MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 66729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_013158	CTG	2	6	553488	553493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051635
11502	NC_013158	ATG	2	6	553494	553499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051635
11503	NC_013158	TGG	2	6	553521	553526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051635
11504	NC_013158	CGG	2	6	553550	553555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051635
11505	NC_013158	GGT	2	6	553583	553588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051635
11506	NC_013158	CGACTC	2	12	553650	553661	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	257051635
11507	NC_013158	ACG	2	6	553667	553672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051635
11508	NC_013158	CG	3	6	553852	553857	0 %	0 %	50 %	50 %	257051636
11509	NC_013158	ACG	2	6	553923	553928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051636
11510	NC_013158	CG	3	6	553947	553952	0 %	0 %	50 %	50 %	257051636
11511	NC_013158	CCG	2	6	553956	553961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051636
11512	NC_013158	CGC	2	6	554072	554077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051636
11513	NC_013158	CGC	2	6	554089	554094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051636
11514	NC_013158	GTG	2	6	554132	554137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051636
11515	NC_013158	TCG	2	6	554192	554197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051636
11516	NC_013158	CCG	2	6	554217	554222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051636
11517	NC_013158	CAC	2	6	554234	554239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051636
11518	NC_013158	GGGA	2	8	554281	554288	25 %	0 %	75 %	0 %	257051636
11519	NC_013158	CGT	3	9	554306	554314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051636
11520	NC_013158	CGA	2	6	554315	554320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051636
11521	NC_013158	GC	3	6	554350	554355	0 %	0 %	50 %	50 %	257051636
11522	NC_013158	TCG	2	6	554482	554487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051636
11523	NC_013158	CGT	2	6	554519	554524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051636
11524	NC_013158	TCGA	2	8	554532	554539	25 %	25 %	25 %	25 %	257051636
11525	NC_013158	CGA	2	6	554546	554551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051636
11526	NC_013158	CGA	2	6	554609	554614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051636
11527	NC_013158	CCA	2	6	554717	554722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051636
11528	NC_013158	GTCGAG	2	12	554748	554759	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	257051636
11529	NC_013158	GGCG	2	8	554771	554778	0 %	0 %	75 %	25 %	257051636
11530	NC_013158	CCT	2	6	554800	554805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051636
11531	NC_013158	CGT	2	6	554843	554848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051636
11532	NC_013158	ACA	2	6	554854	554859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257051636
11533	NC_013158	CGGG	3	12	554894	554905	0 %	0 %	75 %	25 %	257051636
11534	NC_013158	ACG	2	6	554943	554948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051636
11535	NC_013158	CGA	2	6	554954	554959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051636
11536	NC_013158	CCA	2	6	555023	555028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051636
11537	NC_013158	CGT	2	6	555065	555070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051636
11538	NC_013158	CGCC	2	8	555092	555099	0 %	0 %	25 %	75 %	257051636
11539	NC_013158	CGTG	2	8	555167	555174	0 %	25 %	50 %	25 %	257051636
11540	NC_013158	GAC	3	9	555210	555218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051636
11541	NC_013158	GAT	2	6	555269	555274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051636
11542	NC_013158	CGA	2	6	555278	555283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051636
11543	NC_013158	ACG	2	6	555292	555297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051636
11544	NC_013158	CGGC	2	8	555314	555321	0 %	0 %	50 %	50 %	257051636
11545	NC_013158	TCG	2	6	555346	555351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051636
11546	NC_013158	CGC	2	6	555359	555364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051636
11547	NC_013158	CGA	2	6	555416	555421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051636
11548	NC_013158	GAG	2	6	555426	555431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051636
11549	NC_013158	CGGC	2	8	555460	555467	0 %	0 %	50 %	50 %	257051636
11550	NC_013158	CCT	2	6	555475	555480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051636
11551	NC_013158	ACG	2	6	555508	555513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051636
11552	NC_013158	G	6	6	555538	555543	0 %	0 %	100 %	0 %	257051636
11553	NC_013158	ATG	2	6	555610	555615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051636
11554	NC_013158	CCG	2	6	555616	555621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051636
11555	NC_013158	CGA	2	6	555625	555630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051636
