MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halomicrobium mukohataei DSM 12286 plasmid pHmuk01

Total Repeats: 4911

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013201	CCG	2	6	205132	205137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257373069
4502	NC_013201	GAG	2	6	205179	205184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257373069
4503	NC_013201	GTC	2	6	205200	205205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373069
4504	NC_013201	GCG	2	6	205225	205230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257373069
4505	NC_013201	CTG	2	6	205242	205247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373069
4506	NC_013201	CGT	2	6	205276	205281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373069
4507	NC_013201	TGA	2	6	205291	205296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257373069
4508	NC_013201	TCG	2	6	205468	205473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373070
4509	NC_013201	CCA	2	6	205529	205534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257373070
4510	NC_013201	GTCTCG	2	12	205567	205578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373070
4511	NC_013201	CTC	2	6	205641	205646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257373070
4512	NC_013201	ACGA	2	8	205657	205664	50 %	0 %	25 %	25 %	257373070
4513	NC_013201	GCCG	2	8	205666	205673	0 %	0 %	50 %	50 %	257373070
4514	NC_013201	GTC	2	6	205674	205679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373070
4515	NC_013201	GTG	2	6	205693	205698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257373070
4516	NC_013201	GCC	2	6	205735	205740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257373070
4517	NC_013201	CGT	2	6	205742	205747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373070
4518	NC_013201	AGCG	2	8	205791	205798	25 %	0 %	50 %	25 %	257373070
4519	NC_013201	CGC	2	6	205814	205819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257373070
4520	NC_013201	TCG	2	6	205831	205836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373070
4521	NC_013201	CGAT	2	8	206102	206109	25 %	25 %	25 %	25 %	257373071
4522	NC_013201	CCGA	2	8	206122	206129	25 %	0 %	25 %	50 %	257373071
4523	NC_013201	GGC	2	6	206175	206180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257373071
4524	NC_013201	GGT	2	6	206211	206216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257373071
4525	NC_013201	GCC	2	6	206235	206240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257373071
4526	NC_013201	CAGA	2	8	206270	206277	50 %	0 %	25 %	25 %	257373071
4527	NC_013201	AC	3	6	206338	206343	50 %	0 %	0 %	50 %	257373071
4528	NC_013201	CGAG	2	8	206370	206377	25 %	0 %	50 %	25 %	257373071
4529	NC_013201	ACGG	2	8	206447	206454	25 %	0 %	50 %	25 %	257373071
4530	NC_013201	CTG	2	6	206473	206478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373071
4531	NC_013201	CCG	2	6	206540	206545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257373071
4532	NC_013201	TGC	2	6	206585	206590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373071
4533	NC_013201	ACA	2	6	206597	206602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257373071
4534	NC_013201	GTCG	2	8	206613	206620	0 %	25 %	50 %	25 %	257373071
4535	NC_013201	TGT	2	6	206696	206701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257373071
4536	NC_013201	GA	3	6	206710	206715	50 %	0 %	50 %	0 %	257373071
4537	NC_013201	GCGA	2	8	206716	206723	25 %	0 %	50 %	25 %	257373071
4538	NC_013201	GGC	2	6	206787	206792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257373071
4539	NC_013201	CG	4	8	206832	206839	0 %	0 %	50 %	50 %	257373071
4540	NC_013201	GCG	2	6	206855	206860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257373071
4541	NC_013201	CTG	2	6	206970	206975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373071
4542	NC_013201	GAT	2	6	207046	207051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257373072
4543	NC_013201	CGA	2	6	207054	207059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373072
4544	NC_013201	GCGA	2	8	207101	207108	25 %	0 %	50 %	25 %	257373072
4545	NC_013201	GGT	2	6	207149	207154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257373072
4546	NC_013201	CGG	2	6	207234	207239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257373072
4547	NC_013201	GACGGT	2	12	207265	207276	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	257373072
4548	NC_013201	GCGG	2	8	207329	207336	0 %	0 %	75 %	25 %	257373072
4549	NC_013201	CGG	2	6	207416	207421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257373072
4550	NC_013201	ACG	2	6	207432	207437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373072
4551	NC_013201	TCGCCG	2	12	207453	207464	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	257373072
4552	NC_013201	CGC	2	6	207484	207489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257373072
4553	NC_013201	GCTG	2	8	207529	207536	0 %	25 %	50 %	25 %	257373072
4554	NC_013201	TCG	2	6	207591	207596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373072
4555	NC_013201	GTCCT	2	10	207614	207623	0 %	40 %	20 %	40 %	257373072
4556	NC_013201	AGT	2	6	207651	207656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257373072
4557	NC_013201	TCC	3	9	207728	207736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257373073
4558	NC_013201	CGC	2	6	207786	207791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257373073
4559	NC_013201	ACG	2	6	207800	207805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373073
4560	NC_013201	CGT	2	6	207825	207830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373073
4561	NC_013201	CGACGC	2	12	207831	207842	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	257373073
4562	NC_013201	CGA	2	6	207861	207866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373073
4563	NC_013201	GAA	2	6	207904	207909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257373073
4564	NC_013201	GCCG	2	8	207910	207917	0 %	0 %	50 %	50 %	257373073
4565	NC_013201	GGC	2	6	207945	207950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257373073
4566	NC_013201	GAG	2	6	208000	208005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257373073
4567	NC_013201	CGA	2	6	208020	208025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373073
4568	NC_013201	GTC	2	6	208045	208050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373073
4569	NC_013201	GCT	2	6	208083	208088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373073
4570	NC_013201	ACGA	2	8	208328	208335	50 %	0 %	25 %	25 %	257373074
4571	NC_013201	GA	3	6	208334	208339	50 %	0 %	50 %	0 %	257373074
4572	NC_013201	TAG	2	6	208364	208369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257373074
4573	NC_013201	CGT	2	6	208390	208395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373074
4574	NC_013201	GGT	2	6	208410	208415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257373074
4575	NC_013201	CGC	2	6	208419	208424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257373074
