MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 66729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_013158	GAC	2	6	670364	670369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051765
14002	NC_013158	CCG	2	6	670411	670416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051765
14003	NC_013158	AAC	2	6	670421	670426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257051765
14004	NC_013158	CTT	2	6	670504	670509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051765
14005	NC_013158	GA	3	6	670526	670531	50 %	0 %	50 %	0 %	257051765
14006	NC_013158	CGA	3	9	670582	670590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051765
14007	NC_013158	CGAC	2	8	670670	670677	25 %	0 %	25 %	50 %	257051766
14008	NC_013158	TCG	2	6	670682	670687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051766
14009	NC_013158	AGC	2	6	670712	670717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051766
14010	NC_013158	CCT	2	6	670725	670730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051766
14011	NC_013158	GTC	2	6	670747	670752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051766
14012	NC_013158	GGC	2	6	670764	670769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051766
14013	NC_013158	AAC	2	6	670832	670837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257051766
14014	NC_013158	TC	3	6	670899	670904	0 %	50 %	0 %	50 %	257051766
14015	NC_013158	GCT	2	6	670929	670934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051766
14016	NC_013158	CGGC	2	8	670946	670953	0 %	0 %	50 %	50 %	257051766
14017	NC_013158	TCG	2	6	670982	670987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051766
14018	NC_013158	TTC	2	6	671036	671041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051766
14019	NC_013158	CAC	2	6	671118	671123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051766
14020	NC_013158	GC	3	6	671129	671134	0 %	0 %	50 %	50 %	257051766
14021	NC_013158	CATC	2	8	671135	671142	25 %	25 %	0 %	50 %	257051766
14022	NC_013158	CGG	2	6	671323	671328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051767
14023	NC_013158	TCG	2	6	671340	671345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051767
14024	NC_013158	CGA	2	6	671401	671406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051767
14025	NC_013158	TCGGC	2	10	671488	671497	0 %	20 %	40 %	40 %	257051767
14026	NC_013158	GGA	2	6	671518	671523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051767
14027	NC_013158	CGT	2	6	671543	671548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051767
14028	NC_013158	GGA	2	6	671551	671556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051767
14029	NC_013158	CTC	2	6	671576	671581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051767
14030	NC_013158	TCGA	2	8	671619	671626	25 %	25 %	25 %	25 %	257051767
14031	NC_013158	CCTCGA	2	12	671641	671652	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	257051767
14032	NC_013158	TCC	2	6	671721	671726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051768
14033	NC_013158	ACG	2	6	671733	671738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051768
14034	NC_013158	ATC	2	6	671799	671804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051768
14035	NC_013158	TCG	2	6	671847	671852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051768
14036	NC_013158	GAC	2	6	671954	671959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051768
14037	NC_013158	TCGATC	2	12	671982	671993	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	257051768
14038	NC_013158	TCG	2	6	672015	672020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051768
14039	NC_013158	CTC	2	6	672059	672064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051768
14040	NC_013158	CGA	2	6	672076	672081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051768
14041	NC_013158	CGTGGA	2	12	672085	672096	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	257051768
14042	NC_013158	CGT	2	6	672142	672147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051768
14043	NC_013158	CGA	2	6	672148	672153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051768
14044	NC_013158	GACA	2	8	672224	672231	50 %	0 %	25 %	25 %	257051768
14045	NC_013158	GTC	3	9	672284	672292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051768
14046	NC_013158	CCT	2	6	672295	672300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051768
14047	NC_013158	TCG	2	6	672324	672329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051768
14048	NC_013158	TCC	2	6	672378	672383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051768
14049	NC_013158	GAC	2	6	672392	672397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051768
14050	NC_013158	AGTC	2	8	672404	672411	25 %	25 %	25 %	25 %	257051768
14051	NC_013158	CCG	2	6	672470	672475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051768
14052	NC_013158	ATG	2	6	672480	672485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051768
14053	NC_013158	CTTCC	2	10	672533	672542	0 %	40 %	0 %	60 %	257051768
14054	NC_013158	GCCG	2	8	672581	672588	0 %	0 %	50 %	50 %	257051768
14055	NC_013158	GAC	2	6	672647	672652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051768
14056	NC_013158	TCT	2	6	672706	672711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051768
