MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 66729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013158	CG	3	6	169369	169374	0 %	0 %	50 %	50 %	257051257
3502	NC_013158	CGAG	2	8	169387	169394	25 %	0 %	50 %	25 %	257051257
3503	NC_013158	GAG	3	9	169392	169400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051257
3504	NC_013158	GTC	2	6	169416	169421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051257
3505	NC_013158	CGC	2	6	169436	169441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051257
3506	NC_013158	CGG	2	6	169472	169477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051257
3507	NC_013158	GAC	2	6	169547	169552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051257
3508	NC_013158	TCC	2	6	169564	169569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051257
3509	NC_013158	CG	3	6	169575	169580	0 %	0 %	50 %	50 %	257051257
3510	NC_013158	GCTG	2	8	169586	169593	0 %	25 %	50 %	25 %	257051257
3511	NC_013158	GGA	2	6	169640	169645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051257
3512	NC_013158	GCC	2	6	169701	169706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051257
3513	NC_013158	GTC	2	6	169743	169748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051257
3514	NC_013158	CGACGG	2	12	169796	169807	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	257051257
3515	NC_013158	GCCG	2	8	169845	169852	0 %	0 %	50 %	50 %	257051257
3516	NC_013158	ATCGAC	2	12	169866	169877	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	257051257
3517	NC_013158	CTGG	2	8	169889	169896	0 %	25 %	50 %	25 %	257051257
3518	NC_013158	TGA	2	6	169967	169972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051257
3519	NC_013158	GGC	2	6	169980	169985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051257
3520	NC_013158	TCG	2	6	169987	169992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051257
3521	NC_013158	ACG	2	6	170056	170061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051257
3522	NC_013158	ACG	2	6	170089	170094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051257
3523	NC_013158	AGC	2	6	170135	170140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051257
3524	NC_013158	TAC	2	6	170172	170177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051257
3525	NC_013158	GAC	2	6	170196	170201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051257
3526	NC_013158	GAC	2	6	170298	170303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051257
3527	NC_013158	GTG	2	6	170323	170328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051257
3528	NC_013158	GCCA	2	8	170334	170341	25 %	0 %	25 %	50 %	257051257
3529	NC_013158	GCG	2	6	170343	170348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051257
3530	NC_013158	GGC	2	6	170355	170360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051257
3531	NC_013158	ACG	3	9	170505	170513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051258
3532	NC_013158	GA	3	6	170523	170528	50 %	0 %	50 %	0 %	257051258
3533	NC_013158	TCG	2	6	170529	170534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051258
3534	NC_013158	GTC	2	6	170564	170569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051258
3535	NC_013158	GAA	2	6	170609	170614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257051258
3536	NC_013158	CGTCG	2	10	170695	170704	0 %	20 %	40 %	40 %	257051259
3537	NC_013158	GA	3	6	170724	170729	50 %	0 %	50 %	0 %	257051259
3538	NC_013158	TCG	2	6	170738	170743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051259
3539	NC_013158	GC	3	6	170766	170771	0 %	0 %	50 %	50 %	257051259
3540	NC_013158	TCG	2	6	170798	170803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051259
3541	NC_013158	GGGC	2	8	170845	170852	0 %	0 %	75 %	25 %	257051259
3542	NC_013158	GTC	2	6	170887	170892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051259
3543	NC_013158	CGC	2	6	170905	170910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051259
3544	NC_013158	TCC	2	6	170938	170943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051260
3545	NC_013158	GTC	2	6	171006	171011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051260
3546	NC_013158	GCCG	2	8	171126	171133	0 %	0 %	50 %	50 %	257051260
3547	NC_013158	CGT	2	6	171144	171149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051260
3548	NC_013158	TCG	2	6	171181	171186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051260
3549	NC_013158	CGC	2	6	171275	171280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051260
3550	NC_013158	TCG	2	6	171403	171408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051260
3551	NC_013158	GCT	2	6	171417	171422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051260
3552	NC_013158	GTG	3	9	171595	171603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051261
3553	NC_013158	CGA	2	6	171627	171632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051261
3554	NC_013158	GCCA	2	8	171721	171728	25 %	0 %	25 %	50 %	257051261
