MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 45067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_013422	AC	3	6	333947	333952	50 %	0 %	0 %	50 %	261854946
6002	NC_013422	ACC	2	6	334024	334029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261854947
6003	NC_013422	CA	3	6	334124	334129	50 %	0 %	0 %	50 %	261854947
6004	NC_013422	GCC	2	6	334153	334158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261854947
6005	NC_013422	TGGA	2	8	334168	334175	25 %	25 %	50 %	0 %	261854947
6006	NC_013422	GCAGGA	2	12	334176	334187	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	261854947
6007	NC_013422	CTG	2	6	334208	334213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854947
6008	NC_013422	CTA	2	6	334214	334219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261854947
6009	NC_013422	GGT	2	6	334231	334236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854947
6010	NC_013422	GTGG	2	8	334360	334367	0 %	25 %	75 %	0 %	261854947
6011	NC_013422	CAA	2	6	334404	334409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261854947
6012	NC_013422	TGC	2	6	334523	334528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854947
6013	NC_013422	TCT	2	6	334566	334571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261854947
6014	NC_013422	GAT	2	6	334677	334682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261854947
6015	NC_013422	GAT	2	6	334747	334752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261854947
6016	NC_013422	CAA	2	6	334785	334790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261854947
6017	NC_013422	ATC	2	6	334795	334800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261854947
6018	NC_013422	TTC	2	6	335011	335016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261854947
6019	NC_013422	GTG	2	6	335032	335037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854947
6020	NC_013422	CCA	2	6	335063	335068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261854947
6021	NC_013422	CAA	2	6	335073	335078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261854947
6022	NC_013422	ATGC	2	8	335104	335111	25 %	25 %	25 %	25 %	261854947
6023	NC_013422	AAG	2	6	335132	335137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261854947
6024	NC_013422	GCC	2	6	335155	335160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261854947
6025	NC_013422	CGGT	2	8	335162	335169	0 %	25 %	50 %	25 %	261854947
6026	NC_013422	TCA	2	6	335180	335185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261854947
6027	NC_013422	CCAAT	2	10	335210	335219	40 %	20 %	0 %	40 %	261854947
6028	NC_013422	GT	3	6	335345	335350	0 %	50 %	50 %	0 %	261854947
6029	NC_013422	GAA	2	6	335359	335364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261854947
6030	NC_013422	CAT	2	6	335376	335381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261854947
6031	NC_013422	GTTC	2	8	335517	335524	0 %	50 %	25 %	25 %	261854947
6032	NC_013422	GGT	2	6	335533	335538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854947
6033	NC_013422	CGG	3	9	335586	335594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854947
6034	NC_013422	TGG	2	6	335619	335624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854947
6035	NC_013422	CGT	2	6	335625	335630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854947
6036	NC_013422	GTT	2	6	335707	335712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261854947
6037	NC_013422	AAG	2	6	335801	335806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261854947
6038	NC_013422	GAT	2	6	335841	335846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261854947
6039	NC_013422	CGT	2	6	335905	335910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854947
6040	NC_013422	TGG	3	9	335943	335951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854947
6041	NC_013422	CTAC	2	8	336032	336039	25 %	25 %	0 %	50 %	261854947
6042	NC_013422	CTG	2	6	336232	336237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854948
6043	NC_013422	TGG	2	6	336266	336271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854948
6044	NC_013422	GC	3	6	336318	336323	0 %	0 %	50 %	50 %	261854948
6045	NC_013422	AC	3	6	336364	336369	50 %	0 %	0 %	50 %	261854948
6046	NC_013422	CTG	2	6	336507	336512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854948
6047	NC_013422	TCG	2	6	336538	336543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854948
6048	NC_013422	CTC	2	6	336582	336587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261854948
6049	NC_013422	TCG	2	6	336592	336597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854948
6050	NC_013422	CTG	2	6	336615	336620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854948
6051	NC_013422	CGA	2	6	336641	336646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854948
6052	NC_013422	GAC	2	6	336741	336746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854948
6053	NC_013422	CAGAGC	2	12	336754	336765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854948
