MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 45067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9502	NC_013422	TCA	2	6	538153	538158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855123
9503	NC_013422	CGC	2	6	538223	538228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855123
9504	NC_013422	ATG	2	6	538230	538235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855123
9505	NC_013422	GAAAA	2	10	538265	538274	80 %	0 %	20 %	0 %	261855123
9506	NC_013422	CCAT	2	8	538417	538424	25 %	25 %	0 %	50 %	261855123
9507	NC_013422	CCGATG	2	12	538500	538511	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	261855123
9508	NC_013422	CCAC	2	8	538633	538640	25 %	0 %	0 %	75 %	261855123
9509	NC_013422	TTG	2	6	538713	538718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855124
9510	NC_013422	TGG	2	6	538738	538743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855124
9511	NC_013422	TCG	2	6	538756	538761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855124
9512	NC_013422	CGG	2	6	538823	538828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855124
9513	NC_013422	TCA	2	6	538877	538882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855124
9514	NC_013422	GTTC	2	8	538903	538910	0 %	50 %	25 %	25 %	261855124
9515	NC_013422	CGG	2	6	538930	538935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855124
9516	NC_013422	GTTC	2	8	538991	538998	0 %	50 %	25 %	25 %	261855124
9517	NC_013422	CAGG	2	8	539042	539049	25 %	0 %	50 %	25 %	261855125
9518	NC_013422	GCA	2	6	539133	539138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855125
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9520	NC_013422	CGG	2	6	539250	539255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855125
9521	NC_013422	AGT	2	6	539357	539362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855126
9522	NC_013422	TCG	2	6	539450	539455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855126
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9524	NC_013422	TGC	2	6	539493	539498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855126
9525	NC_013422	CGTT	2	8	539535	539542	0 %	50 %	25 %	25 %	261855126
9526	NC_013422	TGCC	2	8	539563	539570	0 %	25 %	25 %	50 %	261855126
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9528	NC_013422	TGG	2	6	539613	539618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855126
9529	NC_013422	GC	3	6	539816	539821	0 %	0 %	50 %	50 %	261855126
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9531	NC_013422	TCG	2	6	539906	539911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855126
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9533	NC_013422	TGC	2	6	539964	539969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855126
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9537	NC_013422	GCA	2	6	540069	540074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855126
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9539	NC_013422	ACGGC	2	10	540261	540270	20 %	0 %	40 %	40 %	261855126
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9541	NC_013422	CCGT	2	8	540458	540465	0 %	25 %	25 %	50 %	261855126
9542	NC_013422	T	7	7	540514	540520	0 %	100 %	0 %	0 %	261855127
9543	NC_013422	AGGGA	2	10	540533	540542	40 %	0 %	60 %	0 %	261855127
9544	NC_013422	ATGG	2	8	540633	540640	25 %	25 %	50 %	0 %	261855127
9545	NC_013422	TGA	2	6	540676	540681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855127
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9622	NC_013422	CTA	2	6	544825	544830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855132
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9625	NC_013422	GCT	2	6	544978	544983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855132
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9986	NC_013422	C	6	6	565300	565305	0 %	0 %	0 %	100 %	261855148
9987	NC_013422	CTG	2	6	565312	565317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855148
9988	NC_013422	CGT	2	6	565413	565418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855148
9989	NC_013422	CG	3	6	565451	565456	0 %	0 %	50 %	50 %	261855148
9990	NC_013422	GAA	2	6	565546	565551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855148
9991	NC_013422	CCG	2	6	565619	565624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855148
9992	NC_013422	CGG	2	6	565694	565699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855148
9993	NC_013422	GTC	2	6	565714	565719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855148
9994	NC_013422	AAG	2	6	565739	565744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855148
9995	NC_013422	CCG	2	6	565778	565783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855148
9996	NC_013422	ATC	2	6	565840	565845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855148
9997	NC_013422	TGA	2	6	565879	565884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855148
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9999	NC_013422	CGG	2	6	566011	566016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855149
10000	NC_013422	CCG	2	6	566061	566066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855149

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