MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halomicrobium mukohataei DSM 12286 chromosome

Total Repeats: 75791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_013202	GTC	3	9	521782	521790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386617
12502	NC_013202	GCC	2	6	521795	521800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386617
12503	NC_013202	CGT	2	6	521812	521817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386617
12504	NC_013202	CTC	2	6	521818	521823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257386617
12505	NC_013202	GTGA	2	8	521860	521867	25 %	25 %	50 %	0 %	257386617
12506	NC_013202	GCT	2	6	521910	521915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386617
12507	NC_013202	TCG	2	6	521933	521938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386617
12508	NC_013202	TCG	2	6	521945	521950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386617
12509	NC_013202	TAG	2	6	522123	522128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257386618
12510	NC_013202	AGTG	2	8	522134	522141	25 %	25 %	50 %	0 %	257386618
12511	NC_013202	GTA	2	6	522146	522151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257386618
12512	NC_013202	CAG	2	6	522152	522157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386618
12513	NC_013202	AGG	2	6	522204	522209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257386618
12514	NC_013202	ACG	2	6	522238	522243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386618
12515	NC_013202	AGG	2	6	522249	522254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257386618
12516	NC_013202	GAA	2	6	522389	522394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257386619
12517	NC_013202	CGA	2	6	522448	522453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386619
12518	NC_013202	GC	3	6	522535	522540	0 %	0 %	50 %	50 %	257386619
12519	NC_013202	CCG	2	6	522550	522555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386619
12520	NC_013202	TCG	2	6	522564	522569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386619
12521	NC_013202	GGCC	2	8	522571	522578	0 %	0 %	50 %	50 %	257386619
12522	NC_013202	GGC	2	6	522610	522615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386619
12523	NC_013202	TCG	2	6	522657	522662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386619
12524	NC_013202	GTC	2	6	522668	522673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386619
12525	NC_013202	CGA	2	6	522691	522696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386619
12526	NC_013202	CGA	2	6	522745	522750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386619
12527	NC_013202	CGG	2	6	522754	522759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386619
12528	NC_013202	TCG	2	6	522768	522773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386619
12529	NC_013202	TCG	3	9	522790	522798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386619
12530	NC_013202	GCA	3	9	522811	522819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386619
12531	NC_013202	CGA	2	6	523087	523092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386620
12532	NC_013202	ACG	2	6	523110	523115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386620
12533	NC_013202	CGCGT	2	10	523148	523157	0 %	20 %	40 %	40 %	257386620
12534	NC_013202	CGC	2	6	523168	523173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386620
12535	NC_013202	TCG	2	6	523197	523202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386620
12536	NC_013202	GCGATC	2	12	523211	523222	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257386620
12537	NC_013202	GC	3	6	523254	523259	0 %	0 %	50 %	50 %	257386620
12538	NC_013202	GCC	2	6	523319	523324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386620
12539	NC_013202	GAC	2	6	523345	523350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386620
12540	NC_013202	TCG	2	6	523371	523376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386620
12541	NC_013202	GTT	2	6	523396	523401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257386620
12542	NC_013202	TCGGG	2	10	523455	523464	0 %	20 %	60 %	20 %	257386620
12543	NC_013202	TCG	2	6	523479	523484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386620
12544	NC_013202	TCG	3	9	523506	523514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386620
12545	NC_013202	GAG	2	6	523523	523528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257386620
12546	NC_013202	GCT	2	6	523537	523542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386620
12547	NC_013202	CGA	2	6	523632	523637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386620
12548	NC_013202	CTA	2	6	523774	523779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257386620
12549	NC_013202	TCA	2	6	523824	523829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257386620
12550	NC_013202	TCG	2	6	523839	523844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386620
12551	NC_013202	ACA	2	6	523866	523871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257386620
12552	NC_013202	CGT	2	6	523882	523887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386620
12553	NC_013202	CGT	2	6	523894	523899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386620
12554	NC_013202	CGC	2	6	523920	523925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386620
12555	NC_013202	ACG	2	6	523956	523961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386620
12556	NC_013202	TGC	2	6	523977	523982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386620
12557	NC_013202	CA	3	6	524022	524027	50 %	0 %	0 %	50 %	257386620
12558	NC_013202	CGA	2	6	524029	524034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386620
12559	NC_013202	GTC	2	6	524151	524156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386621
12560	NC_013202	CGT	2	6	524158	524163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386621
12561	NC_013202	GTC	2	6	524166	524171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386621
12562	NC_013202	GAT	2	6	524174	524179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257386621
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12564	NC_013202	CGA	2	6	524254	524259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386621
12565	NC_013202	CGG	2	6	524275	524280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386621
