MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 66729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_013158	TCC	2	6	711529	711534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051806
15002	NC_013158	CCG	2	6	711535	711540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051806
15003	NC_013158	AAC	2	6	711560	711565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257051806
15004	NC_013158	GTC	2	6	711567	711572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051806
15005	NC_013158	GAA	2	6	711575	711580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257051806
15006	NC_013158	CGG	2	6	711653	711658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051806
15007	NC_013158	GCG	4	12	711700	711711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051806
15008	NC_013158	GAA	2	6	711747	711752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257051806
15009	NC_013158	TCGACG	2	12	711892	711903	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257051807
15010	NC_013158	CTT	2	6	711926	711931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051807
15011	NC_013158	CGT	2	6	711948	711953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051807
15012	NC_013158	CGA	2	6	712028	712033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051807
15013	NC_013158	TCG	2	6	712048	712053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051807
15014	NC_013158	GCC	2	6	712069	712074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051807
15015	NC_013158	ATC	2	6	712081	712086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051807
15016	NC_013158	CTT	2	6	712131	712136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051807
15017	NC_013158	GTC	2	6	712138	712143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051807
15018	NC_013158	GTC	2	6	712173	712178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051807
15019	NC_013158	CGT	2	6	712179	712184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051807
15020	NC_013158	GAG	2	6	712213	712218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051807
15021	NC_013158	GTT	2	6	712326	712331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257051807
15022	NC_013158	CGT	2	6	712340	712345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051807
15023	NC_013158	GTC	2	6	712363	712368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051807
15024	NC_013158	GTG	2	6	712411	712416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051807
15025	NC_013158	CTC	2	6	712437	712442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051807
15026	NC_013158	ACC	2	6	712460	712465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051807
15027	NC_013158	TGTC	2	8	712476	712483	0 %	50 %	25 %	25 %	257051807
15028	NC_013158	GT	3	6	712513	712518	0 %	50 %	50 %	0 %	257051808
15029	NC_013158	ACG	2	6	712556	712561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051808
15030	NC_013158	GTC	2	6	712592	712597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051808
15031	NC_013158	TCG	2	6	712608	712613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051808
15032	NC_013158	GTC	3	9	712637	712645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051808
15033	NC_013158	GTG	2	6	712652	712657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051808
15034	NC_013158	GCC	2	6	712673	712678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051808
15035	NC_013158	GTC	2	6	712712	712717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051808
15036	NC_013158	TCG	2	6	712722	712727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051808
15037	NC_013158	CTCA	2	8	712735	712742	25 %	25 %	0 %	50 %	257051808
15038	NC_013158	GATC	2	8	712840	712847	25 %	25 %	25 %	25 %	257051809
15039	NC_013158	CG	3	6	712871	712876	0 %	0 %	50 %	50 %	257051809
15040	NC_013158	CGT	2	6	712879	712884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051809
15041	NC_013158	CGC	2	6	712895	712900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051809
15042	NC_013158	CGA	2	6	712924	712929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051809
15043	NC_013158	CGAGC	2	10	712963	712972	20 %	0 %	40 %	40 %	257051809
15044	NC_013158	CGA	3	9	713002	713010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051809
15045	NC_013158	CGT	2	6	713047	713052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051809
15046	NC_013158	GC	3	6	713086	713091	0 %	0 %	50 %	50 %	257051809
15047	NC_013158	GCG	2	6	713151	713156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051809
15048	NC_013158	CCG	2	6	713178	713183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051809
15049	NC_013158	GTC	2	6	713187	713192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051809
15050	NC_013158	ACC	2	6	713198	713203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051809
15051	NC_013158	CGA	2	6	713281	713286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051809
15052	NC_013158	CGC	2	6	713291	713296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051809
15053	NC_013158	TCG	2	6	713310	713315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051809
15054	NC_013158	GC	3	6	713488	713493	0 %	0 %	50 %	50 %	257051809
15055	NC_013158	GCA	2	6	713511	713516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051809
15056	NC_013158	ACG	2	6	713517	713522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051809
15057	NC_013158	CGC	2	6	713525	713530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051809
15058	NC_013158	CGA	2	6	713539	713544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051809
15059	NC_013158	GTCG	2	8	713546	713553	0 %	25 %	50 %	25 %	257051809
15060	NC_013158	CGAG	2	8	713572	713579	25 %	0 %	50 %	25 %	257051809
15061	NC_013158	GCC	2	6	713595	713600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051809
15062	NC_013158	CGATC	2	10	713613	713622	20 %	20 %	20 %	40 %	257051809
15063	NC_013158	TCGC	2	8	713683	713690	0 %	25 %	25 %	50 %	257051809
15064	NC_013158	GCG	2	6	713691	713696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051809
15065	NC_013158	GAC	2	6	713711	713716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051809