11556	NC_013158	TCCGC	2	10	555631	555640	0 %	20 %	20 %	60 %	257051636
11557	NC_013158	GCCCG	2	10	555674	555683	0 %	0 %	40 %	60 %	257051636
11558	NC_013158	TCG	3	9	555691	555699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051636
11559	NC_013158	CGT	2	6	555716	555721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051636
11560	NC_013158	TGC	2	6	555728	555733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051636
11561	NC_013158	CTC	2	6	555768	555773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051636
11562	NC_013158	TCG	2	6	555801	555806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051636
11563	NC_013158	CCG	2	6	555862	555867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051636
11564	NC_013158	CGT	2	6	555872	555877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051636
11565	NC_013158	GAA	2	6	555935	555940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257051636
11566	NC_013158	GC	3	6	555946	555951	0 %	0 %	50 %	50 %	257051636
11567	NC_013158	CCA	2	6	555976	555981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051636
11568	NC_013158	GC	3	6	555988	555993	0 %	0 %	50 %	50 %	257051636
11569	NC_013158	GCT	2	6	556040	556045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051636
11570	NC_013158	ACG	2	6	556072	556077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051636
11571	NC_013158	GCGA	2	8	556122	556129	25 %	0 %	50 %	25 %	257051636
11572	NC_013158	CGG	2	6	556175	556180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051636
11573	NC_013158	CGG	2	6	556199	556204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051636
11574	NC_013158	GCA	2	6	556213	556218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051636
11575	NC_013158	CTC	2	6	556224	556229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051636
11576	NC_013158	AGG	2	6	556282	556287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051636
11577	NC_013158	ACC	2	6	556329	556334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051636
11578	NC_013158	GAG	2	6	556416	556421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051636
11579	NC_013158	CGA	2	6	556442	556447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051636
11580	NC_013158	ACG	2	6	556466	556471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051636
11581	NC_013158	CAT	2	6	556526	556531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051636
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11583	NC_013158	CGA	2	6	556558	556563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051636
11584	NC_013158	CAT	2	6	556574	556579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051636
11585	NC_013158	CAA	2	6	556580	556585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257051636
11586	NC_013158	CGA	2	6	556707	556712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051637
11587	NC_013158	AAT	2	6	556785	556790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257051637
11588	NC_013158	ATCG	2	8	556829	556836	25 %	25 %	25 %	25 %	257051637
11589	NC_013158	ACC	2	6	556884	556889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051637
11590	NC_013158	GCG	2	6	556891	556896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051637
11591	NC_013158	CGC	2	6	556898	556903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051637
11592	NC_013158	ACC	2	6	556920	556925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051637
11593	NC_013158	CGA	2	6	556936	556941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051637
11594	NC_013158	GAT	2	6	557015	557020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051637
11595	NC_013158	CCGG	2	8	557123	557130	0 %	0 %	50 %	50 %	257051637
11596	NC_013158	CGA	2	6	557167	557172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051637
11597	NC_013158	GTCC	2	8	557197	557204	0 %	25 %	25 %	50 %	257051637
11598	NC_013158	GCG	2	6	557257	557262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051637
11599	NC_013158	TCG	2	6	557286	557291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051637
11600	NC_013158	ACT	2	6	557419	557424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051638
11601	NC_013158	CGC	2	6	557486	557491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051638
11602	NC_013158	GGGCG	2	10	557573	557582	0 %	0 %	80 %	20 %	257051638
11603	NC_013158	CGC	2	6	557666	557671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051638
11604	NC_013158	CTC	2	6	557685	557690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051638
11605	NC_013158	CGC	2	6	557692	557697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051638
11606	NC_013158	CGA	2	6	557768	557773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051638
11607	NC_013158	GT	3	6	557887	557892	0 %	50 %	50 %	0 %	257051638
11608	NC_013158	CGC	2	6	557896	557901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051638
11609	NC_013158	CGC	2	6	557930	557935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051638
11610	NC_013158	CGC	2	6	557948	557953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051638
11611	NC_013158	CGG	2	6	557959	557964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051638
