MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 66729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_013158	GCG	2	6	530139	530144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051611
11002	NC_013158	GAA	2	6	530181	530186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257051611
11003	NC_013158	GGCCGA	2	12	530192	530203	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	257051611
11004	NC_013158	CGA	3	9	530201	530209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051611
11005	NC_013158	GTC	2	6	530231	530236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051612
11006	NC_013158	GC	3	6	530290	530295	0 %	0 %	50 %	50 %	257051612
11007	NC_013158	CCT	2	6	530471	530476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051612
11008	NC_013158	ACA	2	6	530503	530508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257051612
11009	NC_013158	CGT	2	6	530509	530514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051612
11010	NC_013158	CGA	2	6	530608	530613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051612
11011	NC_013158	CG	3	6	530619	530624	0 %	0 %	50 %	50 %	257051612
11012	NC_013158	GGC	2	6	530668	530673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051613
11013	NC_013158	ACG	2	6	530717	530722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051613
11014	NC_013158	GCC	2	6	530723	530728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051613
11015	NC_013158	ACG	2	6	530739	530744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051613
11016	NC_013158	GTC	2	6	530750	530755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051613
11017	NC_013158	CGA	2	6	530793	530798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051613
11018	NC_013158	TCG	2	6	530823	530828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051613
11019	NC_013158	CGA	2	6	530848	530853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051613
11020	NC_013158	ATC	2	6	530892	530897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051613
11021	NC_013158	CGG	2	6	530917	530922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051613
11022	NC_013158	CGG	2	6	530958	530963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051613
11023	NC_013158	CGA	2	6	530989	530994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051613
11024	NC_013158	TCC	2	6	531069	531074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051613
11025	NC_013158	CGG	2	6	531082	531087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051613
11026	NC_013158	ACG	2	6	531144	531149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051613
11027	NC_013158	CGT	2	6	531157	531162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051613
11028	NC_013158	CA	3	6	531178	531183	50 %	0 %	0 %	50 %	257051613
11029	NC_013158	GC	3	6	531193	531198	0 %	0 %	50 %	50 %	257051613
11030	NC_013158	CCG	2	6	531239	531244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051613
11031	NC_013158	GCGT	2	8	531330	531337	0 %	25 %	50 %	25 %	257051613
11032	NC_013158	GAC	2	6	531347	531352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051613
11033	NC_013158	TCC	2	6	531489	531494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051614
11034	NC_013158	CGGTT	2	10	531545	531554	0 %	40 %	40 %	20 %	257051614
11035	NC_013158	CGA	2	6	531593	531598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051614
11036	NC_013158	GAC	2	6	531644	531649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051614
11037	NC_013158	TCG	2	6	531651	531656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051614
11038	NC_013158	TCG	2	6	531693	531698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051614
11039	NC_013158	CTG	2	6	531717	531722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051614
11040	NC_013158	GAG	2	6	531776	531781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051614
11041	NC_013158	GACG	2	8	531821	531828	25 %	0 %	50 %	25 %	257051614
11042	NC_013158	GTT	2	6	531854	531859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257051614
11043	NC_013158	CGG	2	6	531865	531870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051614
11044	NC_013158	TCCG	2	8	531888	531895	0 %	25 %	25 %	50 %	257051614
11045	NC_013158	GC	3	6	531935	531940	0 %	0 %	50 %	50 %	257051614
11046	NC_013158	CGA	2	6	531952	531957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051614
11047	NC_013158	ATCG	2	8	531989	531996	25 %	25 %	25 %	25 %	257051614
11048	NC_013158	CTGA	2	8	532037	532044	25 %	25 %	25 %	25 %	257051614
11049	NC_013158	ACA	2	6	532045	532050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257051614
11050	NC_013158	GGC	2	6	532097	532102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051614
11051	NC_013158	GAAAGT	2	12	532161	532172	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	257051614
11052	NC_013158	CGA	3	9	532198	532206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051614
11053	NC_013158	CA	3	6	532565	532570	50 %	0 %	0 %	50 %	257051615
11054	NC_013158	CGA	2	6	532608	532613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051615
11055	NC_013158	CGT	2	6	532622	532627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051615
11056	NC_013158	GGA	2	6	532680	532685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051615
11057	NC_013158	GTC	3	9	532864	532872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051616
11058	NC_013158	CGA	2	6	532878	532883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051616
