MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 66729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013158	TCG	2	6	69042	69047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051157
1502	NC_013158	GCC	2	6	69084	69089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051157
1503	NC_013158	GGC	2	6	69131	69136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051157
1504	NC_013158	CAG	2	6	69170	69175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051157
1505	NC_013158	TCG	2	6	69195	69200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051157
1506	NC_013158	AAT	2	6	69235	69240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257051157
1507	NC_013158	CTA	2	6	69289	69294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051157
1508	NC_013158	CACC	2	8	69332	69339	25 %	0 %	0 %	75 %	257051157
1509	NC_013158	CGC	2	6	69433	69438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051157
1510	NC_013158	CCA	2	6	69443	69448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051157
1511	NC_013158	CGT	2	6	69451	69456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051157
1512	NC_013158	GAG	2	6	69518	69523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051157
1513	NC_013158	CCGGC	2	10	69535	69544	0 %	0 %	40 %	60 %	257051157
1514	NC_013158	CGT	2	6	69559	69564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051157
1515	NC_013158	ATCG	2	8	69608	69615	25 %	25 %	25 %	25 %	257051157
1516	NC_013158	CGA	2	6	69750	69755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051158
1517	NC_013158	CGA	2	6	69761	69766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051158
1518	NC_013158	ACT	2	6	69818	69823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051158
1519	NC_013158	CG	3	6	69841	69846	0 %	0 %	50 %	50 %	257051158
1520	NC_013158	AGG	2	6	69851	69856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051158
1521	NC_013158	CGT	2	6	69867	69872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051158
1522	NC_013158	CGA	2	6	69893	69898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051158
1523	NC_013158	GACC	2	8	69903	69910	25 %	0 %	25 %	50 %	257051158
1524	NC_013158	CGA	2	6	69921	69926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051158
1525	NC_013158	ATC	2	6	69967	69972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051158
1526	NC_013158	AGG	2	6	69977	69982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051158
1527	NC_013158	GGC	2	6	70009	70014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051158
1528	NC_013158	ACG	2	6	70070	70075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051158
1529	NC_013158	CGC	2	6	70091	70096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051158
1530	NC_013158	CGA	3	9	70175	70183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051158
1531	NC_013158	GGC	2	6	70206	70211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051158
1532	NC_013158	GAA	2	6	70216	70221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257051158
1533	NC_013158	GTGG	2	8	70222	70229	0 %	25 %	75 %	0 %	257051158
1534	NC_013158	TCA	2	6	70238	70243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051158
1535	NC_013158	GAC	2	6	70342	70347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051158
1536	NC_013158	TGA	2	6	70352	70357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051158
1537	NC_013158	ATC	3	9	70426	70434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051158
1538	NC_013158	GTC	2	6	70486	70491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051158
1539	NC_013158	CGA	2	6	70512	70517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051158
1540	NC_013158	CCA	2	6	70521	70526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051158
1541	NC_013158	CGG	2	6	70575	70580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051158
1542	NC_013158	CGA	2	6	70605	70610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051158
1543	NC_013158	CGG	2	6	70620	70625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051158
1544	NC_013158	CGT	2	6	70635	70640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051158
1545	NC_013158	TC	3	6	70658	70663	0 %	50 %	0 %	50 %	257051158
1546	NC_013158	TCG	2	6	70666	70671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051158
1547	NC_013158	ACC	2	6	70774	70779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051158
1548	NC_013158	CGT	2	6	70806	70811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051158
1549	NC_013158	GGCGA	2	10	70888	70897	20 %	0 %	60 %	20 %	257051158
1550	NC_013158	GAG	2	6	70918	70923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051158
1551	NC_013158	CGA	3	9	70986	70994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051158
1552	NC_013158	GCC	2	6	71143	71148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051158
1553	NC_013158	CGC	2	6	71151	71156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051158
1554	NC_013158	ACCA	2	8	71197	71204	50 %	0 %	0 %	50 %	257051158
1555	NC_013158	GCG	2	6	71225	71230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051158
1556	NC_013158	CGA	2	6	71238	71243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051158
1557	NC_013158	CACG	2	8	71244	71251	25 %	0 %	25 %	50 %	257051158
1558	NC_013158	CCT	2	6	71252	71257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051158
1559	NC_013158	CGA	2	6	71277	71282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051158
1560	NC_013158	GCGTG	2	10	71283	71292	0 %	20 %	60 %	20 %	257051158
1561	NC_013158	CGA	2	6	71298	71303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051158
1562	NC_013158	CGG	3	9	71328	71336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051158
1563	NC_013158	CGC	2	6	71361	71366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051158
1564	NC_013158	CCCG	2	8	71368	71375	0 %	0 %	25 %	75 %	257051158
1565	NC_013158	TAC	3	9	71428	71436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051158
1566	NC_013158	CT	3	6	71450	71455	0 %	50 %	0 %	50 %	257051158
1567	NC_013158	CGT	2	6	71502	71507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051158
1568	NC_013158	GTC	2	6	71509	71514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051158
1569	NC_013158	GGC	3	9	71515	71523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051158
