MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 45067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_013422	CGC	2	6	361804	361809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261854984
6502	NC_013422	CCA	2	6	361837	361842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261854984
6503	NC_013422	CGA	2	6	361990	361995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854984
6504	NC_013422	TG	3	6	362085	362090	0 %	50 %	50 %	0 %	261854984
6505	NC_013422	CGG	2	6	362110	362115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854984
6506	NC_013422	GTCA	2	8	362285	362292	25 %	25 %	25 %	25 %	261854984
6507	NC_013422	CGAG	2	8	362317	362324	25 %	0 %	50 %	25 %	261854984
6508	NC_013422	G	6	6	362362	362367	0 %	0 %	100 %	0 %	261854984
6509	NC_013422	ACC	2	6	362378	362383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261854984
6510	NC_013422	CTGATG	2	12	362427	362438	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	261854984
6511	NC_013422	CCG	2	6	362490	362495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261854984
6512	NC_013422	GGT	2	6	362648	362653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854984
6513	NC_013422	CGG	2	6	362673	362678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854984
6514	NC_013422	GCT	2	6	362687	362692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854984
6515	NC_013422	GAA	2	6	362704	362709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261854984
6516	NC_013422	TGG	2	6	362945	362950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854985
6517	NC_013422	ATG	2	6	363022	363027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261854985
6518	NC_013422	GTT	3	9	363033	363041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261854985
6519	NC_013422	AACC	2	8	363059	363066	50 %	0 %	0 %	50 %	261854985
6520	NC_013422	AGC	2	6	363085	363090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854985
6521	NC_013422	GAC	2	6	363149	363154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854985
6522	NC_013422	TGC	2	6	363175	363180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854985
6523	NC_013422	TCGT	2	8	363197	363204	0 %	50 %	25 %	25 %	261854985
6524	NC_013422	GC	3	6	363211	363216	0 %	0 %	50 %	50 %	261854985
6525	NC_013422	ACG	2	6	363228	363233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854985
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6527	NC_013422	GC	3	6	363252	363257	0 %	0 %	50 %	50 %	261854985
6528	NC_013422	TCAA	2	8	363260	363267	50 %	25 %	0 %	25 %	261854985
6529	NC_013422	GTG	3	9	363309	363317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854985
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6531	NC_013422	GCC	2	6	363402	363407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261854985
6532	NC_013422	ACC	2	6	363459	363464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261854985
6533	NC_013422	CG	3	6	363481	363486	0 %	0 %	50 %	50 %	261854985
6534	NC_013422	CGC	2	6	363489	363494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261854985
6535	NC_013422	GAA	2	6	363513	363518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261854985
6536	NC_013422	TGC	2	6	363550	363555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854985
6537	NC_013422	GTC	2	6	363608	363613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854985
6538	NC_013422	GGA	2	6	363647	363652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261854985
6539	NC_013422	TGA	2	6	363698	363703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261854985
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6541	NC_013422	TTTTAC	2	12	363833	363844	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	261854985
6542	NC_013422	GCA	2	6	363848	363853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854985
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6544	NC_013422	GC	4	8	363907	363914	0 %	0 %	50 %	50 %	261854985
6545	NC_013422	GGT	2	6	363950	363955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854985
6546	NC_013422	TGC	2	6	363986	363991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854985
6547	NC_013422	A	6	6	364018	364023	100 %	0 %	0 %	0 %	261854985
6548	NC_013422	GTAC	2	8	364098	364105	25 %	25 %	25 %	25 %	261854985
6549	NC_013422	ATG	2	6	364111	364116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261854985
6550	NC_013422	TGA	2	6	364277	364282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261854986
6551	NC_013422	CAG	2	6	364425	364430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854986
6552	NC_013422	GAA	2	6	364440	364445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261854986
6553	NC_013422	ATGC	2	8	364597	364604	25 %	25 %	25 %	25 %	261854987
6554	NC_013422	CGC	2	6	364636	364641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261854987
6555	NC_013422	AAT	2	6	364668	364673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261854987
6556	NC_013422	TTC	2	6	364705	364710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261854987
6557	NC_013422	TTC	3	9	364795	364803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261854987
6558	NC_013422	GCC	2	6	364819	364824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261854987
6559	NC_013422	CAT	2	6	364833	364838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261854987
6560	NC_013422	GGC	2	6	364843	364848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854987
6561	NC_013422	CCA	2	6	364971	364976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261854987
6562	NC_013422	TGG	2	6	365012	365017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854987
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6565	NC_013422	TGC	2	6	365054	365059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854987
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6569	NC_013422	GT	3	6	365332	365337	0 %	50 %	50 %	0 %	261854987
6570	NC_013422	GTT	2	6	365409	365414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261854987
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6573	NC_013422	TGG	2	6	365538	365543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854987
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6580	NC_013422	TGC	2	6	367200	367205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854988
6581	NC_013422	TGC	2	6	367235	367240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854988
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6588	NC_013422	CGG	2	6	367521	367526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854988
6589	NC_013422	GCG	2	6	367537	367542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854988
6590	NC_013422	CAT	2	6	367552	367557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261854988
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6592	NC_013422	GCA	2	6	367591	367596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854988
6593	NC_013422	CTGC	2	8	367684	367691	0 %	25 %	25 %	50 %	261854988
6594	NC_013422	CAAA	2	8	367857	367864	75 %	0 %	0 %	25 %	261854988
6595	NC_013422	GCGTT	2	10	368031	368040	0 %	40 %	40 %	20 %	261854988
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6599	NC_013422	TCGAT	2	10	368268	368277	20 %	40 %	20 %	20 %	261854988
6600	NC_013422	TGC	2	6	368330	368335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854988
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6602	NC_013422	GCGCT	2	10	368434	368443	0 %	20 %	40 %	40 %	261854988
6603	NC_013422	GTC	2	6	368519	368524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854988
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6605	NC_013422	GT	3	6	368570	368575	0 %	50 %	50 %	0 %	261854988
6606	NC_013422	T	7	7	368678	368684	0 %	100 %	0 %	0 %	261854988
6607	NC_013422	T	6	6	368773	368778	0 %	100 %	0 %	0 %	261854988
6608	NC_013422	CACC	2	8	368794	368801	25 %	0 %	0 %	75 %	261854988
6609	NC_013422	GCCT	2	8	368842	368849	0 %	25 %	25 %	50 %	261854988
6610	NC_013422	GCT	2	6	368853	368858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854988
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6612	NC_013422	ATTTCG	2	12	368916	368927	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	261854988
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6619	NC_013422	TTCA	2	8	369522	369529	25 %	50 %	0 %	25 %	261854989
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6621	NC_013422	CAT	2	6	369713	369718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261854989
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6743	NC_013422	CTGG	2	8	375153	375160	0 %	25 %	50 %	25 %	261854993
6744	NC_013422	GCG	2	6	375172	375177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854993
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6747	NC_013422	TGC	2	6	375233	375238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854993
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