11612	NC_013158	GAC	2	6	557985	557990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051638
11613	NC_013158	CGA	2	6	557996	558001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051638
11614	NC_013158	GCC	2	6	558036	558041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051638
11615	NC_013158	CGA	2	6	558092	558097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051638
11616	NC_013158	TCG	2	6	558112	558117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051638
11617	NC_013158	CGT	2	6	558122	558127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051638
11618	NC_013158	CGC	2	6	558224	558229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051638
11619	NC_013158	CGC	2	6	558317	558322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051638
11620	NC_013158	CGT	2	6	558329	558334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051638
11621	NC_013158	CGA	2	6	558335	558340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051638
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11658	NC_013158	TCG	3	9	560644	560652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051641
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11714	NC_013158	ACGGC	2	10	563035	563044	20 %	0 %	40 %	40 %	257051645
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11719	NC_013158	CGAC	2	8	563157	563164	25 %	0 %	25 %	50 %	257051645
11720	NC_013158	GC	3	6	563209	563214	0 %	0 %	50 %	50 %	257051645
11721	NC_013158	CGA	2	6	563278	563283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051645
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11723	NC_013158	GTC	2	6	563365	563370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051645
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11730	NC_013158	GCCA	2	8	563672	563679	25 %	0 %	25 %	50 %	257051645
11731	NC_013158	CGAG	2	8	563770	563777	25 %	0 %	50 %	25 %	257051645
11732	NC_013158	CCGCGC	2	12	563809	563820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051645
11733	NC_013158	CGA	3	9	563821	563829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051645
11734	NC_013158	CGA	2	6	563833	563838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051645
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11854	NC_013158	ATT	2	6	568461	568466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257051648
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11857	NC_013158	GC	3	6	568573	568578	0 %	0 %	50 %	50 %	257051648
11858	NC_013158	CGT	2	6	568601	568606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051648
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11970	NC_013158	GTC	2	6	572759	572764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051654
11971	NC_013158	GTC	2	6	572773	572778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051654
11972	NC_013158	GAA	2	6	572857	572862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257051654
11973	NC_013158	GAC	2	6	572896	572901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051654
11974	NC_013158	ATG	2	6	572939	572944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051654
11975	NC_013158	TCG	2	6	572946	572951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051654
11976	NC_013158	CGG	2	6	572990	572995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051654
11977	NC_013158	CCG	2	6	573024	573029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051654
11978	NC_013158	GAC	2	6	573052	573057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051654
11979	NC_013158	CGG	3	9	573174	573182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051655
11980	NC_013158	TCGTG	2	10	573225	573234	0 %	40 %	40 %	20 %	257051655
11981	NC_013158	TCG	2	6	573236	573241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051655
11982	NC_013158	GAT	2	6	573289	573294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051655
11983	NC_013158	TCG	3	9	573335	573343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051655
11984	NC_013158	TCG	2	6	573449	573454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051655
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11989	NC_013158	GCC	2	6	573610	573615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051655
11990	NC_013158	CCG	2	6	573647	573652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051655
11991	NC_013158	CCT	2	6	573678	573683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051655
11992	NC_013158	CGA	2	6	573735	573740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051655
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11995	NC_013158	CGC	2	6	573825	573830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051655
11996	NC_013158	GGCG	2	8	573888	573895	0 %	0 %	75 %	25 %	257051655
11997	NC_013158	CTT	2	6	574012	574017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051655
11998	NC_013158	GTT	2	6	574042	574047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257051655
11999	NC_013158	TG	3	6	574053	574058	0 %	50 %	50 %	0 %	257051655
12000	NC_013158	GCG	2	6	574137	574142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051655

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