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15067	NC_013158	GGC	2	6	713837	713842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051809
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15069	NC_013158	GAG	2	6	713891	713896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051810
15070	NC_013158	CGT	2	6	713908	713913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051810
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15072	NC_013158	GTA	2	6	713951	713956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051810
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15076	NC_013158	CGT	2	6	714100	714105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051810
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15084	NC_013158	CGA	2	6	714668	714673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051811
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15087	NC_013158	GC	3	6	714797	714802	0 %	0 %	50 %	50 %	257051811
15088	NC_013158	CG	4	8	714829	714836	0 %	0 %	50 %	50 %	257051811
15089	NC_013158	TGG	2	6	714841	714846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051811
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15094	NC_013158	CTG	3	9	715077	715085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051811
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15097	NC_013158	ATC	2	6	715131	715136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051811
15098	NC_013158	GCGG	2	8	715164	715171	0 %	0 %	75 %	25 %	257051811
15099	NC_013158	CGAA	2	8	715222	715229	50 %	0 %	25 %	25 %	257051811
15100	NC_013158	ACGCGA	2	12	715303	715314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051811
15101	NC_013158	CTGGG	2	10	715359	715368	0 %	20 %	60 %	20 %	257051811
15102	NC_013158	ACGG	2	8	715389	715396	25 %	0 %	50 %	25 %	257051811
15103	NC_013158	CGG	2	6	715451	715456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051811
15104	NC_013158	CCTG	2	8	715496	715503	0 %	25 %	25 %	50 %	257051811
15105	NC_013158	CGC	2	6	715514	715519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051811
15106	NC_013158	ACC	2	6	715522	715527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051811
15107	NC_013158	TTCACT	2	12	715624	715635	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	257051811
15108	NC_013158	GAG	2	6	715731	715736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051811
15109	NC_013158	CGAAA	2	10	715740	715749	60 %	0 %	20 %	20 %	257051811
15110	NC_013158	CGAT	2	8	715750	715757	25 %	25 %	25 %	25 %	257051811
15111	NC_013158	CGAACT	2	12	715759	715770	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	257051811
15112	NC_013158	TCT	2	6	715814	715819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051811
15113	NC_013158	ACG	2	6	715840	715845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051811
15114	NC_013158	CAA	2	6	715880	715885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257051811
15115	NC_013158	CCGA	2	8	715929	715936	25 %	0 %	25 %	50 %	257051811
15116	NC_013158	CGG	2	6	715979	715984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051811
15117	NC_013158	TCG	2	6	716005	716010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051811
15118	NC_013158	CGG	2	6	716066	716071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051811
15119	NC_013158	CGA	2	6	716084	716089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051811
15120	NC_013158	CGG	2	6	716131	716136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051811
15121	NC_013158	TCC	2	6	716149	716154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051811
15122	NC_013158	GAC	2	6	716265	716270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051812
15123	NC_013158	CCG	2	6	716341	716346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051812
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15126	NC_013158	CTGC	2	8	716504	716511	0 %	25 %	25 %	50 %	257051812
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15134	NC_013158	GC	3	6	716777	716782	0 %	0 %	50 %	50 %	257051812
15135	NC_013158	TCGT	2	8	716851	716858	0 %	50 %	25 %	25 %	257051812
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15147	NC_013158	GC	3	6	717305	717310	0 %	0 %	50 %	50 %	257051813
15148	NC_013158	CGT	2	6	717367	717372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051813
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15237	NC_013158	GTA	2	6	722845	722850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051819
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15354	NC_013158	ACT	2	6	728220	728225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051827
15355	NC_013158	TCG	2	6	728231	728236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051827
15356	NC_013158	CAT	2	6	728245	728250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051828
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15358	NC_013158	TCGC	2	8	728306	728313	0 %	25 %	25 %	50 %	257051828
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15471	NC_013158	CGC	2	6	733377	733382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051832
15472	NC_013158	CGA	2	6	733418	733423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051832
15473	NC_013158	GAC	2	6	733485	733490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051832
15474	NC_013158	GAA	2	6	733557	733562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257051832
15475	NC_013158	GGA	2	6	733619	733624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051832
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15491	NC_013158	GAC	2	6	734153	734158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051833
15492	NC_013158	GCCT	2	8	734198	734205	0 %	25 %	25 %	50 %	257051833
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15496	NC_013158	CGC	3	9	734385	734393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051833
15497	NC_013158	GCC	2	6	734409	734414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051833
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15499	NC_013158	CTTC	2	8	734467	734474	0 %	50 %	0 %	50 %	257051833
15500	NC_013158	CGC	2	6	734495	734500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051833

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