MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 45067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_013422	AGGA	2	8	664672	664679	50 %	0 %	50 %	0 %	261855234
11502	NC_013422	GAT	2	6	664689	664694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855234
11503	NC_013422	GCA	2	6	664701	664706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855234
11504	NC_013422	GATC	2	8	664760	664767	25 %	25 %	25 %	25 %	261855234
11505	NC_013422	CAG	2	6	664774	664779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855234
11506	NC_013422	TTG	2	6	665063	665068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855235
11507	NC_013422	CGG	2	6	665103	665108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855235
11508	NC_013422	GCA	2	6	665130	665135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855235
11509	NC_013422	CGG	2	6	665142	665147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855235
11510	NC_013422	GTGG	2	8	665206	665213	0 %	25 %	75 %	0 %	261855235
11511	NC_013422	CGATGC	2	12	665256	665267	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	261855235
11512	NC_013422	TGC	2	6	665278	665283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855235
11513	NC_013422	CGT	2	6	665331	665336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855235
11514	NC_013422	TCC	2	6	665339	665344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261855235
11515	NC_013422	TTG	2	6	665359	665364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855235
11516	NC_013422	GCC	2	6	665437	665442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855235
11517	NC_013422	T	6	6	665467	665472	0 %	100 %	0 %	0 %	261855235
11518	NC_013422	ATG	2	6	665519	665524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855235
11519	NC_013422	T	6	6	665698	665703	0 %	100 %	0 %	0 %	261855235
11520	NC_013422	CGC	2	6	665719	665724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855235
11521	NC_013422	TGGGC	2	10	665800	665809	0 %	20 %	60 %	20 %	261855235
11522	NC_013422	GCC	3	9	665890	665898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855235
11523	NC_013422	GGT	2	6	665905	665910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855235
11524	NC_013422	ACG	2	6	665930	665935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855235
11525	NC_013422	TCG	2	6	665981	665986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855235
11526	NC_013422	GGT	2	6	665995	666000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855235
11527	NC_013422	TCCA	2	8	666023	666030	25 %	25 %	0 %	50 %	261855235
11528	NC_013422	TTC	2	6	666038	666043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855235
11529	NC_013422	ATG	2	6	666137	666142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855235
11530	NC_013422	GATC	2	8	666160	666167	25 %	25 %	25 %	25 %	261855235
11531	NC_013422	CGA	2	6	666180	666185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855235
11532	NC_013422	GAA	2	6	666659	666664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855236
11533	NC_013422	CCG	2	6	666702	666707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855236
11534	NC_013422	GTG	2	6	666723	666728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855236
11535	NC_013422	TCAA	2	8	666813	666820	50 %	25 %	0 %	25 %	261855236
11536	NC_013422	CAAGGT	2	12	666832	666843	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	261855236
11537	NC_013422	TGA	2	6	666861	666866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855236
11538	NC_013422	GCT	2	6	666959	666964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855237
11539	NC_013422	AAG	2	6	666966	666971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855237
11540	NC_013422	GCG	2	6	667008	667013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855237
11541	NC_013422	GC	3	6	667164	667169	0 %	0 %	50 %	50 %	261855237
11542	NC_013422	AAG	2	6	667179	667184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855237
11543	NC_013422	GCTG	2	8	667237	667244	0 %	25 %	50 %	25 %	261855237
11544	NC_013422	TGC	2	6	667276	667281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855237
11545	NC_013422	TGC	2	6	667330	667335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855237
11546	NC_013422	GAA	2	6	667348	667353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855237
11547	NC_013422	ACA	2	6	667374	667379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855237
11548	NC_013422	CCA	2	6	667398	667403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855237
11549	NC_013422	TGA	2	6	667417	667422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855237
11550	NC_013422	AGA	2	6	667486	667491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855237
11551	NC_013422	CT	3	6	667553	667558	0 %	50 %	0 %	50 %	261855237
11552	NC_013422	CAA	2	6	667570	667575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855237
11553	NC_013422	CTG	2	6	667590	667595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855237
11554	NC_013422	CTG	2	6	667652	667657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855237
