MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 66729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_013158	TCG	2	6	642129	642134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051731
13502	NC_013158	GA	5	10	642211	642220	50 %	0 %	50 %	0 %	257051731
13503	NC_013158	GA	3	6	642229	642234	50 %	0 %	50 %	0 %	257051731
13504	NC_013158	CGG	2	6	642298	642303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051731
13505	NC_013158	CGC	2	6	642398	642403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051731
13506	NC_013158	GAC	3	9	642443	642451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051731
13507	NC_013158	ACG	2	6	642546	642551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051731
13508	NC_013158	GTG	2	6	642730	642735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051732
13509	NC_013158	GGA	2	6	642829	642834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051732
13510	NC_013158	GCA	2	6	642865	642870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051732
13511	NC_013158	ACAG	2	8	642890	642897	50 %	0 %	25 %	25 %	257051732
13512	NC_013158	CTGTCG	2	12	642912	642923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051732
13513	NC_013158	CGA	2	6	642985	642990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051732
13514	NC_013158	GCC	2	6	643004	643009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051732
13515	NC_013158	GGC	2	6	643028	643033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051732
13516	NC_013158	GTC	2	6	643074	643079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051732
13517	NC_013158	CCG	2	6	643116	643121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051732
13518	NC_013158	CGA	2	6	643124	643129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051732
13519	NC_013158	GCA	2	6	643187	643192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051732
13520	NC_013158	CTC	2	6	643193	643198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051732
13521	NC_013158	GA	3	6	643219	643224	50 %	0 %	50 %	0 %	257051732
13522	NC_013158	GGA	2	6	643558	643563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051733
13523	NC_013158	CTC	2	6	643613	643618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051733
13524	NC_013158	CTG	2	6	643622	643627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051733
13525	NC_013158	GCG	3	9	643640	643648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051733
13526	NC_013158	AATC	2	8	643680	643687	50 %	25 %	0 %	25 %	257051733
13527	NC_013158	GTC	2	6	643693	643698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051734
13528	NC_013158	AGTT	2	8	643705	643712	25 %	50 %	25 %	0 %	257051734
13529	NC_013158	TCT	2	6	643736	643741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051734
13530	NC_013158	AG	3	6	643744	643749	50 %	0 %	50 %	0 %	257051734
13531	NC_013158	TCA	2	6	643754	643759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051734
13532	NC_013158	TA	3	6	643804	643809	50 %	50 %	0 %	0 %	257051734
13533	NC_013158	CCA	2	6	643847	643852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051734
13534	NC_013158	GACT	2	8	643943	643950	25 %	25 %	25 %	25 %	257051734
13535	NC_013158	CGA	2	6	643977	643982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051734
13536	NC_013158	GTT	2	6	644001	644006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257051734
13537	NC_013158	TCG	2	6	644085	644090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051734
13538	NC_013158	GAA	2	6	644187	644192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257051734
13539	NC_013158	CGA	2	6	644209	644214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051734
13540	NC_013158	TCG	3	9	644258	644266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051734
13541	NC_013158	GGA	2	6	644283	644288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051734
13542	NC_013158	TCG	2	6	644402	644407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051734
13543	NC_013158	GACCCG	2	12	644437	644448	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	257051734
13544	NC_013158	GGC	2	6	644475	644480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051734
13545	NC_013158	CCGG	2	8	644565	644572	0 %	0 %	50 %	50 %	257051734
13546	NC_013158	CGA	2	6	644602	644607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051734
13547	NC_013158	GAA	2	6	644677	644682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257051734
13548	NC_013158	TCC	2	6	644714	644719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051734
13549	NC_013158	GTC	3	9	644728	644736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051734
13550	NC_013158	CA	3	6	644992	644997	50 %	0 %	0 %	50 %	257051734
13551	NC_013158	GAGCC	2	10	645088	645097	20 %	0 %	40 %	40 %	257051734
13552	NC_013158	GCG	2	6	645138	645143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051734
13553	NC_013158	CGGC	2	8	645144	645151	0 %	0 %	50 %	50 %	257051734
13554	NC_013158	TCGA	2	8	645179	645186	25 %	25 %	25 %	25 %	257051734
13555	NC_013158	CAC	2	6	645210	645215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051734
13556	NC_013158	CTC	2	6	645229	645234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051734
13557	NC_013158	CCA	2	6	645243	645248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051734
13558	NC_013158	CAC	2	6	645306	645311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051734
13559	NC_013158	CGT	3	9	645352	645360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051734
13560	NC_013158	CGA	2	6	645399	645404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051734
13561	NC_013158	CGA	2	6	645435	645440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051734
13562	NC_013158	GGA	2	6	645502	645507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051734
13563	NC_013158	CGA	2	6	645513	645518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051734
13564	NC_013158	C	6	6	645551	645556	0 %	0 %	0 %	100 %	257051734
13565	NC_013158	CGA	2	6	645567	645572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051734
13566	NC_013158	ATCG	2	8	645634	645641	25 %	25 %	25 %	25 %	257051734
13567	NC_013158	GATCG	2	10	645736	645745	20 %	20 %	40 %	20 %	257051734
13568	NC_013158	CAGC	2	8	645768	645775	25 %	0 %	25 %	50 %	257051734
13569	NC_013158	CGG	2	6	646140	646145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051735
