MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halomicrobium mukohataei DSM 12286 chromosome

Total Repeats: 75791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013202	CGG	2	6	37394	37399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386125
1002	NC_013202	TCG	2	6	37484	37489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386125
1003	NC_013202	ACGGTG	2	12	37490	37501	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	257386125
1004	NC_013202	CGA	2	6	37550	37555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386125
1005	NC_013202	CAGC	2	8	37565	37572	25 %	0 %	25 %	50 %	257386125
1006	NC_013202	CGT	2	6	37584	37589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386125
1007	NC_013202	ACG	2	6	37661	37666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386125
1008	NC_013202	TGG	2	6	37704	37709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257386125
1009	NC_013202	GAC	2	6	37758	37763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386125
1010	NC_013202	CCG	2	6	37781	37786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386125
1011	NC_013202	CGA	2	6	37799	37804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386125
1012	NC_013202	GCGA	2	8	37807	37814	25 %	0 %	50 %	25 %	257386125
1013	NC_013202	GC	3	6	37838	37843	0 %	0 %	50 %	50 %	257386125
1014	NC_013202	CGT	2	6	37989	37994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386126
1015	NC_013202	CGC	2	6	38021	38026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386126
1016	NC_013202	CGA	3	9	38072	38080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386126
1017	NC_013202	GCCGTC	3	18	38085	38102	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	257386126
1018	NC_013202	CG	3	6	38172	38177	0 %	0 %	50 %	50 %	257386126
1019	NC_013202	CGT	2	6	38324	38329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386126
1020	NC_013202	CGA	2	6	38366	38371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386126
1021	NC_013202	TCG	2	6	38395	38400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386126
1022	NC_013202	CGG	3	9	38432	38440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386126
1023	NC_013202	CGGT	2	8	38449	38456	0 %	25 %	50 %	25 %	257386126
1024	NC_013202	GAA	2	6	38526	38531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257386126
1025	NC_013202	CGT	2	6	38562	38567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386126
1026	NC_013202	CGT	2	6	38696	38701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386126
1027	NC_013202	CTC	2	6	38718	38723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257386126
1028	NC_013202	CGT	2	6	38768	38773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386126
1029	NC_013202	CGT	2	6	38870	38875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386126
1030	NC_013202	CGA	2	6	38882	38887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386126
1031	NC_013202	CGT	2	6	38915	38920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386126
1032	NC_013202	TG	3	6	38941	38946	0 %	50 %	50 %	0 %	257386126
1033	NC_013202	CGG	2	6	38948	38953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386126
1034	NC_013202	GAA	2	6	38970	38975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257386126
1035	NC_013202	ACCG	2	8	38985	38992	25 %	0 %	25 %	50 %	257386126
1036	NC_013202	CG	3	6	38991	38996	0 %	0 %	50 %	50 %	257386126
1037	NC_013202	GCG	2	6	39001	39006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386126
1038	NC_013202	GTC	2	6	39057	39062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386126
1039	NC_013202	ATCG	2	8	39074	39081	25 %	25 %	25 %	25 %	257386126
1040	NC_013202	CGG	2	6	39098	39103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386126
1041	NC_013202	CTC	2	6	39132	39137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257386126
1042	NC_013202	CAG	2	6	39148	39153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386126
1043	NC_013202	CGC	2	6	39157	39162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386126
1044	NC_013202	CGG	2	6	39179	39184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386126
1045	NC_013202	AGCG	2	8	39186	39193	25 %	0 %	50 %	25 %	257386126
1046	NC_013202	TCG	2	6	39207	39212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386126
1047	NC_013202	ACGT	2	8	39223	39230	25 %	25 %	25 %	25 %	257386126
1048	NC_013202	ACCG	2	8	39237	39244	25 %	0 %	25 %	50 %	257386126
1049	NC_013202	TCA	2	6	39278	39283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257386126
1050	NC_013202	CTC	2	6	39493	39498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257386127
1051	NC_013202	TCG	2	6	39518	39523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386127
