NC_013422	TGC	2	6	784876	784881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855334
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13568	NC_013422	GCT	2	6	785157	785162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855334
13569	NC_013422	GGC	2	6	785165	785170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855334
13570	NC_013422	CGGAT	2	10	785171	785180	20 %	20 %	40 %	20 %	261855334
13571	NC_013422	GAT	2	6	785211	785216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855334
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13573	NC_013422	AGC	2	6	785243	785248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855334
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13578	NC_013422	TGC	2	6	785481	785486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855335
13579	NC_013422	ACC	2	6	785516	785521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855335
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13581	NC_013422	GTT	2	6	785566	785571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855335
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13587	NC_013422	TTG	2	6	786125	786130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855335
13588	NC_013422	CAAG	2	8	786159	786166	50 %	0 %	25 %	25 %	261855335
13589	NC_013422	GCA	2	6	786167	786172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855335
13590	NC_013422	ACA	2	6	786189	786194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855335
13591	NC_013422	CGC	2	6	786202	786207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855335
13592	NC_013422	TGC	2	6	786228	786233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855335
13593	NC_013422	TCA	2	6	786243	786248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855336
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13595	NC_013422	TTCA	2	8	786257	786264	25 %	50 %	0 %	25 %	261855336
13596	NC_013422	GAGC	2	8	786357	786364	25 %	0 %	50 %	25 %	261855336
13597	NC_013422	ACG	3	9	786404	786412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855336
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13600	NC_013422	GCA	2	6	786520	786525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855336
13601	NC_013422	AGA	2	6	786552	786557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855336
13602	NC_013422	TCT	2	6	786562	786567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855336
13603	NC_013422	TGG	2	6	786587	786592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855336
13604	NC_013422	GAA	2	6	786616	786621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855336
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13606	NC_013422	ATT	2	6	786763	786768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261855336
13607	NC_013422	GATC	2	8	786835	786842	25 %	25 %	25 %	25 %	261855336
13608	NC_013422	CTG	2	6	786904	786909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855336
13609	NC_013422	TGC	2	6	787041	787046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855336
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13611	NC_013422	ATC	2	6	787323	787328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855337
13612	NC_013422	GC	3	6	787362	787367	0 %	0 %	50 %	50 %	261855337
13613	NC_013422	TTTTC	2	10	787369	787378	0 %	80 %	0 %	20 %	261855337
13614	NC_013422	CAT	2	6	787412	787417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855337
13615	NC_013422	GTC	2	6	787455	787460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855337
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13848	NC_013422	CGC	2	6	800786	800791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855353
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13853	NC_013422	CACC	2	8	800966	800973	25 %	0 %	0 %	75 %	261855353
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13856	NC_013422	ACG	2	6	801065	801070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855353
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13978	NC_013422	GAT	2	6	807710	807715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855359
13979	NC_013422	AGC	2	6	807741	807746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855359
13980	NC_013422	CGT	2	6	807807	807812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855359
13981	NC_013422	GC	3	6	807947	807952	0 %	0 %	50 %	50 %	261855359
13982	NC_013422	TTG	2	6	807992	807997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855359
13983	NC_013422	GCA	2	6	808006	808011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855359
13984	NC_013422	GGC	2	6	808029	808034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855359
13985	NC_013422	TGC	2	6	808284	808289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855360
13986	NC_013422	GTC	2	6	808403	808408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855360
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13991	NC_013422	AGCC	2	8	808693	808700	25 %	0 %	25 %	50 %	261855360
13992	NC_013422	TGC	2	6	808719	808724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855360
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13999	NC_013422	GAT	2	6	809248	809253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855361
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