MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halomicrobium mukohataei DSM 12286 plasmid pHmuk01

Total Repeats: 4911

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013201	CGA	2	6	26932	26937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372923
502	NC_013201	GCT	2	6	26971	26976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372923
503	NC_013201	CGG	2	6	26984	26989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372923
504	NC_013201	AAC	2	6	27023	27028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257372923
505	NC_013201	TCG	2	6	27087	27092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372923
506	NC_013201	CGGA	2	8	27095	27102	25 %	0 %	50 %	25 %	257372923
507	NC_013201	CGT	3	9	27187	27195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372923
508	NC_013201	TCCC	2	8	27312	27319	0 %	25 %	0 %	75 %	257372924
509	NC_013201	CGA	2	6	27326	27331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372924
510	NC_013201	CGTCG	2	10	27388	27397	0 %	20 %	40 %	40 %	257372924
511	NC_013201	CGA	2	6	27399	27404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372924
512	NC_013201	CGC	2	6	27419	27424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372924
513	NC_013201	CGG	2	6	27516	27521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372924
514	NC_013201	TCGCG	2	10	27530	27539	0 %	20 %	40 %	40 %	257372924
515	NC_013201	CGA	3	9	27543	27551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372924
516	NC_013201	CGC	2	6	27573	27578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372924
517	NC_013201	GTCG	2	8	27600	27607	0 %	25 %	50 %	25 %	257372924
518	NC_013201	GCCG	2	8	27613	27620	0 %	0 %	50 %	50 %	257372924
519	NC_013201	GTG	2	6	27646	27651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257372924
520	NC_013201	GGC	2	6	27657	27662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372924
521	NC_013201	CGC	2	6	27666	27671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372924
522	NC_013201	CGA	2	6	27729	27734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372924
523	NC_013201	CGAGC	2	10	27798	27807	20 %	0 %	40 %	40 %	257372924
524	NC_013201	TCG	2	6	27809	27814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372924
525	NC_013201	CCG	2	6	27827	27832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372924
526	NC_013201	TCG	2	6	27842	27847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372924
527	NC_013201	GCC	2	6	27901	27906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372924
528	NC_013201	GGC	2	6	27966	27971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372924
529	NC_013201	CGA	2	6	27996	28001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372924
530	NC_013201	CG	3	6	28052	28057	0 %	0 %	50 %	50 %	257372924
531	NC_013201	GAC	3	9	28071	28079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372924
532	NC_013201	TCC	2	6	28082	28087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257372924
533	NC_013201	GCGA	2	8	28088	28095	25 %	0 %	50 %	25 %	257372924
534	NC_013201	CGA	2	6	28098	28103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372924
535	NC_013201	CGA	2	6	28190	28195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372924
536	NC_013201	GGC	2	6	28200	28205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372924
537	NC_013201	GC	3	6	28215	28220	0 %	0 %	50 %	50 %	257372924
538	NC_013201	CGA	2	6	28238	28243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372924
539	NC_013201	GC	3	6	28304	28309	0 %	0 %	50 %	50 %	257372924
540	NC_013201	GGGA	2	8	28383	28390	25 %	0 %	75 %	0 %	257372925
541	NC_013201	ATCGAG	2	12	28426	28437	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	257372925
542	NC_013201	GGC	2	6	28438	28443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372925
543	NC_013201	ACG	2	6	28504	28509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372925
544	NC_013201	CAG	2	6	28522	28527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372925
545	NC_013201	GCT	2	6	28581	28586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372925
546	NC_013201	GCGAC	2	10	28703	28712	20 %	0 %	40 %	40 %	257372925
547	NC_013201	CGG	2	6	28760	28765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372925
548	NC_013201	ACG	2	6	28790	28795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372925
549	NC_013201	GAC	2	6	28818	28823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372925
550	NC_013201	TCG	2	6	28865	28870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372925
551	NC_013201	CGA	3	9	28914	28922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372925
552	NC_013201	CTG	2	6	28930	28935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372925
553	NC_013201	AGCG	2	8	28955	28962	25 %	0 %	50 %	25 %	257372925
554	NC_013201	TC	3	6	28964	28969	0 %	50 %	0 %	50 %	257372925
555	NC_013201	GGACG	2	10	29016	29025	20 %	0 %	60 %	20 %	257372925
556	NC_013201	GCGA	2	8	29036	29043	25 %	0 %	50 %	25 %	257372925
557	NC_013201	GGC	2	6	29114	29119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372925
558	NC_013201	GTC	2	6	29134	29139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372925
559	NC_013201	CGG	2	6	29234	29239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372925
560	NC_013201	CGG	2	6	29301	29306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372925
561	NC_013201	GCT	2	6	29325	29330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372925
562	NC_013201	CGG	2	6	29367	29372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372925
563	NC_013201	GAC	2	6	29374	29379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372925
564	NC_013201	G	6	6	29385	29390	0 %	0 %	100 %	0 %	257372925