1052	NC_013202	TCG	2	6	39557	39562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386127
1053	NC_013202	CGG	2	6	39669	39674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386128
1054	NC_013202	GCC	2	6	39719	39724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386128
1055	NC_013202	GAA	2	6	39755	39760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257386128
1056	NC_013202	GTC	2	6	39786	39791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386128
1057	NC_013202	GCCT	2	8	39804	39811	0 %	25 %	25 %	50 %	257386128
1058	NC_013202	CGT	2	6	39836	39841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386128
1059	NC_013202	CGGATC	2	12	39944	39955	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257386128
1060	NC_013202	CGG	2	6	39976	39981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386128
1061	NC_013202	CGT	2	6	40051	40056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386128
1062	NC_013202	GT	4	8	40059	40066	0 %	50 %	50 %	0 %	257386128
1063	NC_013202	ATC	2	6	40092	40097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257386128
1064	NC_013202	CGT	2	6	40105	40110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386128
1065	NC_013202	C	6	6	40138	40143	0 %	0 %	0 %	100 %	257386128
1066	NC_013202	GCCGTC	2	12	40181	40192	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	257386128
1067	NC_013202	AGG	2	6	40215	40220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257386128
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1069	NC_013202	CGG	2	6	40243	40248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386128
1070	NC_013202	CAA	2	6	40295	40300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257386128
1071	NC_013202	CGC	2	6	40313	40318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386128
1072	NC_013202	ATC	2	6	40365	40370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257386128
1073	NC_013202	CGT	2	6	40391	40396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386128
1074	NC_013202	GC	3	6	40406	40411	0 %	0 %	50 %	50 %	257386128
1075	NC_013202	TCGAG	2	10	40429	40438	20 %	20 %	40 %	20 %	257386128
1076	NC_013202	AG	3	6	40445	40450	50 %	0 %	50 %	0 %	257386128
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1078	NC_013202	TCG	3	9	40486	40494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386128
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1081	NC_013202	CGTC	2	8	40573	40580	0 %	25 %	25 %	50 %	257386128
1082	NC_013202	TCG	2	6	40597	40602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386128
1083	NC_013202	CTC	2	6	40673	40678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257386128
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1088	NC_013202	TCG	2	6	41022	41027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386129
1089	NC_013202	CGT	2	6	41044	41049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386129
1090	NC_013202	TCGC	2	8	41094	41101	0 %	25 %	25 %	50 %	257386129
1091	NC_013202	TCG	2	6	41124	41129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386129
1092	NC_013202	GGT	2	6	41132	41137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257386129
1093	NC_013202	GT	3	6	41136	41141	0 %	50 %	50 %	0 %	257386129
1094	NC_013202	TCG	2	6	41187	41192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386129
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1096	NC_013202	CGAG	2	8	41200	41207	25 %	0 %	50 %	25 %	257386129
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1099	NC_013202	CGAA	2	8	41239	41246	50 %	0 %	25 %	25 %	257386129
1100	NC_013202	CG	4	8	41247	41254	0 %	0 %	50 %	50 %	257386129
1101	NC_013202	CGAT	2	8	41274	41281	25 %	25 %	25 %	25 %	257386129
1102	NC_013202	CGA	4	12	41287	41298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386129
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1104	NC_013202	CGC	2	6	41588	41593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386130
1105	NC_013202	TCG	2	6	41633	41638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386130
1106	NC_013202	CGG	2	6	41814	41819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386131
1107	NC_013202	CGGTG	2	10	41868	41877	0 %	20 %	60 %	20 %	257386131
1108	NC_013202	GGC	2	6	41881	41886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386131
1109	NC_013202	TCGC	2	8	41894	41901	0 %	25 %	25 %	50 %	257386131
1110	NC_013202	CGC	2	6	41905	41910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386131
1111	NC_013202	CTC	2	6	41911	41916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257386131
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1114	NC_013202	TCGA	2	8	42014	42021	25 %	25 %	25 %	25 %	257386131
1115	NC_013202	CGG	2	6	42028	42033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386131
