MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 66729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_013158	GCG	2	6	597136	597141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051685
12502	NC_013158	CGA	2	6	597163	597168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051685
12503	NC_013158	CACG	2	8	597220	597227	25 %	0 %	25 %	50 %	257051685
12504	NC_013158	CGA	2	6	597247	597252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051685
12505	NC_013158	CGT	2	6	597597	597602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051686
12506	NC_013158	ACGA	2	8	597607	597614	50 %	0 %	25 %	25 %	257051686
12507	NC_013158	GTC	2	6	597667	597672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051686
12508	NC_013158	GAG	2	6	597796	597801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051686
12509	NC_013158	CGA	2	6	597806	597811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051686
12510	NC_013158	CCTG	2	8	597834	597841	0 %	25 %	25 %	50 %	257051686
12511	NC_013158	CGT	2	6	597912	597917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051686
12512	NC_013158	CGA	2	6	597930	597935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051686
12513	NC_013158	GGA	2	6	598083	598088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051686
12514	NC_013158	GAC	2	6	598111	598116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051686
12515	NC_013158	GCGA	2	8	598144	598151	25 %	0 %	50 %	25 %	257051686
12516	NC_013158	CGC	2	6	598197	598202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051686
12517	NC_013158	CGT	2	6	598236	598241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051686
12518	NC_013158	C	6	6	598247	598252	0 %	0 %	0 %	100 %	257051686
12519	NC_013158	ACG	2	6	598259	598264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051686
12520	NC_013158	ACA	2	6	598283	598288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257051686
12521	NC_013158	CGA	2	6	598332	598337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051686
12522	NC_013158	TCA	2	6	598352	598357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051686
12523	NC_013158	CGG	2	6	598370	598375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051686
12524	NC_013158	CGG	2	6	598446	598451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051686
12525	NC_013158	TCG	2	6	598454	598459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051686
12526	NC_013158	CGC	2	6	598479	598484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051686
12527	NC_013158	ATC	2	6	598498	598503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051686
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12529	NC_013158	TCG	3	9	598520	598528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051686
12530	NC_013158	CGA	2	6	598542	598547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051686
12531	NC_013158	TCG	2	6	598640	598645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051686
12532	NC_013158	GCC	2	6	598649	598654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051686
12533	NC_013158	GTC	2	6	598702	598707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051686
12534	NC_013158	CCGA	2	8	598720	598727	25 %	0 %	25 %	50 %	257051686
12535	NC_013158	CGTCGG	2	12	598815	598826	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	257051686
12536	NC_013158	CTT	2	6	598932	598937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051686
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12538	NC_013158	ACG	4	12	599012	599023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051686
12539	NC_013158	GC	3	6	599031	599036	0 %	0 %	50 %	50 %	257051686
12540	NC_013158	CGA	2	6	599037	599042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051686
12541	NC_013158	CTC	2	6	599269	599274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051687
12542	NC_013158	TCGA	2	8	599326	599333	25 %	25 %	25 %	25 %	257051687
12543	NC_013158	CCGA	2	8	599347	599354	25 %	0 %	25 %	50 %	257051687
12544	NC_013158	AC	3	6	599390	599395	50 %	0 %	0 %	50 %	257051687
12545	NC_013158	GACAGA	2	12	599403	599414	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	257051687
12546	NC_013158	CCGA	2	8	599419	599426	25 %	0 %	25 %	50 %	257051687
12547	NC_013158	CGA	2	6	599439	599444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051687
12548	NC_013158	GTC	2	6	599485	599490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051687
12549	NC_013158	GCG	2	6	599491	599496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051687
12550	NC_013158	ACG	2	6	599533	599538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051687
12551	NC_013158	AGG	2	6	599546	599551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051687
12552	NC_013158	CAA	2	6	599553	599558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257051687
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12554	NC_013158	AACG	2	8	599608	599615	50 %	0 %	25 %	25 %	257051687
12555	NC_013158	TGA	2	6	599621	599626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051687
12556	NC_013158	GTAC	2	8	599666	599673	25 %	25 %	25 %	25 %	257051687
12557	NC_013158	CAG	2	6	599770	599775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051687