565	NC_013201	TCG	2	6	29411	29416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372925
566	NC_013201	ACC	2	6	29417	29422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257372925
567	NC_013201	GCG	2	6	29500	29505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372925
568	NC_013201	CTCGC	2	10	29521	29530	0 %	20 %	20 %	60 %	257372925
569	NC_013201	GACG	2	8	29568	29575	25 %	0 %	50 %	25 %	257372925
570	NC_013201	TCG	2	6	29639	29644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372925
571	NC_013201	CGT	2	6	29649	29654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372925
572	NC_013201	GAC	2	6	29698	29703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372925
573	NC_013201	CGA	2	6	29706	29711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372925
574	NC_013201	TCC	2	6	29714	29719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257372925
575	NC_013201	TCG	2	6	29720	29725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372925
576	NC_013201	GCG	2	6	29726	29731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372925
577	NC_013201	CAG	2	6	29779	29784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372925
578	NC_013201	GAG	2	6	29803	29808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257372925
579	NC_013201	CGA	2	6	29859	29864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372925
580	NC_013201	GTG	2	6	29866	29871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257372925
581	NC_013201	TCG	2	6	29933	29938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372925
582	NC_013201	GCGAG	2	10	29940	29949	20 %	0 %	60 %	20 %	257372925
583	NC_013201	CAC	2	6	29979	29984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257372925
584	NC_013201	GAC	2	6	29992	29997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372925
585	NC_013201	CGG	2	6	30002	30007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372925
586	NC_013201	GCC	2	6	30087	30092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372925
587	NC_013201	CGA	2	6	30135	30140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372925
588	NC_013201	ACG	2	6	30170	30175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372925
589	NC_013201	CGAT	2	8	30194	30201	25 %	25 %	25 %	25 %	257372925
590	NC_013201	CGA	2	6	30309	30314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372925
591	NC_013201	CGA	2	6	30357	30362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372925
592	NC_013201	TCGA	2	8	30415	30422	25 %	25 %	25 %	25 %	257372925
593	NC_013201	GAC	2	6	30459	30464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372925
594	NC_013201	TCG	2	6	30482	30487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372925
595	NC_013201	CGA	2	6	30516	30521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372925
596	NC_013201	GAG	2	6	30529	30534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257372925
597	NC_013201	TCG	2	6	30548	30553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372925
598	NC_013201	GGC	2	6	30561	30566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372925
599	NC_013201	CGA	2	6	30594	30599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372925
600	NC_013201	CGA	2	6	30624	30629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372925
601	NC_013201	GCG	2	6	30670	30675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372925
602	NC_013201	TCG	2	6	30686	30691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372925
603	NC_013201	CGG	2	6	30699	30704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372925
604	NC_013201	AG	3	6	30747	30752	50 %	0 %	50 %	0 %	257372925
605	NC_013201	CAG	2	6	30784	30789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372925
606	NC_013201	CGGTG	2	10	30807	30816	0 %	20 %	60 %	20 %	257372925
607	NC_013201	GGT	2	6	30831	30836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257372925
608	NC_013201	TCGA	2	8	30914	30921	25 %	25 %	25 %	25 %	257372925
609	NC_013201	ACGC	2	8	30932	30939	25 %	0 %	25 %	50 %	257372925
610	NC_013201	CAC	2	6	30968	30973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257372925
611	NC_013201	CGGT	2	8	30976	30983	0 %	25 %	50 %	25 %	257372925
612	NC_013201	CGG	2	6	31023	31028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372925
613	NC_013201	GAC	2	6	31047	31052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372925
614	NC_013201	AC	3	6	31120	31125	50 %	0 %	0 %	50 %	257372925
615	NC_013201	CGA	2	6	31173	31178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257372925
616	NC_013201	CGAG	2	8	31182	31189	25 %	0 %	50 %	25 %	257372925
617	NC_013201	AG	3	6	31188	31193	50 %	0 %	50 %	0 %	257372925
618	NC_013201	TCG	2	6	31220	31225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372925
619	NC_013201	CGT	2	6	31227	31232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372925
620	NC_013201	CGG	2	6	31278	31283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372925
621	NC_013201	GAG	2	6	31327	31332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257372925
622	NC_013201	CG	3	6	31360	31365	0 %	0 %	50 %	50 %	257372925
623	NC_013201	GCT	2	6	31491	31496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257372925
624	NC_013201	CGC	2	6	31536	31541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257372925
625	NC_013201	GCTGT	2	10	31609	31618	0 %	40 %	40 %	20 %	257372925
626	NC_013201	GCG	2	6	31649	31654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257372925
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753	NC_013201	TCT	2	6	43603	43608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257372934
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