14057	NC_013158	CGC	2	6	672754	672759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051768
14058	NC_013158	CTC	2	6	672809	672814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051768
14059	NC_013158	AGT	2	6	672820	672825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051768
14060	NC_013158	CTG	2	6	672851	672856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051768
14061	NC_013158	GCC	2	6	672863	672868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051768
14062	NC_013158	TCG	2	6	672900	672905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051768
14063	NC_013158	CCGG	2	8	672942	672949	0 %	0 %	50 %	50 %	257051768
14064	NC_013158	ACC	3	9	672950	672958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051768
14065	NC_013158	GAC	3	9	672959	672967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051768
14066	NC_013158	CGG	2	6	673006	673011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051768
14067	NC_013158	GCCTCG	2	12	673044	673055	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	257051768
14068	NC_013158	CCT	2	6	673076	673081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051769
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14070	NC_013158	CGA	2	6	673193	673198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051769
14071	NC_013158	TGGC	2	8	673203	673210	0 %	25 %	50 %	25 %	257051769
14072	NC_013158	ATC	2	6	673321	673326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051769
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14075	NC_013158	CGG	3	9	673410	673418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051769
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14078	NC_013158	GATCCG	2	12	673569	673580	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257051769
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14084	NC_013158	TCG	2	6	673765	673770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051769
14085	NC_013158	GAC	2	6	673779	673784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051769
14086	NC_013158	GTA	2	6	673860	673865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051769
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14089	NC_013158	GTC	2	6	673893	673898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051769
14090	NC_013158	GAT	2	6	673917	673922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051769
14091	NC_013158	GAC	2	6	673947	673952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051769
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14098	NC_013158	GC	3	6	674276	674281	0 %	0 %	50 %	50 %	257051769
14099	NC_013158	GTTC	2	8	674333	674340	0 %	50 %	25 %	25 %	257051769
14100	NC_013158	GCT	2	6	674443	674448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051769
14101	NC_013158	CCG	3	9	674512	674520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051769
14102	NC_013158	TTG	2	6	674549	674554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257051769
14103	NC_013158	CGA	2	6	674984	674989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051770
14104	NC_013158	TCG	2	6	675025	675030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051770
14105	NC_013158	TGG	2	6	675040	675045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051770
14106	NC_013158	CTCG	2	8	675161	675168	0 %	25 %	25 %	50 %	257051770
14107	NC_013158	CGACG	2	10	675197	675206	20 %	0 %	40 %	40 %	257051770
14108	NC_013158	CGC	2	6	675239	675244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051770
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14116	NC_013158	CGC	2	6	675605	675610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051770
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14118	NC_013158	AGG	2	6	675619	675624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051770
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14237	NC_013158	CGT	2	6	680322	680327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051775
14238	NC_013158	ACG	2	6	680347	680352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051775
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14351	NC_013158	CGA	2	6	684920	684925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051779
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14472	NC_013158	TCG	2	6	689566	689571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051784
14473	NC_013158	TGGCC	2	10	689573	689582	0 %	20 %	40 %	40 %	257051784
14474	NC_013158	GCC	2	6	689591	689596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051784
14475	NC_013158	AGA	2	6	689603	689608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257051784
14476	NC_013158	GAA	2	6	689616	689621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257051784
14477	NC_013158	GGT	2	6	689708	689713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051784
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14479	NC_013158	TCCC	2	8	689791	689798	0 %	25 %	0 %	75 %	257051785
14480	NC_013158	CGC	2	6	689878	689883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051785
14481	NC_013158	GCC	2	6	689898	689903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051785
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