MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halomicrobium mukohataei DSM 12286 chromosome

Total Repeats: 75791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_013202	ACG	2	6	211908	211913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386283
5002	NC_013202	CA	3	6	211929	211934	50 %	0 %	0 %	50 %	257386283
5003	NC_013202	GAC	2	6	211978	211983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386283
5004	NC_013202	CCT	2	6	212002	212007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257386283
5005	NC_013202	CGA	2	6	212026	212031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386283
5006	NC_013202	GCAC	2	8	212037	212044	25 %	0 %	25 %	50 %	257386283
5007	NC_013202	CGC	2	6	212058	212063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386283
5008	NC_013202	CGC	2	6	212078	212083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386283
5009	NC_013202	CGT	2	6	212101	212106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386283
5010	NC_013202	CGAC	2	8	212130	212137	25 %	0 %	25 %	50 %	257386283
5011	NC_013202	TCG	2	6	212277	212282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386283
5012	NC_013202	CCG	2	6	212292	212297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386283
5013	NC_013202	ACG	2	6	212340	212345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386283
5014	NC_013202	CGA	2	6	212368	212373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386283
5015	NC_013202	GTC	2	6	212477	212482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386283
5016	NC_013202	GAC	2	6	212495	212500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386283
5017	NC_013202	CAG	2	6	212513	212518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386283
5018	NC_013202	GAC	2	6	212591	212596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386284
5019	NC_013202	AGT	2	6	212604	212609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257386284
5020	NC_013202	GAC	2	6	212675	212680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386284
5021	NC_013202	ACG	2	6	212706	212711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386284
5022	NC_013202	GTC	2	6	212744	212749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386284
5023	NC_013202	GT	3	6	212752	212757	0 %	50 %	50 %	0 %	257386284
5024	NC_013202	CCA	2	6	212816	212821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257386284
5025	NC_013202	CGA	2	6	212827	212832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386284
5026	NC_013202	GAT	2	6	212864	212869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257386284
5027	NC_013202	ACG	2	6	212874	212879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386284
5028	NC_013202	CG	3	6	213039	213044	0 %	0 %	50 %	50 %	257386285
5029	NC_013202	CGCC	2	8	213068	213075	0 %	0 %	25 %	75 %	257386285
5030	NC_013202	CGGC	2	8	213109	213116	0 %	0 %	50 %	50 %	257386285
5031	NC_013202	CGA	2	6	213272	213277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386285
5032	NC_013202	GTCG	2	8	213300	213307	0 %	25 %	50 %	25 %	257386285
5033	NC_013202	CAG	2	6	213380	213385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386286
5034	NC_013202	GAA	2	6	213425	213430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257386286
5035	NC_013202	AG	3	6	213431	213436	50 %	0 %	50 %	0 %	257386286
5036	NC_013202	CCA	2	6	213437	213442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257386286
5037	NC_013202	CCGG	2	8	213443	213450	0 %	0 %	50 %	50 %	257386286
5038	NC_013202	GA	3	6	213475	213480	50 %	0 %	50 %	0 %	257386286
5039	NC_013202	ACG	2	6	213493	213498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386286
5040	NC_013202	AG	3	6	213530	213535	50 %	0 %	50 %	0 %	257386286
5041	NC_013202	GAT	2	6	213548	213553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257386286
5042	NC_013202	GGA	2	6	213607	213612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257386286
5043	NC_013202	CGTCG	2	10	213656	213665	0 %	20 %	40 %	40 %	257386286
5044	NC_013202	AGCGA	2	10	213713	213722	40 %	0 %	40 %	20 %	257386286
5045	NC_013202	GCG	2	6	213744	213749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386286
5046	NC_013202	CCAGCG	2	12	213790	213801	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	257386286
5047	NC_013202	ACG	2	6	213849	213854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386286
5048	NC_013202	GTA	2	6	213872	213877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257386286
5049	NC_013202	CGC	2	6	213878	213883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386286
5050	NC_013202	GCCGAC	2	12	213896	213907	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	257386286
5051	NC_013202	GGC	2	6	213989	213994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386286
5052	NC_013202	CGG	2	6	214046	214051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386286
5053	NC_013202	CG	3	6	214052	214057	0 %	0 %	50 %	50 %	257386286
5054	NC_013202	CCG	2	6	214066	214071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386286
5055	NC_013202	TGCG	2	8	214114	214121	0 %	25 %	50 %	25 %	257386286
5056	NC_013202	CGA	2	6	214162	214167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386286
5057	NC_013202	GAGC	2	8	214168	214175	25 %	0 %	50 %	25 %	257386286
