MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halomicrobium mukohataei DSM 12286 chromosome

Total Repeats: 75791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_013202	GCCC	2	8	231522	231529	0 %	0 %	25 %	75 %	257386305
5502	NC_013202	GCC	2	6	231532	231537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386305
5503	NC_013202	CTC	2	6	231541	231546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257386305
5504	NC_013202	GGA	2	6	231555	231560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257386305
5505	NC_013202	GTC	2	6	231571	231576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386305
5506	NC_013202	TCG	2	6	231587	231592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386305
5507	NC_013202	GTA	2	6	231610	231615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257386305
5508	NC_013202	GAG	2	6	231655	231660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257386305
5509	NC_013202	CGA	3	9	231675	231683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386305
5510	NC_013202	GCC	2	6	231700	231705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386305
5511	NC_013202	CCG	2	6	231741	231746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386305
5512	NC_013202	GTC	2	6	231797	231802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386305
5513	NC_013202	GTC	2	6	231833	231838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386305
5514	NC_013202	TCCGGT	2	12	231896	231907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386305
5515	NC_013202	TCGC	2	8	231932	231939	0 %	25 %	25 %	50 %	257386305
5516	NC_013202	TCG	3	9	231962	231970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386305
5517	NC_013202	CGT	2	6	231981	231986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386305
5518	NC_013202	TCG	2	6	231995	232000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386305
5519	NC_013202	GTC	2	6	232018	232023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386305
5520	NC_013202	TCC	2	6	232028	232033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257386305
5521	NC_013202	GAG	2	6	232043	232048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257386305
5522	NC_013202	TCG	2	6	232052	232057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386305
5523	NC_013202	TCG	2	6	232073	232078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386305
5524	NC_013202	CGT	2	6	232083	232088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386305
5525	NC_013202	TCG	2	6	232091	232096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386305
5526	NC_013202	CGC	2	6	232107	232112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386305
5527	NC_013202	CGTCGC	2	12	232194	232205	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	257386305
5528	NC_013202	CGT	2	6	232209	232214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386305
5529	NC_013202	GTC	3	9	232231	232239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386305
5530	NC_013202	CTC	2	6	232240	232245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257386305
5531	NC_013202	GTC	2	6	232261	232266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386305
5532	NC_013202	C	6	6	232268	232273	0 %	0 %	0 %	100 %	257386305
5533	NC_013202	TCG	2	6	232274	232279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386305
5534	NC_013202	GTC	2	6	232282	232287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386305
5535	NC_013202	GTC	2	6	232291	232296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386305
5536	NC_013202	GCC	2	6	232306	232311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386305
5537	NC_013202	GTC	2	6	232312	232317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386305
5538	NC_013202	CCG	2	6	232325	232330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386305
5539	NC_013202	TCG	2	6	232331	232336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386305
5540	NC_013202	CGT	2	6	232341	232346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386305
5541	NC_013202	CGT	2	6	232356	232361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386305
5542	NC_013202	CCG	3	9	232373	232381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386305
5543	NC_013202	TCG	2	6	232388	232393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386305
5544	NC_013202	CGT	2	6	232395	232400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386305
5545	NC_013202	TCG	2	6	232415	232420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386305
5546	NC_013202	TCGGCG	2	12	232430	232441	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	257386305
5547	NC_013202	TCG	2	6	232454	232459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386305
5548	NC_013202	TCC	2	6	232463	232468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257386305
5549	NC_013202	TCG	2	6	232475	232480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386305
5550	NC_013202	TCG	3	9	232484	232492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386305
5551	NC_013202	CCG	3	9	232505	232513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386305
5552	NC_013202	GCC	2	6	232522	232527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386305
5553	NC_013202	CCG	2	6	232529	232534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386305
5554	NC_013202	GTC	2	6	232552	232557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386305
5555	NC_013202	AGC	2	6	232601	232606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386305
5556	NC_013202	CTT	2	6	232626	232631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257386305
5557	NC_013202	CGA	2	6	232681	232686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386305
5558	NC_013202	TCG	2	6	232712	232717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386305
5559	NC_013202	TCG	2	6	232733	232738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386305
5560	NC_013202	CGT	2	6	232752	232757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386305
5561	NC_013202	TCG	2	6	232772	232777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386305
5562	NC_013202	GTC	2	6	232795	232800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386305
5563	NC_013202	GCC	2	6	232810	232815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386305
