MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 66729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_013158	GTC	2	6	734502	734507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051833
15502	NC_013158	CGCTC	2	10	734703	734712	0 %	20 %	20 %	60 %	257051834
15503	NC_013158	CGC	2	6	734732	734737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051834
15504	NC_013158	CG	3	6	734887	734892	0 %	0 %	50 %	50 %	257051834
15505	NC_013158	ACG	2	6	735045	735050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051834
15506	NC_013158	CCG	2	6	735087	735092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051834
15507	NC_013158	GT	3	6	735114	735119	0 %	50 %	50 %	0 %	257051834
15508	NC_013158	CAG	2	6	735125	735130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051834
15509	NC_013158	GCCC	2	8	735132	735139	0 %	0 %	25 %	75 %	257051834
15510	NC_013158	GTC	2	6	735140	735145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051834
15511	NC_013158	CGC	2	6	735178	735183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051834
15512	NC_013158	CGA	2	6	735244	735249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051834
15513	NC_013158	GAG	2	6	735320	735325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051834
15514	NC_013158	CGT	2	6	735355	735360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051834
15515	NC_013158	CGG	2	6	735397	735402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051834
15516	NC_013158	GGC	2	6	735492	735497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051834
15517	NC_013158	CAG	2	6	735515	735520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051834
15518	NC_013158	GAC	2	6	735530	735535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051834
15519	NC_013158	CGT	2	6	735541	735546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051834
15520	NC_013158	TCCG	2	8	735606	735613	0 %	25 %	25 %	50 %	257051834
15521	NC_013158	GCG	2	6	735621	735626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051834
15522	NC_013158	GAG	2	6	735629	735634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051834
15523	NC_013158	CG	3	6	735690	735695	0 %	0 %	50 %	50 %	257051834
15524	NC_013158	AGG	2	6	735697	735702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051834
15525	NC_013158	CGA	2	6	735724	735729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051834
15526	NC_013158	TGG	2	6	735740	735745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051834
15527	NC_013158	CG	3	6	735747	735752	0 %	0 %	50 %	50 %	257051834
15528	NC_013158	GTC	2	6	735915	735920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051834
15529	NC_013158	CGGC	2	8	735931	735938	0 %	0 %	50 %	50 %	257051834
15530	NC_013158	CGA	2	6	735988	735993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051834
15531	NC_013158	GT	3	6	736016	736021	0 %	50 %	50 %	0 %	257051834
15532	NC_013158	TCGG	2	8	736029	736036	0 %	25 %	50 %	25 %	257051834
15533	NC_013158	CCG	2	6	736117	736122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051834
15534	NC_013158	GCC	2	6	736218	736223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051834
15535	NC_013158	ACG	2	6	736269	736274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051834
15536	NC_013158	CTG	2	6	736282	736287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051834
15537	NC_013158	AC	3	6	736309	736314	50 %	0 %	0 %	50 %	257051834
15538	NC_013158	CGT	2	6	736342	736347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051834
15539	NC_013158	CGG	2	6	736376	736381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051834
15540	NC_013158	AGTC	2	8	736418	736425	25 %	25 %	25 %	25 %	257051834
15541	NC_013158	CGA	2	6	736456	736461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051834
15542	NC_013158	CGA	2	6	736492	736497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051834
15543	NC_013158	CGG	2	6	736538	736543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051834
15544	NC_013158	TCG	2	6	736557	736562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051834
15545	NC_013158	ATCG	2	8	736585	736592	25 %	25 %	25 %	25 %	257051834
15546	NC_013158	GCG	3	9	736594	736602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051834
15547	NC_013158	C	6	6	736619	736624	0 %	0 %	0 %	100 %	257051834
15548	NC_013158	CGA	2	6	736639	736644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051834
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15550	NC_013158	TCG	2	6	736809	736814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051834
15551	NC_013158	CGG	2	6	736843	736848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051834
15552	NC_013158	AGC	2	6	736884	736889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051834
15553	NC_013158	TCG	2	6	736896	736901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051834
15554	NC_013158	GAC	2	6	736928	736933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051834
15555	NC_013158	CG	3	6	737313	737318	0 %	0 %	50 %	50 %	257051835
15556	NC_013158	AAAG	2	8	737334	737341	75 %	0 %	25 %	0 %	257051835
15557	NC_013158	GAC	2	6	737352	737357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051835
15558	NC_013158	TCG	4	12	737387	737398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051835
15559	NC_013158	GGA	2	6	737415	737420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051835
15560	NC_013158	TCG	2	6	737474	737479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051835
15561	NC_013158	CGGC	2	8	737504	737511	0 %	0 %	50 %	50 %	257051835
15562	NC_013158	CGG	2	6	737528	737533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051835
15563	NC_013158	TCG	2	6	737540	737545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051835
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15565	NC_013158	CGA	2	6	737639	737644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051836
15566	NC_013158	ATC	2	6	737751	737756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051836
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15568	NC_013158	AAT	2	6	737842	737847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257051836
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15572	NC_013158	GAC	2	6	737926	737931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051837
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15577	NC_013158	GCG	2	6	738024	738029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051837
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15587	NC_013158	CGA	2	6	738393	738398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051838
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15589	NC_013158	TCG	2	6	738455	738460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051838
15590	NC_013158	TCA	2	6	738464	738469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051838
15591	NC_013158	GACGC	2	10	738508	738517	20 %	0 %	40 %	40 %	257051838
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15594	NC_013158	CAT	2	6	738609	738614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051838
15595	NC_013158	CGAA	2	8	738644	738651	50 %	0 %	25 %	25 %	257051838
15596	NC_013158	TTC	2	6	738667	738672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051838
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15599	NC_013158	CTG	2	6	738806	738811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051839
15600	NC_013158	CGG	2	6	738817	738822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051839
15601	NC_013158	GAC	2	6	738865	738870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051839
15602	NC_013158	TCGA	2	8	738898	738905	25 %	25 %	25 %	25 %	257051839
15603	NC_013158	CGGCAG	2	12	738957	738968	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	257051839
15604	NC_013158	CGTC	2	8	739221	739228	0 %	25 %	25 %	50 %	257051839
15605	NC_013158	GAG	2	6	739344	739349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051840
15606	NC_013158	GTCA	2	8	739353	739360	25 %	25 %	25 %	25 %	257051840
15607	NC_013158	CGT	2	6	739361	739366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051840
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15609	NC_013158	GAC	2	6	739395	739400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051840
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15613	NC_013158	GAC	2	6	739698	739703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051840
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15975	NC_013158	TCG	2	6	755282	755287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051861
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15999	NC_013158	CGA	2	6	756530	756535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051863
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