1116	NC_013202	CGG	2	6	42066	42071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386131
1117	NC_013202	GCA	2	6	42081	42086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386131
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1119	NC_013202	CGA	2	6	42141	42146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386131
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1122	NC_013202	TGA	2	6	42222	42227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257386131
1123	NC_013202	ACGA	2	8	42230	42237	50 %	0 %	25 %	25 %	257386131
1124	NC_013202	AGG	3	9	42263	42271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257386131
1125	NC_013202	TCG	2	6	42317	42322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386131
1126	NC_013202	TCA	2	6	42342	42347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257386131
1127	NC_013202	GCT	2	6	42372	42377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386131
1128	NC_013202	AG	3	6	42388	42393	50 %	0 %	50 %	0 %	257386131
1129	NC_013202	TGG	2	6	42395	42400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257386131
1130	NC_013202	GGC	2	6	42425	42430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386131
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1132	NC_013202	CGG	2	6	42470	42475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386131
1133	NC_013202	CTT	2	6	42502	42507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257386131
1134	NC_013202	CGT	2	6	42523	42528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386131
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1155	NC_013202	GTCG	2	8	43265	43272	0 %	25 %	50 %	25 %	257386132
1156	NC_013202	CAG	2	6	43374	43379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386132
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1239	NC_013202	CG	3	6	47126	47131	0 %	0 %	50 %	50 %	257386135
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1247	NC_013202	CCG	2	6	47343	47348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386135
1248	NC_013202	CGTC	2	8	47380	47387	0 %	25 %	25 %	50 %	257386135
1249	NC_013202	GAC	2	6	47533	47538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386135
1250	NC_013202	GTCG	2	8	47614	47621	0 %	25 %	50 %	25 %	257386135
1251	NC_013202	TCG	3	9	47619	47627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386135
1252	NC_013202	GTC	2	6	47630	47635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386135
1253	NC_013202	TCCC	2	8	47651	47658	0 %	25 %	0 %	75 %	257386135
1254	NC_013202	GTC	2	6	47723	47728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386135
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1257	NC_013202	CTG	2	6	47927	47932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386135
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1260	NC_013202	ATT	2	6	48029	48034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257386135
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1353	NC_013202	GAC	2	6	52547	52552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386138
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1357	NC_013202	AC	3	6	52695	52700	50 %	0 %	0 %	50 %	257386138
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1361	NC_013202	GAG	2	6	52832	52837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257386138
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1364	NC_013202	AACG	2	8	52915	52922	50 %	0 %	25 %	25 %	257386138
1365	NC_013202	GTC	2	6	52955	52960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386138
1366	NC_013202	TC	3	6	52986	52991	0 %	50 %	0 %	50 %	257386138
1367	NC_013202	CTG	2	6	53009	53014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386138
1368	NC_013202	GAC	2	6	53039	53044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386138
1369	NC_013202	CGA	2	6	53219	53224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386139
1370	NC_013202	AGC	2	6	53233	53238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386139
1371	NC_013202	GTC	2	6	53278	53283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386139
1372	NC_013202	CGT	2	6	53319	53324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386139
1373	NC_013202	CGT	2	6	53376	53381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386139
1374	NC_013202	CGA	2	6	53406	53411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386139
1375	NC_013202	ACC	2	6	53496	53501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257386139
1376	NC_013202	CCA	3	9	53503	53511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257386139
1377	NC_013202	TCG	4	12	53522	53533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386139
