MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 66729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7003	NC_013158	ACG	2	6	338498	338503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051438
7004	NC_013158	CAG	2	6	338617	338622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051438
7005	NC_013158	CG	3	6	338660	338665	0 %	0 %	50 %	50 %	257051438
7006	NC_013158	AGCG	2	8	338671	338678	25 %	0 %	50 %	25 %	257051438
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7012	NC_013158	CCG	2	6	338882	338887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051438
7013	NC_013158	CG	4	8	338898	338905	0 %	0 %	50 %	50 %	257051438
7014	NC_013158	GCC	2	6	338979	338984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051438
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7238	NC_013158	GTTGA	2	10	349406	349415	20 %	40 %	40 %	0 %	257051447
7239	NC_013158	TTC	2	6	349424	349429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257051447
7240	NC_013158	GCT	2	6	349443	349448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051447
7241	NC_013158	GGA	2	6	349532	349537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051447
7242	NC_013158	C	6	6	349538	349543	0 %	0 %	0 %	100 %	257051447
7243	NC_013158	CACCGC	2	12	349549	349560	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	257051447
7244	NC_013158	CTG	2	6	349575	349580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051447
7245	NC_013158	CGA	2	6	349595	349600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051447
7246	NC_013158	TCA	2	6	349671	349676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051447
7247	NC_013158	GATCCC	2	12	350000	350011	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	257051448
7248	NC_013158	CCGATC	2	12	350047	350058	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	257051448
7249	NC_013158	GCC	2	6	350076	350081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051448
7250	NC_013158	TTG	2	6	350130	350135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257051448
7251	NC_013158	GAC	2	6	350142	350147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051448
7252	NC_013158	CGT	2	6	350192	350197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051448
7253	NC_013158	AGCG	2	8	350199	350206	25 %	0 %	50 %	25 %	257051448
7254	NC_013158	CGT	2	6	350210	350215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051448
7255	NC_013158	GAC	2	6	350262	350267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051448
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7258	NC_013158	CGT	2	6	350357	350362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051448
7259	NC_013158	TCG	2	6	350365	350370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051448
7260	NC_013158	GCG	2	6	350429	350434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051449
7261	NC_013158	ACG	2	6	350496	350501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051449
7262	NC_013158	GTCG	2	8	350512	350519	0 %	25 %	50 %	25 %	257051449
7263	NC_013158	CG	3	6	350558	350563	0 %	0 %	50 %	50 %	257051449
7264	NC_013158	AGG	2	6	350568	350573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051449
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7266	NC_013158	CGG	2	6	350632	350637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257051449
7267	NC_013158	GTC	2	6	350690	350695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051449
7268	NC_013158	TCG	2	6	350715	350720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051449
7269	NC_013158	GAC	2	6	350737	350742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051449
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7272	NC_013158	TCC	2	6	350817	350822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257051449
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7275	NC_013158	CGA	2	6	350974	350979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051449
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7277	NC_013158	GTCGCG	2	12	351101	351112	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	257051449
7278	NC_013158	TCG	2	6	351156	351161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051449
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7310	NC_013158	CGAT	2	8	353190	353197	25 %	25 %	25 %	25 %	257051450
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7321	NC_013158	GGTC	2	8	353999	354006	0 %	25 %	50 %	25 %	257051452
7322	NC_013158	CAG	2	6	354011	354016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051452
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7327	NC_013158	TCA	2	6	354125	354130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051452
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7329	NC_013158	CAG	2	6	354198	354203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051452
7330	NC_013158	GCCG	2	8	354240	354247	0 %	0 %	50 %	50 %	257051452
7331	NC_013158	CCAG	2	8	354293	354300	25 %	0 %	25 %	50 %	257051452
7332	NC_013158	CCG	2	6	354352	354357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051452
7333	NC_013158	CCGC	2	8	354379	354386	0 %	0 %	25 %	75 %	257051452
7334	NC_013158	TGA	2	6	354407	354412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257051452
7335	NC_013158	GCCGA	2	10	354426	354435	20 %	0 %	40 %	40 %	257051452
7336	NC_013158	AACG	2	8	354447	354454	50 %	0 %	25 %	25 %	257051452
7337	NC_013158	AGC	2	6	354460	354465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051452
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7339	NC_013158	GCT	2	6	354724	354729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051453
7340	NC_013158	CGT	2	6	354808	354813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051453
7341	NC_013158	TCG	2	6	354856	354861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051453
7342	NC_013158	TCG	3	9	354870	354878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051453
7343	NC_013158	GCTC	2	8	354946	354953	0 %	25 %	25 %	50 %	257051453
7344	NC_013158	CGC	2	6	355112	355117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051454
7345	NC_013158	CGA	2	6	355160	355165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051454
7346	NC_013158	CCG	2	6	355177	355182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051454
7347	NC_013158	CGA	2	6	355235	355240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051454
7348	NC_013158	TCG	2	6	355264	355269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051454
7349	NC_013158	GGCC	2	8	355286	355293	0 %	0 %	50 %	50 %	257051454
7350	NC_013158	GAC	2	6	355419	355424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051454
7351	NC_013158	TCG	2	6	355432	355437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051454
7352	NC_013158	CG	3	6	355436	355441	0 %	0 %	50 %	50 %	257051454
7353	NC_013158	TCG	2	6	355492	355497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051454
7354	NC_013158	ACC	2	6	355501	355506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257051454
7355	NC_013158	CGT	2	6	355514	355519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051454
7356	NC_013158	GCGA	2	8	355549	355556	25 %	0 %	50 %	25 %	257051454
7357	NC_013158	ATC	2	6	355597	355602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257051454
7358	NC_013158	ATCCG	2	10	355627	355636	20 %	20 %	20 %	40 %	257051454
7359	NC_013158	CGA	2	6	355661	355666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051454
7360	NC_013158	GTG	2	6	355689	355694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257051454
7361	NC_013158	GATC	2	8	355757	355764	25 %	25 %	25 %	25 %	257051454
7362	NC_013158	CGC	2	6	355796	355801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257051454
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7365	NC_013158	CGA	2	6	356046	356051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051454
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7367	NC_013158	TCG	2	6	356197	356202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051455
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7370	NC_013158	GTC	2	6	356268	356273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051455
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7372	NC_013158	TCG	2	6	356425	356430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257051455
7373	NC_013158	GGA	2	6	356471	356476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051455
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7474	NC_013158	GA	3	6	360559	360564	50 %	0 %	50 %	0 %	257051458
7475	NC_013158	ATCGA	2	10	360586	360595	40 %	20 %	20 %	20 %	257051458
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7478	NC_013158	CGA	2	6	360663	360668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257051458
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7481	NC_013158	GAG	2	6	360793	360798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051458
7482	NC_013158	GAG	2	6	360862	360867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257051458
7483	NC_013158	TCGA	2	8	361000	361007	25 %	25 %	25 %	25 %	257051458
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