MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 45067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_013422	CGTT	2	8	751512	751519	0 %	50 %	25 %	25 %	261855301
13002	NC_013422	TCA	2	6	751555	751560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855301
13003	NC_013422	AGC	2	6	751576	751581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855301
13004	NC_013422	GCCG	2	8	751673	751680	0 %	0 %	50 %	50 %	261855301
13005	NC_013422	GCA	2	6	751689	751694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855301
13006	NC_013422	GGC	2	6	751732	751737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855301
13007	NC_013422	GCC	2	6	751752	751757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855301
13008	NC_013422	AAT	2	6	751826	751831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261855302
13009	NC_013422	AGT	2	6	751883	751888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855302
13010	NC_013422	GGT	2	6	751893	751898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855302
13011	NC_013422	CAGC	2	8	751901	751908	25 %	0 %	25 %	50 %	261855302
13012	NC_013422	GAGG	2	8	751919	751926	25 %	0 %	75 %	0 %	261855302
13013	NC_013422	GTGC	2	8	751956	751963	0 %	25 %	50 %	25 %	261855302
13014	NC_013422	GTT	2	6	751966	751971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855302
13015	NC_013422	A	6	6	752005	752010	100 %	0 %	0 %	0 %	261855302
13016	NC_013422	AAG	2	6	752023	752028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855302
13017	NC_013422	AATT	2	8	752086	752093	50 %	50 %	0 %	0 %	261855302
13018	NC_013422	CTT	2	6	752120	752125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855302
13019	NC_013422	ATA	2	6	752155	752160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261855302
13020	NC_013422	GAA	2	6	752280	752285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855302
13021	NC_013422	GAA	2	6	752290	752295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855302
13022	NC_013422	AGA	2	6	752659	752664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855303
13023	NC_013422	CAA	2	6	752741	752746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855303
13024	NC_013422	AAGA	2	8	752765	752772	75 %	0 %	25 %	0 %	261855303
13025	NC_013422	TCC	2	6	752795	752800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261855303
13026	NC_013422	AGA	2	6	752820	752825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855303
13027	NC_013422	TTG	2	6	752859	752864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855303
13028	NC_013422	TTC	2	6	752871	752876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855303
13029	NC_013422	GATA	2	8	752906	752913	50 %	25 %	25 %	0 %	261855303
13030	NC_013422	GAT	2	6	753233	753238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855304
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13032	NC_013422	A	6	6	753431	753436	100 %	0 %	0 %	0 %	261855304
13033	NC_013422	TGTC	2	8	753522	753529	0 %	50 %	25 %	25 %	261855304
13034	NC_013422	CGG	2	6	753651	753656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855304
13035	NC_013422	TCA	2	6	753771	753776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855305
13036	NC_013422	GAT	3	9	753789	753797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855305
13037	NC_013422	TTCT	2	8	753800	753807	0 %	75 %	0 %	25 %	261855305
13038	NC_013422	ACACC	2	10	753838	753847	40 %	0 %	0 %	60 %	261855305
13039	NC_013422	GA	3	6	753852	753857	50 %	0 %	50 %	0 %	261855305
13040	NC_013422	CAT	2	6	753881	753886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855305
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13043	NC_013422	ATG	2	6	753969	753974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855305
13044	NC_013422	TGA	2	6	753997	754002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855305
13045	NC_013422	CAA	2	6	754028	754033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855305
13046	NC_013422	TGA	2	6	754068	754073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855305
13047	NC_013422	GAT	3	9	754145	754153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855305
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13050	NC_013422	ACC	2	6	754808	754813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855306
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13052	NC_013422	TGC	2	6	754929	754934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855306
13053	NC_013422	GC	3	6	754946	754951	0 %	0 %	50 %	50 %	261855306
13054	NC_013422	GGC	2	6	755041	755046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855306
13055	NC_013422	TTG	2	6	755054	755059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855306
13056	NC_013422	GCTT	2	8	755157	755164	0 %	50 %	25 %	25 %	261855306
13057	NC_013422	GCT	2	6	755226	755231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855306
13058	NC_013422	T	7	7	755231	755237	0 %	100 %	0 %	0 %	261855306
13059	NC_013422	GGTG	2	8	755304	755311	0 %	25 %	75 %	0 %	261855306
13060	NC_013422	CAG	2	6	755314	755319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855306
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13062	NC_013422	CAGCG	2	10	755473	755482	20 %	0 %	40 %	40 %	261855306
13063	NC_013422	CCG	2	6	755564	755569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855306
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13065	NC_013422	GC	3	6	755691	755696	0 %	0 %	50 %	50 %	261855306
13066	NC_013422	GAT	2	6	755716	755721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855306
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13069	NC_013422	CCG	2	6	755909	755914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855306
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13074	NC_013422	CAG	3	9	756081	756089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855307
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13080	NC_013422	CAG	2	6	756381	756386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855307
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13087	NC_013422	GC	4	8	756548	756555	0 %	0 %	50 %	50 %	261855307
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13106	NC_013422	TGG	2	6	757553	757558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855309
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13120	NC_013422	T	6	6	758238	758243	0 %	100 %	0 %	0 %	261855310
13121	NC_013422	CGC	4	12	758279	758290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855310
13122	NC_013422	TGA	2	6	758294	758299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855310
13123	NC_013422	TGG	2	6	758450	758455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855310