1378	NC_013202	GTC	3	9	53554	53562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386139
1379	NC_013202	GAC	2	6	53622	53627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386139
1380	NC_013202	TCG	2	6	53641	53646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386139
1381	NC_013202	TCG	2	6	53663	53668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386139
1382	NC_013202	GTCC	2	8	53681	53688	0 %	25 %	25 %	50 %	257386139
1383	NC_013202	CGT	2	6	53705	53710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386139
1384	NC_013202	TCC	2	6	53713	53718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257386139
1385	NC_013202	CTCCGT	2	12	53793	53804	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	257386139
1386	NC_013202	CGT	2	6	53811	53816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386139
1387	NC_013202	TCG	2	6	53818	53823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386139
1388	NC_013202	GA	3	6	53836	53841	50 %	0 %	50 %	0 %	257386139
1389	NC_013202	CGA	2	6	53993	53998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386139
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1397	NC_013202	GTCGT	2	10	54413	54422	0 %	40 %	40 %	20 %	257386140
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1401	NC_013202	CGTC	2	8	54486	54493	0 %	25 %	25 %	50 %	257386140
1402	NC_013202	CGTC	2	8	54507	54514	0 %	25 %	25 %	50 %	257386140
1403	NC_013202	CGTC	2	8	54528	54535	0 %	25 %	25 %	50 %	257386140
1404	NC_013202	CGTC	2	8	54549	54556	0 %	25 %	25 %	50 %	257386140
1405	NC_013202	CGTC	2	8	54570	54577	0 %	25 %	25 %	50 %	257386140
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1407	NC_013202	TCG	4	12	54626	54637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386140
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1425	NC_013202	CGAC	2	8	55320	55327	25 %	0 %	25 %	50 %	257386140
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1444	NC_013202	GAC	2	6	56732	56737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386141
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1452	NC_013202	CGA	2	6	57021	57026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386141
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1472	NC_013202	CCG	2	6	57880	57885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386141
1473	NC_013202	CGGAGT	2	12	57892	57903	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	257386141
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1475	NC_013202	GACCG	2	10	57935	57944	20 %	0 %	40 %	40 %	257386141
1476	NC_013202	AGTCG	2	10	57966	57975	20 %	20 %	40 %	20 %	257386141
1477	NC_013202	CGTGG	2	10	58022	58031	0 %	20 %	60 %	20 %	257386141
1478	NC_013202	AGC	2	6	58045	58050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386141
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1480	NC_013202	GTC	2	6	58167	58172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386141
1481	NC_013202	ACGA	2	8	58227	58234	50 %	0 %	25 %	25 %	257386141
1482	NC_013202	GCT	2	6	58240	58245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386141
1483	NC_013202	GCTC	2	8	58693	58700	0 %	25 %	25 %	50 %	257386142
1484	NC_013202	CGA	2	6	58757	58762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386142
1485	NC_013202	GAG	2	6	58813	58818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257386142
1486	NC_013202	TGA	2	6	58857	58862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257386143
1487	NC_013202	GCA	2	6	58915	58920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386143
1488	NC_013202	TC	3	6	58924	58929	0 %	50 %	0 %	50 %	257386143
1489	NC_013202	CATC	2	8	59026	59033	25 %	25 %	0 %	50 %	257386143
1490	NC_013202	CCG	2	6	59034	59039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386143
1491	NC_013202	CT	3	6	59069	59074	0 %	50 %	0 %	50 %	257386143
1492	NC_013202	TCA	2	6	59118	59123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257386143
1493	NC_013202	GTT	2	6	59141	59146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257386143
1494	NC_013202	CGA	2	6	59173	59178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386143
1495	NC_013202	TCGAGA	2	12	59196	59207	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	257386143
1496	NC_013202	GTC	2	6	59305	59310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386144
1497	NC_013202	TCG	2	6	59359	59364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386144
1498	NC_013202	CAC	2	6	59368	59373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257386144
1499	NC_013202	CGT	2	6	59487	59492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386144
1500	NC_013202	GTG	2	6	59497	59502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257386144

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