11059	NC_013158	GCA	2	6	532891	532896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051616
11060	NC_013158	GCG	2	6	532927	532932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051616
11061	NC_013158	ACG	2	6	532958	532963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051616
11062	NC_013158	GTC	2	6	532981	532986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051616
11063	NC_013158	GCTCGC	2	12	533010	533021	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	257051616
11064	NC_013158	CGTCGA	2	12	533055	533066	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257051616
11065	NC_013158	GAC	2	6	533118	533123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051616
11066	NC_013158	C	7	7	533155	533161	0 %	0 %	0 %	100 %	257051616
11067	NC_013158	GTCC	2	8	533165	533172	0 %	25 %	25 %	50 %	257051616
11068	NC_013158	GAAC	2	8	533220	533227	50 %	0 %	25 %	25 %	257051616
11069	NC_013158	CCG	3	9	533252	533260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051616
11070	NC_013158	TCG	2	6	533309	533314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051616
11071	NC_013158	CGC	2	6	533322	533327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051616
11072	NC_013158	CGA	2	6	533363	533368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051616
11073	NC_013158	ACG	2	6	533396	533401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051616
11074	NC_013158	CGA	2	6	533489	533494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051617
11075	NC_013158	GTC	2	6	533591	533596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051617
11076	NC_013158	TCGC	2	8	533669	533676	0 %	25 %	25 %	50 %	257051617
11077	NC_013158	TGA	2	6	533728	533733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051617
11078	NC_013158	CGA	2	6	533799	533804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051617
11079	NC_013158	CGC	2	6	533850	533855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051617
11080	NC_013158	CGA	2	6	533856	533861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051617
11081	NC_013158	GC	3	6	533891	533896	0 %	0 %	50 %	50 %	257051617
11082	NC_013158	CGC	2	6	533946	533951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051617
11083	NC_013158	CTG	2	6	534004	534009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051617
11084	NC_013158	CGT	2	6	534060	534065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051617
11085	NC_013158	CGC	2	6	534075	534080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051617
11086	NC_013158	CGC	2	6	534151	534156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051617
11087	NC_013158	CGA	2	6	534178	534183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051617
11088	NC_013158	CTG	2	6	534210	534215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051617
11089	NC_013158	CCGGT	2	10	534217	534226	0 %	20 %	40 %	40 %	257051617
11090	NC_013158	CGA	2	6	534240	534245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051617
11091	NC_013158	CCCA	2	8	534307	534314	25 %	0 %	0 %	75 %	257051617
11092	NC_013158	CCG	2	6	534394	534399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051617
11093	NC_013158	GCG	2	6	534419	534424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051617
11094	NC_013158	CGT	2	6	534583	534588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051617
11095	NC_013158	CGTA	2	8	534624	534631	25 %	25 %	25 %	25 %	257051617
11096	NC_013158	GAT	2	6	534646	534651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051617
11097	NC_013158	CGC	2	6	534667	534672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051617
11098	NC_013158	CGATCC	2	12	534708	534719	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	257051617
11099	NC_013158	GATGCC	2	12	534729	534740	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257051617
11100	NC_013158	ACG	2	6	534741	534746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051617
11101	NC_013158	TCGG	2	8	534767	534774	0 %	25 %	50 %	25 %	257051617
11102	NC_013158	CGG	2	6	534867	534872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051617
11103	NC_013158	GAC	2	6	534973	534978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051617
11104	NC_013158	GAG	2	6	534991	534996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051617
11105	NC_013158	GGGC	2	8	535058	535065	0 %	0 %	75 %	25 %	257051617
11106	NC_013158	GACA	2	8	535084	535091	50 %	0 %	25 %	25 %	257051617
11107	NC_013158	GGA	2	6	535092	535097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051617
11108	NC_013158	CGG	2	6	535101	535106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051617
11109	NC_013158	TCG	2	6	535146	535151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051617
11110	NC_013158	AGCGGG	2	12	535172	535183	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	257051617
11111	NC_013158	CGA	2	6	535363	535368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051618
11112	NC_013158	TC	3	6	535372	535377	0 %	50 %	0 %	50 %	257051618
11113	NC_013158	ACGC	2	8	535416	535423	25 %	0 %	25 %	50 %	257051618
11114	NC_013158	GAG	2	6	535454	535459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051618
11115	NC_013158	GGA	2	6	535522	535527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051618
11116	NC_013158	GATC	2	8	535540	535547	25 %	25 %	25 %	25 %	257051618
11117	NC_013158	CTC	2	6	535574	535579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051618
