MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 45067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7003	NC_013422	GGTG	2	8	392610	392617	0 %	25 %	75 %	0 %	261855001
7004	NC_013422	CAC	2	6	392642	392647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855001
7005	NC_013422	CAC	2	6	392651	392656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855001
7006	NC_013422	GCTG	2	8	392686	392693	0 %	25 %	50 %	25 %	261855001
7007	NC_013422	ACC	2	6	392739	392744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261855001
7008	NC_013422	TGT	2	6	392774	392779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855001
7009	NC_013422	TTG	2	6	392821	392826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855001
7010	NC_013422	TG	3	6	392908	392913	0 %	50 %	50 %	0 %	261855001
7011	NC_013422	GAT	2	6	392946	392951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855001
7012	NC_013422	GCCAC	2	10	392974	392983	20 %	0 %	20 %	60 %	261855001
7013	NC_013422	GCC	2	6	392985	392990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855001
7014	NC_013422	GGC	2	6	393069	393074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855001
7015	NC_013422	AGT	2	6	393088	393093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855001
7016	NC_013422	GCCGG	2	10	393563	393572	0 %	0 %	60 %	40 %	261855002
7017	NC_013422	TCA	2	6	393573	393578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855002
7018	NC_013422	AG	3	6	393613	393618	50 %	0 %	50 %	0 %	261855002
7019	NC_013422	CCG	2	6	393623	393628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855002
7020	NC_013422	CGA	2	6	393665	393670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855002
7021	NC_013422	CGC	2	6	393720	393725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855002
7022	NC_013422	CGA	2	6	393765	393770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855002
7023	NC_013422	ATC	2	6	393821	393826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855002
7024	NC_013422	TGAC	2	8	393836	393843	25 %	25 %	25 %	25 %	261855002
7025	NC_013422	TCA	2	6	393926	393931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855002
7026	NC_013422	GTTG	2	8	393979	393986	0 %	50 %	50 %	0 %	261855002
7027	NC_013422	GCA	2	6	394041	394046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855002
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7032	NC_013422	CGC	2	6	394155	394160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855002
7033	NC_013422	CGG	2	6	394197	394202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855002
7034	NC_013422	CGA	2	6	394215	394220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855002
7035	NC_013422	TTGA	2	8	394297	394304	25 %	50 %	25 %	0 %	261855002
7036	NC_013422	GGC	2	6	394583	394588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855003
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7039	NC_013422	GC	3	6	394658	394663	0 %	0 %	50 %	50 %	261855003
7040	NC_013422	GGT	2	6	394676	394681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855003
7041	NC_013422	GCG	2	6	394700	394705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855003
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7044	NC_013422	TGA	2	6	394861	394866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855003
7045	NC_013422	CGT	2	6	394875	394880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855003
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7049	NC_013422	ATT	2	6	395114	395119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261855004
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7052	NC_013422	GAT	2	6	395209	395214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855004
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7055	NC_013422	TGC	3	9	395385	395393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855004
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7057	NC_013422	TTG	2	6	395472	395477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855004
7058	NC_013422	TCA	2	6	395478	395483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261855004
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7121	NC_013422	CGC	2	6	398720	398725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855006
7122	NC_013422	CGT	2	6	398767	398772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855006
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7130	NC_013422	GTG	2	6	399473	399478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855006
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7144	NC_013422	GTT	3	9	400264	400272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261855007
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7240	NC_013422	GAT	2	6	406450	406455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855012
7241	NC_013422	GCG	2	6	406475	406480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855012
7242	NC_013422	GAA	2	6	406522	406527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855012
7243	NC_013422	TGG	2	6	406655	406660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261855012
7244	NC_013422	TTA	2	6	406692	406697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261855012
7245	NC_013422	GGC	2	6	406848	406853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855012
7246	NC_013422	AAG	2	6	406862	406867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855012
7247	NC_013422	CGCAA	2	10	406950	406959	40 %	0 %	20 %	40 %	261855012
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7250	NC_013422	CCG	2	6	407063	407068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855012
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7265	NC_013422	CG	3	6	408074	408079	0 %	0 %	50 %	50 %	261855013
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7273	NC_013422	TGC	2	6	408668	408673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855014
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7283	NC_013422	GCTG	2	8	409186	409193	0 %	25 %	50 %	25 %	261855014
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7332	NC_013422	GAT	2	6	411326	411331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855016
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7342	NC_013422	GCT	2	6	411970	411975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855017
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7350	NC_013422	TGC	2	6	412596	412601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855017
7351	NC_013422	GAT	2	6	412612	412617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855017
7352	NC_013422	TGA	2	6	412635	412640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261855017
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7354	NC_013422	GAA	2	6	412667	412672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261855017
7355	NC_013422	GCAA	2	8	412677	412684	50 %	0 %	25 %	25 %	261855017
7356	NC_013422	CCGC	2	8	412695	412702	0 %	0 %	25 %	75 %	261855017
7357	NC_013422	CGG	2	6	412721	412726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855017
7358	NC_013422	CGG	2	6	412782	412787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855017
7359	NC_013422	T	6	6	412802	412807	0 %	100 %	0 %	0 %	261855017
7360	NC_013422	GGGCTG	2	12	412847	412858	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	261855017
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7362	NC_013422	GAGC	2	8	413010	413017	25 %	0 %	50 %	25 %	261855017
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7479	NC_013422	ATT	2	6	420283	420288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261855024
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7481	NC_013422	GTC	2	6	420373	420378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855024
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7483	NC_013422	TGAT	2	8	420497	420504	25 %	50 %	25 %	0 %	261855024
7484	NC_013422	CGA	2	6	420615	420620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261855024
7485	NC_013422	CTG	2	6	420638	420643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855024
7486	NC_013422	GC	3	6	420715	420720	0 %	0 %	50 %	50 %	261855024
7487	NC_013422	ATT	2	6	420745	420750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261855024
7488	NC_013422	GTC	2	6	420751	420756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261855024
7489	NC_013422	CCAG	2	8	420798	420805	25 %	0 %	25 %	50 %	261855024
7490	NC_013422	CG	3	6	420806	420811	0 %	0 %	50 %	50 %	261855024
7491	NC_013422	GCC	2	6	420829	420834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855024
7492	NC_013422	GCC	2	6	420872	420877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261855024
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7497	NC_013422	GTCG	2	8	421152	421159	0 %	25 %	50 %	25 %	261855024
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7499	NC_013422	GC	3	6	421264	421269	0 %	0 %	50 %	50 %	261855024
7500	NC_013422	GGC	2	6	421331	421336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261855024

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