5058	NC_013202	CCGCG	2	10	214225	214234	0 %	0 %	40 %	60 %	257386286
5059	NC_013202	TTG	2	6	214255	214260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257386286
5060	NC_013202	CGA	3	9	214293	214301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386287
5061	NC_013202	GAC	2	6	214348	214353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386287
5062	NC_013202	GC	3	6	214365	214370	0 %	0 %	50 %	50 %	257386287
5063	NC_013202	CAG	2	6	214441	214446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386287
5064	NC_013202	GAT	2	6	214465	214470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257386287
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5067	NC_013202	CGA	2	6	214585	214590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386287
5068	NC_013202	CAT	2	6	214594	214599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257386287
5069	NC_013202	AAG	2	6	214646	214651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257386287
5070	NC_013202	CAG	2	6	214690	214695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386287
5071	NC_013202	GAG	3	9	214741	214749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257386287
5072	NC_013202	GTCGA	2	10	214772	214781	20 %	20 %	40 %	20 %	257386287
5073	NC_013202	AGA	2	6	214848	214853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257386287
5074	NC_013202	GGTC	2	8	214896	214903	0 %	25 %	50 %	25 %	257386287
5075	NC_013202	AG	3	6	214924	214929	50 %	0 %	50 %	0 %	257386287
5076	NC_013202	GCGG	2	8	215109	215116	0 %	0 %	75 %	25 %	257386287
5077	NC_013202	CGG	2	6	215132	215137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386287
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5080	NC_013202	CGA	2	6	215370	215375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386288
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5085	NC_013202	TCGT	2	8	215477	215484	0 %	50 %	25 %	25 %	257386288
5086	NC_013202	GTCC	2	8	215592	215599	0 %	25 %	25 %	50 %	257386288
5087	NC_013202	CGT	2	6	215604	215609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386288
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5089	NC_013202	CGT	2	6	215691	215696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386288
5090	NC_013202	GGC	2	6	215697	215702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386288
5091	NC_013202	AG	3	6	215758	215763	50 %	0 %	50 %	0 %	257386288
5092	NC_013202	CG	3	6	215826	215831	0 %	0 %	50 %	50 %	257386288
5093	NC_013202	CTCGAA	2	12	215851	215862	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	257386288
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5099	NC_013202	GCA	2	6	216123	216128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386288
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5101	NC_013202	CG	3	6	216219	216224	0 %	0 %	50 %	50 %	257386288
5102	NC_013202	GAC	2	6	216250	216255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386288
5103	NC_013202	TCGGT	2	10	216360	216369	0 %	40 %	40 %	20 %	257386288
5104	NC_013202	CCG	3	9	216432	216440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386288
5105	NC_013202	CTGG	2	8	216508	216515	0 %	25 %	50 %	25 %	257386288
5106	NC_013202	GTA	2	6	216583	216588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257386288
5107	NC_013202	CGG	2	6	216636	216641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386288
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5109	NC_013202	CGT	2	6	216694	216699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386288
5110	NC_013202	AGT	2	6	216711	216716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257386288
5111	NC_013202	CGG	2	6	216753	216758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386288
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5118	NC_013202	CGG	2	6	216909	216914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386288
5119	NC_013202	TCG	2	6	216926	216931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386288
5120	NC_013202	TCG	2	6	216944	216949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386288
5121	NC_013202	TCG	2	6	216968	216973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386288
5122	NC_013202	CGT	2	6	216978	216983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386288
5123	NC_013202	GCC	2	6	217028	217033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386288
5124	NC_013202	CGT	2	6	217046	217051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386288
5125	NC_013202	GCC	2	6	217215	217220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386289
5126	NC_013202	CGA	2	6	217339	217344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386289
5127	NC_013202	CGG	2	6	217364	217369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386289
5128	NC_013202	CGAG	2	8	217409	217416	25 %	0 %	50 %	25 %	257386289
5129	NC_013202	CGCT	2	8	217418	217425	0 %	25 %	25 %	50 %	257386289
5130	NC_013202	GCC	2	6	217432	217437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386289
5131	NC_013202	C	6	6	217436	217441	0 %	0 %	0 %	100 %	257386289
5132	NC_013202	CGC	2	6	217484	217489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386289
5133	NC_013202	CGTT	2	8	217503	217510	0 %	50 %	25 %	25 %	257386289
