MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halomicrobium mukohataei DSM 12286 chromosome

Total Repeats: 75791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_013202	TGGC	2	8	544856	544863	0 %	25 %	50 %	25 %	257386646
13002	NC_013202	CTC	2	6	544942	544947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257386646
13003	NC_013202	CGA	3	9	544974	544982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386646
13004	NC_013202	CGT	2	6	544989	544994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386646
13005	NC_013202	TGC	2	6	545076	545081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386646
13006	NC_013202	GAC	2	6	545270	545275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386647
13007	NC_013202	CAG	2	6	545282	545287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386647
13008	NC_013202	CGA	2	6	545305	545310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386647
13009	NC_013202	GAA	2	6	545372	545377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257386647
13010	NC_013202	CGC	2	6	545380	545385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386647
13011	NC_013202	CGG	2	6	545397	545402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386647
13012	NC_013202	CAG	2	6	545432	545437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386647
13013	NC_013202	CGG	2	6	545489	545494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386647
13014	NC_013202	CGA	2	6	545512	545517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386647
13015	NC_013202	CAG	2	6	545525	545530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386647
13016	NC_013202	GAG	2	6	545573	545578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257386647
13017	NC_013202	GAC	2	6	545579	545584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386647
13018	NC_013202	CGA	2	6	545602	545607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386647
13019	NC_013202	C	7	7	545609	545615	0 %	0 %	0 %	100 %	257386647
13020	NC_013202	CGA	2	6	545623	545628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386647
13021	NC_013202	CGA	2	6	545638	545643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386647
13022	NC_013202	CTC	2	6	545663	545668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257386647
13023	NC_013202	TCG	2	6	545682	545687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386647
13024	NC_013202	TCG	2	6	545694	545699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386647
13025	NC_013202	TCG	2	6	545706	545711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386647
13026	NC_013202	GTGCG	2	10	545717	545726	0 %	20 %	60 %	20 %	257386647
13027	NC_013202	CGA	2	6	545908	545913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386648
13028	NC_013202	GCT	3	9	545921	545929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386648
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13030	NC_013202	CGG	2	6	545963	545968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386648
13031	NC_013202	GTC	2	6	545987	545992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386648
13032	NC_013202	GC	3	6	546008	546013	0 %	0 %	50 %	50 %	257386648
13033	NC_013202	CGGT	2	8	546048	546055	0 %	25 %	50 %	25 %	257386648
13034	NC_013202	CGC	2	6	546061	546066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386648
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13037	NC_013202	TCG	2	6	546126	546131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386648
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13039	NC_013202	CGG	2	6	546166	546171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386648
13040	NC_013202	CGT	2	6	546178	546183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386648
13041	NC_013202	CGTCG	2	10	546221	546230	0 %	20 %	40 %	40 %	257386648
13042	NC_013202	GTC	2	6	546234	546239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386648
13043	NC_013202	CGT	2	6	546241	546246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386648
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13047	NC_013202	GAC	2	6	546317	546322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386648
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13049	NC_013202	GGTC	2	8	546334	546341	0 %	25 %	50 %	25 %	257386648
13050	NC_013202	GC	3	6	546349	546354	0 %	0 %	50 %	50 %	257386648
13051	NC_013202	GACC	2	8	546360	546367	25 %	0 %	25 %	50 %	257386648
13052	NC_013202	CGAG	2	8	546370	546377	25 %	0 %	50 %	25 %	257386648
13053	NC_013202	GCGAGC	2	12	546402	546413	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	257386648
13054	NC_013202	GCG	2	6	546414	546419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386648
13055	NC_013202	GCC	2	6	546426	546431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386648
13056	NC_013202	CCGTC	2	10	546457	546466	0 %	20 %	20 %	60 %	257386648
13057	NC_013202	GAC	2	6	546566	546571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386648
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13060	NC_013202	GTCG	2	8	546664	546671	0 %	25 %	50 %	25 %	257386648
13061	NC_013202	CGA	2	6	546676	546681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386648
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13065	NC_013202	GAC	2	6	546733	546738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386648
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13084	NC_013202	GACA	2	8	547559	547566	50 %	0 %	25 %	25 %	257386649
13085	NC_013202	CGT	3	9	547567	547575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386649
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13090	NC_013202	CGC	2	6	547672	547677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386649
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13098	NC_013202	CTTG	2	8	548023	548030	0 %	50 %	25 %	25 %	257386649
13099	NC_013202	CAG	2	6	548057	548062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386649
13100	NC_013202	TCGCCG	2	12	548074	548085	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	257386649
13101	NC_013202	AGC	2	6	548145	548150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386649
13102	NC_013202	GTT	2	6	548165	548170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257386649
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13105	NC_013202	CGT	2	6	548318	548323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386649
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13112	NC_013202	GACG	2	8	548600	548607	25 %	0 %	50 %	25 %	257386650
13113	NC_013202	CGT	2	6	548610	548615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386650
13114	NC_013202	CAG	2	6	548619	548624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386650
13115	NC_013202	CGT	2	6	548650	548655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386650
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13117	NC_013202	CGG	2	6	548700	548705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386650
13118	NC_013202	TCG	3	9	548752	548760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386650
