MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halomicrobium mukohataei DSM 12286 chromosome

Total Repeats: 75791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12004	NC_013202	CTG	2	6	499869	499874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386597
12005	NC_013202	CG	3	6	500013	500018	0 %	0 %	50 %	50 %	257386597
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12118	NC_013202	GTCA	2	8	505193	505200	25 %	25 %	25 %	25 %	257386601
12119	NC_013202	CGT	2	6	505213	505218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386601
12120	NC_013202	GCC	2	6	505266	505271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386601
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12123	NC_013202	GTC	2	6	505406	505411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386601
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12220	NC_013202	TCG	2	6	509142	509147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386605
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12223	NC_013202	GTCTG	2	10	509232	509241	0 %	40 %	40 %	20 %	257386605
12224	NC_013202	CAG	2	6	509276	509281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386605
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12226	NC_013202	G	6	6	509304	509309	0 %	0 %	100 %	0 %	257386605
12227	NC_013202	TCGG	2	8	509322	509329	0 %	25 %	50 %	25 %	257386605
12228	NC_013202	CGATC	2	10	509365	509374	20 %	20 %	20 %	40 %	257386605
12229	NC_013202	CGA	2	6	509386	509391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386605
12230	NC_013202	CTC	2	6	509432	509437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257386605
12231	NC_013202	GGAC	2	8	509473	509480	25 %	0 %	50 %	25 %	257386605
12232	NC_013202	TCG	2	6	509502	509507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386605
12233	NC_013202	GAT	2	6	509510	509515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257386605
12234	NC_013202	GC	5	10	509536	509545	0 %	0 %	50 %	50 %	257386605
12235	NC_013202	C	6	6	509568	509573	0 %	0 %	0 %	100 %	257386605
12236	NC_013202	GAG	2	6	509627	509632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257386605
12237	NC_013202	CGC	2	6	509659	509664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386605
12238	NC_013202	GAT	2	6	509696	509701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257386605
12239	NC_013202	TTCGAG	2	12	509784	509795	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	257386605
12240	NC_013202	CGT	2	6	509824	509829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386605
12241	NC_013202	GTA	2	6	509831	509836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257386605
12242	NC_013202	CGA	2	6	509857	509862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386605
12243	NC_013202	CGT	2	6	509885	509890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386605
12244	NC_013202	CGA	2	6	509911	509916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386605
12245	NC_013202	AGC	2	6	509988	509993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386605
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12247	NC_013202	TCG	2	6	510009	510014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386605
12248	NC_013202	GTA	2	6	510020	510025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257386605
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12250	NC_013202	CCG	2	6	510124	510129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386606
12251	NC_013202	CAGG	2	8	510150	510157	25 %	0 %	50 %	25 %	257386606
12252	NC_013202	CGG	2	6	510158	510163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386606
12253	NC_013202	CGC	2	6	510179	510184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386606
12254	NC_013202	CGA	2	6	510209	510214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386606
12255	NC_013202	CCT	2	6	510239	510244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257386606
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12257	NC_013202	TCA	2	6	510362	510367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257386606
12258	NC_013202	CCGA	2	8	510370	510377	25 %	0 %	25 %	50 %	257386606
12259	NC_013202	GTA	2	6	510396	510401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257386606
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12263	NC_013202	TCG	2	6	510520	510525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386606
12264	NC_013202	TCG	2	6	510589	510594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386606
12265	NC_013202	CGCT	2	8	510639	510646	0 %	25 %	25 %	50 %	257386606
12266	NC_013202	CCG	2	6	510655	510660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386606
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12268	NC_013202	TCG	2	6	510715	510720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386606
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12288	NC_013202	GAAGGC	2	12	511559	511570	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	257386607
12289	NC_013202	CGA	2	6	511654	511659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386607
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12292	NC_013202	GCC	2	6	511685	511690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386607
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12297	NC_013202	GCC	2	6	511775	511780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386607
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12301	NC_013202	CGT	2	6	511964	511969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386607
12302	NC_013202	ACC	2	6	511974	511979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257386607
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12306	NC_013202	TAGT	2	8	512167	512174	25 %	50 %	25 %	0 %	257386607
12307	NC_013202	GAC	2	6	512335	512340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386608
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12309	NC_013202	CGA	2	6	512361	512366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386608
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12312	NC_013202	CG	5	10	512461	512470	0 %	0 %	50 %	50 %	257386608
