MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 66729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_013158	TCG	2	6	756677	756682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051863
16003	NC_013158	CGG	3	9	756741	756749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051863
16004	NC_013158	GCTCC	2	10	756765	756774	0 %	20 %	20 %	60 %	257051863
16005	NC_013158	TCG	2	6	756791	756796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051863
16006	NC_013158	CGG	2	6	756846	756851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051863
16007	NC_013158	CGGC	2	8	756857	756864	0 %	0 %	50 %	50 %	257051863
16008	NC_013158	TCT	2	6	756869	756874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051863
16009	NC_013158	GCC	2	6	756932	756937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051863
16010	NC_013158	GTC	2	6	756943	756948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051863
16011	NC_013158	GCGA	2	8	757052	757059	25 %	0 %	50 %	25 %	257051863
16012	NC_013158	CGC	2	6	757071	757076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051863
16013	NC_013158	GAGCG	2	10	757078	757087	20 %	0 %	60 %	20 %	257051863
16014	NC_013158	TCG	2	6	757121	757126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051863
16015	NC_013158	CGA	2	6	757471	757476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051864
16016	NC_013158	CGAG	2	8	757593	757600	25 %	0 %	50 %	25 %	257051864
16017	NC_013158	CCGG	2	8	757642	757649	0 %	0 %	50 %	50 %	257051864
16018	NC_013158	CAC	2	6	757660	757665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051864
16019	NC_013158	CGT	2	6	757810	757815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051864
16020	NC_013158	ATCGA	2	10	757826	757835	40 %	20 %	20 %	20 %	257051864
16021	NC_013158	GTC	2	6	757965	757970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051865
16022	NC_013158	CGG	2	6	757996	758001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051865
16023	NC_013158	TCG	2	6	758053	758058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051865
16024	NC_013158	CTC	2	6	758091	758096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051865
16025	NC_013158	CGT	2	6	758105	758110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051865
16026	NC_013158	CGGC	2	8	758117	758124	0 %	0 %	50 %	50 %	257051865
16027	NC_013158	CGA	2	6	758138	758143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051865
16028	NC_013158	CCGA	2	8	758226	758233	25 %	0 %	25 %	50 %	257051865
16029	NC_013158	GAC	2	6	758259	758264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051865
16030	NC_013158	TCG	3	9	758284	758292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051865
16031	NC_013158	CGA	3	9	758333	758341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051865
16032	NC_013158	TCG	2	6	758353	758358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051865
16033	NC_013158	GCCGC	2	10	758389	758398	0 %	0 %	40 %	60 %	257051866
16034	NC_013158	CGA	2	6	758459	758464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051866
16035	NC_013158	GGC	2	6	758511	758516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051866
16036	NC_013158	CAG	2	6	758520	758525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051866
16037	NC_013158	TGC	2	6	758573	758578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051866
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16039	NC_013158	ATG	2	6	758626	758631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051866
16040	NC_013158	GACG	2	8	758651	758658	25 %	0 %	50 %	25 %	257051866
16041	NC_013158	CGT	2	6	758663	758668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051866
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16044	NC_013158	TGT	2	6	758759	758764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257051866
16045	NC_013158	CGT	2	6	758769	758774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051866
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16050	NC_013158	GGA	2	6	758951	758956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051866
16051	NC_013158	GGC	2	6	759042	759047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051866
16052	NC_013158	CTC	2	6	759093	759098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051866
16053	NC_013158	TCG	2	6	759146	759151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051866
16054	NC_013158	GAC	2	6	759195	759200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051866
16055	NC_013158	GC	3	6	759208	759213	0 %	0 %	50 %	50 %	257051866
16056	NC_013158	TCA	2	6	759251	759256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051866
16057	NC_013158	ACG	2	6	759373	759378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051866
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16059	NC_013158	GAC	2	6	759477	759482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051866
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16063	NC_013158	CGC	2	6	759630	759635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051866
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16065	NC_013158	CGT	2	6	759681	759686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051866
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16086	NC_013158	GTC	2	6	760941	760946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051866
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16090	NC_013158	TCG	2	6	761213	761218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051867
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16101	NC_013158	CAC	2	6	761683	761688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051867
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16105	NC_013158	TCG	3	9	761912	761920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051867
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16112	NC_013158	CTCG	2	8	762118	762125	0 %	25 %	25 %	50 %	257051867
16113	NC_013158	TCGAGG	2	12	762131	762142	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	257051867
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16115	NC_013158	TCG	2	6	762224	762229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051867
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16471	NC_013158	GAC	3	9	780821	780829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051884
16472	NC_013158	ATC	2	6	780918	780923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051884
16473	NC_013158	GTC	2	6	780944	780949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051884
16474	NC_013158	ACG	2	6	780982	780987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051884
16475	NC_013158	CGA	2	6	781045	781050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051884
16476	NC_013158	TCGC	2	8	781116	781123	0 %	25 %	25 %	50 %	257051884
16477	NC_013158	CGG	2	6	781130	781135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051884
16478	NC_013158	TGC	2	6	781181	781186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051884
16479	NC_013158	TCG	2	6	781231	781236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051884
16480	NC_013158	GGT	2	6	781253	781258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051884
16481	NC_013158	TGA	2	6	781263	781268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051884
16482	NC_013158	GGC	2	6	781288	781293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051885
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16484	NC_013158	GCT	2	6	781337	781342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051885
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16487	NC_013158	GAC	3	9	781564	781572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051885
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16490	NC_013158	TCGT	2	8	781679	781686	0 %	50 %	25 %	25 %	257051885
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16492	NC_013158	ATGG	2	8	781741	781748	25 %	25 %	50 %	0 %	257051885
16493	NC_013158	GGC	2	6	781781	781786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051885
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16495	NC_013158	CGA	2	6	781932	781937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051886
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16497	NC_013158	TCG	2	6	781983	781988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051886
16498	NC_013158	CGA	2	6	782074	782079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051886
16499	NC_013158	CCCG	2	8	782101	782108	0 %	0 %	25 %	75 %	257051886
16500	NC_013158	TAC	2	6	782192	782197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051886

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