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13122	NC_013202	CCCA	2	8	548874	548881	25 %	0 %	0 %	75 %	257386650
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13222	NC_013202	CGC	2	6	554091	554096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386657
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13230	NC_013202	CTG	2	6	554357	554362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386657
13231	NC_013202	CGA	2	6	554371	554376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386657
13232	NC_013202	ACCAC	2	10	554385	554394	40 %	0 %	0 %	60 %	257386657
13233	NC_013202	CCGTCG	2	12	554412	554423	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	257386657
13234	NC_013202	CGACGC	2	12	554469	554480	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	257386657
13235	NC_013202	AGC	2	6	554526	554531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386657
13236	NC_013202	GCC	2	6	554532	554537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386657
13237	NC_013202	TCG	2	6	554562	554567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386657
13238	NC_013202	TCG	2	6	554592	554597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386657
13239	NC_013202	CGA	2	6	554608	554613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386657
13240	NC_013202	GAG	2	6	554639	554644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257386657
13241	NC_013202	GAC	2	6	554662	554667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386657
13242	NC_013202	CGA	2	6	554671	554676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386657
13243	NC_013202	CGA	2	6	554722	554727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386657
13244	NC_013202	CG	3	6	554730	554735	0 %	0 %	50 %	50 %	257386657
13245	NC_013202	CGC	2	6	554778	554783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386657
13246	NC_013202	ACG	2	6	554805	554810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386657
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13248	NC_013202	CGA	2	6	554838	554843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386658
13249	NC_013202	GGA	2	6	554853	554858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257386658
13250	NC_013202	CGA	2	6	554870	554875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386658
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13255	NC_013202	CAC	2	6	555136	555141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257386658
13256	NC_013202	CTG	2	6	555142	555147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386658
13257	NC_013202	ACCG	2	8	555176	555183	25 %	0 %	25 %	50 %	257386658
13258	NC_013202	GTC	2	6	555193	555198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386658
13259	NC_013202	CG	3	6	555266	555271	0 %	0 %	50 %	50 %	257386658
13260	NC_013202	GGC	2	6	555288	555293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386658
13261	NC_013202	CGG	2	6	555305	555310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386658
13262	NC_013202	CCAC	2	8	555332	555339	25 %	0 %	0 %	75 %	257386658
13263	NC_013202	GCG	2	6	555356	555361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386658
13264	NC_013202	ACG	3	9	555376	555384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386658
13265	NC_013202	GTC	2	6	555394	555399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386658
13266	NC_013202	CGA	3	9	555407	555415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386658
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13268	NC_013202	ACGA	2	8	555459	555466	50 %	0 %	25 %	25 %	257386658
13269	NC_013202	CCG	4	12	555468	555479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386659
13270	NC_013202	GCG	2	6	555489	555494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386659
13271	NC_013202	ACC	2	6	555521	555526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257386659
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13273	NC_013202	GAC	2	6	555538	555543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386659
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13293	NC_013202	CGT	2	6	556534	556539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386660
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13300	NC_013202	CG	3	6	556834	556839	0 %	0 %	50 %	50 %	257386660
13301	NC_013202	ACT	2	6	556894	556899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257386661
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13303	NC_013202	CGT	2	6	556933	556938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386661
13304	NC_013202	TCG	2	6	556965	556970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386661
13305	NC_013202	GAC	2	6	556979	556984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386661
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13307	NC_013202	TCG	2	6	556995	557000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386661
13308	NC_013202	TCG	2	6	557022	557027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386661
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13312	NC_013202	GTC	2	6	557144	557149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386661
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13319	NC_013202	TCCG	2	8	557857	557864	0 %	25 %	25 %	50 %	257386662
13320	NC_013202	CGC	2	6	557882	557887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386662
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13330	NC_013202	CGC	2	6	558601	558606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386663
13331	NC_013202	GCTCG	2	10	558622	558631	0 %	20 %	40 %	40 %	257386663
13332	NC_013202	CGG	2	6	558652	558657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386663
13333	NC_013202	GGC	2	6	558683	558688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386663
13334	NC_013202	CTA	2	6	558721	558726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257386663
13335	NC_013202	GTC	2	6	558743	558748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386663
13336	NC_013202	CCG	2	6	558814	558819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386663
13337	NC_013202	GCG	2	6	558834	558839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386663
13338	NC_013202	GAC	2	6	558898	558903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386663
13339	NC_013202	ACC	2	6	558935	558940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257386663
13340	NC_013202	CGAC	2	8	558951	558958	25 %	0 %	25 %	50 %	257386663
13341	NC_013202	GGA	2	6	558967	558972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257386663
13342	NC_013202	CGA	2	6	558994	558999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386663
13343	NC_013202	CGA	3	9	559021	559029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386663
13344	NC_013202	CGA	2	6	559042	559047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386663
13345	NC_013202	TCG	3	9	559050	559058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386663