3555	NC_013158	GGA	2	6	171729	171734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051261
3556	NC_013158	CCAG	2	8	171822	171829	25 %	0 %	25 %	50 %	257051261
3557	NC_013158	ACG	2	6	171866	171871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051261
3558	NC_013158	CAG	2	6	171889	171894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051261
3559	NC_013158	GCCA	2	8	171947	171954	25 %	0 %	25 %	50 %	257051261
3560	NC_013158	GCCC	2	8	171970	171977	0 %	0 %	25 %	75 %	257051261
3561	NC_013158	CGA	2	6	171996	172001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051261
3562	NC_013158	CGTAC	2	10	172005	172014	20 %	20 %	20 %	40 %	257051261
3563	NC_013158	GAC	2	6	172099	172104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051261
3564	NC_013158	GAG	2	6	172117	172122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051261
3565	NC_013158	CGA	2	6	172176	172181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051261
3566	NC_013158	CGC	2	6	172185	172190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051261
3567	NC_013158	GTC	2	6	172213	172218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051261
3568	NC_013158	TG	3	6	172226	172231	0 %	50 %	50 %	0 %	257051261
3569	NC_013158	AG	4	8	172367	172374	50 %	0 %	50 %	0 %	257051261
3570	NC_013158	AGG	2	6	172394	172399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051261
3571	NC_013158	CAG	2	6	172408	172413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051261
3572	NC_013158	TGT	2	6	172476	172481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257051261
3573	NC_013158	CAG	2	6	172507	172512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051261
3574	NC_013158	CGA	2	6	172560	172565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051261
3575	NC_013158	CGA	2	6	172683	172688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051261
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3577	NC_013158	CGATC	2	10	172997	173006	20 %	20 %	20 %	40 %	257051262
3578	NC_013158	G	6	6	173023	173028	0 %	0 %	100 %	0 %	257051262
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3580	NC_013158	GTC	2	6	173059	173064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051262
3581	NC_013158	GAG	2	6	173104	173109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051262
3582	NC_013158	GCT	2	6	173120	173125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051262
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3584	NC_013158	AGG	2	6	173225	173230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051262
3585	NC_013158	GCG	2	6	173231	173236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051262
3586	NC_013158	ATCC	2	8	173255	173262	25 %	25 %	0 %	50 %	257051262
3587	NC_013158	CGG	2	6	173273	173278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051262
3588	NC_013158	TCG	2	6	173549	173554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051263
3589	NC_013158	CCT	2	6	173616	173621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051263
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3591	NC_013158	CCA	2	6	173769	173774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051263
3592	NC_013158	CGG	2	6	173803	173808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051263
3593	NC_013158	CGT	2	6	173892	173897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051263
3594	NC_013158	TGA	2	6	173910	173915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051263
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3599	NC_013158	ATC	2	6	174046	174051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051263
3600	NC_013158	GTC	2	6	174058	174063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051263
3601	NC_013158	AGCGA	2	10	174070	174079	40 %	0 %	40 %	20 %	257051263
3602	NC_013158	GAC	2	6	174099	174104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051263
3603	NC_013158	CTC	2	6	174166	174171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051263
3604	NC_013158	CCG	2	6	174254	174259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051263
3605	NC_013158	AGTC	2	8	174293	174300	25 %	25 %	25 %	25 %	257051263
3606	NC_013158	CGA	2	6	174318	174323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051263
3607	NC_013158	ACG	2	6	174427	174432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051263
3608	NC_013158	CCG	2	6	174452	174457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051263
3609	NC_013158	CCG	2	6	174975	174980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051264
3610	NC_013158	TCG	2	6	175009	175014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051264
3611	NC_013158	GGC	3	9	175025	175033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051264
3612	NC_013158	TGC	2	6	175117	175122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051264
3613	NC_013158	ACG	3	9	175192	175200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051264
3614	NC_013158	CGC	2	6	175214	175219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051264
