MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 66729

< Previous12...3233343536373839404142...133134Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_013158	CGG	2	6	853666	853671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051968
18003	NC_013158	ACG	2	6	853700	853705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051968
18004	NC_013158	GTC	2	6	853747	853752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051968
18005	NC_013158	TCGCG	2	10	853812	853821	0 %	20 %	40 %	40 %	257051968
18006	NC_013158	CGA	2	6	853863	853868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051968
18007	NC_013158	TCGACG	2	12	853874	853885	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257051968
18008	NC_013158	CGA	2	6	853899	853904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051968
18009	NC_013158	CGG	2	6	853938	853943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051968
18010	NC_013158	CTTC	2	8	853953	853960	0 %	50 %	0 %	50 %	257051968
18011	NC_013158	CGC	2	6	853992	853997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051968
18012	NC_013158	TCG	2	6	854039	854044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051968
18013	NC_013158	CGA	2	6	854088	854093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051968
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18015	NC_013158	CGA	2	6	854414	854419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051969
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18024	NC_013158	GAA	2	6	854634	854639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257051969
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18032	NC_013158	CGCC	2	8	854839	854846	0 %	0 %	25 %	75 %	257051969
18033	NC_013158	CGA	2	6	854873	854878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051969
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18053	NC_013158	ACG	2	6	855571	855576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051970
18054	NC_013158	GCG	2	6	855592	855597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051970
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18118	NC_013158	CGGAG	2	10	858496	858505	20 %	0 %	60 %	20 %	257051971
18119	NC_013158	CGA	2	6	858519	858524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051971
18120	NC_013158	CGGC	2	8	858540	858547	0 %	0 %	50 %	50 %	257051971
18121	NC_013158	ATC	2	6	858577	858582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051971
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18222	NC_013158	CGA	2	6	863534	863539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051978
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18230	NC_013158	CGGCGT	2	12	863921	863932	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	257051978
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18232	NC_013158	GC	3	6	863990	863995	0 %	0 %	50 %	50 %	257051978
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18235	NC_013158	CGG	2	6	864059	864064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051978
18236	NC_013158	CTG	2	6	864096	864101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051978
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18348	NC_013158	CGA	4	12	869228	869239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051984
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18351	NC_013158	CGA	2	6	869421	869426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051985
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18469	NC_013158	CGA	2	6	875012	875017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051990
18470	NC_013158	CGG	2	6	875024	875029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051990
18471	NC_013158	GTG	2	6	875041	875046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051990
18472	NC_013158	CGG	2	6	875071	875076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051990
18473	NC_013158	CGG	2	6	875122	875127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051990
18474	NC_013158	TCGA	2	8	875163	875170	25 %	25 %	25 %	25 %	257051990
18475	NC_013158	ATC	2	6	875226	875231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051990
18476	NC_013158	AAC	2	6	875257	875262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257051990
18477	NC_013158	AGG	2	6	875263	875268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051990
18478	NC_013158	GAG	2	6	875283	875288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051990
18479	NC_013158	GCGG	2	8	875378	875385	0 %	0 %	75 %	25 %	257051990
18480	NC_013158	CGCC	2	8	875387	875394	0 %	0 %	25 %	75 %	257051990
18481	NC_013158	CA	3	6	875399	875404	50 %	0 %	0 %	50 %	257051990
18482	NC_013158	CTGGCC	2	12	875409	875420	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	257051990
18483	NC_013158	GGC	2	6	875496	875501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051990
18484	NC_013158	GTC	2	6	875519	875524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051990
18485	NC_013158	TCC	2	6	875530	875535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051990
18486	NC_013158	CGG	2	6	875552	875557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051990
18487	NC_013158	GAC	2	6	875972	875977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051991
18488	NC_013158	CGT	3	9	876205	876213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051992
18489	NC_013158	GCG	2	6	876237	876242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051992
18490	NC_013158	GAG	3	9	876287	876295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051992
18491	NC_013158	TCG	2	6	876330	876335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051992
18492	NC_013158	GTG	2	6	876336	876341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051992
18493	NC_013158	TCG	2	6	876345	876350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051992
18494	NC_013158	GCC	2	6	876468	876473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051992
18495	NC_013158	CGA	3	9	876493	876501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051992
18496	NC_013158	GACGTC	2	12	876518	876529	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257051992
18497	NC_013158	TGA	2	6	876607	876612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051992
18498	NC_013158	GCT	2	6	876655	876660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051992
18499	NC_013158	TCGAGA	2	12	876690	876701	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	257051992
18500	NC_013158	CTT	2	6	876736	876741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051992

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