MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 66729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_013158	GGT	2	6	574167	574172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051655
12003	NC_013158	GTC	2	6	574192	574197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051655
12004	NC_013158	CGG	2	6	574221	574226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051655
12005	NC_013158	CCG	2	6	574271	574276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051655
12006	NC_013158	TCG	2	6	574298	574303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051655
12007	NC_013158	GTC	2	6	574306	574311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051655
12008	NC_013158	GCC	2	6	574652	574657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051656
12009	NC_013158	TAC	2	6	574681	574686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051656
12010	NC_013158	CGT	2	6	574687	574692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051656
12011	NC_013158	GCC	2	6	574770	574775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051656
12012	NC_013158	TCG	2	6	574833	574838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051656
12013	NC_013158	CAC	2	6	575236	575241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051657
12014	NC_013158	GAA	2	6	575252	575257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257051657
12015	NC_013158	GAC	2	6	575327	575332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051657
12016	NC_013158	CTTCGA	2	12	575347	575358	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	257051657
12017	NC_013158	CGA	3	9	575377	575385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051657
12018	NC_013158	AGT	2	6	575422	575427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051657
12019	NC_013158	GTC	2	6	575507	575512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051657
12020	NC_013158	ACG	2	6	575520	575525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051657
12021	NC_013158	CCG	3	9	575587	575595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051657
12022	NC_013158	CCCGAA	2	12	575597	575608	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	257051657
12023	NC_013158	CGG	2	6	575661	575666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051657
12024	NC_013158	ACC	2	6	575701	575706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051657
12025	NC_013158	CGG	2	6	575746	575751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051657
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12027	NC_013158	TGCCG	2	10	575771	575780	0 %	20 %	40 %	40 %	257051657
12028	NC_013158	CAG	2	6	575782	575787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051657
12029	NC_013158	TCG	2	6	575835	575840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051657
12030	NC_013158	AT	3	6	575872	575877	50 %	50 %	0 %	0 %	257051658
12031	NC_013158	GGC	2	6	575904	575909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051658
12032	NC_013158	ATC	2	6	575918	575923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051658
12033	NC_013158	GATC	2	8	575944	575951	25 %	25 %	25 %	25 %	257051658
12034	NC_013158	TCG	2	6	575979	575984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051658
12035	NC_013158	AG	3	6	576002	576007	50 %	0 %	50 %	0 %	257051658
12036	NC_013158	ACGA	2	8	576041	576048	50 %	0 %	25 %	25 %	257051658
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12040	NC_013158	CGT	2	6	576153	576158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051659
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12042	NC_013158	GTC	2	6	576175	576180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051659
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12049	NC_013158	CGT	2	6	576564	576569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051659
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12051	NC_013158	CGC	2	6	576604	576609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051659
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12054	NC_013158	GCCCT	2	10	576716	576725	0 %	20 %	20 %	60 %	257051659
12055	NC_013158	CGA	2	6	576771	576776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051659
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12091	NC_013158	CGA	2	6	578471	578476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051662
12092	NC_013158	CCTC	2	8	578546	578553	0 %	25 %	0 %	75 %	257051663
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12101	NC_013158	GTCG	2	8	578842	578849	0 %	25 %	50 %	25 %	257051663
12102	NC_013158	TCGG	2	8	578858	578865	0 %	25 %	50 %	25 %	257051663
12103	NC_013158	CGG	2	6	578871	578876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051663
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12114	NC_013158	ACG	2	6	579166	579171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051664
12115	NC_013158	CGA	4	12	579182	579193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051664
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12118	NC_013158	GC	3	6	579350	579355	0 %	0 %	50 %	50 %	257051664
12119	NC_013158	TG	3	6	579359	579364	0 %	50 %	50 %	0 %	257051664
12120	NC_013158	GCC	3	9	579373	579381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051664
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12123	NC_013158	GTC	2	6	579538	579543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051664
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12125	NC_013158	TCG	2	6	579592	579597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051664
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12225	NC_013158	GCCA	2	8	583540	583547	25 %	0 %	25 %	50 %	257051670
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12230	NC_013158	GAC	2	6	583773	583778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051670
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12233	NC_013158	CTT	2	6	583872	583877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051670
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12235	NC_013158	TCC	2	6	583907	583912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051670
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12353	NC_013158	CGA	2	6	588336	588341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051676
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12451	NC_013158	CGAA	2	8	594296	594303	50 %	0 %	25 %	25 %	257051682
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12455	NC_013158	AG	3	6	594608	594613	50 %	0 %	50 %	0 %	257051682
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12464	NC_013158	TCC	2	6	595240	595245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051683
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12467	NC_013158	CCG	2	6	595345	595350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051683
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12469	NC_013158	AGC	2	6	595411	595416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051683
12470	NC_013158	GTG	2	6	595417	595422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051683
12471	NC_013158	CCAG	2	8	595443	595450	25 %	0 %	25 %	50 %	257051683
12472	NC_013158	GGA	2	6	595466	595471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051683
12473	NC_013158	GA	3	6	595990	595995	50 %	0 %	50 %	0 %	257051684
12474	NC_013158	CG	3	6	596098	596103	0 %	0 %	50 %	50 %	257051684
12475	NC_013158	CGGG	2	8	596122	596129	0 %	0 %	75 %	25 %	257051684
12476	NC_013158	CGT	2	6	596177	596182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051684
12477	NC_013158	TCG	2	6	596185	596190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051684
12478	NC_013158	ACC	2	6	596220	596225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051684
12479	NC_013158	CGG	2	6	596234	596239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051684
12480	NC_013158	CGA	2	6	596255	596260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051684
12481	NC_013158	CGG	2	6	596336	596341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051684
12482	NC_013158	CGC	2	6	596387	596392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051684
12483	NC_013158	AAC	2	6	596394	596399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257051684
12484	NC_013158	ATC	2	6	596517	596522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051684
12485	NC_013158	GAG	2	6	596529	596534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051684
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12489	NC_013158	ACGCCG	2	12	596668	596679	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	257051684
12490	NC_013158	CGA	2	6	596690	596695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051684
12491	NC_013158	ACG	2	6	596767	596772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051684
12492	NC_013158	CCG	2	6	596788	596793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051684
12493	NC_013158	GAC	2	6	596807	596812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051684
12494	NC_013158	TC	3	6	596837	596842	0 %	50 %	0 %	50 %	257051684
12495	NC_013158	GGC	2	6	596844	596849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051684
12496	NC_013158	CGA	2	6	597034	597039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051685
12497	NC_013158	ACG	2	6	597057	597062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051685
12498	NC_013158	GGA	2	6	597079	597084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051685
12499	NC_013158	CTA	2	6	597094	597099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051685
12500	NC_013158	GCC	2	6	597130	597135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051685

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