5134	NC_013202	CTCGAT	2	12	217556	217567	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	257386289
5135	NC_013202	CGGG	2	8	217573	217580	0 %	0 %	75 %	25 %	257386289
5136	NC_013202	CAG	2	6	217703	217708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386289
5137	NC_013202	GTC	2	6	217733	217738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386289
5138	NC_013202	CGA	2	6	217765	217770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386289
5139	NC_013202	GA	3	6	217821	217826	50 %	0 %	50 %	0 %	257386289
5140	NC_013202	TCC	2	6	217872	217877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257386289
5141	NC_013202	TGA	2	6	217885	217890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257386289
5142	NC_013202	GGAC	2	8	217900	217907	25 %	0 %	50 %	25 %	257386289
5143	NC_013202	GC	3	6	217963	217968	0 %	0 %	50 %	50 %	257386289
5144	NC_013202	CGCTGG	2	12	217983	217994	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	257386289
5145	NC_013202	TGT	2	6	218082	218087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257386289
5146	NC_013202	TCG	2	6	218100	218105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386289
5147	NC_013202	ATC	2	6	218199	218204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257386289
5148	NC_013202	GGCC	2	8	218245	218252	0 %	0 %	50 %	50 %	257386289
5149	NC_013202	GTCG	2	8	218282	218289	0 %	25 %	50 %	25 %	257386289
5150	NC_013202	CAG	2	6	218294	218299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386289
5151	NC_013202	GTC	2	6	218319	218324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386289
5152	NC_013202	TCC	2	6	218445	218450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257386289
5153	NC_013202	CGA	2	6	218485	218490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386289
5154	NC_013202	GTCC	2	8	218498	218505	0 %	25 %	25 %	50 %	257386289
5155	NC_013202	CGT	2	6	218507	218512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386289
5156	NC_013202	CTCG	2	8	218513	218520	0 %	25 %	25 %	50 %	257386289
5157	NC_013202	CGC	2	6	218539	218544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386289
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5159	NC_013202	GGT	2	6	218587	218592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257386289
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5161	NC_013202	GTC	2	6	218642	218647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386289
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5163	NC_013202	CAG	2	6	218762	218767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386289
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5167	NC_013202	CGA	2	6	218872	218877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386289
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5174	NC_013202	TCG	2	6	219078	219083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386289
5175	NC_013202	GTC	2	6	219090	219095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386289
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5185	NC_013202	ACCG	2	8	219476	219483	25 %	0 %	25 %	50 %	257386289
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5191	NC_013202	CGT	2	6	219610	219615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386289
5192	NC_013202	CGC	2	6	219631	219636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386289
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5199	NC_013202	CGA	2	6	220160	220165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386290
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5203	NC_013202	GA	3	6	220358	220363	50 %	0 %	50 %	0 %	257386290
5204	NC_013202	GCTCTC	2	12	220424	220435	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	257386290
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5209	NC_013202	CGCGTG	2	12	220557	220568	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	257386290
5210	NC_013202	CGA	2	6	220574	220579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386290
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5212	NC_013202	TCG	2	6	220804	220809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386291
5213	NC_013202	TCC	2	6	220879	220884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257386291
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5218	NC_013202	CG	3	6	221040	221045	0 %	0 %	50 %	50 %	257386291
5219	NC_013202	GGCG	2	8	221162	221169	0 %	0 %	75 %	25 %	257386291
5220	NC_013202	CCG	2	6	221236	221241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386291
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5222	NC_013202	CGTC	2	8	221285	221292	0 %	25 %	25 %	50 %	257386291
5223	NC_013202	AG	3	6	221296	221301	50 %	0 %	50 %	0 %	257386291
5224	NC_013202	TCG	3	9	221326	221334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386291
5225	NC_013202	CGA	2	6	221370	221375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386291
5226	NC_013202	CGGCT	2	10	221376	221385	0 %	20 %	40 %	40 %	257386291
5227	NC_013202	TCG	2	6	221398	221403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386291
5228	NC_013202	TCG	2	6	221407	221412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386291