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12316	NC_013202	TTG	2	6	512741	512746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257386608
12317	NC_013202	ATG	2	6	512837	512842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257386608
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12319	NC_013202	TGA	2	6	512871	512876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257386608
12320	NC_013202	CGTATC	2	12	512943	512954	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	257386608
12321	NC_013202	CGC	2	6	512965	512970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386608
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12323	NC_013202	CTG	2	6	513143	513148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386609
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12337	NC_013202	CCGA	2	8	513597	513604	25 %	0 %	25 %	50 %	257386609
12338	NC_013202	GTC	2	6	513643	513648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386609
12339	NC_013202	CGA	2	6	513717	513722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386609
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12341	NC_013202	CGA	2	6	513771	513776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386609
12342	NC_013202	GCT	2	6	513777	513782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386609
12343	NC_013202	GTC	2	6	513787	513792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386609
12344	NC_013202	CCCGGC	2	12	513796	513807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386609
12345	NC_013202	CGG	2	6	513814	513819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386609
12346	NC_013202	GCG	2	6	513822	513827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386609
12347	NC_013202	GGT	2	6	513888	513893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257386609
12348	NC_013202	GGA	2	6	513948	513953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257386609
12349	NC_013202	GTCG	2	8	513970	513977	0 %	25 %	50 %	25 %	257386609
12350	NC_013202	TCC	2	6	514085	514090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257386609
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12352	NC_013202	TCG	2	6	514112	514117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386609
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12357	NC_013202	GTA	2	6	514423	514428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257386609
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12462	NC_013202	GTC	2	6	519980	519985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386614
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12464	NC_013202	CGA	3	9	520068	520076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386614
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12466	NC_013202	GCG	2	6	520127	520132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386614
12467	NC_013202	GTC	2	6	520147	520152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386614
12468	NC_013202	CCT	2	6	520158	520163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257386614
12469	NC_013202	CGA	2	6	520164	520169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386614
12470	NC_013202	GCGG	2	8	520207	520214	0 %	0 %	75 %	25 %	257386614
12471	NC_013202	GCC	2	6	520318	520323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386614
12472	NC_013202	TGA	2	6	520344	520349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257386614
12473	NC_013202	GAC	2	6	520408	520413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386614
12474	NC_013202	CTG	2	6	520462	520467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386614
12475	NC_013202	GA	3	6	520509	520514	50 %	0 %	50 %	0 %	257386614
12476	NC_013202	CGG	2	6	520536	520541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386614
12477	NC_013202	CGT	2	6	520546	520551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386614
12478	NC_013202	GCC	2	6	520712	520717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386615
12479	NC_013202	GAC	2	6	520723	520728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386615
12480	NC_013202	CGA	2	6	520760	520765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386615
12481	NC_013202	GCC	2	6	520771	520776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386615
12482	NC_013202	AGGTGT	2	12	520855	520866	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	257386615
12483	NC_013202	GGC	2	6	520903	520908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386615
12484	NC_013202	TCG	2	6	520942	520947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386615
12485	NC_013202	CG	3	6	520951	520956	0 %	0 %	50 %	50 %	257386615
12486	NC_013202	CGA	3	9	520967	520975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386615
12487	NC_013202	CGT	2	6	521035	521040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386615
12488	NC_013202	GA	3	6	521188	521193	50 %	0 %	50 %	0 %	257386616
12489	NC_013202	TCC	2	6	521194	521199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257386616
12490	NC_013202	CAG	2	6	521214	521219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386616
12491	NC_013202	GCC	2	6	521223	521228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386616
12492	NC_013202	GACGG	2	10	521229	521238	20 %	0 %	60 %	20 %	257386616
12493	NC_013202	CA	3	6	521240	521245	50 %	0 %	0 %	50 %	257386616
12494	NC_013202	CGA	2	6	521351	521356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386616
12495	NC_013202	GAC	2	6	521379	521384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386616
12496	NC_013202	GCC	2	6	521401	521406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386616
12497	NC_013202	ACG	2	6	521419	521424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386616
12498	NC_013202	GTG	2	6	521451	521456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257386616
12499	NC_013202	CCG	2	6	521671	521676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386617
12500	NC_013202	CAG	2	6	521734	521739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386617

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