5564	NC_013202	TCG	2	6	232829	232834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386305
5565	NC_013202	CCG	2	6	232838	232843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386305
5566	NC_013202	TCG	2	6	232844	232849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386305
5567	NC_013202	C	6	6	232858	232863	0 %	0 %	0 %	100 %	257386305
5568	NC_013202	TCG	2	6	232877	232882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386305
5569	NC_013202	CGT	2	6	232884	232889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386305
5570	NC_013202	CAC	2	6	232890	232895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257386305
5571	NC_013202	CGT	2	6	232899	232904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386305
5572	NC_013202	CTC	2	6	232909	232914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257386305
5573	NC_013202	GTC	2	6	232915	232920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386305
5574	NC_013202	GA	3	6	232922	232927	50 %	0 %	50 %	0 %	257386305
5575	NC_013202	CGA	2	6	232959	232964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386305
5576	NC_013202	GAG	2	6	232975	232980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257386305
5577	NC_013202	ACG	2	6	232982	232987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386305
5578	NC_013202	GATC	2	8	233002	233009	25 %	25 %	25 %	25 %	257386305
5579	NC_013202	AGCG	2	8	233372	233379	25 %	0 %	50 %	25 %	257386306
5580	NC_013202	CGC	2	6	233388	233393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386306
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5583	NC_013202	GGC	2	6	233449	233454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386306
5584	NC_013202	CCCG	2	8	233506	233513	0 %	0 %	25 %	75 %	257386306
5585	NC_013202	CG	3	6	233599	233604	0 %	0 %	50 %	50 %	257386306
5586	NC_013202	GCCCTC	2	12	233608	233619	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	257386306
5587	NC_013202	GTCGT	2	10	233620	233629	0 %	40 %	40 %	20 %	257386306
5588	NC_013202	TGG	2	6	233709	233714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257386306
5589	NC_013202	CGTC	2	8	233727	233734	0 %	25 %	25 %	50 %	257386306
5590	NC_013202	CTT	2	6	233761	233766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257386306
5591	NC_013202	CGAC	2	8	233781	233788	25 %	0 %	25 %	50 %	257386306
5592	NC_013202	CGT	2	6	233808	233813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386306
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5594	NC_013202	TCG	2	6	233908	233913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386307
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5598	NC_013202	CGA	2	6	234020	234025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386307
5599	NC_013202	GGA	2	6	234080	234085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257386307
5600	NC_013202	CGA	2	6	234101	234106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386307
5601	NC_013202	ATG	2	6	234118	234123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257386307
5602	NC_013202	TTC	2	6	234132	234137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257386307
5603	NC_013202	TCGG	2	8	234181	234188	0 %	25 %	50 %	25 %	257386307
5604	NC_013202	TCG	2	6	234223	234228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386307
5605	NC_013202	AAC	2	6	234229	234234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257386307
5606	NC_013202	GAG	2	6	234237	234242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257386307
5607	NC_013202	GTC	2	6	234291	234296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386307
5608	NC_013202	TCA	2	6	234371	234376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257386307
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5610	NC_013202	TCG	2	6	234410	234415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386307
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5612	NC_013202	GGTC	2	8	234476	234483	0 %	25 %	50 %	25 %	257386307
5613	NC_013202	ATGTAG	2	12	234517	234528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257386307
5614	NC_013202	G	6	6	234645	234650	0 %	0 %	100 %	0 %	257386307
5615	NC_013202	TCG	2	6	234662	234667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386307
5616	NC_013202	TCA	2	6	234704	234709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257386307
5617	NC_013202	GCT	2	6	234732	234737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386307
5618	NC_013202	CCG	2	6	234760	234765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386307
5619	NC_013202	GACC	2	8	234788	234795	25 %	0 %	25 %	50 %	257386307
5620	NC_013202	CGA	2	6	234860	234865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386307
5621	NC_013202	TTC	2	6	234882	234887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257386307
5622	NC_013202	CGT	2	6	234893	234898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386307
5623	NC_013202	CGA	2	6	234929	234934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386307
5624	NC_013202	GAC	2	6	235048	235053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386308
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5627	NC_013202	ATG	2	6	235166	235171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257386308
5628	NC_013202	TCG	2	6	235202	235207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386308
5629	NC_013202	TCCCG	2	10	235218	235227	0 %	20 %	20 %	60 %	257386308
5630	NC_013202	CAT	2	6	235246	235251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257386308
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5637	NC_013202	GTC	2	6	235604	235609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386309
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5639	NC_013202	CGA	3	9	235680	235688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386309
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5642	NC_013202	CGC	2	6	235780	235785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386309
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5646	NC_013202	ACG	2	6	235973	235978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386309
5647	NC_013202	CGA	2	6	235989	235994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386309
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5649	NC_013202	CCG	2	6	236067	236072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386309
