MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 66729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_013158	CGT	2	6	804349	804354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051914
17003	NC_013158	TCG	2	6	804387	804392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051914
17004	NC_013158	CGT	2	6	804586	804591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051915
17005	NC_013158	TCG	2	6	804603	804608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051915
17006	NC_013158	GTC	2	6	804614	804619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051915
17007	NC_013158	CGC	2	6	804637	804642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051915
17008	NC_013158	GTC	2	6	804686	804691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051915
17009	NC_013158	CCA	2	6	804698	804703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051915
17010	NC_013158	CA	3	6	804702	804707	50 %	0 %	0 %	50 %	257051915
17011	NC_013158	CCA	2	6	804717	804722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051915
17012	NC_013158	CCG	2	6	804782	804787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051915
17013	NC_013158	CGA	2	6	804877	804882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051915
17014	NC_013158	CTC	3	9	805158	805166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051916
17015	NC_013158	GGC	2	6	805167	805172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051916
17016	NC_013158	CGTTCC	2	12	805177	805188	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	257051916
17017	NC_013158	GGC	2	6	805229	805234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051916
17018	NC_013158	GAC	3	9	805253	805261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051916
17019	NC_013158	ACG	2	6	805300	805305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051916
17020	NC_013158	CGAC	2	8	805321	805328	25 %	0 %	25 %	50 %	257051916
17021	NC_013158	GCT	2	6	805358	805363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051916
17022	NC_013158	TCG	2	6	805369	805374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051916
17023	NC_013158	GCG	3	9	805378	805386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051916
17024	NC_013158	CGGCG	2	10	805403	805412	0 %	0 %	60 %	40 %	257051916
17025	NC_013158	GAC	2	6	805418	805423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051916
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17028	NC_013158	GAG	2	6	805464	805469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051916
17029	NC_013158	CGG	2	6	805496	805501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051916
17030	NC_013158	TCG	2	6	805546	805551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051916
17031	NC_013158	CAC	2	6	805557	805562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051916
17032	NC_013158	CGATCA	2	12	805564	805575	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	257051916
17033	NC_013158	ACG	2	6	805597	805602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051916
17034	NC_013158	GTC	2	6	805614	805619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051916
17035	NC_013158	CGA	2	6	805622	805627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051916
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17039	NC_013158	CGG	2	6	805793	805798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051916
17040	NC_013158	TCG	2	6	805911	805916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051917
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17043	NC_013158	GAC	2	6	805993	805998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051917
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17049	NC_013158	CGA	2	6	806172	806177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051917
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17051	NC_013158	GCCGC	2	10	806195	806204	0 %	0 %	40 %	60 %	257051917
17052	NC_013158	CCGT	2	8	806267	806274	0 %	25 %	25 %	50 %	257051917
17053	NC_013158	TCG	2	6	806276	806281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051917
17054	NC_013158	CGT	2	6	806284	806289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051917
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17062	NC_013158	TCC	2	6	806675	806680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051918
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17066	NC_013158	CGAG	2	8	806798	806805	25 %	0 %	50 %	25 %	257051918
17067	NC_013158	ATCGA	2	10	806884	806893	40 %	20 %	20 %	20 %	257051918
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17237	NC_013158	TCG	2	6	816168	816173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051929
17238	NC_013158	TCG	2	6	816297	816302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051929
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17352	NC_013158	CGA	2	6	822484	822489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051938
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17354	NC_013158	GAC	2	6	822536	822541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051938
17355	NC_013158	CGT	2	6	822556	822561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051938
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17471	NC_013158	CGA	2	6	827800	827805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051944
17472	NC_013158	CGA	2	6	827809	827814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051944
17473	NC_013158	CGT	2	6	827899	827904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051944
17474	NC_013158	GTC	2	6	827912	827917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051944
17475	NC_013158	GA	3	6	827952	827957	50 %	0 %	50 %	0 %	257051944
17476	NC_013158	CGAG	2	8	827965	827972	25 %	0 %	50 %	25 %	257051944
17477	NC_013158	GAG	2	6	828006	828011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051944
17478	NC_013158	CGG	2	6	828036	828041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051944
17479	NC_013158	CTC	2	6	828044	828049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051944
17480	NC_013158	CGA	2	6	828064	828069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051944
17481	NC_013158	CGAG	2	8	828078	828085	25 %	0 %	50 %	25 %	257051944
17482	NC_013158	GATCCG	2	12	828139	828150	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257051944
17483	NC_013158	GAT	2	6	828260	828265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051944
17484	NC_013158	CCT	2	6	828277	828282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051944
17485	NC_013158	TCGAT	2	10	828303	828312	20 %	40 %	20 %	20 %	257051944
17486	NC_013158	AG	3	6	828512	828517	50 %	0 %	50 %	0 %	257051945
17487	NC_013158	CGG	2	6	828535	828540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051945
17488	NC_013158	TCG	2	6	828541	828546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051945
17489	NC_013158	GGATCG	2	12	828549	828560	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	257051945
17490	NC_013158	GACTT	2	10	828582	828591	20 %	40 %	20 %	20 %	257051945
17491	NC_013158	GGC	2	6	828650	828655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051945
17492	NC_013158	CTG	2	6	828668	828673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051945
17493	NC_013158	GAAG	2	8	828679	828686	50 %	0 %	50 %	0 %	257051945
17494	NC_013158	GGGGT	2	10	828718	828727	0 %	20 %	80 %	0 %	257051945
17495	NC_013158	TCG	2	6	828789	828794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051945
17496	NC_013158	CGT	2	6	828800	828805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051945
17497	NC_013158	GTC	2	6	828902	828907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051945
17498	NC_013158	TCG	3	9	828957	828965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051945
17499	NC_013158	GAG	2	6	828993	828998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051945
17500	NC_013158	CGT	3	9	829006	829014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051945

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