11118	NC_013158	ACCC	2	8	535586	535593	25 %	0 %	0 %	75 %	257051618
11119	NC_013158	CGA	2	6	535607	535612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051618
11120	NC_013158	CGCT	2	8	535646	535653	0 %	25 %	25 %	50 %	257051618
11121	NC_013158	CGG	2	6	535821	535826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051619
11122	NC_013158	GAG	2	6	535906	535911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051619
11123	NC_013158	AAC	2	6	536056	536061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257051619
11124	NC_013158	GGT	2	6	536065	536070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051619
11125	NC_013158	AC	3	6	536084	536089	50 %	0 %	0 %	50 %	257051619
11126	NC_013158	TCGA	2	8	536144	536151	25 %	25 %	25 %	25 %	257051619
11127	NC_013158	TGA	2	6	536226	536231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051619
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11129	NC_013158	CGGT	2	8	536353	536360	0 %	25 %	50 %	25 %	257051619
11130	NC_013158	GCCGTC	2	12	536365	536376	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	257051619
11131	NC_013158	GGCCT	2	10	536425	536434	0 %	20 %	40 %	40 %	257051619
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11138	NC_013158	TCG	2	6	536852	536857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051620
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11142	NC_013158	CGAC	2	8	537110	537117	25 %	0 %	25 %	50 %	257051620
11143	NC_013158	GGAA	2	8	537137	537144	50 %	0 %	50 %	0 %	257051620
11144	NC_013158	CGT	2	6	537170	537175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051620
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11146	NC_013158	GCTCG	2	10	537222	537231	0 %	20 %	40 %	40 %	257051620
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11148	NC_013158	TC	3	6	537332	537337	0 %	50 %	0 %	50 %	257051620
11149	NC_013158	CGT	2	6	537347	537352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051620
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11160	NC_013158	CGC	2	6	537871	537876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051620
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11222	NC_013158	GAT	2	6	541459	541464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051623
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11224	NC_013158	ACG	2	6	541493	541498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051623
11225	NC_013158	CGA	2	6	541515	541520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051623
11226	NC_013158	GAT	2	6	541521	541526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051623
11227	NC_013158	TCG	2	6	541535	541540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051623
11228	NC_013158	TCG	2	6	541577	541582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051623
11229	NC_013158	CA	3	6	541628	541633	50 %	0 %	0 %	50 %	257051623
11230	NC_013158	GACG	2	8	541644	541651	25 %	0 %	50 %	25 %	257051623
11231	NC_013158	CA	3	6	541726	541731	50 %	0 %	0 %	50 %	257051623
11232	NC_013158	GCT	2	6	541746	541751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051623
11233	NC_013158	AAC	2	6	541805	541810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257051623
11234	NC_013158	CGGTC	2	10	541833	541842	0 %	20 %	40 %	40 %	257051623
11235	NC_013158	GGATC	2	10	541954	541963	20 %	20 %	40 %	20 %	257051623
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11237	NC_013158	TGACG	2	10	541989	541998	20 %	20 %	40 %	20 %	257051623
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11241	NC_013158	GTC	2	6	542187	542192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051624
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11343	NC_013158	CTGA	2	8	546295	546302	25 %	25 %	25 %	25 %	257051627
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11354	NC_013158	C	6	6	546772	546777	0 %	0 %	0 %	100 %	257051627
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11465	NC_013158	CGA	2	6	551554	551559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051632
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11467	NC_013158	CGGC	2	8	551686	551693	0 %	0 %	50 %	50 %	257051632
11468	NC_013158	GTC	2	6	551773	551778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051633
11469	NC_013158	AAGG	2	8	551815	551822	50 %	0 %	50 %	0 %	257051633
11470	NC_013158	GCG	2	6	551850	551855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051633
11471	NC_013158	GAG	2	6	551956	551961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051633
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11473	NC_013158	ACG	2	6	552023	552028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051633
11474	NC_013158	GCT	2	6	552042	552047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051633
11475	NC_013158	CGC	2	6	552147	552152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051633
11476	NC_013158	CGT	2	6	552183	552188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051633
11477	NC_013158	GGA	2	6	552195	552200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051633
11478	NC_013158	CGG	2	6	552207	552212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051633
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11480	NC_013158	CGAT	2	8	552245	552252	25 %	25 %	25 %	25 %	257051633
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11488	NC_013158	CG	3	6	552947	552952	0 %	0 %	50 %	50 %	257051635
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