MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 66729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_013158	CCCGGT	2	12	619359	619370	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	257051704
13002	NC_013158	CGA	2	6	619389	619394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051704
13003	NC_013158	CGA	2	6	619441	619446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051704
13004	NC_013158	TCG	2	6	619478	619483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051704
13005	NC_013158	CGG	2	6	619527	619532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051704
13006	NC_013158	CGA	2	6	619548	619553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051704
13007	NC_013158	CTT	2	6	619561	619566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051704
13008	NC_013158	GAC	2	6	619639	619644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051704
13009	NC_013158	CCCG	2	8	619663	619670	0 %	0 %	25 %	75 %	257051704
13010	NC_013158	ACG	2	6	619679	619684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051704
13011	NC_013158	CGA	2	6	619710	619715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051704
13012	NC_013158	GAT	2	6	619780	619785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051704
13013	NC_013158	CG	3	6	619787	619792	0 %	0 %	50 %	50 %	257051704
13014	NC_013158	CGA	2	6	619827	619832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051704
13015	NC_013158	CGA	2	6	619872	619877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051704
13016	NC_013158	CGCTC	2	10	619890	619899	0 %	20 %	20 %	60 %	257051704
13017	NC_013158	TCG	2	6	619908	619913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051704
13018	NC_013158	CGTCGG	2	12	619953	619964	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	257051704
13019	NC_013158	ACG	2	6	620028	620033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051704
13020	NC_013158	TCCG	2	8	620096	620103	0 %	25 %	25 %	50 %	257051704
13021	NC_013158	TCG	2	6	620159	620164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051704
13022	NC_013158	CAT	2	6	620167	620172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051704
13023	NC_013158	AGA	2	6	620262	620267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257051704
13024	NC_013158	TCGGGA	2	12	620268	620279	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	257051704
13025	NC_013158	TCG	2	6	620285	620290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051704
13026	NC_013158	GCTC	2	8	620298	620305	0 %	25 %	25 %	50 %	257051704
13027	NC_013158	CATCG	2	10	620371	620380	20 %	20 %	20 %	40 %	257051704
13028	NC_013158	GGC	2	6	620389	620394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051704
13029	NC_013158	ATC	2	6	620417	620422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051704
13030	NC_013158	CG	3	6	620449	620454	0 %	0 %	50 %	50 %	257051704
13031	NC_013158	GTC	2	6	620558	620563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051704
13032	NC_013158	TCC	2	6	620570	620575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051704
13033	NC_013158	CTG	2	6	620741	620746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051705
13034	NC_013158	CGA	2	6	620761	620766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051705
13035	NC_013158	GTC	2	6	620789	620794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051705
13036	NC_013158	GAG	2	6	620804	620809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051705
13037	NC_013158	GCCG	2	8	620857	620864	0 %	0 %	50 %	50 %	257051705
13038	NC_013158	GCG	2	6	620897	620902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051705
13039	NC_013158	GTC	2	6	620903	620908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051705
13040	NC_013158	CAC	2	6	620936	620941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051705
13041	NC_013158	CGA	2	6	620947	620952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051705
13042	NC_013158	CGG	2	6	620970	620975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051705
13043	NC_013158	CGA	2	6	621001	621006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051705
13044	NC_013158	CCG	2	6	621010	621015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051705
13045	NC_013158	CCG	2	6	621025	621030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051705
13046	NC_013158	GTC	2	6	621062	621067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051705
13047	NC_013158	CCA	2	6	621084	621089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051705
13048	NC_013158	CGG	2	6	621090	621095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051705
13049	NC_013158	CGA	2	6	621148	621153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051705
13050	NC_013158	GAG	2	6	621245	621250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051705
13051	NC_013158	GTC	2	6	621311	621316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051705
13052	NC_013158	GCG	2	6	621345	621350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051705