6054	NC_013422	AGA	2	6	336797	336802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261854948
6055	NC_013422	GAA	2	6	336873	336878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261854948
6056	NC_013422	TCG	2	6	336886	336891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854948
6057	NC_013422	ACC	2	6	336903	336908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261854948
6058	NC_013422	ACC	2	6	336912	336917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261854948
6059	NC_013422	TGGC	2	8	336961	336968	0 %	25 %	50 %	25 %	261854948
6060	NC_013422	CTT	2	6	336984	336989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261854948
6061	NC_013422	GAC	2	6	337005	337010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854948
6062	NC_013422	TCAA	2	8	337044	337051	50 %	25 %	0 %	25 %	261854948
6063	NC_013422	GGT	2	6	337101	337106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854948
6064	NC_013422	TTC	2	6	337119	337124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261854948
6065	NC_013422	GGC	2	6	337290	337295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854948
6066	NC_013422	ATC	2	6	337326	337331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261854948
6067	NC_013422	TAAT	2	8	337335	337342	50 %	50 %	0 %	0 %	261854948
6068	NC_013422	TATCCG	2	12	337357	337368	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	261854949
6069	NC_013422	ATC	2	6	337383	337388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261854949
6070	NC_013422	TTGA	2	8	337391	337398	25 %	50 %	25 %	0 %	261854949
6071	NC_013422	GCA	2	6	337406	337411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854949
6072	NC_013422	GC	3	6	337427	337432	0 %	0 %	50 %	50 %	261854949
6073	NC_013422	CAA	2	6	337513	337518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261854949
6074	NC_013422	CG	3	6	337522	337527	0 %	0 %	50 %	50 %	261854949
6075	NC_013422	CAT	2	6	337567	337572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261854949
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6077	NC_013422	TGC	2	6	337618	337623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854949
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6079	NC_013422	GTCG	2	8	337817	337824	0 %	25 %	50 %	25 %	261854950
6080	NC_013422	CCG	2	6	337941	337946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261854950
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6083	NC_013422	GGC	2	6	338402	338407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854950
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6085	NC_013422	GCT	2	6	338479	338484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854951
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6087	NC_013422	AAG	2	6	338620	338625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261854951
6088	NC_013422	CG	4	8	338650	338657	0 %	0 %	50 %	50 %	261854951
6089	NC_013422	TGG	2	6	338691	338696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854951
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6091	NC_013422	CCGC	2	8	338712	338719	0 %	0 %	25 %	75 %	261854951
6092	NC_013422	AGA	2	6	338732	338737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261854951
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6097	NC_013422	TTC	2	6	338926	338931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261854951
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6100	NC_013422	TCGCG	2	10	339149	339158	0 %	20 %	40 %	40 %	261854952
6101	NC_013422	CAA	2	6	339166	339171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261854952
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6104	NC_013422	GTG	2	6	339265	339270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854952
6105	NC_013422	GTC	2	6	339277	339282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854952
6106	NC_013422	A	6	6	339294	339299	100 %	0 %	0 %	0 %	261854952
6107	NC_013422	AACC	2	8	339402	339409	50 %	0 %	0 %	50 %	261854953
6108	NC_013422	GTC	2	6	339417	339422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854953
6109	NC_013422	GATC	2	8	339436	339443	25 %	25 %	25 %	25 %	261854953
6110	NC_013422	GGT	2	6	339503	339508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854953
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6112	NC_013422	GGT	3	9	339545	339553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854953
6113	NC_013422	ACCGC	2	10	339639	339648	20 %	0 %	20 %	60 %	261854953
6114	NC_013422	CATTG	2	10	339652	339661	20 %	40 %	20 %	20 %	261854953
6115	NC_013422	CGTGG	2	10	339704	339713	0 %	20 %	60 %	20 %	261854953
6116	NC_013422	GTT	2	6	339725	339730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261854953
6117	NC_013422	GC	3	6	339834	339839	0 %	0 %	50 %	50 %	261854953
6118	NC_013422	TGG	2	6	339873	339878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854953