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13571	NC_013158	GC	3	6	646241	646246	0 %	0 %	50 %	50 %	257051735
13572	NC_013158	TC	3	6	646266	646271	0 %	50 %	0 %	50 %	257051735
13573	NC_013158	CGAG	2	8	646272	646279	25 %	0 %	50 %	25 %	257051735
13574	NC_013158	TCG	2	6	646419	646424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051735
13575	NC_013158	TCG	2	6	646431	646436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051735
13576	NC_013158	GCT	2	6	646486	646491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051735
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13580	NC_013158	GGC	2	6	646672	646677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051735
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13585	NC_013158	TCG	2	6	646824	646829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051735
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13592	NC_013158	CGG	2	6	647360	647365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051736
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13598	NC_013158	CGA	2	6	647656	647661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051736
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13600	NC_013158	CGA	2	6	647704	647709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051736
13601	NC_013158	CGA	2	6	647749	647754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051736
13602	NC_013158	TCG	2	6	647763	647768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051736
13603	NC_013158	CGA	2	6	647785	647790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051736
13604	NC_013158	CTT	2	6	647792	647797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051736
13605	NC_013158	GAG	2	6	647850	647855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051736
13606	NC_013158	TGG	2	6	647901	647906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051736
13607	NC_013158	GGCA	2	8	648010	648017	25 %	0 %	50 %	25 %	257051736
13608	NC_013158	CTCC	2	8	648061	648068	0 %	25 %	0 %	75 %	257051736
13609	NC_013158	CAT	2	6	648077	648082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051736
13610	NC_013158	CGA	2	6	648109	648114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051736
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13612	NC_013158	CCG	2	6	648165	648170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051736
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13614	NC_013158	TCG	2	6	648326	648331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051737
13615	NC_013158	TCG	2	6	648415	648420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051737
13616	NC_013158	CGG	2	6	648449	648454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051737
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13618	NC_013158	GCG	3	9	648503	648511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051737
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13725	NC_013158	ATCG	2	8	654512	654519	25 %	25 %	25 %	25 %	257051742
13726	NC_013158	CGA	2	6	654681	654686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051743
13727	NC_013158	CGGACT	2	12	654730	654741	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257051743
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13729	NC_013158	CGA	2	6	655138	655143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051744
13730	NC_013158	GGA	2	6	655259	655264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051744
13731	NC_013158	GGT	2	6	655291	655296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051745
13732	NC_013158	AATCG	2	10	655350	655359	40 %	20 %	20 %	20 %	257051745
13733	NC_013158	GTC	2	6	655401	655406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051745
13734	NC_013158	GGGC	2	8	655412	655419	0 %	0 %	75 %	25 %	257051745
13735	NC_013158	GTC	2	6	655424	655429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051745
13736	NC_013158	GC	3	6	655624	655629	0 %	0 %	50 %	50 %	257051745
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13841	NC_013158	CGAC	2	8	661479	661486	25 %	0 %	25 %	50 %	257051753
13842	NC_013158	TCG	2	6	661493	661498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051753
13843	NC_013158	GCGAT	2	10	661512	661521	20 %	20 %	40 %	20 %	257051753
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13845	NC_013158	GC	3	6	662645	662650	0 %	0 %	50 %	50 %	257051754
13846	NC_013158	TCGT	2	8	662695	662702	0 %	50 %	25 %	25 %	257051754
13847	NC_013158	TGC	2	6	662729	662734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051754
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13850	NC_013158	GAC	2	6	662823	662828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051754
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13852	NC_013158	GTC	2	6	662880	662885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051754
13853	NC_013158	CCTCGA	2	12	662945	662956	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	257051754
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13886	NC_013158	TCGA	2	8	664759	664766	25 %	25 %	25 %	25 %	257051758
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13953	NC_013158	CGG	2	6	668084	668089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051763
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13955	NC_013158	GGC	2	6	668186	668191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051763
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13958	NC_013158	GC	3	6	668362	668367	0 %	0 %	50 %	50 %	257051763
13959	NC_013158	TCG	2	6	668481	668486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051763
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13961	NC_013158	ACG	3	9	668541	668549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051763
13962	NC_013158	CGA	2	6	668551	668556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051763
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13964	NC_013158	GCG	2	6	668623	668628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051763
13965	NC_013158	GCCA	2	8	668643	668650	25 %	0 %	25 %	50 %	257051763
13966	NC_013158	GAA	2	6	668672	668677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257051763
13967	NC_013158	CCA	2	6	668692	668697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051763
13968	NC_013158	GCCGCT	2	12	668714	668725	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	257051763
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