MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 66729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_013158	TGA	2	6	829090	829095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051945
17502	NC_013158	CAT	2	6	829204	829209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051945
17503	NC_013158	GTT	2	6	829213	829218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257051945
17504	NC_013158	CGA	2	6	829228	829233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051945
17505	NC_013158	GCTC	2	8	829269	829276	0 %	25 %	25 %	50 %	257051945
17506	NC_013158	GTT	2	6	829301	829306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257051945
17507	NC_013158	GTA	2	6	829334	829339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051945
17508	NC_013158	AG	3	6	829526	829531	50 %	0 %	50 %	0 %	257051945
17509	NC_013158	TCG	2	6	829533	829538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051945
17510	NC_013158	CGT	3	9	829544	829552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051945
17511	NC_013158	CTC	2	6	829553	829558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051945
17512	NC_013158	ACG	2	6	829567	829572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051945
17513	NC_013158	GCC	2	6	829608	829613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051945
17514	NC_013158	TGG	2	6	829686	829691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051945
17515	NC_013158	ATC	2	6	829901	829906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051946
17516	NC_013158	CGA	2	6	829937	829942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051946
17517	NC_013158	CGG	3	9	829961	829969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051946
17518	NC_013158	TTC	2	6	829992	829997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051946
17519	NC_013158	CGA	2	6	830147	830152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051946
17520	NC_013158	GTC	2	6	830175	830180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051946
17521	NC_013158	CGC	2	6	830261	830266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051946
17522	NC_013158	CGGG	2	8	830278	830285	0 %	0 %	75 %	25 %	257051946
17523	NC_013158	CGC	2	6	830327	830332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051946
17524	NC_013158	CG	3	6	830400	830405	0 %	0 %	50 %	50 %	257051946
17525	NC_013158	ACG	2	6	830410	830415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051946
17526	NC_013158	CAT	2	6	830469	830474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051946
17527	NC_013158	TCG	2	6	830485	830490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051946
17528	NC_013158	GAA	2	6	830493	830498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257051946
17529	NC_013158	GAG	2	6	830505	830510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051946
17530	NC_013158	CG	3	6	830513	830518	0 %	0 %	50 %	50 %	257051946
17531	NC_013158	CGA	2	6	830567	830572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051946
17532	NC_013158	ACCG	2	8	830625	830632	25 %	0 %	25 %	50 %	257051946
17533	NC_013158	CG	3	6	830631	830636	0 %	0 %	50 %	50 %	257051946
17534	NC_013158	CAG	2	6	830691	830696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051946
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17536	NC_013158	CGG	3	9	830734	830742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051946
17537	NC_013158	TCG	2	6	830755	830760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051946
17538	NC_013158	CCT	2	6	830770	830775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051946
17539	NC_013158	TCG	2	6	830779	830784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051946
17540	NC_013158	AGG	2	6	830791	830796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051946
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17543	NC_013158	CCG	2	6	830857	830862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051946
17544	NC_013158	ACC	2	6	830874	830879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051946
17545	NC_013158	CGAA	2	8	830929	830936	50 %	0 %	25 %	25 %	257051946
17546	NC_013158	CGA	2	6	830942	830947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051946
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17548	NC_013158	CGT	2	6	831038	831043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051946
17549	NC_013158	ACC	2	6	831084	831089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051946
17550	NC_013158	GTCCG	2	10	831106	831115	0 %	20 %	40 %	40 %	257051946
17551	NC_013158	GAT	2	6	831119	831124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051946
17552	NC_013158	ATCGA	2	10	831144	831153	40 %	20 %	20 %	20 %	257051946
17553	NC_013158	CGA	2	6	831182	831187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051946
17554	NC_013158	CAG	2	6	831213	831218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051946
17555	NC_013158	GAG	2	6	831237	831242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051946
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17558	NC_013158	GGC	2	6	831558	831563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051947
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17563	NC_013158	GA	3	6	831744	831749	50 %	0 %	50 %	0 %	257051947
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17590	NC_013158	CA	3	6	833077	833082	50 %	0 %	0 %	50 %	257051949
17591	NC_013158	AC	3	6	833151	833156	50 %	0 %	0 %	50 %	257051949
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17597	NC_013158	GGACG	2	10	833525	833534	20 %	0 %	60 %	20 %	257051950
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17601	NC_013158	GTA	2	6	833772	833777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051950
17602	NC_013158	TGC	2	6	833785	833790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051950
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17608	NC_013158	GCGACG	2	12	834130	834141	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	257051950
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17610	NC_013158	CTC	2	6	834177	834182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051950
17611	NC_013158	TCG	2	6	834200	834205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051950
17612	NC_013158	AC	3	6	834274	834279	50 %	0 %	0 %	50 %	257051950
17613	NC_013158	GCGG	2	8	834309	834316	0 %	0 %	75 %	25 %	257051950
17614	NC_013158	CGT	2	6	834347	834352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051950
17615	NC_013158	CGA	2	6	834365	834370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051950
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17972	NC_013158	CGA	2	6	852062	852067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051967
17973	NC_013158	TCG	2	6	852082	852087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051967
17974	NC_013158	ATC	2	6	852142	852147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051967
17975	NC_013158	GCC	2	6	852177	852182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051967
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17978	NC_013158	GCCA	2	8	852293	852300	25 %	0 %	25 %	50 %	257051967
17979	NC_013158	GCC	2	6	852725	852730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051968
17980	NC_013158	CGT	2	6	852763	852768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051968
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17982	NC_013158	CGA	2	6	852897	852902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051968
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17991	NC_013158	TCG	2	6	853319	853324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051968
17992	NC_013158	TCG	2	6	853343	853348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051968
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17996	NC_013158	GTA	2	6	853444	853449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051968
17997	NC_013158	TCG	2	6	853475	853480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051968
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17999	NC_013158	CGA	2	6	853509	853514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051968
18000	NC_013158	CGG	2	6	853530	853535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051968

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