6119	NC_013422	CTGCGT	2	12	339902	339913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854953
6120	NC_013422	TCCG	2	8	340029	340036	0 %	25 %	25 %	50 %	261854953
6121	NC_013422	GGT	3	9	340079	340087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854953
6122	NC_013422	GTC	2	6	340107	340112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854953
6123	NC_013422	CGT	3	9	340190	340198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854953
6124	NC_013422	AAT	2	6	340203	340208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261854953
6125	NC_013422	GCT	2	6	340295	340300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854954
6126	NC_013422	TCG	2	6	340336	340341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854954
6127	NC_013422	GAT	2	6	340345	340350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261854954
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6129	NC_013422	CTGAT	2	10	340647	340656	20 %	40 %	20 %	20 %	261854955
6130	NC_013422	AAG	2	6	340658	340663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261854955
6131	NC_013422	CGA	2	6	340731	340736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854955
6132	NC_013422	CGA	2	6	340744	340749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854955
6133	NC_013422	A	7	7	340808	340814	100 %	0 %	0 %	0 %	261854955
6134	NC_013422	AGCG	2	8	340838	340845	25 %	0 %	50 %	25 %	261854955
6135	NC_013422	GTT	2	6	340940	340945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261854956
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6141	NC_013422	TGC	3	9	341567	341575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854957
6142	NC_013422	CGA	2	6	341627	341632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261854957
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6151	NC_013422	ATCA	2	8	342249	342256	50 %	25 %	0 %	25 %	261854959
6152	NC_013422	CG	3	6	342431	342436	0 %	0 %	50 %	50 %	261854959
6153	NC_013422	ACA	2	6	342494	342499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261854960
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6186	NC_013422	TCAG	2	8	344566	344573	25 %	25 %	25 %	25 %	261854965
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6230	NC_013422	AAGA	2	8	346807	346814	75 %	0 %	25 %	0 %	261854970
6231	NC_013422	CTTGG	2	10	346870	346879	0 %	40 %	40 %	20 %	261854970
6232	NC_013422	TGG	2	6	346923	346928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854970
6233	NC_013422	AC	3	6	346943	346948	50 %	0 %	0 %	50 %	261854970
6234	NC_013422	TCG	2	6	346967	346972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854970
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6237	NC_013422	ATC	2	6	347062	347067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261854970
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6361	NC_013422	GAG	2	6	354555	354560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261854978
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6473	NC_013422	CTG	2	6	360212	360217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854984
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6480	NC_013422	CTGC	2	8	360464	360471	0 %	25 %	25 %	50 %	261854984
6481	NC_013422	TGA	2	6	360529	360534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261854984
6482	NC_013422	GAA	2	6	360548	360553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261854984
6483	NC_013422	GGT	2	6	360584	360589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854984
6484	NC_013422	GC	3	6	360660	360665	0 %	0 %	50 %	50 %	261854984
6485	NC_013422	GGC	2	6	360823	360828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854984
6486	NC_013422	CGCAG	2	10	360886	360895	20 %	0 %	40 %	40 %	261854984
6487	NC_013422	CTT	2	6	360967	360972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261854984
6488	NC_013422	TCG	2	6	360975	360980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854984
6489	NC_013422	ATC	2	6	361028	361033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261854984
6490	NC_013422	CG	3	6	361042	361047	0 %	0 %	50 %	50 %	261854984
6491	NC_013422	TGC	2	6	361167	361172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854984
6492	NC_013422	G	6	6	361252	361257	0 %	0 %	100 %	0 %	261854984
6493	NC_013422	GGT	2	6	361273	361278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261854984
6494	NC_013422	GCG	2	6	361387	361392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854984
6495	NC_013422	GCCA	2	8	361409	361416	25 %	0 %	25 %	50 %	261854984
6496	NC_013422	AC	3	6	361430	361435	50 %	0 %	0 %	50 %	261854984
6497	NC_013422	GC	3	6	361557	361562	0 %	0 %	50 %	50 %	261854984
6498	NC_013422	CGG	2	6	361597	361602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261854984
6499	NC_013422	GGTGA	2	10	361694	361703	20 %	20 %	60 %	0 %	261854984
6500	NC_013422	CGT	2	6	361757	361762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261854984

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