12566	NC_013202	CGTCG	2	10	524339	524348	0 %	20 %	40 %	40 %	257386621
12567	NC_013202	CCG	2	6	524386	524391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386621
12568	NC_013202	TCG	2	6	524415	524420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386621
12569	NC_013202	TCG	2	6	524433	524438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386621
12570	NC_013202	CTC	2	6	524501	524506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257386621
12571	NC_013202	CGC	2	6	524521	524526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386621
12572	NC_013202	CGATC	2	10	524567	524576	20 %	20 %	20 %	40 %	257386621
12573	NC_013202	GTC	2	6	524581	524586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386621
12574	NC_013202	CCGC	2	8	524608	524615	0 %	0 %	25 %	75 %	257386621
12575	NC_013202	CGA	2	6	524632	524637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386621
12576	NC_013202	CGT	2	6	524801	524806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386622
12577	NC_013202	CTA	2	6	524901	524906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257386622
12578	NC_013202	GAC	2	6	524910	524915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386622
12579	NC_013202	CGA	2	6	524919	524924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386622
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12581	NC_013202	GCGG	2	8	524946	524953	0 %	0 %	75 %	25 %	257386622
12582	NC_013202	GGGT	2	8	524956	524963	0 %	25 %	75 %	0 %	257386622
12583	NC_013202	GAC	3	9	524971	524979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386622
12584	NC_013202	TAT	2	6	525174	525179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257386623
12585	NC_013202	GGT	2	6	525180	525185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257386623
12586	NC_013202	TCC	2	6	525218	525223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257386623
12587	NC_013202	TGC	2	6	525224	525229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386623
12588	NC_013202	GGT	2	6	525316	525321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257386623
12589	NC_013202	GGA	2	6	525325	525330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257386623
12590	NC_013202	TAT	2	6	525361	525366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257386623
12591	NC_013202	CTC	2	6	526591	526596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257386624
12592	NC_013202	CGA	2	6	526659	526664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386624
12593	NC_013202	TCGC	2	8	526684	526691	0 %	25 %	25 %	50 %	257386624
12594	NC_013202	CGTT	2	8	526724	526731	0 %	50 %	25 %	25 %	257386624
12595	NC_013202	GATCG	2	10	526747	526756	20 %	20 %	40 %	20 %	257386624
12596	NC_013202	CTC	2	6	526771	526776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257386624
12597	NC_013202	CGA	2	6	526827	526832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386624
12598	NC_013202	CGA	2	6	526854	526859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386624
12599	NC_013202	CGG	3	9	526998	527006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386624
12600	NC_013202	TCG	2	6	527102	527107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386624
12601	NC_013202	TCG	2	6	527111	527116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386624
12602	NC_013202	GTC	2	6	527122	527127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386624
12603	NC_013202	TCG	2	6	527201	527206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386624
12604	NC_013202	CGC	2	6	527223	527228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386624
12605	NC_013202	CGGT	2	8	527246	527253	0 %	25 %	50 %	25 %	257386624
12606	NC_013202	GGTC	2	8	527265	527272	0 %	25 %	50 %	25 %	257386624
12607	NC_013202	ATC	2	6	527348	527353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257386624
12608	NC_013202	TCG	4	12	527363	527374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386624
12609	NC_013202	CGG	2	6	527381	527386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386624
12610	NC_013202	CGC	2	6	527436	527441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386624
12611	NC_013202	CCT	2	6	527442	527447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257386624
12612	NC_013202	TCG	2	6	527552	527557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386624
12613	NC_013202	TCC	2	6	527570	527575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257386624
12614	NC_013202	GAC	2	6	527611	527616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386624
12615	NC_013202	GTC	3	9	527620	527628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386624
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12617	NC_013202	CGT	2	6	527676	527681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386624
12618	NC_013202	GTG	2	6	527690	527695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257386624
12619	NC_013202	TCG	2	6	527708	527713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386624
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12735	NC_013202	TCG	2	6	533455	533460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386631
12736	NC_013202	GCG	2	6	533473	533478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386631
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12739	NC_013202	CGT	2	6	533513	533518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386631
12740	NC_013202	GTG	2	6	533529	533534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257386631
12741	NC_013202	CGT	2	6	533573	533578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386631
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12840	NC_013202	ACG	2	6	537705	537710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386636
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12844	NC_013202	GTC	2	6	537791	537796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386636
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12847	NC_013202	ACT	2	6	537816	537821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257386636
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12849	NC_013202	CGG	2	6	537873	537878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386636
12850	NC_013202	GTCGC	2	10	537921	537930	0 %	20 %	40 %	40 %	257386636