13053	NC_013158	TCGAGT	2	12	621432	621443	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	257051705
13054	NC_013158	CGA	2	6	621578	621583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051706
13055	NC_013158	CCG	2	6	621785	621790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051706
13056	NC_013158	GCT	2	6	621859	621864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051706
13057	NC_013158	CTT	2	6	621975	621980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051706
13058	NC_013158	CA	3	6	622103	622108	50 %	0 %	0 %	50 %	257051707
13059	NC_013158	GAC	2	6	622115	622120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051707
13060	NC_013158	CGA	2	6	622150	622155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051707
13061	NC_013158	CGA	2	6	622157	622162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051707
13062	NC_013158	CTG	2	6	622215	622220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051707
13063	NC_013158	CG	3	6	622289	622294	0 %	0 %	50 %	50 %	257051707
13064	NC_013158	CG	3	6	622428	622433	0 %	0 %	50 %	50 %	257051707
13065	NC_013158	GGCA	2	8	622462	622469	25 %	0 %	50 %	25 %	257051707
13066	NC_013158	ACC	2	6	622491	622496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051707
13067	NC_013158	GC	3	6	622516	622521	0 %	0 %	50 %	50 %	257051707
13068	NC_013158	ATCG	2	8	622550	622557	25 %	25 %	25 %	25 %	257051707
13069	NC_013158	CTCG	2	8	622558	622565	0 %	25 %	25 %	50 %	257051707
13070	NC_013158	CCG	2	6	622567	622572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051707
13071	NC_013158	GCT	2	6	622645	622650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051707
13072	NC_013158	CTC	2	6	622691	622696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051707
13073	NC_013158	GTCA	2	8	622700	622707	25 %	25 %	25 %	25 %	257051707
13074	NC_013158	GA	3	6	622765	622770	50 %	0 %	50 %	0 %	257051708
13075	NC_013158	GC	3	6	622777	622782	0 %	0 %	50 %	50 %	257051708
13076	NC_013158	TCG	2	6	622798	622803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051708
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13079	NC_013158	TCG	2	6	622881	622886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051708
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13082	NC_013158	GTTCG	2	10	622944	622953	0 %	40 %	40 %	20 %	257051708
13083	NC_013158	GCGG	2	8	622987	622994	0 %	0 %	75 %	25 %	257051708
13084	NC_013158	CGA	2	6	623024	623029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051708
13085	NC_013158	GTC	2	6	623076	623081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051708
13086	NC_013158	GTC	2	6	623261	623266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051708
13087	NC_013158	CAG	2	6	623330	623335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051708
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13089	NC_013158	GC	3	6	623372	623377	0 %	0 %	50 %	50 %	257051708
13090	NC_013158	GCCC	2	8	623382	623389	0 %	0 %	25 %	75 %	257051708
13091	NC_013158	GATC	2	8	623411	623418	25 %	25 %	25 %	25 %	257051708
13092	NC_013158	GTC	2	6	623460	623465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051708
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13099	NC_013158	CTTC	2	8	623656	623663	0 %	50 %	0 %	50 %	257051709
13100	NC_013158	GCTTTC	2	12	623716	623727	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	257051709
13101	NC_013158	TCG	2	6	623730	623735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051709
13102	NC_013158	TTTC	2	8	623753	623760	0 %	75 %	0 %	25 %	257051709
13103	NC_013158	AGG	2	6	623772	623777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051709
13104	NC_013158	GA	3	6	623780	623785	50 %	0 %	50 %	0 %	257051709
13105	NC_013158	GAA	2	6	623819	623824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257051709
13106	NC_013158	CGA	2	6	623851	623856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051709
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13109	NC_013158	GAG	2	6	624002	624007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051709
13110	NC_013158	TCG	2	6	624066	624071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051709
13111	NC_013158	GAT	2	6	624091	624096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051709
13112	NC_013158	ACG	2	6	624102	624107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051709
13113	NC_013158	TCA	2	6	624132	624137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051709
13114	NC_013158	CGA	2	6	624222	624227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051710
13115	NC_013158	GTC	2	6	624238	624243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051710
13116	NC_013158	TCG	2	6	624248	624253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051710
13117	NC_013158	G	6	6	624309	624314	0 %	0 %	100 %	0 %	257051710
13118	NC_013158	TCG	2	6	624344	624349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051710
13119	NC_013158	GAG	2	6	624364	624369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051710