1570	NC_013158	ACT	2	6	71555	71560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051158
1571	NC_013158	CCGT	2	8	71573	71580	0 %	25 %	25 %	50 %	257051158
1572	NC_013158	CGT	2	6	71610	71615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051158
1573	NC_013158	CAA	3	9	71616	71624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257051158
1574	NC_013158	TTC	2	6	71668	71673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051158
1575	NC_013158	CCG	2	6	71684	71689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051158
1576	NC_013158	GAG	2	6	71710	71715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051158
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1578	NC_013158	GTCG	2	8	71757	71764	0 %	25 %	50 %	25 %	257051158
1579	NC_013158	CCG	2	6	71796	71801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051158
1580	NC_013158	GGA	2	6	71853	71858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051158
1581	NC_013158	CG	3	6	71949	71954	0 %	0 %	50 %	50 %	257051158
1582	NC_013158	GGGC	2	8	72001	72008	0 %	0 %	75 %	25 %	257051158
1583	NC_013158	GTC	2	6	72016	72021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051158
1584	NC_013158	ACG	3	9	72026	72034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051158
1585	NC_013158	GAG	2	6	72052	72057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051158
1586	NC_013158	TCG	2	6	72089	72094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051158
1587	NC_013158	TCGACG	2	12	72122	72133	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257051158
1588	NC_013158	CGA	2	6	72147	72152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051158
1589	NC_013158	CGG	2	6	72162	72167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051158
1590	NC_013158	CCG	2	6	72188	72193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051158
1591	NC_013158	C	6	6	72225	72230	0 %	0 %	0 %	100 %	257051158
1592	NC_013158	CGA	2	6	72237	72242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051158
1593	NC_013158	CTC	2	6	72375	72380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051158
1594	NC_013158	ACGG	2	8	72381	72388	25 %	0 %	50 %	25 %	257051158
1595	NC_013158	GCTG	2	8	72429	72436	0 %	25 %	50 %	25 %	257051158
1596	NC_013158	CGA	2	6	72462	72467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051158
1597	NC_013158	GTC	2	6	72514	72519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051158
1598	NC_013158	TCG	2	6	72674	72679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051158
1599	NC_013158	TCG	2	6	72689	72694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051158
1600	NC_013158	GT	4	8	72817	72824	0 %	50 %	50 %	0 %	257051158
1601	NC_013158	GAG	2	6	72826	72831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051158
1602	NC_013158	CTAC	2	8	72836	72843	25 %	25 %	0 %	50 %	257051158
1603	NC_013158	GGC	2	6	72867	72872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051158
1604	NC_013158	GAC	2	6	72892	72897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051158
1605	NC_013158	CCCG	2	8	73072	73079	0 %	0 %	25 %	75 %	257051159
1606	NC_013158	TGC	2	6	73212	73217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051159
1607	NC_013158	C	6	6	73308	73313	0 %	0 %	0 %	100 %	257051159
1608	NC_013158	TCG	2	6	73335	73340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051159
1609	NC_013158	TCG	2	6	73347	73352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051159
1610	NC_013158	TAC	2	6	73391	73396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051159
1611	NC_013158	CGT	2	6	73450	73455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051159
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1613	NC_013158	C	6	6	73548	73553	0 %	0 %	0 %	100 %	257051160
1614	NC_013158	GCC	2	6	73653	73658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051160
1615	NC_013158	CGA	2	6	73763	73768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051160
1616	NC_013158	CGA	3	9	73796	73804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051160
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1618	NC_013158	GGCT	2	8	73857	73864	0 %	25 %	50 %	25 %	257051160
1619	NC_013158	CGG	2	6	73873	73878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051160
1620	NC_013158	ACG	2	6	73900	73905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051160
1621	NC_013158	GAA	2	6	73923	73928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257051160
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1623	NC_013158	GTC	2	6	73989	73994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051160
1624	NC_013158	GAG	2	6	73995	74000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051160
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1902	NC_013158	AACG	2	8	87189	87196	50 %	0 %	25 %	25 %	257051176
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1986	NC_013158	CAA	2	6	91981	91986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257051182
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1988	NC_013158	TGC	2	6	92062	92067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051182
1989	NC_013158	GACA	2	8	92075	92082	50 %	0 %	25 %	25 %	257051182
1990	NC_013158	A	6	6	92235	92240	100 %	0 %	0 %	0 %	257051183
1991	NC_013158	GCA	2	6	92259	92264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051183
1992	NC_013158	GAG	2	6	92319	92324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051183
1993	NC_013158	CGA	2	6	92465	92470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051183
1994	NC_013158	GAG	2	6	92481	92486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051183
1995	NC_013158	GAC	2	6	92517	92522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051183
1996	NC_013158	GAA	2	6	92530	92535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257051183
1997	NC_013158	GGC	2	6	92656	92661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051184
1998	NC_013158	TCG	2	6	92688	92693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051184
1999	NC_013158	GCC	2	6	92745	92750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051184
2000	NC_013158	CGA	2	6	92752	92757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051184

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