12851	NC_013202	GAC	2	6	537956	537961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386636
12852	NC_013202	GCC	2	6	537964	537969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386636
12853	NC_013202	CGG	2	6	537986	537991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386636
12854	NC_013202	ACG	2	6	537999	538004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386636
12855	NC_013202	CGC	2	6	538030	538035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386636
12856	NC_013202	CGA	3	9	538054	538062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386636
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12858	NC_013202	CGC	2	6	538105	538110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386636
12859	NC_013202	CGA	2	6	538111	538116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386636
12860	NC_013202	GCGCGA	2	12	538153	538164	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	257386636
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12863	NC_013202	TGCC	2	8	538522	538529	0 %	25 %	25 %	50 %	257386637
12864	NC_013202	AAC	2	6	538543	538548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257386637
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12866	NC_013202	TCGC	2	8	538683	538690	0 %	25 %	25 %	50 %	257386637
12867	NC_013202	CA	3	6	538701	538706	50 %	0 %	0 %	50 %	257386637
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12870	NC_013202	GTA	2	6	538783	538788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257386637
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12872	NC_013202	CTG	2	6	538900	538905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386637
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12875	NC_013202	CGT	3	9	539214	539222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386637
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12882	NC_013202	GTA	2	6	539467	539472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257386637
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12944	NC_013202	GGCG	2	8	542494	542501	0 %	0 %	75 %	25 %	257386643
12945	NC_013202	ACC	2	6	542520	542525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257386643
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12955	NC_013202	TGC	2	6	543157	543162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386644
12956	NC_013202	TTCGTC	2	12	543183	543194	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	257386644
12957	NC_013202	CTG	2	6	543264	543269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386644
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12960	NC_013202	CTG	2	6	543333	543338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386644
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12963	NC_013202	CT	3	6	543492	543497	0 %	50 %	0 %	50 %	257386644
12964	NC_013202	GTC	2	6	543505	543510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386644
12965	NC_013202	GTC	2	6	543515	543520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386644
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12967	NC_013202	TCG	2	6	543592	543597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386644
12968	NC_013202	GCA	2	6	543598	543603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386644
12969	NC_013202	TCGCGC	2	12	543616	543627	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	257386644
12970	NC_013202	TCG	2	6	543649	543654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386644
12971	NC_013202	CGC	2	6	543674	543679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386644
12972	NC_013202	CTA	2	6	543788	543793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257386644
12973	NC_013202	TGCTGG	2	12	543799	543810	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	257386644
12974	NC_013202	GAC	3	9	543864	543872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386644
12975	NC_013202	CGA	4	12	544000	544011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386645
12976	NC_013202	GCC	2	6	544025	544030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386645
12977	NC_013202	CTCG	2	8	544057	544064	0 %	25 %	25 %	50 %	257386645
12978	NC_013202	GC	4	8	544070	544077	0 %	0 %	50 %	50 %	257386645
12979	NC_013202	TCC	2	6	544080	544085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257386645
12980	NC_013202	CGA	2	6	544093	544098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386645
12981	NC_013202	ACA	2	6	544119	544124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257386645
12982	NC_013202	GC	3	6	544152	544157	0 %	0 %	50 %	50 %	257386645
12983	NC_013202	GAC	2	6	544166	544171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386645
12984	NC_013202	AAG	2	6	544196	544201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257386645
12985	NC_013202	GC	3	6	544219	544224	0 %	0 %	50 %	50 %	257386645
12986	NC_013202	CGC	2	6	544264	544269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386645
12987	NC_013202	GCT	2	6	544279	544284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386645
12988	NC_013202	CGC	2	6	544366	544371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386645
12989	NC_013202	GAG	2	6	544385	544390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257386645
12990	NC_013202	CGA	2	6	544393	544398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386645
12991	NC_013202	CGA	3	9	544408	544416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386645
12992	NC_013202	TCGC	2	8	544484	544491	0 %	25 %	25 %	50 %	257386646
12993	NC_013202	TC	3	6	544529	544534	0 %	50 %	0 %	50 %	257386646
12994	NC_013202	CCGTT	2	10	544545	544554	0 %	40 %	20 %	40 %	257386646
12995	NC_013202	CTC	2	6	544564	544569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257386646
12996	NC_013202	AGG	3	9	544679	544687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257386646
12997	NC_013202	GACCG	2	10	544696	544705	20 %	0 %	40 %	40 %	257386646
12998	NC_013202	CCGTC	2	10	544764	544773	0 %	20 %	20 %	60 %	257386646
12999	NC_013202	GCC	2	6	544816	544821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386646
13000	NC_013202	GAC	4	12	544831	544842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386646

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