5650	NC_013202	GAG	2	6	236080	236085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257386309
5651	NC_013202	CGA	2	6	236091	236096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386309
5652	NC_013202	TCGAC	2	10	236103	236112	20 %	20 %	20 %	40 %	257386309
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5654	NC_013202	GCA	2	6	236234	236239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386309
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5657	NC_013202	TCG	2	6	236354	236359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386309
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5674	NC_013202	GATC	2	8	236957	236964	25 %	25 %	25 %	25 %	257386309
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5683	NC_013202	CGAGG	2	10	237108	237117	20 %	0 %	60 %	20 %	257386309
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5690	NC_013202	GA	3	6	237440	237445	50 %	0 %	50 %	0 %	257386309
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5721	NC_013202	CGT	2	6	238857	238862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386312
5722	NC_013202	CAG	2	6	238908	238913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386312
5723	NC_013202	GTC	2	6	238948	238953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386312
5724	NC_013202	TTCCGA	2	12	238965	238976	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	257386312
5725	NC_013202	CAC	2	6	238980	238985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257386312
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5727	NC_013202	CGA	2	6	239022	239027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386312
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5732	NC_013202	ACT	2	6	239143	239148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257386312
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5734	NC_013202	CGA	2	6	239187	239192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386312
5735	NC_013202	CT	3	6	239234	239239	0 %	50 %	0 %	50 %	257386312
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5737	NC_013202	CGG	2	6	239283	239288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386312
5738	NC_013202	CGC	2	6	239293	239298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386312
5739	NC_013202	TCCCGA	2	12	239331	239342	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	257386312
5740	NC_013202	TCG	2	6	239363	239368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386312
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5742	NC_013202	CAT	2	6	239834	239839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257386313
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5852	NC_013202	CGGC	2	8	244776	244783	0 %	0 %	50 %	50 %	257386319
5853	NC_013202	GGAC	2	8	244784	244791	25 %	0 %	50 %	25 %	257386319
5854	NC_013202	CGG	2	6	244815	244820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386319
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5857	NC_013202	TCG	2	6	244899	244904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386319
5858	NC_013202	GA	3	6	244963	244968	50 %	0 %	50 %	0 %	257386320
5859	NC_013202	AAC	2	6	244992	244997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257386320
5860	NC_013202	CTG	2	6	245001	245006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386320
5861	NC_013202	GGA	2	6	245024	245029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257386320
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5863	NC_013202	CGA	2	6	245099	245104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386320
5864	NC_013202	CGT	2	6	245107	245112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386320
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5957	NC_013202	CA	3	6	248561	248566	50 %	0 %	0 %	50 %	257386322
5958	NC_013202	GCG	2	6	248576	248581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386322
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5964	NC_013202	GTCG	2	8	248744	248751	0 %	25 %	50 %	25 %	257386322
5965	NC_013202	GAGC	2	8	248816	248823	25 %	0 %	50 %	25 %	257386322
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5968	NC_013202	CGG	2	6	248909	248914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386322
5969	NC_013202	CGA	2	6	248916	248921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386322
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5973	NC_013202	TC	3	6	249225	249230	0 %	50 %	0 %	50 %	257386323
5974	NC_013202	GGTCG	2	10	249237	249246	0 %	20 %	60 %	20 %	257386323
5975	NC_013202	GC	3	6	249302	249307	0 %	0 %	50 %	50 %	257386323
5976	NC_013202	CGT	2	6	249321	249326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386323
5977	NC_013202	GCG	2	6	249353	249358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386323
5978	NC_013202	GAC	2	6	249386	249391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386323
5979	NC_013202	TCGT	2	8	249436	249443	0 %	50 %	25 %	25 %	257386323
5980	NC_013202	CGA	2	6	249456	249461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386323
5981	NC_013202	AGC	2	6	249503	249508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386323
5982	NC_013202	AC	3	6	249528	249533	50 %	0 %	0 %	50 %	257386323
5983	NC_013202	TCGT	2	8	249598	249605	0 %	50 %	25 %	25 %	257386323
5984	NC_013202	AGG	2	6	249650	249655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257386323
5985	NC_013202	TC	3	6	249689	249694	0 %	50 %	0 %	50 %	257386323
5986	NC_013202	TCG	2	6	249713	249718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386323
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5989	NC_013202	CGA	2	6	249846	249851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386323
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5991	NC_013202	TCT	2	6	249961	249966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257386324
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5993	NC_013202	CGA	2	6	250061	250066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386324
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5999	NC_013202	CGA	2	6	250314	250319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386324
6000	NC_013202	CGAC	2	8	250328	250335	25 %	0 %	25 %	50 %	257386324

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