13124	NC_013422	GTAC	2	8	758519	758526	25 %	25 %	25 %	25 %	261855310
13125	NC_013422	GCT	2	6	758533	758538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855310
13126	NC_013422	TGT	2	6	758548	758553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855310
13127	NC_013422	CCGC	2	8	758890	758897	0 %	0 %	25 %	75 %	261855311
13128	NC_013422	ACG	2	6	758902	758907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855311
13129	NC_013422	TTG	2	6	758970	758975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855311
13130	NC_013422	GCG	2	6	759016	759021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855311
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13135	NC_013422	CAG	2	6	759255	759260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855311
13136	NC_013422	GGGCA	2	10	759321	759330	20 %	0 %	60 %	20 %	261855311
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13157	NC_013422	CCG	2	6	760006	760011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855311
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13159	NC_013422	TGC	2	6	760168	760173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855311
13160	NC_013422	TGG	2	6	760255	760260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855311
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13173	NC_013422	TGA	2	6	761868	761873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855313
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13233	NC_013422	GC	4	8	765428	765435	0 %	0 %	50 %	50 %	261855316
13234	NC_013422	TTCG	2	8	765510	765517	0 %	50 %	25 %	25 %	261855316
13235	NC_013422	TCA	2	6	765556	765561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855316
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13237	NC_013422	GGC	2	6	765696	765701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855316
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13239	NC_013422	GA	3	6	765853	765858	50 %	0 %	50 %	0 %	261855316
13240	NC_013422	GAA	2	6	765876	765881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855316
13241	NC_013422	TGA	2	6	765892	765897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855316
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13342	NC_013422	GGCT	2	8	771635	771642	0 %	25 %	50 %	25 %	261855323
13343	NC_013422	GGT	2	6	771667	771672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855323
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13346	NC_013422	GCC	2	6	771765	771770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855323
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13350	NC_013422	GGACG	2	10	771943	771952	20 %	0 %	60 %	20 %	261855323
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13352	NC_013422	TGC	2	6	772054	772059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855323
13353	NC_013422	TGGGT	2	10	772090	772099	0 %	40 %	60 %	0 %	261855323
13354	NC_013422	TGA	2	6	772165	772170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855323
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13358	NC_013422	ATT	2	6	772326	772331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261855324
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13360	NC_013422	CGC	2	6	772356	772361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855324
13361	NC_013422	CGG	2	6	772400	772405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855324
13362	NC_013422	GAC	2	6	772413	772418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855324
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13365	NC_013422	CGT	2	6	772490	772495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855324
13366	NC_013422	TGC	3	9	772496	772504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855324
13367	NC_013422	TGA	2	6	772505	772510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855324
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13371	NC_013422	TCA	2	6	772847	772852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855324
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13373	NC_013422	ATC	2	6	772909	772914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855324
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13397	NC_013422	CCGCA	2	10	774018	774027	20 %	0 %	20 %	60 %	261855326
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13404	NC_013422	GCTC	2	8	774259	774266	0 %	25 %	25 %	50 %	261855327
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13477	NC_013422	TC	3	6	780176	780181	0 %	50 %	0 %	50 %	261855330
13478	NC_013422	TG	3	6	780234	780239	0 %	50 %	50 %	0 %	261855330
13479	NC_013422	GAT	2	6	780262	780267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855330
13480	NC_013422	CTA	2	6	780465	780470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855330
13481	NC_013422	GTG	2	6	780911	780916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855331
13482	NC_013422	CCA	2	6	780927	780932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855331
13483	NC_013422	GCG	2	6	780934	780939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855331
13484	NC_013422	ATT	2	6	780941	780946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261855331
13485	NC_013422	CTG	2	6	780953	780958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855331
13486	NC_013422	GAA	2	6	780983	780988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855331
13487	NC_013422	CGA	2	6	780991	780996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855331
13488	NC_013422	TGAC	2	8	781047	781054	25 %	25 %	25 %	25 %	261855331
13489	NC_013422	ATC	2	6	781166	781171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855331
13490	NC_013422	GTC	2	6	781202	781207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855331
13491	NC_013422	GAAA	2	8	781231	781238	75 %	0 %	25 %	0 %	261855331
13492	NC_013422	GAA	3	9	781389	781397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855332
13493	NC_013422	TTGC	2	8	781428	781435	0 %	50 %	25 %	25 %	261855332
13494	NC_013422	CGA	2	6	781451	781456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855332
13495	NC_013422	GGCTGA	2	12	781592	781603	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	261855332
13496	NC_013422	CTGA	2	8	781644	781651	25 %	25 %	25 %	25 %	261855332
13497	NC_013422	GAA	2	6	781683	781688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855332
13498	NC_013422	CAA	2	6	781737	781742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855332
13499	NC_013422	AGG	2	6	781762	781767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261855332
13500	NC_013422	ATG	2	6	781869	781874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855332

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