13120	NC_013158	CGA	2	6	624375	624380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051710
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13231	NC_013158	CGG	2	6	630246	630251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051721
13232	NC_013158	GAC	3	9	630252	630260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051721
13233	NC_013158	GAG	2	6	630301	630306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051721
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13235	NC_013158	GCC	2	6	630346	630351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051721
13236	NC_013158	CCG	2	6	630353	630358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051721
13237	NC_013158	TCT	2	6	630377	630382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051721
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13239	NC_013158	GTT	2	6	630632	630637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257051722
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13245	NC_013158	TCC	2	6	630885	630890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051722
13246	NC_013158	CGTC	2	8	630943	630950	0 %	25 %	25 %	50 %	257051722
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13347	NC_013158	ACGC	2	8	635523	635530	25 %	0 %	25 %	50 %	257051725
13348	NC_013158	CA	4	8	635540	635547	50 %	0 %	0 %	50 %	257051725
13349	NC_013158	CGA	2	6	635548	635553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051725
13350	NC_013158	CGG	2	6	635596	635601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051725
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13352	NC_013158	GTC	2	6	635666	635671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051725
13353	NC_013158	GAG	2	6	635747	635752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051725
13354	NC_013158	GCG	2	6	635757	635762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051725
13355	NC_013158	CAA	2	6	635776	635781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257051725
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13357	NC_013158	CGC	2	6	635827	635832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051725
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13469	NC_013158	ACG	3	9	640843	640851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051729
13470	NC_013158	GTC	2	6	640884	640889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051729
13471	NC_013158	ACG	2	6	640899	640904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051729
13472	NC_013158	GGCATC	2	12	640914	640925	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257051729
13473	NC_013158	CCTG	2	8	640952	640959	0 %	25 %	25 %	50 %	257051729
13474	NC_013158	CG	3	6	640976	640981	0 %	0 %	50 %	50 %	257051729
13475	NC_013158	CGCC	2	8	641069	641076	0 %	0 %	25 %	75 %	257051729
13476	NC_013158	TCG	2	6	641104	641109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051729
13477	NC_013158	CGA	2	6	641123	641128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051729
13478	NC_013158	GTC	2	6	641145	641150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051729
13479	NC_013158	CAGC	2	8	641156	641163	25 %	0 %	25 %	50 %	257051729
13480	NC_013158	GCC	2	6	641175	641180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051729
13481	NC_013158	GAG	2	6	641181	641186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051729
13482	NC_013158	CGA	2	6	641282	641287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051729
13483	NC_013158	TCC	2	6	641298	641303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051729
13484	NC_013158	TCG	2	6	641317	641322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051729
13485	NC_013158	TGA	2	6	641356	641361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051729
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13488	NC_013158	TGAC	2	8	641401	641408	25 %	25 %	25 %	25 %	257051729
13489	NC_013158	ATC	2	6	641528	641533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051730
13490	NC_013158	CG	3	6	641536	641541	0 %	0 %	50 %	50 %	257051730
13491	NC_013158	GTC	2	6	641552	641557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051730
13492	NC_013158	CTT	2	6	641584	641589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051730
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13494	NC_013158	GTC	2	6	641669	641674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051730
13495	NC_013158	C	6	6	641712	641717	0 %	0 %	0 %	100 %	257051730
13496	NC_013158	ATCGAC	2	12	641876	641887	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	257051730
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13498	NC_013158	CGA	2	6	641938	641943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051730
13499	NC_013158	TGA	2	6	641991	641996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051730
13500	NC_013158	TCG	3	9	642105	642113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051731

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