11555	NC_013422	TCA	2	6	667743	667748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855237
11556	NC_013422	TCG	2	6	667804	667809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855237
11557	NC_013422	TGC	2	6	667818	667823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855237
11558	NC_013422	ACC	2	6	667943	667948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855237
11559	NC_013422	ACC	2	6	668018	668023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855237
11560	NC_013422	GCTG	2	8	668068	668075	0 %	25 %	50 %	25 %	261855237
11561	NC_013422	GCG	2	6	668076	668081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855237
11562	NC_013422	TCA	2	6	668088	668093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855237
11563	NC_013422	TGAAA	2	10	668116	668125	60 %	20 %	20 %	0 %	261855237
11564	NC_013422	GAA	2	6	668128	668133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855237
11565	NC_013422	TGCAC	2	10	668149	668158	20 %	20 %	20 %	40 %	261855237
11566	NC_013422	TGC	2	6	668167	668172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855237
11567	NC_013422	GAA	2	6	668177	668182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855237
11568	NC_013422	GGT	2	6	668195	668200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855237
11569	NC_013422	TGCG	2	8	668286	668293	0 %	25 %	50 %	25 %	261855237
11570	NC_013422	GAA	2	6	668333	668338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855237
11571	NC_013422	GTTC	2	8	668360	668367	0 %	50 %	25 %	25 %	261855237
11572	NC_013422	ACG	2	6	668388	668393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855237
11573	NC_013422	CCA	2	6	668442	668447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855237
11574	NC_013422	TGA	2	6	668493	668498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855237
11575	NC_013422	CAC	2	6	668500	668505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855237
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11578	NC_013422	CGT	2	6	668848	668853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855238
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11583	NC_013422	GCGG	2	8	669185	669192	0 %	0 %	75 %	25 %	261855238
11584	NC_013422	ATCC	2	8	669240	669247	25 %	25 %	0 %	50 %	261855238
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11586	NC_013422	CTT	2	6	669325	669330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855238
11587	NC_013422	CCA	2	6	669422	669427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855238
11588	NC_013422	AGAT	2	8	669440	669447	50 %	25 %	25 %	0 %	261855238
11589	NC_013422	GTGCCA	2	12	669550	669561	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	261855238
11590	NC_013422	AGC	2	6	669576	669581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855238
11591	NC_013422	TCG	2	6	669651	669656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855238
11592	NC_013422	TCA	2	6	669702	669707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855238
11593	NC_013422	CAG	2	6	669710	669715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855238
11594	NC_013422	CGA	2	6	669787	669792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855238
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11596	NC_013422	T	6	6	669979	669984	0 %	100 %	0 %	0 %	261855238
11597	NC_013422	CTG	2	6	670017	670022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855238
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11599	NC_013422	CAGCGC	2	12	670190	670201	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	261855238
11600	NC_013422	GTG	2	6	670350	670355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855238
11601	NC_013422	CAACG	2	10	670382	670391	40 %	0 %	20 %	40 %	261855238
11602	NC_013422	GCA	2	6	670446	670451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855238
11603	NC_013422	GC	3	6	670494	670499	0 %	0 %	50 %	50 %	261855238
11604	NC_013422	CGC	2	6	670510	670515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855238
11605	NC_013422	CCG	2	6	670560	670565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855238
11606	NC_013422	TCA	2	6	670590	670595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855238
11607	NC_013422	CAG	2	6	670622	670627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855238
11608	NC_013422	GTG	2	6	670749	670754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855238
11609	NC_013422	ACA	2	6	670828	670833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855238
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11613	NC_013422	GGAT	2	8	671179	671186	25 %	25 %	50 %	0 %	261855238
11614	NC_013422	TAA	2	6	671199	671204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261855238
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11616	NC_013422	GC	3	6	671682	671687	0 %	0 %	50 %	50 %	261855239
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11618	NC_013422	CA	3	6	671793	671798	50 %	0 %	0 %	50 %	261855239
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11737	NC_013422	GGC	2	6	678628	678633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855245