12558	NC_013158	AC	3	6	599777	599782	50 %	0 %	0 %	50 %	257051687
12559	NC_013158	CAG	2	6	599791	599796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051687
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12592	NC_013158	TCGA	2	8	601337	601344	25 %	25 %	25 %	25 %	257051688
12593	NC_013158	CGA	2	6	601361	601366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051688
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12602	NC_013158	AG	3	6	601909	601914	50 %	0 %	50 %	0 %	257051689
12603	NC_013158	CGC	2	6	601943	601948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051689
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12605	NC_013158	GCG	2	6	602002	602007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051689
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12607	NC_013158	ACCG	2	8	602044	602051	25 %	0 %	25 %	50 %	257051689
12608	NC_013158	GCC	3	9	602053	602061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051689
12609	NC_013158	TTC	2	6	602077	602082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051689
12610	NC_013158	ACGTCG	2	12	602126	602137	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257051689
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12613	NC_013158	AC	3	6	602226	602231	50 %	0 %	0 %	50 %	257051689
12614	NC_013158	CCT	2	6	602235	602240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051689
12615	NC_013158	CGA	2	6	602253	602258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051689
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12854	NC_013158	GACGCC	2	12	612057	612068	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	257051697
12855	NC_013158	GTG	2	6	612165	612170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051697
12856	NC_013158	GCG	2	6	612173	612178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051697
12857	NC_013158	GTC	2	6	612202	612207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051697
12858	NC_013158	GCCC	2	8	612254	612261	0 %	0 %	25 %	75 %	257051697
12859	NC_013158	CTTG	2	8	612353	612360	0 %	50 %	25 %	25 %	257051697
12860	NC_013158	TCGG	2	8	612391	612398	0 %	25 %	50 %	25 %	257051697
12861	NC_013158	CGC	2	6	612401	612406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051697
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12866	NC_013158	TGG	2	6	612709	612714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051697
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12971	NC_013158	CGC	2	6	618024	618029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051702
12972	NC_013158	TCGGC	2	10	618048	618057	0 %	20 %	40 %	40 %	257051702
12973	NC_013158	GCC	2	6	618074	618079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051702
12974	NC_013158	TCA	2	6	618099	618104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051702
12975	NC_013158	CCT	2	6	618128	618133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051703
12976	NC_013158	GTCG	2	8	618195	618202	0 %	25 %	50 %	25 %	257051703
12977	NC_013158	GAC	2	6	618237	618242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051703
12978	NC_013158	GCC	2	6	618267	618272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051703
12979	NC_013158	TCAG	2	8	618289	618296	25 %	25 %	25 %	25 %	257051703
12980	NC_013158	TCG	2	6	618442	618447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051703
12981	NC_013158	CTCGCC	2	12	618480	618491	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	257051703
12982	NC_013158	GGC	2	6	618517	618522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051703
12983	NC_013158	CGA	2	6	618545	618550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051703
12984	NC_013158	GGC	2	6	618573	618578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051703
12985	NC_013158	CGC	2	6	618582	618587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051703
12986	NC_013158	GTC	2	6	618603	618608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051703
12987	NC_013158	CCCG	2	8	618612	618619	0 %	0 %	25 %	75 %	257051703
12988	NC_013158	CGA	2	6	618653	618658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051703
12989	NC_013158	TTC	2	6	618747	618752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051703
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12991	NC_013158	GCC	2	6	618810	618815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051703
12992	NC_013158	CGC	2	6	618895	618900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051703
12993	NC_013158	GTTTCT	2	12	618977	618988	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	257051703
12994	NC_013158	TCG	2	6	619000	619005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051703
12995	NC_013158	TCC	2	6	619015	619020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051703
12996	NC_013158	CCGG	2	8	619039	619046	0 %	0 %	50 %	50 %	257051703
12997	NC_013158	TCC	2	6	619081	619086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051703
12998	NC_013158	TCGATC	2	12	619159	619170	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	257051703
12999	NC_013158	CGT	2	6	619232	619237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051703
13000	NC_013158	ATCT	2	8	619315	619322	25 %	50 %	0 %	25 %	257051704

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