13346	NC_013202	CGT	2	6	559108	559113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386663
13347	NC_013202	CGTCGA	2	12	559135	559146	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257386663
13348	NC_013202	AAG	2	6	559232	559237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257386663
13349	NC_013202	GAT	2	6	559243	559248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257386663
13350	NC_013202	GAT	2	6	559309	559314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257386663
13351	NC_013202	GTG	2	6	559347	559352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257386663
13352	NC_013202	GAC	2	6	559442	559447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386663
13353	NC_013202	CGG	2	6	559482	559487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386663
13354	NC_013202	TCG	2	6	559503	559508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386663
13355	NC_013202	CGA	2	6	559525	559530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386663
13356	NC_013202	CGA	2	6	559567	559572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386663
13357	NC_013202	CGA	2	6	559609	559614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386663
13358	NC_013202	CGA	3	9	559621	559629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386663
13359	NC_013202	TCA	2	6	559632	559637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257386663
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13362	NC_013202	CAC	2	6	559726	559731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257386663
13363	NC_013202	CAT	2	6	559738	559743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257386663
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13366	NC_013202	CGA	2	6	559816	559821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386663
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13370	NC_013202	TCG	2	6	559863	559868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386663
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13379	NC_013202	GCG	2	6	560560	560565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386664
13380	NC_013202	GCT	2	6	560651	560656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386664
13381	NC_013202	CGG	2	6	560696	560701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386664
13382	NC_013202	CGC	2	6	560719	560724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386664
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13384	NC_013202	TCGA	2	8	560823	560830	25 %	25 %	25 %	25 %	257386664
13385	NC_013202	CTA	2	6	560831	560836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257386664
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13389	NC_013202	GAC	2	6	561078	561083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386664
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13393	NC_013202	GC	3	6	561168	561173	0 %	0 %	50 %	50 %	257386664
13394	NC_013202	GCT	2	6	561179	561184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386664
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13398	NC_013202	GTCG	2	8	561290	561297	0 %	25 %	50 %	25 %	257386664
13399	NC_013202	CGT	2	6	561317	561322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386664
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13405	NC_013202	CGA	2	6	561479	561484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386664
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13420	NC_013202	CGC	2	6	562190	562195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386665
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13423	NC_013202	CCG	2	6	562374	562379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386665
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13449	NC_013202	CGAGGT	2	12	563149	563160	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	257386667
13450	NC_013202	CCG	2	6	563201	563206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386667
13451	NC_013202	CCG	2	6	563217	563222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386667
13452	NC_013202	AGG	3	9	563238	563246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257386667
13453	NC_013202	GCC	2	6	563252	563257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386667
13454	NC_013202	CCT	2	6	563331	563336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257386668
13455	NC_013202	GTC	2	6	563350	563355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386668
13456	NC_013202	GCT	2	6	563391	563396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386668
13457	NC_013202	GCG	2	6	563402	563407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386668
13458	NC_013202	CTA	2	6	563412	563417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257386668
13459	NC_013202	CGG	2	6	563493	563498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386668
13460	NC_013202	ACCC	2	8	563518	563525	25 %	0 %	0 %	75 %	257386668
13461	NC_013202	ACG	3	9	563530	563538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386668
13462	NC_013202	CGGTC	2	10	563592	563601	0 %	20 %	40 %	40 %	257386668
13463	NC_013202	CGA	2	6	563634	563639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386668
13464	NC_013202	GGC	2	6	563643	563648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386668
13465	NC_013202	GGC	2	6	563670	563675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386668
13466	NC_013202	CA	3	6	563699	563704	50 %	0 %	0 %	50 %	257386668
13467	NC_013202	TATCG	2	10	563716	563725	20 %	40 %	20 %	20 %	257386668
13468	NC_013202	CA	3	6	563730	563735	50 %	0 %	0 %	50 %	257386668
13469	NC_013202	GCC	2	6	563773	563778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386669
13470	NC_013202	TCG	2	6	563800	563805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386669
13471	NC_013202	CGG	2	6	563840	563845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386669
13472	NC_013202	CTA	2	6	563885	563890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257386669
13473	NC_013202	CGT	2	6	563912	563917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386669
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13491	NC_013202	GCCG	2	8	564454	564461	0 %	0 %	50 %	50 %	257386670
13492	NC_013202	TCG	3	9	564471	564479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386670
13493	NC_013202	TCG	2	6	564507	564512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386670
13494	NC_013202	CGGC	2	8	564555	564562	0 %	0 %	50 %	50 %	257386670
13495	NC_013202	CGA	2	6	564568	564573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386670
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13497	NC_013202	GCC	2	6	564593	564598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386670
13498	NC_013202	TGG	2	6	564714	564719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257386670
13499	NC_013202	CGA	2	6	564775	564780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386670
13500	NC_013202	GCTC	2	8	564844	564851	0 %	25 %	25 %	50 %	257386670

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