4576	NC_013201	ACCT	2	8	208441	208448	25 %	25 %	0 %	50 %	257373074
4577	NC_013201	TCG	2	6	208457	208462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373074
4578	NC_013201	CAC	2	6	208495	208500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257373074
4579	NC_013201	GAT	2	6	208518	208523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257373074
4580	NC_013201	ACG	2	6	208553	208558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373074
4581	NC_013201	GTG	2	6	208566	208571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257373074
4582	NC_013201	CGA	2	6	208598	208603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373074
4583	NC_013201	CGG	2	6	208608	208613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257373074
4584	NC_013201	CGG	2	6	208633	208638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257373074
4585	NC_013201	GTC	2	6	208663	208668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373074
4586	NC_013201	GCC	2	6	208669	208674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257373074
4587	NC_013201	GGC	2	6	208684	208689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257373074
4588	NC_013201	CTG	2	6	208690	208695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373074
4589	NC_013201	TCG	2	6	208703	208708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373074
4590	NC_013201	GCT	2	6	208782	208787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373074
4591	NC_013201	CTG	2	6	208792	208797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373074
4592	NC_013201	TCG	2	6	208805	208810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373074
4593	NC_013201	TACGTG	2	12	209723	209734	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	257373075
4594	NC_013201	TCG	2	6	209814	209819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373075
4595	NC_013201	CGA	2	6	209844	209849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373075
4596	NC_013201	CGT	3	9	209850	209858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373075
4597	NC_013201	AC	3	6	209879	209884	50 %	0 %	0 %	50 %	257373075
4598	NC_013201	TCG	3	9	209906	209914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373075
4599	NC_013201	TCG	2	6	209960	209965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373075
4600	NC_013201	GAT	2	6	210013	210018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257373075
4601	NC_013201	TCG	2	6	210020	210025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373075
4602	NC_013201	CGA	2	6	210168	210173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373075
4603	NC_013201	GGTC	2	8	210207	210214	0 %	25 %	50 %	25 %	257373075
4604	NC_013201	CT	3	6	210244	210249	0 %	50 %	0 %	50 %	257373075
4605	NC_013201	TGC	2	6	210300	210305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373075
4606	NC_013201	GAC	2	6	210313	210318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373075
4607	NC_013201	TGC	2	6	210357	210362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373075
4608	NC_013201	GCG	3	9	210412	210420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257373075
4609	NC_013201	ACTG	2	8	210452	210459	25 %	25 %	25 %	25 %	257373075
4610	NC_013201	GTT	2	6	210472	210477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257373075
4611	NC_013201	GA	3	6	210726	210731	50 %	0 %	50 %	0 %	257373076
4612	NC_013201	CGTC	2	8	210733	210740	0 %	25 %	25 %	50 %	257373076
4613	NC_013201	TAC	2	6	210782	210787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257373076
4614	NC_013201	AACG	2	8	210791	210798	50 %	0 %	25 %	25 %	257373076
4615	NC_013201	TCG	2	6	210801	210806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373076
4616	NC_013201	TCG	2	6	210849	210854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373076
4617	NC_013201	CGA	2	6	210855	210860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373076
4618	NC_013201	AGCC	2	8	210916	210923	25 %	0 %	25 %	50 %	257373076
4619	NC_013201	GACTC	2	10	210936	210945	20 %	20 %	20 %	40 %	257373076
4620	NC_013201	CTG	2	6	210953	210958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373076
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4861	NC_013201	TGG	2	6	220094	220099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257373083
4862	NC_013201	AGCG	2	8	220121	220128	25 %	0 %	50 %	25 %	257373083
4863	NC_013201	CTG	2	6	220132	220137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373083
4864	NC_013201	TCG	2	6	220151	220156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373083
4865	NC_013201	GGCT	2	8	220183	220190	0 %	25 %	50 %	25 %	257373083
4866	NC_013201	GTCG	2	8	220201	220208	0 %	25 %	50 %	25 %	257373083
4867	NC_013201	CGA	2	6	220217	220222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373083
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4869	NC_013201	GTC	2	6	220288	220293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373083
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4873	NC_013201	GGCTG	2	10	220463	220472	0 %	20 %	60 %	20 %	257373083
4874	NC_013201	CGG	3	9	220511	220519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257373083
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4879	NC_013201	TCG	2	6	220818	220823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373084
4880	NC_013201	GGC	2	6	220862	220867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257373084
4881	NC_013201	CGG	3	9	220870	220878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257373084
4882	NC_013201	GTC	2	6	220937	220942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373084
4883	NC_013201	GTA	2	6	220958	220963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257373084
4884	NC_013201	CGG	2	6	221014	221019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257373084
4885	NC_013201	CG	3	6	221053	221058	0 %	0 %	50 %	50 %	257373084
4886	NC_013201	CAG	2	6	221061	221066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373084
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4889	NC_013201	GCG	2	6	221172	221177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257373084
4890	NC_013201	CAG	2	6	221246	221251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257373084
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4893	NC_013201	CCGC	2	8	221282	221289	0 %	0 %	25 %	75 %	257373084
4894	NC_013201	TCG	2	6	221295	221300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373084
4895	NC_013201	TCG	2	6	221304	221309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257373084
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4897	NC_013201	CGGT	2	8	221355	221362	0 %	25 %	50 %	25 %	257373084
4898	NC_013201	CGAT	3	12	221386	221397	25 %	25 %	25 %	25 %	257373084
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4903	NC_013201	CGG	2	6	221518	221523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257373084
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