MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 45067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_013422	AG	3	6	719086	719091	50 %	0 %	50 %	0 %	261855276
12502	NC_013422	GTT	2	6	719147	719152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855276
12503	NC_013422	CAA	2	6	719195	719200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855277
12504	NC_013422	TGGCG	2	10	719245	719254	0 %	20 %	60 %	20 %	261855277
12505	NC_013422	TCA	2	6	719271	719276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855277
12506	NC_013422	CTT	2	6	719278	719283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855277
12507	NC_013422	AATC	2	8	719302	719309	50 %	25 %	0 %	25 %	261855277
12508	NC_013422	CGG	2	6	719328	719333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855277
12509	NC_013422	TCGG	2	8	719334	719341	0 %	25 %	50 %	25 %	261855277
12510	NC_013422	ACG	2	6	719348	719353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855277
12511	NC_013422	TC	3	6	719460	719465	0 %	50 %	0 %	50 %	261855277
12512	NC_013422	GC	3	6	719532	719537	0 %	0 %	50 %	50 %	261855277
12513	NC_013422	TTG	2	6	719587	719592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855277
12514	NC_013422	ATA	2	6	719607	719612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261855277
12515	NC_013422	CGT	2	6	720218	720223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855278
12516	NC_013422	AAT	2	6	720447	720452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261855278
12517	NC_013422	CAC	2	6	720455	720460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855278
12518	NC_013422	GT	3	6	720466	720471	0 %	50 %	50 %	0 %	261855278
12519	NC_013422	GCG	2	6	720494	720499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855278
12520	NC_013422	CGG	2	6	720608	720613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855278
12521	NC_013422	GCA	2	6	720758	720763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855278
12522	NC_013422	GAG	2	6	720840	720845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261855278
12523	NC_013422	TTC	2	6	720893	720898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855278
12524	NC_013422	TTG	2	6	720933	720938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855278
12525	NC_013422	TG	3	6	721017	721022	0 %	50 %	50 %	0 %	261855278
12526	NC_013422	CAAAC	2	10	721032	721041	60 %	0 %	0 %	40 %	261855278
12527	NC_013422	TCG	2	6	721051	721056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855278
12528	NC_013422	CTG	2	6	721086	721091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855278
12529	NC_013422	TGC	2	6	721120	721125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855278
12530	NC_013422	CAA	2	6	721195	721200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855278
12531	NC_013422	GTG	2	6	721252	721257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855278
12532	NC_013422	TGC	2	6	721271	721276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855278
12533	NC_013422	A	6	6	721477	721482	100 %	0 %	0 %	0 %	261855278
12534	NC_013422	CGG	2	6	721490	721495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855278
12535	NC_013422	A	6	6	721618	721623	100 %	0 %	0 %	0 %	261855278
12536	NC_013422	GAA	2	6	721629	721634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855278
12537	NC_013422	CCG	2	6	721660	721665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855278
12538	NC_013422	ATC	2	6	721669	721674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855278
12539	NC_013422	T	6	6	721707	721712	0 %	100 %	0 %	0 %	261855278
12540	NC_013422	CAGT	2	8	721718	721725	25 %	25 %	25 %	25 %	261855278
12541	NC_013422	CG	3	6	721750	721755	0 %	0 %	50 %	50 %	261855278
12542	NC_013422	ATT	2	6	721766	721771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261855278
12543	NC_013422	AGCG	2	8	721801	721808	25 %	0 %	50 %	25 %	261855278
12544	NC_013422	TG	3	6	721895	721900	0 %	50 %	50 %	0 %	261855279
12545	NC_013422	GCA	2	6	721954	721959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855279
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12547	NC_013422	CGC	2	6	722118	722123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855279
12548	NC_013422	GCC	2	6	722135	722140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855279
12549	NC_013422	GTC	2	6	722141	722146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855279
12550	NC_013422	A	6	6	722231	722236	100 %	0 %	0 %	0 %	261855279
12551	NC_013422	GTC	2	6	722270	722275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855279
12552	NC_013422	ACA	2	6	722340	722345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855279
12553	NC_013422	CGGG	2	8	722433	722440	0 %	0 %	75 %	25 %	261855279
12554	NC_013422	GGC	2	6	722456	722461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855279
12555	NC_013422	AC	3	6	722531	722536	50 %	0 %	0 %	50 %	261855279
12556	NC_013422	TGG	2	6	722613	722618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855279
12557	NC_013422	TGA	2	6	722664	722669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855279
12558	NC_013422	GC	3	6	722778	722783	0 %	0 %	50 %	50 %	261855280
12559	NC_013422	GGC	2	6	722842	722847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855280
12560	NC_013422	GGT	2	6	722935	722940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855280
12561	NC_013422	CGCTG	2	10	722985	722994	0 %	20 %	40 %	40 %	261855280
12562	NC_013422	GCG	2	6	723031	723036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855280
12563	NC_013422	TGC	4	12	723123	723134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855280
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12569	NC_013422	GCGCT	2	10	723289	723298	0 %	20 %	40 %	40 %	261855280
12570	NC_013422	A	6	6	723325	723330	100 %	0 %	0 %	0 %	261855280
12571	NC_013422	CGG	2	6	723356	723361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855280
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12585	NC_013422	CTCG	2	8	724287	724294	0 %	25 %	25 %	50 %	261855281
12586	NC_013422	GAT	2	6	724307	724312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855281
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12591	NC_013422	TGG	2	6	724559	724564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855282
12592	NC_013422	GCG	2	6	724591	724596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855282
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12599	NC_013422	GAT	2	6	725207	725212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855282
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12601	NC_013422	TCAG	2	8	725266	725273	25 %	25 %	25 %	25 %	261855282
12602	NC_013422	GAGC	2	8	725324	725331	25 %	0 %	50 %	25 %	261855283
12603	NC_013422	TCG	2	6	725337	725342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855283
12604	NC_013422	TGA	2	6	725413	725418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855283
12605	NC_013422	CGG	2	6	725420	725425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855283
12606	NC_013422	GCA	2	6	725534	725539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855283
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12609	NC_013422	TCT	2	6	725714	725719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855283
12610	NC_013422	CCA	3	9	725752	725760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855283
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12615	NC_013422	TGG	2	6	729041	729046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855284
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12617	NC_013422	GCG	2	6	729301	729306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855284
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12846	NC_013422	CG	3	6	742396	742401	0 %	0 %	50 %	50 %	261855295
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12855	NC_013422	GCT	2	6	742762	742767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855295
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12977	NC_013422	CAT	2	6	749770	749775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855299
12978	NC_013422	TCAA	2	8	749904	749911	50 %	25 %	0 %	25 %	261855299
12979	NC_013422	GATG	2	8	749913	749920	25 %	25 %	50 %	0 %	261855299
12980	NC_013422	CTG	2	6	750032	750037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855299
12981	NC_013422	TGA	2	6	750061	750066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855299
12982	NC_013422	CG	3	6	750131	750136	0 %	0 %	50 %	50 %	261855299
12983	NC_013422	GGC	2	6	750175	750180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855299
12984	NC_013422	AGCA	2	8	750204	750211	50 %	0 %	25 %	25 %	261855299
12985	NC_013422	GCC	2	6	750240	750245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855299
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12989	NC_013422	AGTC	2	8	750358	750365	25 %	25 %	25 %	25 %	261855299
12990	NC_013422	AGC	2	6	750401	750406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855299
12991	NC_013422	CAG	2	6	750485	750490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855299
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12995	NC_013422	TGA	2	6	750832	750837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855299
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