11738	NC_013422	CGA	2	6	678796	678801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855245
11739	NC_013422	CAT	2	6	678961	678966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855245
11740	NC_013422	GGT	2	6	679096	679101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855245
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11744	NC_013422	CGAT	2	8	679311	679318	25 %	25 %	25 %	25 %	261855245
11745	NC_013422	TG	3	6	679369	679374	0 %	50 %	50 %	0 %	261855245
11746	NC_013422	GAG	2	6	679407	679412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261855246
11747	NC_013422	AAG	2	6	679462	679467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855246
11748	NC_013422	GCG	2	6	679476	679481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855246
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11750	NC_013422	TCA	2	6	679642	679647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855246
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11753	NC_013422	CGA	2	6	679821	679826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855246
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11755	NC_013422	CAA	2	6	680006	680011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855246
11756	NC_013422	TCA	2	6	680014	680019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855246
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11758	NC_013422	A	6	6	680097	680102	100 %	0 %	0 %	0 %	261855246
11759	NC_013422	ATG	2	6	680125	680130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855246
11760	NC_013422	GCG	2	6	680166	680171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855246
11761	NC_013422	GTGA	2	8	680274	680281	25 %	25 %	50 %	0 %	261855246
11762	NC_013422	GC	3	6	680290	680295	0 %	0 %	50 %	50 %	261855246
11763	NC_013422	ACT	2	6	680302	680307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855246
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11765	NC_013422	GCC	2	6	680358	680363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855246
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11768	NC_013422	TCA	2	6	680538	680543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855247
11769	NC_013422	CTG	2	6	680567	680572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855247
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11810	NC_013422	GACA	2	8	682729	682736	50 %	0 %	25 %	25 %	261855248
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11833	NC_013422	GGC	2	6	683930	683935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855250
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11838	NC_013422	ATC	2	6	684146	684151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855250
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11841	NC_013422	GCA	2	6	684322	684327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855250
11842	NC_013422	CTT	2	6	684328	684333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261855250
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11845	NC_013422	CTG	2	6	684413	684418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855250
11846	NC_013422	CCG	2	6	684432	684437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855250
11847	NC_013422	CTGG	2	8	684472	684479	0 %	25 %	50 %	25 %	261855250
11848	NC_013422	TCGG	2	8	684483	684490	0 %	25 %	50 %	25 %	261855250
11849	NC_013422	ATGA	2	8	684491	684498	50 %	25 %	25 %	0 %	261855250
11850	NC_013422	ACG	2	6	684516	684521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855250
11851	NC_013422	ATCGG	2	10	684549	684558	20 %	20 %	40 %	20 %	261855251
11852	NC_013422	CG	3	6	684575	684580	0 %	0 %	50 %	50 %	261855251
11853	NC_013422	GC	3	6	684660	684665	0 %	0 %	50 %	50 %	261855251
11854	NC_013422	TGC	2	6	684805	684810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855251
11855	NC_013422	GCG	2	6	684894	684899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855251
11856	NC_013422	GCCT	2	8	684926	684933	0 %	25 %	25 %	50 %	261855251
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11979	NC_013422	GTCAG	2	10	691454	691463	20 %	20 %	40 %	20 %	261855258
11980	NC_013422	CGA	2	6	691473	691478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855258
11981	NC_013422	TTG	2	6	691480	691485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855258
11982	NC_013422	ACA	2	6	691502	691507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261855258
11983	NC_013422	TCGA	2	8	691603	691610	25 %	25 %	25 %	25 %	261855258
11984	NC_013422	GCT	2	6	691800	691805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855258
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11987	NC_013422	ATC	2	6	692096	692101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855258
11988	NC_013422	CAGG	2	8	692140	692147	25 %	0 %	50 %	25 %	261855258
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11991	NC_013422	GC	3	6	692306	692311	0 %	0 %	50 %	50 %	261855258
11992	NC_013422	GGC	2	6	692359	692364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855258
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