5229	NC_013202	TC	3	6	221600	221605	0 %	50 %	0 %	50 %	257386292
5230	NC_013202	CGA	2	6	221618	221623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386292
5231	NC_013202	CGA	2	6	221651	221656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386292
5232	NC_013202	CGA	2	6	221735	221740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386292
5233	NC_013202	GCG	2	6	221773	221778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386292
5234	NC_013202	TCG	2	6	221794	221799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386292
5235	NC_013202	GCG	2	6	221842	221847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386292
5236	NC_013202	CTG	2	6	221898	221903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386292
5237	NC_013202	GACGC	2	10	221935	221944	20 %	0 %	40 %	40 %	257386292
5238	NC_013202	GCCG	2	8	221956	221963	0 %	0 %	50 %	50 %	257386293
5239	NC_013202	CCGCC	2	10	221978	221987	0 %	0 %	20 %	80 %	257386293
5240	NC_013202	GACC	2	8	221992	221999	25 %	0 %	25 %	50 %	257386293
5241	NC_013202	CG	3	6	222026	222031	0 %	0 %	50 %	50 %	257386293
5242	NC_013202	ACCG	2	8	222038	222045	25 %	0 %	25 %	50 %	257386293
5243	NC_013202	CCG	2	6	222081	222086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386293
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5245	NC_013202	CGT	2	6	222169	222174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386293
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5261	NC_013202	TCG	2	6	223042	223047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386294
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5360	NC_013202	CGG	2	6	226855	226860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386300
5361	NC_013202	GTC	2	6	226892	226897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386300
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5364	NC_013202	GGT	2	6	226955	226960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257386300
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5366	NC_013202	GTC	2	6	227015	227020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386300
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5372	NC_013202	C	7	7	227168	227174	0 %	0 %	0 %	100 %	257386300
5373	NC_013202	CGG	2	6	227194	227199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386300
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5465	NC_013202	CGA	2	6	230414	230419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386302
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5470	NC_013202	CCT	2	6	230536	230541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257386303
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5474	NC_013202	CGTC	2	8	230662	230669	0 %	25 %	25 %	50 %	257386303
5475	NC_013202	CGA	2	6	230683	230688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386303
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5477	NC_013202	GAT	2	6	230804	230809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257386303
5478	NC_013202	CGA	2	6	230899	230904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386303
5479	NC_013202	GGC	2	6	230909	230914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257386303
5480	NC_013202	CAT	2	6	230918	230923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257386303
5481	NC_013202	GAT	2	6	230936	230941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257386303
5482	NC_013202	ACC	2	6	230974	230979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257386304
5483	NC_013202	CGT	3	9	230982	230990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386304
5484	NC_013202	GAC	2	6	231018	231023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257386304
5485	NC_013202	TCG	3	9	231040	231048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386304
5486	NC_013202	GCT	2	6	231071	231076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386304
5487	NC_013202	TCG	2	6	231103	231108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386304
5488	NC_013202	ACCG	2	8	231111	231118	25 %	0 %	25 %	50 %	257386304
5489	NC_013202	TGT	2	6	231143	231148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257386304
5490	NC_013202	GTT	2	6	231195	231200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257386304
5491	NC_013202	TGG	2	6	231224	231229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257386304
5492	NC_013202	CTG	2	6	231267	231272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386304
5493	NC_013202	TCGG	2	8	231282	231289	0 %	25 %	50 %	25 %	257386304
5494	NC_013202	TCC	2	6	231295	231300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257386304
5495	NC_013202	GTC	2	6	231331	231336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386304
5496	NC_013202	CGC	2	6	231384	231389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257386304
5497	NC_013202	ACC	2	6	231418	231423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257386305
5498	NC_013202	TCG	2	6	231470	231475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257386305
5499	NC_013202	CTGA	2	8	231478	231485	25 %	25 %	25 %	25 %	257386305
5500	NC_013202	GTG	2	6	231505	231510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257386305

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