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3616	NC_013158	GAC	2	6	175356	175361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051264
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3618	NC_013158	GGC	2	6	175400	175405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051264
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3620	NC_013158	TCG	3	9	175423	175431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051264
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3743	NC_013158	CGG	2	6	181218	181223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051269
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3852	NC_013158	GAC	3	9	185771	185779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051274
3853	NC_013158	TCT	2	6	185818	185823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051274
3854	NC_013158	CCGAGC	2	12	185847	185858	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	257051274
3855	NC_013158	CTGC	2	8	185887	185894	0 %	25 %	25 %	50 %	257051274
3856	NC_013158	CGCGGA	2	12	185932	185943	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	257051274
3857	NC_013158	GCGG	2	8	185972	185979	0 %	0 %	75 %	25 %	257051274
3858	NC_013158	GTC	2	6	186011	186016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051274
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3860	NC_013158	ACG	2	6	186135	186140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051274
3861	NC_013158	CGC	2	6	186173	186178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051274
3862	NC_013158	CGAT	2	8	186180	186187	25 %	25 %	25 %	25 %	257051274
3863	NC_013158	GTT	2	6	186271	186276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257051275
3864	NC_013158	C	7	7	186294	186300	0 %	0 %	0 %	100 %	257051275
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3872	NC_013158	CTG	2	6	186451	186456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051275
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3874	NC_013158	CGT	2	6	186734	186739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051276
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3876	NC_013158	TCG	2	6	186788	186793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051276
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3892	NC_013158	GAC	2	6	187557	187562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051277
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3972	NC_013158	CGTC	2	8	191696	191703	0 %	25 %	25 %	50 %	257051282
3973	NC_013158	CGGC	2	8	191725	191732	0 %	0 %	50 %	50 %	257051282
3974	NC_013158	C	7	7	191792	191798	0 %	0 %	0 %	100 %	257051282
3975	NC_013158	GTC	2	6	191818	191823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051282
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3978	NC_013158	GCG	2	6	192018	192023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051282
3979	NC_013158	CCT	2	6	192029	192034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051282
3980	NC_013158	CGA	2	6	192035	192040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051282
3981	NC_013158	TCG	2	6	192064	192069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051282
3982	NC_013158	CGA	2	6	192098	192103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051282
3983	NC_013158	CGC	2	6	192109	192114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051282
3984	NC_013158	CGAT	2	8	192175	192182	25 %	25 %	25 %	25 %	257051282
3985	NC_013158	GAGG	2	8	192189	192196	25 %	0 %	75 %	0 %	257051282
3986	NC_013158	GCC	2	6	192261	192266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051282
3987	NC_013158	TCG	2	6	192334	192339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051282
3988	NC_013158	CGA	2	6	192374	192379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051282
3989	NC_013158	ACC	2	6	192394	192399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051282
3990	NC_013158	TTG	2	6	192449	192454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257051282
3991	NC_013158	CGA	2	6	192661	192666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051283
3992	NC_013158	TCG	2	6	192708	192713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051283
3993	NC_013158	CGG	2	6	192732	192737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051283
3994	NC_013158	GAC	2	6	192752	192757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051283
3995	NC_013158	CGAAA	2	10	192874	192883	60 %	0 %	20 %	20 %	257051283
3996	NC_013158	GAC	2	6	192932	192937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051283
3997	NC_013158	GAAC	2	8	192988	192995	50 %	0 %	25 %	25 %	257051283
3998	NC_013158	GAG	2	6	193016	193021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051283
3999	NC_013158	GTC	2	6	193043	193048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051283
4000	NC_013158	GTC	2	6	193079	193084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051283

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